77 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcur_3241 on replicon NC_013510
Organism: Thermomonospora curvata DSM 43183



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013510  Tcur_3241  Dimethylargininase  100 
 
 
258 aa  494  1e-139  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0575879  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2100  Dimethylargininase  59.27 
 
 
257 aa  249  2e-65  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1658  Dimethylargininase  53.2 
 
 
262 aa  228  6e-59  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.63661  normal  0.0320201 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0124  dimethylargininase  40.16 
 
 
258 aa  170  3e-41  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0127  Dimethylargininase  37.55 
 
 
256 aa  155  8e-37  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1622  hypothetical protein  32.54 
 
 
255 aa  144  1e-33  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1816  Dimethylargininase  37.1 
 
 
257 aa  140  3e-32  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.000313544  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1628  hypothetical protein  31.75 
 
 
255 aa  137  2e-31  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4094  amidinotransferase  35.69 
 
 
261 aa  135  9e-31  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.94443  normal  0.524488 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2905  Dimethylargininase  32.16 
 
 
258 aa  127  1.0000000000000001e-28  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_48840  hypothetical protein  31.76 
 
 
254 aa  124  2e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.397949  decreased coverage  0.000000000411492 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_13990  N-dimethylarginine dimethylaminohydrolase  33.6 
 
 
263 aa  122  6e-27  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4183  hypothetical protein  31.75 
 
 
254 aa  120  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.201687  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_22890  N-dimethylarginine dimethylaminohydrolase  30.2 
 
 
263 aa  118  9e-26  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2396  dimethylargininase  34.26 
 
 
253 aa  117  9.999999999999999e-26  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3837  dimethylargininase  35.66 
 
 
252 aa  115  5e-25  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.456176  normal  0.996067 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2143  dimethylargininase  35.27 
 
 
256 aa  115  5e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.434845  normal  0.168164 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3320  dimethylargininase  35.27 
 
 
256 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4424  dimethylargininase  34.5 
 
 
256 aa  112  7.000000000000001e-24  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.991286  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3585  dimethylargininase  34.5 
 
 
256 aa  112  7.000000000000001e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.849367  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3943  dimethylargininase  34.5 
 
 
256 aa  112  7.000000000000001e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.444932  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1192  endoribonuclease L-PSP  32.27 
 
 
387 aa  112  8.000000000000001e-24  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4639  amidinotransferase  34.09 
 
 
252 aa  109  4.0000000000000004e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.266629  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4635  amidinotransferase  28.19 
 
 
264 aa  81.6  0.00000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.640839  normal  0.370008 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4475  endoribonuclease L-PSP  29.31 
 
 
368 aa  81.3  0.00000000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0428  amidinotransferase  24.14 
 
 
271 aa  80.1  0.00000000000003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1802  amidinotransferase  30 
 
 
296 aa  71.6  0.00000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0130  amidinotransferase  29.63 
 
 
268 aa  70.1  0.00000000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4521  amidinotransferase  29.15 
 
 
287 aa  69.7  0.00000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4052  amidinotransferase  28.69 
 
 
269 aa  68.9  0.00000000008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.402053  normal  0.043057 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6044  amidinotransferase  29.46 
 
 
271 aa  68.2  0.0000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.227436  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0020  amidinotransferase  28.8 
 
 
293 aa  66.2  0.0000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000289153 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1644  ornithine aminotransferase  29.05 
 
 
680 aa  66.2  0.0000000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3676  amidinotransferase  29.96 
 
 
271 aa  65.9  0.0000000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.324715  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3194  amidinotransferase  27.08 
 
 
304 aa  61.6  0.00000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7970  amidinotransferase  27.98 
 
 
280 aa  60.8  0.00000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2012  amidinotransferase  30.64 
 
 
318 aa  60.8  0.00000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.262975 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0329  amidinotransferase family protein  23.17 
 
 
265 aa  59.7  0.00000004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6661  amidinotransferase  28.87 
 
 
292 aa  59.7  0.00000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0754101  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12346  hypothetical protein  29.34 
 
 
302 aa  59.7  0.00000005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0453  amidinotransferase  28.87 
 
 
279 aa  57  0.0000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.166592  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5070  amidinotransferase  28.81 
 
 
281 aa  56.2  0.0000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1021  amidinotransferase  29.36 
 
 
272 aa  55.8  0.0000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.585434  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1011  amidinotransferase  29.36 
 
 
272 aa  55.8  0.0000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.34213  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0993  amidinotransferase  29.36 
 
 
272 aa  55.8  0.0000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1814  amidinotransferase family protein  25.51 
 
 
275 aa  55.5  0.0000008  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1775  amidinotransferase  24.05 
 
 
279 aa  55.5  0.0000009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00023093  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0382  amidinotransferase family protein  25.1 
 
 
275 aa  54.7  0.000001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.0222666  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3188  amidinotransferase  26.55 
 
 
283 aa  55.1  0.000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1169  amidinotransferase  29.41 
 
 
278 aa  54.3  0.000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.730709  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1288  amidinotransferase  31.25 
 
 
290 aa  53.5  0.000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.254269  normal  0.122965 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2672  amidinotransferase  27.5 
 
 
296 aa  53.1  0.000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2147  amidinotransferase  29.05 
 
 
278 aa  52.4  0.000007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.130609 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1316  amidinotransferase  29.01 
 
 
302 aa  52.4  0.000008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.267233 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3814  amidinotransferase  29.26 
 
 
285 aa  52.4  0.000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3009  Non-specific serine/threonine protein kinase  25.23 
 
 
364 aa  51.6  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.169976  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2664  amidinotransferase  26.75 
 
 
273 aa  52  0.00001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0780  amidinotransferase  25.1 
 
 
275 aa  50.1  0.00004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2244  amidinotransferase  28.15 
 
 
276 aa  50.1  0.00004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.510972 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0585  amidinotransferase  27.54 
 
 
292 aa  49.3  0.00006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.965795 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0887  amidinotransferase  26.61 
 
 
272 aa  47  0.0003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.766224  normal  0.211646 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30700  N-dimethylarginine dimethylaminohydrolase  31.08 
 
 
279 aa  47  0.0003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2800  Arginine deiminase  31.1 
 
 
414 aa  47  0.0003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.551978  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2842  arginine deiminase  27.95 
 
 
407 aa  47  0.0003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1993  arginine deiminase  29.3 
 
 
409 aa  46.6  0.0004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03350  N-dimethylarginine dimethylaminohydrolase  25.71 
 
 
270 aa  46.2  0.0006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.716798 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3304  amidinotransferase  27.02 
 
 
356 aa  45.1  0.001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1108  arginine deiminase  28.86 
 
 
416 aa  43.9  0.002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.279691 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1038  arginine deiminase  31.43 
 
 
417 aa  43.5  0.003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.584278 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4529  amidinotransferase  27.43 
 
 
269 aa  43.1  0.004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.484115 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0521  arginine deiminase  25.32 
 
 
406 aa  43.1  0.005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2321  amidinotransferase  22.6 
 
 
386 aa  42.7  0.005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.187783  normal  0.819339 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1090  arginine deiminase  28.95 
 
 
419 aa  42.7  0.005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.787817 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1693  arginine deiminase  21.26 
 
 
325 aa  42.7  0.005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.309435 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03644  arginine deiminase  27.47 
 
 
406 aa  42.7  0.005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1000  arginine deiminase  30.48 
 
 
419 aa  42  0.01  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1001  arginine deiminase  30.48 
 
 
417 aa  42  0.01  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>