More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_1192 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010571  Oter_1192  endoribonuclease L-PSP  100 
 
 
387 aa  775    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4475  endoribonuclease L-PSP  55.08 
 
 
368 aa  395  1e-108  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1816  Dimethylargininase  35.74 
 
 
257 aa  144  2e-33  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.000313544  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2396  dimethylargininase  36.16 
 
 
253 aa  143  6e-33  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0124  dimethylargininase  35.93 
 
 
258 aa  141  1.9999999999999998e-32  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2905  Dimethylargininase  32.64 
 
 
258 aa  125  2e-27  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0127  Dimethylargininase  33.04 
 
 
256 aa  120  6e-26  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4094  amidinotransferase  32.14 
 
 
261 aa  117  1.9999999999999998e-25  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.94443  normal  0.524488 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2143  dimethylargininase  32.79 
 
 
256 aa  114  3e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.434845  normal  0.168164 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3585  dimethylargininase  32.79 
 
 
256 aa  113  5e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.849367  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4424  dimethylargininase  32.79 
 
 
256 aa  113  5e-24  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.991286  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3943  dimethylargininase  32.79 
 
 
256 aa  113  5e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.444932  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4639  amidinotransferase  32.52 
 
 
252 aa  112  8.000000000000001e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.266629  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_13990  N-dimethylarginine dimethylaminohydrolase  28.03 
 
 
263 aa  111  2.0000000000000002e-23  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_22890  N-dimethylarginine dimethylaminohydrolase  30 
 
 
263 aa  109  7.000000000000001e-23  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3320  dimethylargininase  32.39 
 
 
256 aa  109  7.000000000000001e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3837  dimethylargininase  31.98 
 
 
252 aa  108  1e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.456176  normal  0.996067 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1622  hypothetical protein  29.09 
 
 
255 aa  104  3e-21  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1628  hypothetical protein  27.85 
 
 
255 aa  102  9e-21  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1658  Dimethylargininase  33.08 
 
 
262 aa  100  3e-20  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.63661  normal  0.0320201 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5483  endoribonuclease L-PSP  40.98 
 
 
125 aa  99.8  8e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.387695 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2100  Dimethylargininase  32.28 
 
 
257 aa  98.6  1e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_48840  hypothetical protein  26.36 
 
 
254 aa  95.9  1e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.397949  decreased coverage  0.000000000411492 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4183  hypothetical protein  26.36 
 
 
254 aa  95.1  2e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.201687  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4635  amidinotransferase  28.51 
 
 
264 aa  92.8  9e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.640839  normal  0.370008 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3241  Dimethylargininase  32.27 
 
 
258 aa  92  2e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0575879  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0733  endoribonuclease L-PSP  36 
 
 
128 aa  87.4  3e-16  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2798  endoribonuclease L-PSP  35.25 
 
 
126 aa  87.4  4e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000409658  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0268  cell division protein FtsY  36 
 
 
132 aa  86.7  6e-16  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.279233  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0709  putative endoribonuclease L-PSP  34.92 
 
 
128 aa  85.1  0.000000000000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3641  endoribonuclease L-PSP family protein  36.07 
 
 
130 aa  85.1  0.000000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.787877  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1894  putative endoribonuclease L-PSP  38.46 
 
 
125 aa  84.7  0.000000000000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.373962  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1493  endoribonuclease L-PSP  36.07 
 
 
124 aa  84.3  0.000000000000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1847  endoribonuclease L-PSP, putative  33.88 
 
 
126 aa  82.8  0.00000000000001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3904  putative endoribonuclease L-PSP  38.14 
 
 
128 aa  81.6  0.00000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.147099 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07040  conserved hypothetical protein  38.84 
 
 
134 aa  80.9  0.00000000000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2324  endoribonuclease L-PSP  36.44 
 
 
125 aa  81.3  0.00000000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  6.85805e-18  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1054  putative endoribonuclease L-PSP  35.25 
 
 
126 aa  80.9  0.00000000000004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0726433  normal  0.0135345 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0603  endoribonuclease L-PSP  35.25 
 
 
126 aa  80.9  0.00000000000004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.35425  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0109  endoribonuclease L-PSP  37.61 
 
 
140 aa  80.5  0.00000000000005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.748315  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1265  endoribonuclease L-PSP  38.21 
 
 
124 aa  80.5  0.00000000000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1452  L-PSP family endoribonuclease  36.7 
 
 
127 aa  80.5  0.00000000000005  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0104737  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1134  endoribonuclease L-PSP  35.54 
 
 
126 aa  80.1  0.00000000000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2283  endoribonuclease L-PSP  33.06 
 
 
126 aa  80.1  0.00000000000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00000755149  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0542  putative endoribonuclease L-PSP  34.43 
 
 
126 aa  79.7  0.00000000000008  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0176  endoribonuclease L-PSP  34.43 
 
 
124 aa  78.2  0.0000000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0812936  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1777  endoribonuclease L-PSP  36.59 
 
 
125 aa  78.6  0.0000000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0815  endoribonuclease L-PSP  35 
 
 
132 aa  77.8  0.0000000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6195  Endoribonuclease L-PSP  35.34 
 
 
138 aa  77.4  0.0000000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.393332  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0900  hypothetical protein  37.84 
 
 
134 aa  77.4  0.0000000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0174  endoribonuclease L-PSP  34.86 
 
 
125 aa  77.4  0.0000000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.282996 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0387  endoribonuclease L-PSP  36.36 
 
