More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_1644 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013441  Gbro_1644  ornithine aminotransferase  100 
 
 		 680 aa  1373    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1287  ornithine aminotransferase  77.14 
 
 		 403 aa  600  1e-170  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0501  normal  0.208991 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5071  ornithine aminotransferase  77.14 
 
 		 401 aa  593  1e-168  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0992  aminotransferase  76.36 
 
 		 408 aa  594  1e-168  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1010  aminotransferase  76.36 
 
 		 408 aa  594  1e-168  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.661373  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1020  aminotransferase  76.36 
 
 		 408 aa  594  1e-168  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.828452  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3677  ornithine aminotransferase  67.53 
 
 		 404 aa  540  9.999999999999999e-153  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4053  ornithine aminotransferase  66.33 
 
 		 404 aa  534  1e-150  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.541542  normal  0.130067 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0609  ornithine aminotransferase  63.54 
 
 		 424 aa  521  1e-146  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0918035  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7971  ornithine aminotransferase  64.08 
 
 		 427 aa  518  1.0000000000000001e-145  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1135  ornithine aminotransferase  67.1 
 
 		 399 aa  517  1.0000000000000001e-145  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1168  ornithine aminotransferase  64.39 
 
 		 407 aa  518  1.0000000000000001e-145  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.467281  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2330  ornithine--oxo-acid transaminase  61.86 
 
 		 403 aa  506  9.999999999999999e-143  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2808  ornithine aminotransferase  63.43 
 
 		 412 aa  504  1e-141  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.892113  n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4863  aminotransferase  64.49 
 
 		 406 aa  505  1e-141  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3540  ornithine aminotransferase  65.54 
 
 		 404 aa  505  1e-141  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000260033  hitchhiker  0.00155006 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4523  aminotransferase  61.25 
 
 		 413 aa  499  1e-140  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23960  aminotransferase  66.13 
 
 		 416 aa  491  1e-137  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0400213  normal  0.0558706 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2247  aminotransferase  63.61 
 
 		 418 aa  487  1e-136  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1586  ornithine aminotransferase  61.71 
 
 		 409 aa  479  1e-134  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21320  aminotransferase  61.8 
 
 		 408 aa  465  1e-129  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.210219  hitchhiker  0.00417952 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30710  aminotransferase  58.71 
 
 		 404 aa  459  1e-127  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3316  ornithine aminotransferase  60.94 
 
 		 396 aa  454  1.0000000000000001e-126  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.271295  normal  0.0695851 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0454  aminotransferase  61.48 
 
 		 415 aa  455  1.0000000000000001e-126  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.102369  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0886  ornithine aminotransferase  62.63 
 
 		 406 aa  445  1e-123  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.22367 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0779  ornithine aminotransferase  61.3 
 
 		 407 aa  439  9.999999999999999e-123  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3918  ornithine--oxo-acid transaminase  54.27 
 
 		 399 aa  439  9.999999999999999e-123  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1822  aminotransferase  53.87 
 
 		 402 aa  434  1e-120  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.787584 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0322  ornithine aminotransferase  56.92 
 
 		 403 aa  432  1e-120  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3630  ornithine--oxo-acid transaminase  53.27 
 
 		 399 aa  430  1e-119  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.159022 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0869  ornithine--oxo-acid transaminase  51.63 
 
 		 396 aa  424  1e-117  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.523488  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0686  ornithine--oxo-acid transaminase  51.8 
 
 		 398 aa  421  1e-116  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000099191  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1044  ornithine--oxo-acid transaminase  51.26 
 
 		 399 aa  421  1e-116  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1256  ornithine--oxo-acid transaminase  51.8 
 
 		 396 aa  417  9.999999999999999e-116  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1050  ornithine--oxo-acid transaminase  51.8 
 
 		 396 aa  417  9.999999999999999e-116  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0273827  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1307  ornithine--oxo-acid transaminase  51.8 
 
 		 396 aa  417  9.999999999999999e-116  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0673255  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1231  ornithine--oxo-acid transaminase  51.55 
 
 		 396 aa  416  9.999999999999999e-116  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4137  ornithine--oxo-acid transaminase  51.55 
 
 		 396 aa  414  1e-114  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1071  ornithine--oxo-acid transaminase  51.03 
 
 		 396 aa  412  1e-114  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.953264  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1052  ornithine--oxo-acid transaminase  51.29 
 
 		 396 aa  414  1e-114  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1204  ornithine--oxo-acid transaminase  51.55 
 
 		 396 aa  414  1e-114  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.957107  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1154  ornithine--oxo-acid transaminase  51.03 
 
 		 396 aa  412  1e-114  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1053  ornithine--oxo-acid transaminase  50.77 
 
 		 396 aa  409  1e-113  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0029  ornithine aminotransferase  55.47 
 
 		 402 aa  412  1e-113  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.628841  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0957  ornithine--oxo-acid transaminase  51.56 
 
 		 396 aa  409  1.0000000000000001e-112  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.593517  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0976  ornithine--oxo-acid transaminase  51.56 
 
 		 396 aa  409  1.0000000000000001e-112  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0545  ornithine--oxo-acid transaminase  51.56 
 
 		 396 aa  404  1e-111  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3466  ornithine--oxo-acid transaminase  53.52 
 
 		 415 aa  404  1e-111  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0435653  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2115  acetylornithine aminotransferase  53.92 
 
