More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nham_3111 on replicon NC_007964
Organism: Nitrobacter hamburgensis X14



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007406  Nwi_2516  ornithine aminotransferase  88.37 
 
 		 422 aa  708    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.345897 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3111  ornithine aminotransferase  100 
 
 		 405 aa  822    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1711  ornithine aminotransferase  62.31 
 
 		 409 aa  503  1e-141  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2115  acetylornithine aminotransferase  65.15 
 
 		 411 aa  490  1e-137  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0193211 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0165  aminotransferase  56.01 
 
 		 415 aa  477  1e-133  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1822  aminotransferase  54.2 
 
 		 402 aa  472  1e-132  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.787584 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0322  ornithine aminotransferase  56.42 
 
 		 403 aa  473  1e-132  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0686  ornithine--oxo-acid transaminase  55.5 
 
 		 398 aa  473  1e-132  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000099191  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0159  acetylornithine aminotransferase protein  58.25 
 
 		 408 aa  459  9.999999999999999e-129  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.903246  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1044  ornithine--oxo-acid transaminase  55.7 
 
 		 399 aa  461  9.999999999999999e-129  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0052  ornithine aminotransferase  58.44 
 
 		 408 aa  457  1e-127  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.98585 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3466  ornithine--oxo-acid transaminase  56.01 
 
 		 415 aa  453  1.0000000000000001e-126  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0435653  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1256  ornithine--oxo-acid transaminase  52.94 
 
 		 396 aa  450  1e-125  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1050  ornithine--oxo-acid transaminase  52.94 
 
 		 396 aa  450  1e-125  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0273827  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0049  ornithine aminotransferase  60.64 
 
 		 408 aa  449  1e-125  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1231  ornithine--oxo-acid transaminase  52.94 
 
 		 396 aa  450  1e-125  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1307  ornithine--oxo-acid transaminase  52.94 
 
 		 396 aa  450  1e-125  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0673255  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4137  ornithine--oxo-acid transaminase  52.69 
 
 		 396 aa  447  1.0000000000000001e-124  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1071  ornithine--oxo-acid transaminase  52.69 
 
 		 396 aa  447  1.0000000000000001e-124  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.953264  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1052  ornithine--oxo-acid transaminase  52.69 
 
 		 396 aa  447  1.0000000000000001e-124  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1154  ornithine--oxo-acid transaminase  52.69 
 
 		 396 aa  447  1.0000000000000001e-124  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1204  ornithine--oxo-acid transaminase  52.69 
 
 		 396 aa  447  1.0000000000000001e-124  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.957107  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1053  ornithine--oxo-acid transaminase  51.92 
 
 		 396 aa  443  1e-123  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0957  ornithine--oxo-acid transaminase  53.71 
 
 		 396 aa  441  1e-123  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.593517  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0869  ornithine--oxo-acid transaminase  51.92 
 
 		 396 aa  443  1e-123  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.523488  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0976  ornithine--oxo-acid transaminase  53.71 
 
 		 396 aa  441  1e-123  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0545  ornithine--oxo-acid transaminase  53.2 
 
 		 396 aa  439  9.999999999999999e-123  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1660  ornithine aminotransferase  57.04 
 
 		 410 aa  435  1e-121  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.567958 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3918  ornithine--oxo-acid transaminase  52.04 
 
 		 399 aa  431  1e-119  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3630  ornithine--oxo-acid transaminase  51.92 
 
 		 399 aa  429  1e-119  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.159022 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2814  ornithine aminotransferase  57.72 
 
 		 412 aa  428  1e-119  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.53224  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1135  ornithine aminotransferase  54.15 
 
 		 399 aa  421  1e-116  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0029  ornithine aminotransferase  50.64 
 
 		 402 aa  416  9.999999999999999e-116  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.628841  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1150  aminotransferase  50.38 
 
 		 398 aa  412  1e-114  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.348536 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4863  aminotransferase  52.69 
 
 		 406 aa  413  1e-114  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0170  ornithine aminotransferase  50 
 
 		 394 aa  412  1e-114  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0175  ornithine aminotransferase  50 
 
 		 394 aa  412  1e-114  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2808  ornithine aminotransferase  52.32 
 
 		 412 aa  408  1e-113  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.892113  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3316  ornithine aminotransferase  52.78 
 
 		 396 aa  408  1e-113  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.271295  normal  0.0695851 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7971  ornithine aminotransferase  51.96 
 
 		 427 aa  403  1e-111  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2330  ornithine--oxo-acid transaminase  48.87 
 
 		 403 aa  400  9.999999999999999e-111  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3540  ornithine aminotransferase  52.17 
 
 		 404 aa  399  9.999999999999999e-111  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000260033  hitchhiker  0.00155006 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4657  ornithine aminotransferase  49 
 
 		 417 aa  397  1e-109  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1168  ornithine aminotransferase  49.63 
 
 		 407 aa  396  1e-109  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.467281  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1287  ornithine aminotransferase  50.76 
 
 		 403 aa  396  1e-109  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0501  normal  0.208991 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4031  ornithine aminotransferase  48.73 
 
 		 410 aa  392  1e-108  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.0013504  normal  0.512867 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5071  ornithine aminotransferase  50.51 
 
 		 401 aa  390  1e-107  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0609  ornithine aminotransferase  49.74 
 
 		 424 aa  389  1e-107  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0918035  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1271  acetylornithine aminotransferase, putative  47.34 
 
