More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbd_1851 on replicon NC_007404
Organism: Thiobacillus denitrificans ATCC 25259



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007404  Tbd_1851  acetylornithine aminotransferase  100 
 
 		 394 aa  791    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1041  acetylornithine aminotransferase  65.89 
 
 		 390 aa  540  9.999999999999999e-153  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.370932  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1710  acetylornithine aminotransferase  67.77 
 
 		 392 aa  541  9.999999999999999e-153  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0925352  hitchhiker  0.00335003 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2676  acetylornithine aminotransferase  62.02 
 
 		 391 aa  508  1e-143  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3033  acetylornithine aminotransferase  62.02 
 
 		 390 aa  498  1e-139  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.850335  normal  0.390329 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2464  acetylornithine aminotransferase  63.28 
 
 		 392 aa  495  1e-139  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2079  acetylornithine aminotransferase  60.36 
 
 		 391 aa  478  1e-133  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1164  acetylornithine aminotransferase  59.74 
 
 		 398 aa  474  1e-133  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.581434  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1346  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  59.29 
 
 		 399 aa  472  1e-132  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1452  acetylornithine aminotransferase  57.25 
 
 		 402 aa  462  1e-129  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0946  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  58.96 
 
 		 398 aa  459  9.999999999999999e-129  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.104291  normal  0.0999204 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0982  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  57.29 
 
 		 410 aa  452  1.0000000000000001e-126  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0906  acetylornithine aminotransferase  58.29 
 
 		 402 aa  454  1.0000000000000001e-126  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3029  acetylornithine aminotransferase  57.8 
 
 		 410 aa  452  1.0000000000000001e-126  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.51469  normal  0.939431 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1102  acetylornithine aminotransferase  60.21 
 
 		 394 aa  454  1.0000000000000001e-126  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3572  acetylornithine aminotransferase  56.38 
 
 		 404 aa  448  1e-125  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.331421 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2429  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  56.59 
 
 		 393 aa  446  1.0000000000000001e-124  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0533  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  53.08 
 
 		 394 aa  447  1.0000000000000001e-124  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3708  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  58.27 
 
 		 412 aa  447  1.0000000000000001e-124  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.339324  normal  0.0114471 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2179  acetylornithine aminotransferase  54.1 
 
 		 398 aa  438  9.999999999999999e-123  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.569965  normal  0.442274 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3011  acetylornithine aminotransferase  54.87 
 
 		 404 aa  438  9.999999999999999e-123  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1901  acetylornithine aminotransferase  55.75 
 
 		 400 aa  435  1e-121  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.133726  normal  0.687258 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4636  acetylornithine aminotransferase  56.54 
 
 		 395 aa  435  1e-121  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.621133  normal  0.175641 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0570  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  57.81 
 
 		 388 aa  436  1e-121  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0406  acetylornithine aminotransferase  57.81 
 
 		 388 aa  436  1e-121  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2429  acetylornithine aminotransferase  55.13 
 
 		 398 aa  434  1e-120  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2121  acetylornithine aminotransferase  54.94 
 
 		 404 aa  431  1e-120  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  decreased coverage  0.00994118  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3002  acetylornithine aminotransferase  54.87 
 
 		 398 aa  433  1e-120  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.555766  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2440  acetylornithine aminotransferase  51.42 
 
 		 388 aa  430  1e-119  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.493949  normal  0.0446911 
 
 
-
 
NC_006368  lpp3040  acetylornithine aminotransferase  53.81 
 
 		 389 aa  426  1e-118  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2898  acetylornithine aminotransferase  53.21 
 
 		 389 aa  423  1e-117  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2618  acetylornithine aminotransferase  54.03 
 
 		 400 aa  407  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00459682  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2358  acetylornithine aminotransferase  54.33 
 
 		 400 aa  407  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.284538  normal  0.840689 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1566  acetylornithine aminotransferase  50.13 
 
 		 395 aa  388  1e-107  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0353  acetylornithine aminotransferase  50.13 
 
 		 395 aa  387  1e-106  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00220895 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0727  acetylornithine aminotransferase  58.18 
 
 		 389 aa  383  1e-105  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0226  acetylornithine aminotransferase  52.24 
 
 		 396 aa  383  1e-105  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3741  acetylornithine aminotransferase  48.96 
 
 		 397 aa  376  1e-103  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3636  acetylornithine aminotransferase  48.45 
 
 		 397 aa  374  1e-102  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0483  acetylornithine aminotransferase  49.87 
 
 		 395 aa  373  1e-102  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3150  acetylornithine aminotransferase  51.56 
 
 		 399 aa  373  1e-102  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2287  acetylornithine aminotransferase  49.23 
 
 		 402 aa  370  1e-101  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.194315 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0426  acetylornithine aminotransferase  47.52 
 
 		 396 aa  369  1e-101  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0269327  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0274  acetylornithine aminotransferase  50 
 
 		 396 aa  366  1e-100  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.110157  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1698  acetylornithine aminotransferase  49.47 
 
 		 394 aa  367  1e-100  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1423  acetylornithine aminotransferase  46.43 
 
 		 398 aa  366  1e-100  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.050105  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2493  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  49.87 
 
 		 397 aa  360  2e-98  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0204  acetylornithine aminotransferase  49.1 
 
 		 399 aa  360  2e-98  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000412684 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1405  acetylornithine aminotransferase  46.43 
 
