More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cwoe_4231 on replicon NC_013739
Organism: Conexibacter woesei DSM 14684



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013739  Cwoe_4231  endoribonuclease L-PSP  100 
 
 
130 aa  263  5e-70  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0433121  normal  0.0621047 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0144  putative endoribonuclease L-PSP  48.36 
 
 
126 aa  130  6e-30  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00510728  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0614  putative endoribonuclease L-PSP  43.9 
 
 
127 aa  127  5.0000000000000004e-29  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0968  putative endoribonuclease L-PSP  50.4 
 
 
130 aa  125  2.0000000000000002e-28  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.18464  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2283  endoribonuclease L-PSP  52.21 
 
 
126 aa  125  3e-28  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00000755149  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0664  endoribonuclease L-PSP  48.36 
 
 
129 aa  124  5e-28  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1495  endoribonuclease L-PSP  56.64 
 
 
133 aa  122  2e-27  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1336  endoribonuclease L-PSP  40.5 
 
 
125 aa  122  2e-27  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1089  putative endoribonuclease L-PSP  43.55 
 
 
126 aa  121  3e-27  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1940  putative endoribonuclease L-PSP  53.98 
 
 
128 aa  121  3e-27  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.049388  hitchhiker  0.000000582392 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0943  endoribonuclease L-PSP  47.93 
 
 
126 aa  121  4e-27  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0278799  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1267  putative endoribonuclease L-PSP  43.55 
 
 
126 aa  121  4e-27  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.686095  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2960  putative endoribonuclease L-PSP  52.21 
 
 
129 aa  120  6e-27  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0412  putative endoribonuclease L-PSP  44.83 
 
 
127 aa  120  8e-27  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4387  putative endoribonuclease L-PSP  47.9 
 
 
128 aa  120  8e-27  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.944295  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5264  putative endoribonuclease L-PSP  51.33 
 
 
124 aa  119  9.999999999999999e-27  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.574263  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5540  endoribonuclease L-PSP  47.33 
 
 
131 aa  119  9.999999999999999e-27  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  decreased coverage  0.00356179  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2343  putative endoribonuclease L-PSP  43.09 
 
 
143 aa  118  1.9999999999999998e-26  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.435007  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0709  putative endoribonuclease L-PSP  49.56 
 
 
128 aa  118  1.9999999999999998e-26  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0042  putative endoribonuclease L-PSP  51.33 
 
 
124 aa  117  4.9999999999999996e-26  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0109  endoribonuclease L-PSP  44.44 
 
 
140 aa  117  6e-26  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.748315  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0174  endoribonuclease L-PSP  43.8 
 
 
125 aa  117  6e-26  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.282996 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0733  endoribonuclease L-PSP  49.56 
 
 
128 aa  117  7e-26  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1258  putative endoribonuclease L-PSP  47.93 
 
 
126 aa  117  7e-26  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.768034  normal  0.325919 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2798  endoribonuclease L-PSP  45.08 
 
 
126 aa  117  7.999999999999999e-26  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000409658  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0041  endoribonuclease L-PSP  47.54 
 
 
124 aa  116  9e-26  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2398  putative endoribonuclease L-PSP  49.56 
 
 
126 aa  116  9e-26  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000108439  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1312  putative endoribonuclease L-PSP  50.43 
 
 
128 aa  116  9.999999999999999e-26  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0052  putative endoribonuclease L-PSP  50.44 
 
 
124 aa  116  9.999999999999999e-26  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.000180566  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1323  endoribonuclease L-PSP  46.02 
 
 
126 aa  115  1.9999999999999998e-25  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0868  YjgF family translation initiation inhibitor  46.55 
 
 
126 aa  115  1.9999999999999998e-25  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.000000281222  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0815  endoribonuclease L-PSP  49.56 
 
 
132 aa  115  3e-25  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0043  endoribonuclease L-PSP  48.67 
 
 
124 aa  114  3.9999999999999997e-25  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00285503  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0046  endoribonuclease L-PSP  49.12 
 
