More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_30710 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013521  Sked_30710  aminotransferase  100 
 
 
404 aa  802    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23960  aminotransferase  64.47 
 
 
416 aa  484  1e-135  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0400213  normal  0.0558706 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1586  ornithine aminotransferase  65.05 
 
 
409 aa  480  1e-134  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2808  ornithine aminotransferase  64.1 
 
 
412 aa  475  1e-133  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.892113  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7971  ornithine aminotransferase  62.44 
 
 
427 aa  475  1e-133  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0779  ornithine aminotransferase  66.67 
 
 
407 aa  469  1.0000000000000001e-131  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3677  ornithine aminotransferase  61.99 
 
 
404 aa  464  9.999999999999999e-131  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0886  ornithine aminotransferase  66.25 
 
 
406 aa  466  9.999999999999999e-131  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.22367 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4863  aminotransferase  60.25 
 
 
406 aa  468  9.999999999999999e-131  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5071  ornithine aminotransferase  58.16 
 
 
401 aa  465  9.999999999999999e-131  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4523  aminotransferase  60.97 
 
 
413 aa  465  9.999999999999999e-131  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4053  ornithine aminotransferase  62.66 
 
 
404 aa  464  1e-129  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.541542  normal  0.130067 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1644  ornithine aminotransferase  58.71 
 
 
680 aa  459  9.999999999999999e-129  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1135  ornithine aminotransferase  60 
 
 
399 aa  459  9.999999999999999e-129  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0609  ornithine aminotransferase  59.34 
 
 
424 aa  457  1e-127  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0918035  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1020  aminotransferase  58.44 
 
 
408 aa  456  1e-127  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.828452  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0992  aminotransferase  58.44 
 
 
408 aa  456  1e-127  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1010  aminotransferase  58.44 
 
 
408 aa  456  1e-127  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.661373  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1168  ornithine aminotransferase  59.25 
 
 
407 aa  456  1e-127  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.467281  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3316  ornithine aminotransferase  59.9 
 
 
396 aa  453  1.0000000000000001e-126  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.271295  normal  0.0695851 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1287  ornithine aminotransferase  57.14 
 
 
403 aa  453  1.0000000000000001e-126  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0501  normal  0.208991 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3540  ornithine aminotransferase  61.64 
 
 
404 aa  451  1e-125  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000260033  hitchhiker  0.00155006 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2330  ornithine--oxo-acid transaminase  56.89 
 
 
403 aa  441  9.999999999999999e-123  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21320  aminotransferase  56.93 
 
 
408 aa  436  1e-121  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.210219  hitchhiker  0.00417952 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0454  aminotransferase  58.35 
 
 
415 aa  433  1e-120  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.102369  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2247  aminotransferase  58.93 
 
 
418 aa  420  1e-116  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1822  aminotransferase  51.92 
 
 
402 aa  402  1e-111  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.787584 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3466  ornithine--oxo-acid transaminase  51.87 
 
 
415 aa  398  9.999999999999999e-111  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0435653  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3918  ornithine--oxo-acid transaminase  51.53 
 
 
399 aa  400  9.999999999999999e-111  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0322  ornithine aminotransferase  52.16 
 
 
403 aa  395  1e-109  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1204  ornithine--oxo-acid transaminase  49.62 
 
 
396 aa  392  1e-108  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.957107  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3630  ornithine--oxo-acid transaminase  51.53 
 
 
399 aa  394  1e-108  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.159022 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1053  ornithine--oxo-acid transaminase  48.6 
 
 
396 aa  389  1e-107  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1052  ornithine--oxo-acid transaminase  49.11 
 
 
396 aa  389  1e-107  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4137  ornithine--oxo-acid transaminase  49.36 
 
 
396 aa  390  1e-107  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1044  ornithine--oxo-acid transaminase  48.35 
 
 
399 aa  390  1e-107  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0686  ornithine--oxo-acid transaminase  48.47 
 
 
398 aa  390  1e-107  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000099191  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1231  ornithine--oxo-acid transaminase  48.85 
 
 
396 aa  386  1e-106  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1307  ornithine--oxo-acid transaminase  48.85 
 
 
396 aa  386  1e-106  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0673255  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1256  ornithine--oxo-acid transaminase  48.85 
 
 
396 aa  386  1e-106  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0976  ornithine--oxo-acid transaminase  47.75 
 
 
396 aa  386  1e-106  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1071  ornithine--oxo-acid transaminase  48.85 
 
 
396 aa  388  1e-106  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.953264  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1050  ornithine--oxo-acid transaminase  48.85 
 
 
396 aa  386  1e-106  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0273827  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0957  ornithine--oxo-acid transaminase  47.75 
 
 
396 aa  386  1e-106  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.593517  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1154  ornithine--oxo-acid transaminase  48.85 
 
 
396 aa  388  1e-106  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2814  ornithine aminotransferase  53.94 
 
 
412 aa  385  1e-106  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.53224  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0869  ornithine--oxo-acid transaminase  50 
 
 
396 aa  388  1e-106  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.523488  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0545  ornithine--oxo-acid transaminase  48.47 
 
 
396 aa  384  1e-105  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0159  acetylornithine aminotransferase protein  53.2 
 
 
408 aa  384  1e-105  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.903246  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1660  ornithine aminotransferase  51.26 
 
