More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHU_0647 on replicon NC_008255
Organism: Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008255  CHU_0647  aminotransferase  100 
 
 
410 aa  852    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6558  ornithine aminotransferase  65.78 
 
 
417 aa  585  1e-166  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3421  ornithine aminotransferase  63.9 
 
 
420 aa  558  1e-158  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00000373729  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4031  ornithine aminotransferase  64.5 
 
 
410 aa  541  1e-153  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.0013504  normal  0.512867 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1494  ornithine aminotransferase  60.95 
 
 
414 aa  538  9.999999999999999e-153  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4657  ornithine aminotransferase  63.3 
 
 
417 aa  534  1e-150  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08581  acetylornithine aminotransferase, putative  63.48 
 
 
425 aa  530  1e-149  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.805978  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1271  acetylornithine aminotransferase, putative  58.37 
 
 
409 aa  498  1e-140  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_27726  ornithine aminotransferase  57.46 
 
 
448 aa  498  1e-140  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01810  Ornithine aminotransferase (EC 2.6.1.13)(Ornithine--oxo-acid aminotransferase) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q92413]  54.09 
 
 
454 aa  480  1e-134  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0361813  normal 
 
 
-
 
NC_006681  CNL04880  ornithine-oxo-acid transaminase, putative  56.66 
 
 
452 aa  471  1.0000000000000001e-131  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0178177  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3630  ornithine--oxo-acid transaminase  55.04 
 
 
399 aa  446  1.0000000000000001e-124  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.159022 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_77538  ornithine aminotransferase  52.05 
 
 
435 aa  443  1e-123  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3466  ornithine--oxo-acid transaminase  54.8 
 
 
415 aa  438  9.999999999999999e-123  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0435653  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3918  ornithine--oxo-acid transaminase  54.3 
 
 
399 aa  439  9.999999999999999e-123  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0029  ornithine aminotransferase  52.62 
 
 
402 aa  435  1e-121  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.628841  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1822  aminotransferase  54.5 
 
 
402 aa  433  1e-120  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.787584 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0165  aminotransferase  52.25 
 
 
415 aa  423  1e-117  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0322  ornithine aminotransferase  52.57 
 
 
403 aa  422  1e-117  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1711  ornithine aminotransferase  53.54 
 
 
409 aa  420  1e-116  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1044  ornithine--oxo-acid transaminase  49.75 
 
 
399 aa  400  9.999999999999999e-111  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1150  aminotransferase  51.01 
 
 
398 aa  400  9.999999999999999e-111  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.348536 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0686  ornithine--oxo-acid transaminase  49.13 
 
 
398 aa  397  1e-109  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000099191  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2115  acetylornithine aminotransferase  50.5 
 
 
411 aa  393  1e-108  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0193211 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1256  ornithine--oxo-acid transaminase  49.75 
 
 
396 aa  390  1e-107  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2330  ornithine--oxo-acid transaminase  48.5 
 
 
403 aa  389  1e-107  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1050  ornithine--oxo-acid transaminase  49.75 
 
 
396 aa  390  1e-107  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0273827  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1135  ornithine aminotransferase  49.63 
 
 
399 aa  391  1e-107  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1168  ornithine aminotransferase  47.43 
 
 
407 aa  389  1e-107  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.467281  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1231  ornithine--oxo-acid transaminase  49.75 
 
 
396 aa  390  1e-107  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1307  ornithine--oxo-acid transaminase  49.75 
 
 
396 aa  390  1e-107  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0673255  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0869  ornithine--oxo-acid transaminase  50.5 
 
 
396 aa  390  1e-107  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.523488  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1053  ornithine--oxo-acid transaminase  49 
 
 
396 aa  385  1e-106  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1071  ornithine--oxo-acid transaminase  49.25 
 
 
396 aa  386  1e-106  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.953264  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1052  ornithine--oxo-acid transaminase  49.5 
 
 
396 aa  388  1e-106  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1154  ornithine--oxo-acid transaminase  49.25 
 
 
396 aa  386  1e-106  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4137  ornithine--oxo-acid transaminase  49.5 
 
 
396 aa  387  1e-106  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1204  ornithine--oxo-acid transaminase  49.5 
 
 
396 aa  387  1e-106  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.957107  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0976  ornithine--oxo-acid transaminase  48.5 
 
 
396 aa  386  1e-106  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0957  ornithine--oxo-acid transaminase  48.5 
 
 
396 aa  386  1e-106  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.593517  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0545  ornithine--oxo-acid transaminase  47.65 
 
 
396 aa  379  1e-104  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23960  aminotransferase  47.49 
 
 
416 aa  375  1e-103  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0400213  normal  0.0558706 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0052  ornithine aminotransferase  47.41 
 
 
408 aa  376  1e-103  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.98585 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0159  acetylornithine aminotransferase protein  45.7 
 
 
408 aa  372  1e-102  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.903246  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7971  ornithine aminotransferase  48.23 
 
 
427 aa  370  1e-101  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0454  aminotransferase  47.15 
 
 
415 aa  371  1e-101  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.102369  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0049  ornithine aminotransferase  46.91 
 
 
408 aa  367  1e-100  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4053  ornithine aminotransferase  48.37 
 
 
404 aa  368  1e-100  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.541542  normal  0.130067 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2516  ornithine aminotransferase  47 
 