 		 393 aa  360  2e-98  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.966648  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1057  acetylornithine aminotransferase  46.68 
 
 		 393 aa  360  3e-98  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.00148742  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0151  acetylornithine aminotransferase  49.87 
 
 		 399 aa  359  5e-98  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2649  acetylornithine aminotransferase  47.87 
 
 		 423 aa  359  6e-98  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.46775  normal  0.4632 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0660  acetylornithine aminotransferase  48.05 
 
 		 394 aa  358  9.999999999999999e-98  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3744  acetylornithine aminotransferase  48.45 
 
 		 391 aa  357  1.9999999999999998e-97  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000932106 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3173  acetylornithine aminotransferase  48.67 
 
 		 398 aa  357  1.9999999999999998e-97  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.324258  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0063  acetylornithine and succinylornithine aminotransferases  47.7 
 
 		 396 aa  356  2.9999999999999997e-97  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.857354  normal  0.372491 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0342  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  51.28 
 
 		 417 aa  353  2e-96  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2204  acetylornithine aminotransferase  45.43 
 
 		 390 aa  352  7e-96  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2414  acetylornithine aminotransferase  48.31 
 
 		 396 aa  352  8e-96  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2013  acetylornithine aminotransferase  45.61 
 
 		 418 aa  352  8e-96  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.152714 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1986  acetylornithine aminotransferase  45.61 
 
 		 418 aa  351  1e-95  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1866  acetylornithine aminotransferase  47.45 
 
 		 400 aa  351  2e-95  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5154  acetylornithine aminotransferase  45.23 
 
 		 426 aa  350  3e-95  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000762221 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1094  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  47.14 
 
 		 387 aa  349  4e-95  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0772  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  47.31 
 
 		 399 aa  348  1e-94  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.200689  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0640  acetylornithine aminotransferase  45.93 
 
 		 403 aa  347  3e-94  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.41902  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0871  acetylornithine aminotransferase  47.35 
 
 		 403 aa  346  5e-94  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0637  acetylornithine aminotransferase  47.99 
 
 		 418 aa  343  2e-93  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00130856  normal  0.274942 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1371  acetylornithine aminotransferase  44.56 
 
 		 379 aa  344  2e-93  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3730  acetylornithine aminotransferase  48.29 
 
 		 427 aa  343  2.9999999999999997e-93  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000174283  normal  0.451197 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2912  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  43.93 
 
 		 400 aa  340  2e-92  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.386564  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0481  acetylornithine transaminase protein  48.94 
 
 		 402 aa  339  5.9999999999999996e-92  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4556  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  49.87 
 
 		 396 aa  338  8e-92  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.974298 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3172  acetylornithine aminotransferase  49.37 
 
 		 444 aa  338  9.999999999999999e-92  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.22064  normal  0.239102 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1740  acetylornithine aminotransferase  49.49 
 
 		 414 aa  336  3.9999999999999995e-91  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00212917 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2872  acetylornithine aminotransferase  47.29 
 
 		 397 aa  335  7e-91  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3003  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  46.46 
 
 		 427 aa  335  1e-90  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2767  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  47.95 
 
 		 403 aa  334  1e-90  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0009  acetylornithine transaminase protein  47.84 
 
 		 401 aa  333  2e-90  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4075  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  48.29 
 
 		 396 aa  331  1e-89  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0569  acetylornithine aminotransferase  47.51 
 
 		 400 aa  330  2e-89  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.160273  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02850  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  44.94 
 
 		 399 aa  328  8e-89  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.0000577952  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0395  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  47.3 
 
 		 413 aa  328  9e-89  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.538676 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4200  acetylornithine aminotransferase  43.75 
 
 		 386 aa  328  9e-89  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5259  acetylornithine transaminase protein  46.33 
 
 		 403 aa  327  2.0000000000000001e-88  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0943  acetylornithine aminotransferase  48.18 
 
 		 422 aa  327  2.0000000000000001e-88  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1409  acetylornithine transaminase protein  47.74 
 
 		 396 aa  327  2.0000000000000001e-88  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.111439  normal  0.291313 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2288  acetylornithine and succinylornithine aminotransferases  47.18 
 
 		 396 aa  327  3e-88  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.37355  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1290  acetylornithine transaminase protein  46.07 
 
 		 401 aa  326  4.0000000000000003e-88  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4442  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  48.29 
 
 		 396 aa  326  5e-88  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.977458  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_13491  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  43.83 
 
 		 420 aa  326  5e-88  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1907  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  42.45 
 
 		 387 aa  325  7e-88  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0119007  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3962  acetylornithine aminotransferase  43.01 
 
 		 386 aa  325  9e-88  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00766837  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1069  acetylornithine aminotransferase  45.57 
 
 		 398 aa  325  9e-88  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00131217  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2318  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  47.75 
 
 		 396 aa  325  1e-87  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.156448 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1040  acetylornithine aminotransferase  45.71 
 
 		 385 aa  324  2e-87  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.000111021  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6536  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  47.87 
 
 		 397 aa  324  2e-87  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.396008  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0402  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  47.68 
 
 		 446 aa  323  2e-87  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1218  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  46.25 
 
 		 402 aa  323  3e-87  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.525687  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1258  acetylornithine aminotransferase  43.93 
 
 		 398 aa  322  6e-87  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00185503  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>