 		 411 aa  400  9.999999999999999e-111  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0193211 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2814  ornithine aminotransferase  55.64 
 
 		 412 aa  395  1e-108  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.53224  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1150  aminotransferase  48.72 
 
 		 398 aa  395  1e-108  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.348536 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1494  ornithine aminotransferase  50.76 
 
 		 414 aa  392  1e-107  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1660  ornithine aminotransferase  51.7 
 
 		 410 aa  389  1e-106  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.567958 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0165  aminotransferase  48.16 
 
 		 415 aa  386  1e-106  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2516  ornithine aminotransferase  54.31 
 
 		 422 aa  385  1e-105  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.345897 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0159  acetylornithine aminotransferase protein  51.17 
 
 		 408 aa  381  1e-104  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.903246  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0049  ornithine aminotransferase  53.41 
 
 		 408 aa  380  1e-104  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0052  ornithine aminotransferase  51.7 
 
 		 408 aa  380  1e-104  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.98585 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4657  ornithine aminotransferase  47.07 
 
 		 417 aa  374  1e-102  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1711  ornithine aminotransferase  48.1 
 
 		 409 aa  372  1e-101  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4031  ornithine aminotransferase  49.21 
 
 		 410 aa  369  1e-101  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.0013504  normal  0.512867 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3111  ornithine aminotransferase  51.96 
 
 		 405 aa  365  2e-99  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08581  acetylornithine aminotransferase, putative  47.88 
 
 		 425 aa  355  2e-96  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.805978  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1271  acetylornithine aminotransferase, putative  45.36 
 
 		 409 aa  353  5e-96  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01810  Ornithine aminotransferase (EC 2.6.1.13)(Ornithine--oxo-acid aminotransferase) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q92413]  48.32 
 
 		 454 aa  353  5.9999999999999994e-96  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0361813  normal  1 
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_27726  ornithine aminotransferase  47.42 
 
 		 448 aa  352  2e-95  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0647  aminotransferase  48.2 
 
 		 410 aa  350  6e-95  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0170  ornithine aminotransferase  44.22 
 
 		 394 aa  350  7e-95  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0175  ornithine aminotransferase  44.22 
 
 		 394 aa  350  7e-95  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009044  PICST_77538  ornithine aminotransferase  45 
 
 		 435 aa  348  2e-94  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006681  CNL04880  ornithine-oxo-acid transaminase, putative  45.63 
 
 		 452 aa  347  5e-94  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0178177  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3421  ornithine aminotransferase  46.7 
 
 		 420 aa  343  4e-93  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00000373729  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6558  ornithine aminotransferase  46.32 
 
 		 417 aa  339  9e-92  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1021  amidinotransferase  61.19 
 
 		 272 aa  324  3e-87  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.585434  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0993  amidinotransferase  61.19 
 
 		 272 aa  324  3e-87  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1011  amidinotransferase  61.19 
 
 		 272 aa  324  3e-87  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.34213  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12346  hypothetical protein  62.5 
 
 		 302 aa  318  2e-85  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1288  amidinotransferase  58.51 
 
 		 290 aa  312  1e-83  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.254269  normal  0.122965 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5070  amidinotransferase  59.85 
 
 		 281 aa  311  2.9999999999999997e-83  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2147  amidinotransferase  59.21 
 
 		 278 aa  306  1.0000000000000001e-81  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.130609 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1169  amidinotransferase  55.2 
 
 		 278 aa  298  2e-79  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.730709  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2012  amidinotransferase  56.67 
 
 		 318 aa  297  4e-79  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.262975 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0887  amidinotransferase  57.62 
 
 		 272 aa  295  2e-78  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.766224  normal  0.211646 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2664  amidinotransferase  56.51 
 
 		 273 aa  293  8e-78  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3814  amidinotransferase  54.84 
 
 		 285 aa  292  1e-77  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4052  amidinotransferase  54.58 
 
 		 269 aa  291  2e-77  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.402053  normal  0.043057 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0780  amidinotransferase  55.26 
 
 		 275 aa  288  2.9999999999999996e-76  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3676  amidinotransferase  54.96 
 
 		 271 aa  288  2.9999999999999996e-76  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.324715  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7970  amidinotransferase  52.33 
 
 		 280 aa  287  4e-76  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0453  amidinotransferase  56.18 
 
 		 279 aa  286  7e-76  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.166592  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2331  amidinotransferase  54.79 
 
 		 264 aa  286  1.0000000000000001e-75  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30700  N-dimethylarginine dimethylaminohydrolase  56.99 
 
 		 279 aa  285  2.0000000000000002e-75  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3304  amidinotransferase  53.53 
 
 		 356 aa  280  5e-74  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03350  N-dimethylarginine dimethylaminohydrolase  54.48 
 
 		 270 aa  280  8e-74  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.716798 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6661  amidinotransferase  52.87 
 
 		 292 aa  277  4e-73  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0754101  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2079  acetylornithine aminotransferase  40.2 
 
 		 391 aa  272  1e-71  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1316  amidinotransferase  54.83 
 
 		 302 aa  272  1e-71  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.267233 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3572  acetylornithine aminotransferase  41.71 
 
 		 404 aa  271  4e-71  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.331421 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2244  amidinotransferase  52.85 
 
 		 276 aa  270  5.9999999999999995e-71  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.510972 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6044  amidinotransferase  51.48 
 
 		 271 aa  266  1e-69  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.227436  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>