More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plim_2767 on replicon NC_014148
Organism: Planctomyces limnophilus DSM 3776



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014148  Plim_2767  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  100 
 
 
403 aa  833    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1698  acetylornithine aminotransferase  49.87 
 
 
394 aa  409  1e-113  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2287  acetylornithine aminotransferase  51.65 
 
 
402 aa  408  1e-113  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.194315 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0660  acetylornithine aminotransferase  50.26 
 
 
394 aa  402  1e-111  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0226  acetylornithine aminotransferase  50.63 
 
 
396 aa  400  9.999999999999999e-111  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0274  acetylornithine aminotransferase  49.23 
 
 
396 aa  394  1e-108  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.110157  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3150  acetylornithine aminotransferase  49.75 
 
 
399 aa  388  1e-106  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0151  acetylornithine aminotransferase  48.49 
 
 
399 aa  385  1e-106  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0353  acetylornithine aminotransferase  47.86 
 
 
395 aa  384  1e-105  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  hitchhiker  0.00220895 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1566  acetylornithine aminotransferase  48.61 
 
 
395 aa  382  1e-105  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2414  acetylornithine aminotransferase  48.1 
 
 
396 aa  381  1e-104  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0204  acetylornithine aminotransferase  50.25 
 
 
399 aa  379  1e-104  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000412684 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0426  acetylornithine aminotransferase  45.84 
 
 
396 aa  376  1e-103  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0269327  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0483  acetylornithine aminotransferase  47.61 
 
 
395 aa  376  1e-103  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3636  acetylornithine aminotransferase  46.72 
 
 
397 aa  374  1e-102  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0342  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  48.99 
 
 
417 aa  372  1e-102  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1830  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  48.18 
 
 
395 aa  372  1e-102  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.991221  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3173  acetylornithine aminotransferase  47.85 
 
 
398 aa  375  1e-102  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.324258  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3741  acetylornithine aminotransferase  46.21 
 
 
397 aa  368  1e-100  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1866  acetylornithine aminotransferase  46.19 
 
 
400 aa  362  7.0000000000000005e-99  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02850  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  47.84 
 
 
399 aa  362  9e-99  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.0000577952  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0640  acetylornithine aminotransferase  45.69 
 
 
403 aa  359  5e-98  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.41902  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0569  acetylornithine aminotransferase  45.11 
 
 
400 aa  359  5e-98  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.160273  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1072  acetylornithine aminotransferase  45.71 
 
 
385 aa  357  1.9999999999999998e-97  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0280572  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2288  acetylornithine and succinylornithine aminotransferases  46.58 
 
 
396 aa  355  5.999999999999999e-97  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.37355  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2493  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  44.96 
 
 
397 aa  354  1e-96  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1040  acetylornithine aminotransferase  45.19 
 
 
385 aa  351  1e-95  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.000111021  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1094  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  46.37 
 
 
387 aa  350  2e-95  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3744  acetylornithine aminotransferase  47.52 
 
 
391 aa  347  2e-94  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000932106 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0772  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  44.56 
 
 
399 aa  346  3e-94  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.200689  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1710  acetylornithine aminotransferase  45.9 
 
 
392 aa  345  8e-94  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0925352  hitchhiker  0.00335003 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1041  acetylornithine aminotransferase  46.74 
 
 
390 aa  345  1e-93  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.370932  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2440  acetylornithine aminotransferase  43.78 
 
 
388 aa  343  4e-93  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.493949  normal  0.0446911 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2204  acetylornithine aminotransferase  42.56 
 
 
390 aa  343  4e-93  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2179  acetylornithine aminotransferase  44.06 
 
 
398 aa  343  5e-93  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.569965  normal  0.442274 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1851  acetylornithine aminotransferase  47.95 
 
 
394 aa  342  7e-93  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1784  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  47.07 
 
 
385 aa  341  1e-92  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.74918  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1164  acetylornithine aminotransferase  44.91 
 
 
398 aa  341  2e-92  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.581434  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0063  acetylornithine and succinylornithine aminotransferases  43.41 
 
 
396 aa  339  5.9999999999999996e-92  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.857354  normal  0.372491 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2013  acetylornithine aminotransferase  42.68 
 
 
418 aa  337  1.9999999999999998e-91  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.152714 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2464  acetylornithine aminotransferase  46.07 
 
 
392 aa  337  1.9999999999999998e-91  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3002  acetylornithine aminotransferase  45.45 
 
 
398 aa  337  2.9999999999999997e-91  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.555766  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1986  acetylornithine aminotransferase  42.68 
 