 
422 aa  367  1e-100  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.345897 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3111  ornithine aminotransferase  46.75 
 
 
405 aa  368  1e-100  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4523  aminotransferase  47.33 
 
 
413 aa  367  1e-100  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1586  ornithine aminotransferase  45.57 
 
 
409 aa  362  9e-99  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3677  ornithine aminotransferase  46.75 
 
 
404 aa  358  8e-98  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0609  ornithine aminotransferase  44 
 
 
424 aa  355  7.999999999999999e-97  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0918035  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2808  ornithine aminotransferase  45.48 
 
 
412 aa  353  2.9999999999999997e-96  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.892113  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2247  aminotransferase  45.05 
 
 
418 aa  352  5.9999999999999994e-96  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1287  ornithine aminotransferase  46.75 
 
 
403 aa  351  2e-95  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0501  normal  0.208991 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1644  ornithine aminotransferase  48.2 
 
 
680 aa  350  3e-95  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2814  ornithine aminotransferase  47.1 
 
 
412 aa  350  3e-95  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.53224  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5071  ornithine aminotransferase  46.55 
 
 
401 aa  349  5e-95  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0170  ornithine aminotransferase  45.85 
 
 
394 aa  349  6e-95  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0175  ornithine aminotransferase  45.85 
 
 
394 aa  349  6e-95  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3316  ornithine aminotransferase  46.46 
 
 
396 aa  348  1e-94  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.271295  normal  0.0695851 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1660  ornithine aminotransferase  43.89 
 
 
410 aa  347  2e-94  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.567958 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4863  aminotransferase  45.32 
 
 
406 aa  347  2e-94  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21320  aminotransferase  45.86 
 
 
408 aa  343  2.9999999999999997e-93  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.210219  hitchhiker  0.00417952 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3540  ornithine aminotransferase  43.75 
 
 
404 aa  343  4e-93  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000260033  hitchhiker  0.00155006 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1020  aminotransferase  45.48 
 
 
408 aa  340  4e-92  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.828452  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0992  aminotransferase  45.48 
 
 
408 aa  340  4e-92  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1010  aminotransferase  45.48 
 
 
408 aa  340  4e-92  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.661373  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0886  ornithine aminotransferase  43.24 
 
 
406 aa  330  3e-89  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.22367 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0779  ornithine aminotransferase  44.86 
 
 
407 aa  317  3e-85  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30710  aminotransferase  44.33 
 
 
404 aa  315  7e-85  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0151  acetylornithine aminotransferase  39.27 
 
 
399 aa  300  2e-80  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3150  acetylornithine aminotransferase  38.56 
 
 
399 aa  299  6e-80  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0353  acetylornithine aminotransferase  39.9 
 
 
395 aa  298  2e-79  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  hitchhiker  0.00220895 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1830  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  39.95 
 
 
395 aa  296  6e-79  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.991221  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0226  acetylornithine aminotransferase  38.71 
 
 
396 aa  296  6e-79  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0204  acetylornithine aminotransferase  39.34 
 
 
399 aa  295  1e-78  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000412684 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2287  acetylornithine aminotransferase  38.83 
 
 
402 aa  295  1e-78  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.194315 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1566  acetylornithine aminotransferase  39.65 
 
 
395 aa  293  5e-78  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2414  acetylornithine aminotransferase  37.66 
 
 
396 aa  291  1e-77  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3636  acetylornithine aminotransferase  38 
 
 
397 aa  290  5.0000000000000004e-77  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0426  acetylornithine aminotransferase  38.02 
 
 
396 aa  289  8e-77  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0269327  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3173  acetylornithine aminotransferase  38.31 
 
 
398 aa  289  8e-77  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.324258  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1698  acetylornithine aminotransferase  38.69 
 
 
394 aa  286  2.9999999999999996e-76  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3741  acetylornithine aminotransferase  37.75 
 
 
397 aa  286  2.9999999999999996e-76  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0660  acetylornithine aminotransferase  37.59 
 
 
394 aa  286  5.999999999999999e-76  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0483  acetylornithine aminotransferase  38.65 
 
 
395 aa  285  1.0000000000000001e-75  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2493  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  38.69 
 
 
397 aa  285  1.0000000000000001e-75  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0274  acetylornithine aminotransferase  36.63 
 
 
396 aa  284  2.0000000000000002e-75  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.110157  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1866  acetylornithine aminotransferase  37.47 
 
 
400 aa  282  7.000000000000001e-75  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0640  acetylornithine aminotransferase  38.4 
 
 
403 aa  279  5e-74  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.41902  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1258  acetylornithine aminotransferase  37.88 
 
 
398 aa  273  3e-72  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00185503  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0569  acetylornithine aminotransferase  36.41 
 
 
400 aa  273  3e-72  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.160273  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2204  acetylornithine aminotransferase  36.57 
 
 
390 aa  273  5.000000000000001e-72  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0637  acetylornithine aminotransferase  35.57 
 
 
418 aa  270  2.9999999999999997e-71  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00130856  normal  0.274942 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3003  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  36.1 
 
 
427 aa  270  4e-71  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0772  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  36.92 
 
 
399 aa  267  2e-70  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.200689  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2013  acetylornithine aminotransferase  36.09 
 
 
418 aa  267  2e-70  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.152714 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>