 
410 aa  380  1e-104  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.567958 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0029  ornithine aminotransferase  48.98 
 
 
402 aa  380  1e-104  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.628841  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0165  aminotransferase  48.21 
 
 
415 aa  377  1e-103  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0052  ornithine aminotransferase  52.94 
 
 
408 aa  377  1e-103  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.98585 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1150  aminotransferase  47.34 
 
 
398 aa  377  1e-103  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.348536 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2115  acetylornithine aminotransferase  55.08 
 
 
411 aa  370  1e-101  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0193211 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0049  ornithine aminotransferase  52.81 
 
 
408 aa  368  1e-100  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4031  ornithine aminotransferase  49.74 
 
 
410 aa  358  9.999999999999999e-98  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.0013504  normal  0.512867 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3111  ornithine aminotransferase  51.28 
 
 
405 aa  354  1e-96  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2516  ornithine aminotransferase  51 
 
 
422 aa  353  2e-96  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.345897 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1711  ornithine aminotransferase  46.92 
 
 
409 aa  347  2e-94  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4657  ornithine aminotransferase  46.25 
 
 
417 aa  342  7e-93  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1494  ornithine aminotransferase  47.41 
 
 
414 aa  342  1e-92  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08581  acetylornithine aminotransferase, putative  45.23 
 
 
425 aa  336  3.9999999999999995e-91  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.805978  n/a   
 
 
-
 
NC_009044  PICST_77538  ornithine aminotransferase  45.26 
 
 
435 aa  331  1e-89  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01810  Ornithine aminotransferase (EC 2.6.1.13)(Ornithine--oxo-acid aminotransferase) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q92413]  43.31 
 
 
454 aa  330  2e-89  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0361813  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG1271  acetylornithine aminotransferase, putative  44.36 
 
 
409 aa  328  1.0000000000000001e-88  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0175  ornithine aminotransferase  42.43 
 
 
394 aa  316  5e-85  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0170  ornithine aminotransferase  42.43 
 
 
394 aa  316  5e-85  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0647  aminotransferase  44.33 
 
 
410 aa  315  6e-85  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_27726  ornithine aminotransferase  44.05 
 
 
448 aa  314  1.9999999999999998e-84  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3421  ornithine aminotransferase  40.38 
 
 
420 aa  313  3.9999999999999997e-84  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00000373729  normal 
 
 
-
 
NC_006681  CNL04880  ornithine-oxo-acid transaminase, putative  42.11 
 
 
452 aa  305  6e-82  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0178177  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6558  ornithine aminotransferase  41.04 
 
 
417 aa  304  2.0000000000000002e-81  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2079  acetylornithine aminotransferase  41.58 
 
 
391 aa  271  2e-71  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0533  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  38.38 
 
 
394 aa  265  1e-69  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3065  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  42.15 
 
 
401 aa  263  3e-69  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.110355  normal  0.664029 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0353  acetylornithine aminotransferase  36.2 
 
 
395 aa  261  2e-68  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  hitchhiker  0.00220895 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1566  acetylornithine aminotransferase  35.95 
 
 
395 aa  260  3e-68  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2154  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  40.86 
 
 
401 aa  260  3e-68  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00000952275  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0406  acetylornithine aminotransferase  40.05 
 
 
388 aa  259  4e-68  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1258  acetylornithine aminotransferase  36.97 
 
 
398 aa  259  4e-68  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00185503  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0570  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  40.05 
 
 
388 aa  259  4e-68  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2464  acetylornithine aminotransferase  39.45 
 
 
392 aa  259  8e-68  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2287  acetylornithine aminotransferase  37.78 
 
 
402 aa  258  1e-67  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.194315 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0426  acetylornithine aminotransferase  34.65 
 
 
396 aa  255  9e-67  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0269327  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1784  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  37.22 
 
 
385 aa  254  1.0000000000000001e-66  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.74918  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4636  acetylornithine aminotransferase  40.16 
 
 
395 aa  254  2.0000000000000002e-66  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.621133  normal  0.175641 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2440  acetylornithine aminotransferase  37.14 
 
 
388 aa  254  3e-66  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.493949  normal  0.0446911 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1041  acetylornithine aminotransferase  38.69 
 
 
390 aa  253  4.0000000000000004e-66  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.370932  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0946  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  42.49 
 
 
398 aa  252  9.000000000000001e-66  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.104291  normal  0.0999204 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0395  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  40.69 
 
 
413 aa  252  1e-65  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.538676 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0640  acetylornithine aminotransferase  35.84 
 
 
403 aa  251  2e-65  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.41902  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2898  acetylornithine aminotransferase  37.02 
 
 
389 aa  251  2e-65  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1069  acetylornithine aminotransferase  36.48 
 
 
398 aa  251  2e-65  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00131217  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp3040  acetylornithine aminotransferase  36.76 
 
 
389 aa  248  1e-64  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2414  acetylornithine aminotransferase  37.97 
 
 
396 aa  248  1e-64  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0660  acetylornithine aminotransferase  34.67 
 
 
394 aa  248  1e-64  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0274  acetylornithine aminotransferase  35.44 
 
 
396 aa  248  1e-64  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.110157  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1710  acetylornithine aminotransferase  37.97 
 
 
392 aa  247  2e-64  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0925352  hitchhiker  0.00335003 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0342  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  38.07 
 
 
417 aa  248  2e-64  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>