More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GSU0151 on replicon NC_002939
Organism: Geobacter sulfurreducens PCA



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002939  GSU0151  acetylornithine aminotransferase  100 
 
 
399 aa  818    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3150  acetylornithine aminotransferase  78.09 
 
 
399 aa  648    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0204  acetylornithine aminotransferase  90.73 
 
 
399 aa  732    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000412684 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3636  acetylornithine aminotransferase  75.38 
 
 
397 aa  638    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0226  acetylornithine aminotransferase  83.12 
 
 
396 aa  690    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3741  acetylornithine aminotransferase  74.87 
 
 
397 aa  633  1e-180  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3173  acetylornithine aminotransferase  75.06 
 
 
398 aa  630  1e-179  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.324258  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2414  acetylornithine aminotransferase  62.97 
 
 
396 aa  521  1e-147  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2287  acetylornithine aminotransferase  58.69 
 
 
402 aa  489  1e-137  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.194315 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2493  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  57.29 
 
 
397 aa  468  1.0000000000000001e-131  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0063  acetylornithine and succinylornithine aminotransferases  57.61 
 
 
396 aa  462  1e-129  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.857354  normal  0.372491 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0274  acetylornithine aminotransferase  54.1 
 
 
396 aa  459  9.999999999999999e-129  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.110157  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0569  acetylornithine aminotransferase  55.39 
 
 
400 aa  453  1.0000000000000001e-126  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.160273  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0772  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  54.62 
 
 
399 aa  445  1.0000000000000001e-124  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.200689  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0660  acetylornithine aminotransferase  55.56 
 
 
394 aa  447  1.0000000000000001e-124  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0640  acetylornithine aminotransferase  54.2 
 
 
403 aa  441  1e-123  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.41902  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1566  acetylornithine aminotransferase  54.06 
 
 
395 aa  441  1e-123  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0353  acetylornithine aminotransferase  53.05 
 
 
395 aa  438  9.999999999999999e-123  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  hitchhiker  0.00220895 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0342  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  55.75 
 
 
417 aa  434  1e-120  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1698  acetylornithine aminotransferase  52.81 
 
 
394 aa  434  1e-120  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0483  acetylornithine aminotransferase  53.3 
 
 
395 aa  429  1e-119  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02850  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  52.93 
 
 
399 aa  426  1e-118  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.0000577952  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1830  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  52.34 
 
 
395 aa  426  1e-118  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.991221  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3744  acetylornithine aminotransferase  54.43 
 
 
391 aa  425  1e-118  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000932106 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1866  acetylornithine aminotransferase  54.02 
 
 
400 aa  423  1e-117  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0426  acetylornithine aminotransferase  49.74 
 
 
396 aa  422  1e-117  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0269327  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1069  acetylornithine aminotransferase  50.38 
 
 
398 aa  401  1e-111  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00131217  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1258  acetylornithine aminotransferase  51.15 
 
 
398 aa  401  9.999999999999999e-111  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00185503  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2912  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  51.79 
 
 
400 aa  400  9.999999999999999e-111  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.386564  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2013  acetylornithine aminotransferase  49 
 
 
418 aa  397  1e-109  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.152714 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1986  acetylornithine aminotransferase  48.75 
 
 
418 aa  396  1e-109  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3730  acetylornithine aminotransferase  51.13 
 
 
427 aa  396  1e-109  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000174283  normal  0.451197 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5154  acetylornithine aminotransferase  50 
 
 
426 aa  390  1e-107  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000762221 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2288  acetylornithine and succinylornithine aminotransferases  50.38 
 
 
396 aa  390  1e-107  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.37355  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2429  acetylornithine aminotransferase  48.73 
 
 
398 aa  387  1e-106  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1041  acetylornithine aminotransferase  49.36 
 
 
398 aa  385  1e-106  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0101251  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3003  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  50.13 
 
 
427 aa  385  1e-106  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3002  acetylornithine aminotransferase  48.22 
 
 
398 aa  382  1e-105  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.555766  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0637  acetylornithine aminotransferase  50.62 
 
 
418 aa  382  1e-105  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00130856  normal  0.274942 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2464  acetylornithine aminotransferase  49.22 
 
 
392 aa  383  1e-105  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2649  acetylornithine aminotransferase  50.13 
 
 
423 aa  384  1e-105  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.46775  normal  0.4632 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2179  acetylornithine aminotransferase  48.6 
 
 
398 aa  384  1e-105  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.569965  normal  0.442274 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0906  acetylornithine aminotransferase  49.21 
 
 
402 aa  378  1e-104  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1164  acetylornithine aminotransferase  49.35 
 
 
398 aa  381  1e-104  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.581434  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3572  acetylornithine aminotransferase  47.86 
 
 
404 aa  375  1e-103  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.331421 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1094  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  48.21 
 
 
387 aa  376  1e-103  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2204  acetylornithine aminotransferase  48.06 
 
 
390 aa  372  1e-102  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2079  acetylornithine aminotransferase  48.56 
 
 
391 aa  370  1e-101  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0871  acetylornithine aminotransferase  48.96 
 
 
403 aa  369  1e-101  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3011  acetylornithine aminotransferase  47.34 
 
 
404 aa  370  1e-101  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1041  acetylornithine aminotransferase  48.45 
 