 
124 aa  114  3.9999999999999997e-25  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0042  pur operon repressor  49.12 
 
 
124 aa  114  3.9999999999999997e-25  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0042  pur operon repressor  49.12 
 
 
124 aa  114  3.9999999999999997e-25  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.478295  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0046  endoribonuclease L-PSP  49.12 
 
 
124 aa  114  3.9999999999999997e-25  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0056  putative endoribonuclease L-PSP  49.12 
 
 
124 aa  114  3.9999999999999997e-25  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0053  putative endoribonuclease L-PSP  49.12 
 
 
124 aa  114  3.9999999999999997e-25  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4974  putative endoribonuclease L-PSP  44.44 
 
 
129 aa  114  6e-25  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0045  endoribonuclease L-PSP, putative  48.31 
 
 
127 aa  113  6.9999999999999995e-25  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0156  endoribonuclease L-PSP  44.92 
 
 
126 aa  113  6.9999999999999995e-25  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1096  endoribonuclease L-PSP  47.11 
 
 
126 aa  113  6.9999999999999995e-25  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0517  Endoribonuclease L-PSP  47.46 
 
 
129 aa  112  1.0000000000000001e-24  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0358  endoribonuclease L-PSP, putative  47.01 
 
 
127 aa  112  1.0000000000000001e-24  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03649  hypothetical protein  49.57 
 
 
129 aa  113  1.0000000000000001e-24  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3616  putative endoribonuclease L-PSP  47.01 
 
 
127 aa  113  1.0000000000000001e-24  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0327  putative endoribonuclease L-PSP  47.01 
 
 
127 aa  113  1.0000000000000001e-24  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.701439  normal  0.523278 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2441  endoribonuclease L-PSP  45.24 
 
 
127 aa  113  1.0000000000000001e-24  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.248917 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1306  endoribonuclease L-PSP  42.74 
 
 
126 aa  112  1.0000000000000001e-24  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.566325  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3813  putative endoribonuclease L-PSP  47.01 
 
 
127 aa  112  1.0000000000000001e-24  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.805449  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0637  putative endoribonuclease L-PSP  46.15 
 
 
128 aa  112  1.0000000000000001e-24  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002417  endoribonuclease L-PSP  48.72 
 
 
129 aa  112  1.0000000000000001e-24  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0245  endoribonuclease L-PSP  46.55 
 
 
126 aa  112  2.0000000000000002e-24  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.836469  normal  0.336264 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3109  endoribonuclease L-PSP  48.33 
 
 
123 aa  112  2.0000000000000002e-24  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0400559 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0566  endoribonuclease L-PSP, putative  47.93 
 
 
129 aa  112  2.0000000000000002e-24  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2792  putative endoribonuclease L-PSP  47.79 
 
 
127 aa  112  2.0000000000000002e-24  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0414  putative endoribonuclease L-PSP  45.45 
 
 
124 aa  112  2.0000000000000002e-24  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.59864  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0720  endoribonuclease L-PSP  47.93 
 
 
129 aa  112  2.0000000000000002e-24  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0181894  hitchhiker  0.000000890707 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1664  endoribonuclease L-PSP  41.88 
 
 
124 aa  112  2.0000000000000002e-24  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0042  putative endoribonuclease L-PSP  48.67 
 
 
124 aa  112  2.0000000000000002e-24  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0493131  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2387  endoribonuclease L-PSP  50.86 
 
 
124 aa  111  3e-24  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0072  endoribonuclease L-PSP, putative  46.22 
 
 
126 aa  111  3e-24  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2324  endoribonuclease L-PSP  47.11 
 
 
125 aa  111  3e-24  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  6.85805e-18  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3436  YjgF-like protein  46.55 
 
 
127 aa  111  3e-24  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1716  endoribonuclease L-PSP  47.11 
 
 
124 aa  111  3e-24  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.220452  decreased coverage  0.00000724646 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0208  YjgF-like protein  46.22 
 