 		 409 aa  386  1e-106  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4053  ornithine aminotransferase  50.38 
 
 		 404 aa  388  1e-106  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.541542  normal  0.130067 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1644  ornithine aminotransferase  51.96 
 
 		 680 aa  387  1e-106  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23960  aminotransferase  51.41 
 
 		 416 aa  388  1e-106  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0400213  normal  0.0558706 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3677  ornithine aminotransferase  51.02 
 
 		 404 aa  387  1e-106  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1586  ornithine aminotransferase  51.15 
 
 		 409 aa  382  1e-105  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0992  aminotransferase  50.38 
 
 		 408 aa  382  1e-105  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0647  aminotransferase  46.75 
 
 		 410 aa  384  1e-105  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1010  aminotransferase  50.38 
 
 		 408 aa  382  1e-105  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.661373  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1020  aminotransferase  50.38 
 
 		 408 aa  382  1e-105  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.828452  normal  1 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01810  Ornithine aminotransferase (EC 2.6.1.13)(Ornithine--oxo-acid aminotransferase) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q92413]  45.76 
 
 		 454 aa  379  1e-104  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0361813  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1494  ornithine aminotransferase  47.95 
 
 		 414 aa  380  1e-104  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0454  aminotransferase  50.25 
 
 		 415 aa  380  1e-104  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.102369  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3421  ornithine aminotransferase  46.63 
 
 		 420 aa  380  1e-104  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00000373729  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30710  aminotransferase  51.28 
 
 		 404 aa  376  1e-103  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006681  CNL04880  ornithine-oxo-acid transaminase, putative  45.17 
 
 		 452 aa  376  1e-103  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0178177  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21320  aminotransferase  49.87 
 
 		 408 aa  376  1e-103  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.210219  hitchhiker  0.00417952 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4523  aminotransferase  49.36 
 
 		 413 aa  377  1e-103  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6558  ornithine aminotransferase  44.69 
 
 		 417 aa  369  1e-101  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_27726  ornithine aminotransferase  45.68 
 
 		 448 aa  361  1e-98  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0886  ornithine aminotransferase  50.13 
 
 		 406 aa  346  5e-94  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.22367 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08581  acetylornithine aminotransferase, putative  44.58 
 
 		 425 aa  345  8e-94  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.805978  n/a   
 
 
-
 
NC_009044  PICST_77538  ornithine aminotransferase  42.09 
 
 		 435 aa  340  2.9999999999999998e-92  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2247  aminotransferase  46.45 
 
 		 418 aa  337  2.9999999999999997e-91  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0779  ornithine aminotransferase  49.75 
 
 		 407 aa  335  5.999999999999999e-91  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0342  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  44.53 
 
 		 417 aa  311  1e-83  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0353  acetylornithine aminotransferase  38.78 
 
 		 395 aa  307  3e-82  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00220895 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0426  acetylornithine aminotransferase  36.84 
 
 		 396 aa  305  8.000000000000001e-82  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0269327  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2464  acetylornithine aminotransferase  41.84 
 
 		 392 aa  305  9.000000000000001e-82  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2079  acetylornithine aminotransferase  42.86 
 
 		 391 aa  303  2.0000000000000002e-81  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0063  acetylornithine and succinylornithine aminotransferases  42.23 
 
 		 396 aa  304  2.0000000000000002e-81  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.857354  normal  0.372491 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0226  acetylornithine aminotransferase  41.69 
 
 		 396 aa  302  7.000000000000001e-81  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1566  acetylornithine aminotransferase  38.27 
 
 		 395 aa  302  8.000000000000001e-81  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0274  acetylornithine aminotransferase  40.67 
 
 		 396 aa  296  6e-79  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.110157  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0483  acetylornithine aminotransferase  39.03 
 
 		 395 aa  296  6e-79  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2440  acetylornithine aminotransferase  40 
 
 		 388 aa  295  1e-78  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.493949  normal  0.0446911 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0660  acetylornithine aminotransferase  38.52 
 
 		 394 aa  293  3e-78  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2204  acetylornithine aminotransferase  40 
 
 		 390 aa  293  3e-78  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1069  acetylornithine aminotransferase  38.31 
 
 		 398 aa  293  3e-78  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00131217  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1258  acetylornithine aminotransferase  38.56 
 
 		 398 aa  291  1e-77  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00185503  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0982  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  44.28 
 
 		 410 aa  291  1e-77  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1698  acetylornithine aminotransferase  37.91 
 
 		 394 aa  290  4e-77  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1866  acetylornithine aminotransferase  40.16 
 
 		 400 aa  290  4e-77  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2414  acetylornithine aminotransferase  42.86 
 
 		 396 aa  289  5.0000000000000004e-77  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3741  acetylornithine aminotransferase  39.03 
 
 		 397 aa  288  1e-76  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3150  acetylornithine aminotransferase  41.22 
 
 		 399 aa  287  2e-76  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3636  acetylornithine aminotransferase  39.54 
 
 		 397 aa  287  2e-76  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2287  acetylornithine aminotransferase  40.26 
 
 		 402 aa  288  2e-76  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.194315 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1830  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  41.51 
 
 		 395 aa  286  5.999999999999999e-76  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.991221  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0151  acetylornithine aminotransferase  40.2 
 
 		 399 aa  285  7e-76  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4636  acetylornithine aminotransferase  40.97 
 
 		 395 aa  285  8e-76  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.621133  normal  0.175641 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0533  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  38.21 
 
 		 394 aa  285  8e-76  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>