 
390 aa  369  1e-101  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.370932  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2872  acetylornithine aminotransferase  46.58 
 
 
397 aa  370  1e-101  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0313  acetylornithine aminotransferase  51.03 
 
 
380 aa  371  1e-101  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2121  acetylornithine aminotransferase  46.52 
 
 
404 aa  365  1e-100  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  decreased coverage  0.00994118  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0946  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  48.45 
 
 
398 aa  364  1e-99  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.104291  normal  0.0999204 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0943  acetylornithine aminotransferase  48.98 
 
 
422 aa  363  2e-99  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1452  acetylornithine aminotransferase  48.16 
 
 
402 aa  363  2e-99  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3029  acetylornithine aminotransferase  48.18 
 
 
410 aa  362  5.0000000000000005e-99  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.51469  normal  0.939431 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1710  acetylornithine aminotransferase  48.61 
 
 
392 aa  362  5.0000000000000005e-99  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0925352  hitchhiker  0.00335003 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1072  acetylornithine aminotransferase  45.99 
 
 
385 aa  361  1e-98  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0280572  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2767  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  47.99 
 
 
403 aa  360  2e-98  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0533  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  44.13 
 
 
394 aa  360  2e-98  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0009  acetylornithine transaminase protein  48.31 
 
 
401 aa  359  5e-98  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1901  acetylornithine aminotransferase  47.56 
 
 
400 aa  358  7e-98  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.133726  normal  0.687258 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2440  acetylornithine aminotransferase  45.05 
 
 
388 aa  358  9.999999999999999e-98  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.493949  normal  0.0446911 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4916  acetylornithine transaminase protein  48.56 
 
 
405 aa  356  3.9999999999999996e-97  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.0883749 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1040  acetylornithine aminotransferase  45.48 
 
 
385 aa  356  5e-97  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.000111021  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0406  acetylornithine aminotransferase  47.42 
 
 
388 aa  355  5.999999999999999e-97  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0570  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  47.42 
 
 
388 aa  355  5.999999999999999e-97  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2318  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  50.53 
 
 
396 aa  354  1e-96  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.156448 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1596  acetylornithine aminotransferase  48.56 
 
 
386 aa  355  1e-96  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0395  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  46.29 
 
 
413 aa  351  2e-95  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.538676 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1218  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  48.92 
 
 
402 aa  349  5e-95  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.525687  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1024  acetylornithine transaminase protein  48.16 
 
 
395 aa  348  7e-95  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.433962  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1851  acetylornithine aminotransferase  49.87 
 
 
394 aa  348  8e-95  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1958  acetylornithine aminotransferase  45.06 
 
 
401 aa  347  1e-94  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0982  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  45.74 
 
 
410 aa  348  1e-94  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4075  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  49.08 
 
 
396 aa  347  2e-94  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2686  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  48.57 
 
 
402 aa  347  2e-94  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0960288 
 
 
-
 
NC_011699  PHATRDRAFT_50577  acetylornithine aminotransferase  45.54 
 
 
476 aa  346  3e-94  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_34500  bifunctional N-succinyldiaminopimelate-aminotransferase/ acetylornithine transaminase protein  45.55 
 
 
406 aa  345  8e-94  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4556  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  49.08 
 
 
396 aa  345  1e-93  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.974298 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7457  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  48.28 
 
 
397 aa  343  2e-93  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.484657  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0739  acetylornithine aminotransferase  45.43 
 
 
386 aa  344  2e-93  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.791606  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4582  bifunctional N-succinyldiaminopimelate-aminotransferase/ acetylornithine transaminase protein  45.97 
 
 
405 aa  344  2e-93  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3708  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  46.02 
 
 
412 aa  343  2.9999999999999997e-93  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.339324  normal  0.0114471 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3033  acetylornithine aminotransferase  47.89 
 
 
390 aa  343  2.9999999999999997e-93  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.850335  normal  0.390329 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4442  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  49.08 
 
 
396 aa  343  2.9999999999999997e-93  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.977458  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2151  acetylornithine aminotransferase  44.73 
 
 
405 aa  343  2.9999999999999997e-93  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.0731978 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2541  acetylornithine transaminase protein  48.93 
 
 
398 aa  343  4e-93  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0285  bifunctional N-succinyldiaminopimelate-aminotransferase/ acetylornithine transaminase protein  45.04 
 
 
413 aa  342  5.999999999999999e-93  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2466  bifunctional succinylornithine transaminase/acetylornithine transaminase  45.09 
 
 
406 aa  342  7e-93  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.841609 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1426  acetylornithine aminotransferase  44.9 
 
 
400 aa  342  9e-93  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6536  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  48.81 
 
 
397 aa  342  9e-93  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.396008  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0867  acetylornithine aminotransferase  44.95 
 
 
393 aa  342  1e-92  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2692  acetylornithine aminotransferase  48.84 
 
 
401 aa  341  1e-92  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01717  succinylornithine transaminase, PLP-dependent  44.83 
 
 
406 aa  340  2e-92  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01705  hypothetical protein  44.83 
 
 
406 aa  340  2e-92  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1837  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  46.35 
 
 
401 aa  341  2e-92  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0185  acetylornithine transaminase protein  47.93 
 
 
399 aa  340  2e-92  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.372078 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>