More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cthe_1866 on replicon NC_009012
Organism: Clostridium thermocellum ATCC 27405



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009012  Cthe_1866  acetylornithine aminotransferase  100 
 
 		 400 aa  819    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2912  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  64.32 
 
 		 400 aa  526  1e-148  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.386564  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02850  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  58.19 
 
 		 399 aa  476  1e-133  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.0000577952  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0274  acetylornithine aminotransferase  57.03 
 
 		 396 aa  470  1.0000000000000001e-131  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.110157  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2287  acetylornithine aminotransferase  55.36 
 
 		 402 aa  456  1e-127  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.194315 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1566  acetylornithine aminotransferase  57.18 
 
 		 395 aa  454  1.0000000000000001e-126  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0353  acetylornithine aminotransferase  56.93 
 
 		 395 aa  452  1.0000000000000001e-126  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00220895 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0569  acetylornithine aminotransferase  57.22 
 
 		 400 aa  446  1.0000000000000001e-124  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.160273  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0426  acetylornithine aminotransferase  54.29 
 
 		 396 aa  445  1.0000000000000001e-124  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0269327  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0640  acetylornithine aminotransferase  56.38 
 
 		 403 aa  439  9.999999999999999e-123  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.41902  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0660  acetylornithine aminotransferase  55.67 
 
 		 394 aa  440  9.999999999999999e-123  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0483  acetylornithine aminotransferase  56.93 
 
 		 395 aa  440  9.999999999999999e-123  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0226  acetylornithine aminotransferase  54.16 
 
 		 396 aa  438  1e-121  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0342  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  54.31 
 
 		 417 aa  436  1e-121  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3150  acetylornithine aminotransferase  54.5 
 
 		 399 aa  435  1e-121  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0151  acetylornithine aminotransferase  54.02 
 
 		 399 aa  434  1e-120  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0772  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  56.38 
 
 		 399 aa  431  1e-120  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.200689  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3173  acetylornithine aminotransferase  53.13 
 
 		 398 aa  432  1e-120  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.324258  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0204  acetylornithine aminotransferase  55.28 
 
 		 399 aa  426  1e-118  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000412684 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2493  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  54.19 
 
 		 397 aa  419  1e-116  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1698  acetylornithine aminotransferase  52.81 
 
 		 394 aa  416  9.999999999999999e-116  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1258  acetylornithine aminotransferase  52.69 
 
 		 398 aa  412  1e-114  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00185503  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3741  acetylornithine aminotransferase  53.49 
 
 		 397 aa  412  1e-114  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2414  acetylornithine aminotransferase  52.27 
 
 		 396 aa  408  1e-113  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3636  acetylornithine aminotransferase  53.23 
 
 		 397 aa  410  1e-113  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1069  acetylornithine aminotransferase  52.45 
 
 		 398 aa  407  1.0000000000000001e-112  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00131217  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1072  acetylornithine aminotransferase  52.85 
 
 		 385 aa  398  9.999999999999999e-111  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0280572  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3744  acetylornithine aminotransferase  50.91 
 
 		 391 aa  399  9.999999999999999e-111  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000932106 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1041  acetylornithine aminotransferase  50.64 
 
 		 398 aa  398  1e-109  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0101251  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1040  acetylornithine aminotransferase  52.85 
 
 		 385 aa  396  1e-109  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.000111021  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1830  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  49.22 
 
 		 395 aa  392  1e-108  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.991221  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0063  acetylornithine and succinylornithine aminotransferases  49.37 
 
 		 396 aa  394  1e-108  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.857354  normal  0.372491 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2288  acetylornithine and succinylornithine aminotransferases  47.74 
 
 		 396 aa  388  1e-107  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.37355  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1710  acetylornithine aminotransferase  48.34 
 
 		 392 aa  379  1e-104  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0925352  hitchhiker  0.00335003 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1837  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  52.38 
 
 		 401 aa  375  1e-103  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0637  acetylornithine aminotransferase  49.49 
 
 		 418 aa  378  1e-103  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00130856  normal  0.274942 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2440  acetylornithine aminotransferase  47.15 
 
 		 388 aa  372  1e-102  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.493949  normal  0.0446911 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5154  acetylornithine aminotransferase  49.23 
 
 		 426 aa  373  1e-102  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000762221 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0871  acetylornithine aminotransferase  48.47 
 
 		 403 aa  370  1e-101  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2013  acetylornithine aminotransferase  48.6 
 
 		 418 aa  369  1e-101  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.152714 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1986  acetylornithine aminotransferase  48.6 
 
 		 418 aa  369  1e-101  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1907  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  47.77 
 
 		 387 aa  371  1e-101  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0119007  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2649  acetylornithine aminotransferase  48.84 
 
 		 423 aa  371  1e-101  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.46775  normal  0.4632 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1041  acetylornithine aminotransferase  46.8 
 
 		 390 aa  365  1e-100  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.370932  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3572  acetylornithine aminotransferase  47.04 
 
 		 404 aa  366  1e-100  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.331421 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2464  acetylornithine aminotransferase  45.6 
 
 		 392 aa  368  1e-100  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0009  acetylornithine transaminase protein  49.19 
 
 		 401 aa  365  1e-100  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3730  acetylornithine aminotransferase  48.71 
 
 		 427 aa  363  3e-99  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000174283  normal  0.451197 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0150  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  47.33 
 
 		 405 aa  362  6e-99  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2121  acetylornithine aminotransferase  44.95 
 