 
126 aa  111  4.0000000000000004e-24  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0531  putative endoribonuclease L-PSP  42.74 
 
 
126 aa  111  4.0000000000000004e-24  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000228568  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0518  putative endoribonuclease L-PSP  42.74 
 
 
126 aa  111  4.0000000000000004e-24  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.0000619405  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3444  putative endoribonuclease L-PSP  43.8 
 
 
129 aa  110  5e-24  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.00474727  decreased coverage  0.0000224932 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3633  putative endoribonuclease L-PSP  46.15 
 
 
127 aa  110  6e-24  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00280207  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2971  putative endoribonuclease L-PSP  46.9 
 
 
127 aa  110  6e-24  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2463  endoribonuclease L-PSP  43.48 
 
 
125 aa  110  7.000000000000001e-24  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000173812  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3500  putative endoribonuclease L-PSP  44.83 
 
 
127 aa  110  7.000000000000001e-24  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2875  putative endoribonuclease L-PSP  46.9 
 
 
127 aa  110  7.000000000000001e-24  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.732397  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0360  endoribonuclease L-PSP  46.15 
 
 
127 aa  110  8.000000000000001e-24  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00000000617851 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2235  endoribonuclease L-PSP, putative  49.59 
 
 
126 aa  110  8.000000000000001e-24  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  decreased coverage  0.00087243  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3880  putative endoribonuclease L-PSP  44.83 
 
 
127 aa  110  8.000000000000001e-24  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.196354  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0357  putative endoribonuclease L-PSP  46.15 
 
 
127 aa  110  8.000000000000001e-24  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00527339  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0352  putative endoribonuclease L-PSP  46.15 
 
 
127 aa  110  8.000000000000001e-24  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.249855  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0350  putative endoribonuclease L-PSP  46.15 
 
 
127 aa  110  8.000000000000001e-24  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.039857  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1694  putative endoribonuclease L-PSP  43.36 
 
 
124 aa  110  9e-24  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3783  endoribonuclease L-PSP  48.78 
 
 
133 aa  110  9e-24  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20920  putative endoribonuclease L-PSP  40.98 
 
 
125 aa  109  1.0000000000000001e-23  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2024  endoribonuclease L-PSP, putative  47.46 
 
 
128 aa  109  1.0000000000000001e-23  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0972  YjgF-like protein  47.66 
 
 
130 aa  109  1.0000000000000001e-23  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.00459079  normal  0.578034 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2593  endoribonuclease L-PSP  43.09 
 
 
126 aa  108  2.0000000000000002e-23  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1984  hypothetical protein  43.09 
 
 
128 aa  108  2.0000000000000002e-23  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00156  Endoribonuclease L-PSP family protein  45.76 
 
 
128 aa  108  2.0000000000000002e-23  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5351  endoribonuclease L-PSP  46.22 
 
 
126 aa  108  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.120193  normal  0.233615 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0418  endoribonuclease L-PSP  45.69 
 
 
128 aa  108  2.0000000000000002e-23  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.891288  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0333  putative endoribonuclease L-PSP  43.97 
 
 
127 aa  108  2.0000000000000002e-23  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.117163 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3698  peptidase S1C, Do  47.79 
 
 
127 aa  108  2.0000000000000002e-23  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.239756 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1220  endoribonuclease L-PSP  46.02 
 
 
126 aa  108  2.0000000000000002e-23  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000020508  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0362  putative endoribonuclease L-PSP  45.69 
 
 
127 aa  108  2.0000000000000002e-23  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0835  endoribonuclease L-PSP  42.98 
 
 
125 aa  108  3e-23  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1989  hypothetical protein  43.09 
 
 
128 aa  108  3e-23  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006684  CNB05500  conserved hypothetical protein  41.6 
 
 
156 aa  108  3e-23  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  hitchhiker  0.000381478  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0350  putative endoribonuclease L-PSP  41.53 
 
 
128 aa  108  3e-23  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0603  putative endoribonuclease L-PSP  42.74 
 
 
129 aa  108  3e-23  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>