 
126 aa  77.4  0.0000000000004  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000500244 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0496  endoribonuclease L-PSP  34.43 
 
 
124 aa  77  0.0000000000005  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.000921293  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2235  endoribonuclease L-PSP, putative  36.44 
 
 
126 aa  77  0.0000000000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  decreased coverage  0.00087243  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0144  putative endoribonuclease L-PSP  32.2 
 
 
126 aa  77  0.0000000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00510728  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2593  endoribonuclease L-PSP  31.45 
 
 
126 aa  76.6  0.0000000000006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1220  endoribonuclease L-PSP  33.06 
 
 
126 aa  77  0.0000000000006  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000020508  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5927  endoribonuclease L-PSP  37.82 
 
 
129 aa  76.6  0.0000000000007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0894752  normal  0.145489 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1694  putative endoribonuclease L-PSP  30.65 
 
 
124 aa  76.6  0.0000000000007  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2398  putative endoribonuclease L-PSP  31.97 
 
 
126 aa  76.6  0.0000000000007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000108439  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1443  YjgF-like protein  32.26 
 
 
124 aa  76.3  0.0000000000008  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.00280255  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS04792  hypothetical protein  37.1 
 
 
130 aa  75.9  0.000000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.598375  normal  0.0238785 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0835  endoribonuclease L-PSP  35.54 
 
 
125 aa  75.9  0.000000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2343  putative endoribonuclease L-PSP  29.51 
 
 
143 aa  75.5  0.000000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.435007  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1664  endoribonuclease L-PSP  33.33 
 
 
124 aa  75.5  0.000000000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2931  endoribonuclease L-PSP  33.9 
 
 
129 aa  75.1  0.000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5909  Endoribonuclease L-PSP  35.14 
 
 
134 aa  75.1  0.000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0614  putative endoribonuclease L-PSP  32.23 
 
 
127 aa  75.1  0.000000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0463  endoribonuclease L-PSP  36.07 
 
 
129 aa  75.5  0.000000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.97811  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3399  endoribonuclease L-PSP  32.79 
 
 
132 aa  74.7  0.000000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.0000947362  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1403  endoribonuclease L-PSP  35.78 
 
 
126 aa  74.3  0.000000000003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  hitchhiker  0.000591811 
 
 
-
 
NC_006684  CNB05500  conserved hypothetical protein  33.91 
 
 
156 aa  73.9  0.000000000004  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  hitchhiker  0.000381478  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0230  YjgF-like protein protein  33.33 
 
 
135 aa  73.6  0.000000000006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1940  putative endoribonuclease L-PSP  36.13 
 
 
128 aa  73.2  0.000000000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.049388  hitchhiker  0.000000582392 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0496  endoribonuclease L-PSP  33.61 
 
 
123 aa  72.4  0.00000000001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0676524  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4001  Endoribonuclease L-PSP  34.43 
 
 
129 aa  72  0.00000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.543856  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3238  endoribonuclease L-PSP  33.87 
 
 
151 aa  72.8  0.00000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.635376 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0566  endoribonuclease L-PSP, putative  33.86 
 
 
129 aa  72.4  0.00000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2962  endoribonuclease L-PSP  30.33 
 
 
122 aa  72.4  0.00000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0877  YjgF-like protein  37.84 
 
 
129 aa  72.4  0.00000000001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0720  endoribonuclease L-PSP  33.86 
 
 
129 aa  72.4  0.00000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0181894  hitchhiker  0.000000890707 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1336  endoribonuclease L-PSP  30.25 
 
 
125 aa  72.4  0.00000000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21490  endoribonuclease L-PSP, putative  33.61 
 
 
124 aa  72.4  0.00000000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4114  Endoribonuclease L-PSP  34.43 
 
 
129 aa  72  0.00000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2357  endoribonuclease L-PSP  27.42 
 
 
127 aa  72.8  0.00000000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  7.063190000000001e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002892  endoribonuclease L-PSP  31.4 
 
 
126 aa  72  0.00000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4370  hypothetical protein  33.93 
 
 
140 aa  71.6  0.00000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1301  endoribonuclease L-PSP  34.13 
 
 
130 aa  71.6  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0965  endoribonuclease L-PSP  34.88 
 
 
141 aa  72  0.00000000002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1312  putative endoribonuclease L-PSP  34.4 
 
 
128 aa  71.6  0.00000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3032  endoribonuclease L-PSP  33.07 
 
 
126 aa  71.6  0.00000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4365  endoribonuclease L-PSP  36.21 
 
 
141 aa  72  0.00000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1267  putative endoribonuclease L-PSP  30.58 
 
 
126 aa  71.6  0.00000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.686095  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1053  endoribonuclease L-PSP  31.36 
 
 
127 aa  72  0.00000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000107956 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1215  YjgF-like protein  36.75 
 
 
128 aa  71.2  0.00000000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.55454  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02784  hypothetical protein  33.61 
 
 
127 aa  70.9  0.00000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1089  putative endoribonuclease L-PSP  29.75 
 
 
126 aa  71.2  0.00000000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1306  endoribonuclease L-PSP  28.57 
 
 
126 aa  71.2  0.00000000003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.566325  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0610  putative endoribonuclease L-PSP  32.79 
 
 
126 aa  70.9  0.00000000003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  hitchhiker  0.00344225  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0042  putative endoribonuclease L-PSP  32.26 
 
 
124 aa  70.9  0.00000000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0493131  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>