 		 404 aa  362  7.0000000000000005e-99  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  decreased coverage  0.00994118  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2204  acetylornithine aminotransferase  47.3 
 
 		 390 aa  361  1e-98  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1784  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  47.14 
 
 		 385 aa  360  3e-98  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.74918  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0185  acetylornithine transaminase protein  47.54 
 
 		 399 aa  360  3e-98  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.372078 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1951  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  46.58 
 
 		 398 aa  360  3e-98  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.620278  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1164  acetylornithine aminotransferase  44.33 
 
 		 398 aa  360  3e-98  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.581434  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1094  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  49.5 
 
 		 387 aa  359  4e-98  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2872  acetylornithine aminotransferase  46.62 
 
 		 397 aa  358  9e-98  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2541  acetylornithine transaminase protein  47.14 
 
 		 398 aa  358  9e-98  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0481  acetylornithine transaminase protein  47.87 
 
 		 402 aa  358  9e-98  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1218  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  45.26 
 
 		 402 aa  357  1.9999999999999998e-97  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.525687  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3011  acetylornithine aminotransferase  44.5 
 
 		 404 aa  357  2.9999999999999997e-97  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2300  acetylornithine and succinylornithine aminotransferases  47.45 
 
 		 394 aa  356  3.9999999999999996e-97  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4033  bifunctional N-succinyldiaminopimelate-aminotransferase/ acetylornithine transaminase protein  47.58 
 
 		 408 aa  356  5e-97  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.327701  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6536  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  47.33 
 
 		 397 aa  355  5.999999999999999e-97  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.396008  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1147  acetylornithine aminotransferase  47.72 
 
 		 394 aa  355  5.999999999999999e-97  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.109776  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3003  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  46.37 
 
 		 427 aa  355  6.999999999999999e-97  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0759  acetylornithine transaminase protein  49.33 
 
 		 403 aa  355  8.999999999999999e-97  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0803695 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5259  acetylornithine transaminase protein  47.45 
 
 		 403 aa  354  1e-96  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7457  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  46.79 
 
 		 397 aa  354  1e-96  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.484657  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0127  acetylornithine transaminase protein  50.14 
 
 		 399 aa  353  2e-96  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.383449 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3854  bifunctional N-succinyldiaminopimelate-aminotransferase/ acetylornithine transaminase protein  47.04 
 
 		 408 aa  354  2e-96  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4582  bifunctional N-succinyldiaminopimelate-aminotransferase/ acetylornithine transaminase protein  48.2 
 
 		 405 aa  353  2.9999999999999997e-96  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0313  acetylornithine aminotransferase  46.8 
 
 		 380 aa  353  2.9999999999999997e-96  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4916  acetylornithine transaminase protein  47.18 
 
 		 405 aa  353  4e-96  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0883749 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0886  acetylornithine transaminase protein  47.62 
 
 		 392 aa  352  8.999999999999999e-96  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.0996794  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3033  acetylornithine aminotransferase  47.44 
 
 		 390 aa  351  1e-95  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.850335  normal  0.390329 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2767  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  46.19 
 
 		 403 aa  350  2e-95  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2676  acetylornithine aminotransferase  44.22 
 
 		 391 aa  350  2e-95  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2179  acetylornithine aminotransferase  44.11 
 
 		 398 aa  350  2e-95  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.569965  normal  0.442274 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1346  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  45.27 
 
 		 399 aa  350  2e-95  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2318  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  46.58 
 
 		 396 aa  350  2e-95  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.156448 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4556  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  46.05 
 
 		 396 aa  350  2e-95  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.974298 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1851  acetylornithine aminotransferase  47.45 
 
 		 394 aa  350  3e-95  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0906  acetylornithine aminotransferase  43.22 
 
 		 402 aa  350  3e-95  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0285  bifunctional N-succinyldiaminopimelate-aminotransferase/ acetylornithine transaminase protein  48.08 
 
 		 413 aa  350  4e-95  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1452  acetylornithine aminotransferase  44.33 
 
 		 402 aa  349  4e-95  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0402  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  48.36 
 
 		 446 aa  350  4e-95  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4075  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  46.05 
 
 		 396 aa  349  5e-95  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0214  acetylornithine transaminase protein  47.21 
 
 		 391 aa  348  1e-94  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  hitchhiker  0.000000369674  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0513  acetylornithine transaminase protein  48.91 
 
 		 403 aa  348  1e-94  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.508573 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0394  acetylornithine transaminase protein  47.95 
 
 		 403 aa  348  1e-94  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0533  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  44.22 
 
 		 394 aa  348  1e-94  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0368  bifunctional N-succinyldiaminopimelate-aminotransferase/ acetylornithine transaminase protein  48.61 
 
 		 406 aa  347  1e-94  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3002  acetylornithine aminotransferase  44.07 
 
 		 398 aa  348  1e-94  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.555766  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2429  acetylornithine aminotransferase  44.07 
 
 		 398 aa  347  2e-94  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0175  acetylornithine transaminase protein  47.27 
 
 		 399 aa  347  2e-94  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0395  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  45.02 
 
 		 413 aa  347  2e-94  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.538676 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4442  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  46.05 
 
 		 396 aa  347  2e-94  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.977458  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2165  acetylornithine transaminase protein  45.01 
 
 		 401 aa  347  3e-94  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1901  acetylornithine aminotransferase  43.67 
 
 		 400 aa  346  4e-94  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.133726  normal  0.687258 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>