 
418 aa  337  2.9999999999999997e-91  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0871  acetylornithine aminotransferase  46.98 
 
 
403 aa  335  5.999999999999999e-91  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5154  acetylornithine aminotransferase  43.4 
 
 
426 aa  335  7e-91  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000762221 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0406  acetylornithine aminotransferase  48.66 
 
 
388 aa  334  1e-90  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0570  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  48.66 
 
 
388 aa  334  1e-90  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2429  acetylornithine aminotransferase  45.19 
 
 
398 aa  334  2e-90  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1258  acetylornithine aminotransferase  44.5 
 
 
398 aa  332  5e-90  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00185503  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3572  acetylornithine aminotransferase  42.68 
 
 
404 aa  332  6e-90  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.331421 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2649  acetylornithine aminotransferase  41.61 
 
 
423 aa  332  8e-90  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.46775  normal  0.4632 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0637  acetylornithine aminotransferase  43.5 
 
 
418 aa  330  3e-89  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00130856  normal  0.274942 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1842  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  43.61 
 
 
399 aa  329  5.0000000000000004e-89  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.716815  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1596  acetylornithine aminotransferase  44.95 
 
 
386 aa  329  5.0000000000000004e-89  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2912  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  42.67 
 
 
400 aa  329  6e-89  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.386564  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1069  acetylornithine aminotransferase  44.24 
 
 
398 aa  328  7e-89  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00131217  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2079  acetylornithine aminotransferase  45.95 
 
 
391 aa  327  2.0000000000000001e-88  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0906  acetylornithine aminotransferase  43.19 
 
 
402 aa  326  6e-88  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3029  acetylornithine aminotransferase  44.7 
 
 
410 aa  326  6e-88  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.51469  normal  0.939431 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3011  acetylornithine aminotransferase  42.14 
 
 
404 aa  325  8.000000000000001e-88  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2872  acetylornithine aminotransferase  45.5 
 
 
397 aa  325  1e-87  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1371  acetylornithine aminotransferase  42.53 
 
 
379 aa  325  1e-87  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1041  acetylornithine aminotransferase  43.98 
 
 
398 aa  323  3e-87  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0101251  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0009  acetylornithine transaminase protein  45.24 
 
 
401 aa  323  3e-87  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2676  acetylornithine aminotransferase  44.04 
 
 
391 aa  322  6e-87  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1359  acetylornithine transaminase protein  46.22 
 
 
395 aa  322  7e-87  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.592193  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2888  acetylornithine aminotransferase  45.01 
 
 
397 aa  322  8e-87  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0887768  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0503  acetylornithine aminotransferase  43.35 
 
 
376 aa  322  8e-87  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2121  acetylornithine aminotransferase  41.6 
 
 
404 aa  322  9.999999999999999e-87  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  decreased coverage  0.00994118  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1291  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  40.62 
 
 
393 aa  321  9.999999999999999e-87  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0338748 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0947  aminotransferase class-III  44.42 
 
 
395 aa  321  9.999999999999999e-87  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0679656  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0533  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  41.45 
 
 
394 aa  320  3.9999999999999996e-86  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0946  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  43.09 
 
 
398 aa  317  2e-85  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.104291  normal  0.0999204 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1102  acetylornithine aminotransferase  45.03 
 
 
394 aa  316  4e-85  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0982  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  42.01 
 
 
410 aa  314  9.999999999999999e-85  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1452  acetylornithine aminotransferase  42.31 
 
 
402 aa  315  9.999999999999999e-85  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0739  acetylornithine aminotransferase  41.76 
 
 
386 aa  314  1.9999999999999998e-84  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.791606  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0626  acetylornithine aminotransferase  39.29 
 
 
426 aa  313  3.9999999999999997e-84  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.882273  normal  0.369402 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0690  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  43 
 
 
405 aa  313  4.999999999999999e-84  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3003  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  40.73 
 
 
427 aa  312  5.999999999999999e-84  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1901  acetylornithine aminotransferase  42.24 
 
 
400 aa  312  5.999999999999999e-84  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.133726  normal  0.687258 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0321  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  42.41 
 
 
391 aa  311  1e-83  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3708  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  40.99 
 
 
412 aa  311  2e-83  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.339324  normal  0.0114471 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0943  acetylornithine aminotransferase  41.85 
 
 
422 aa  310  4e-83  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3730  acetylornithine aminotransferase  41.44 
 
 
427 aa  309  5e-83  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000174283  normal  0.451197 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3033  acetylornithine aminotransferase  43.58 
 
 
390 aa  308  1.0000000000000001e-82  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.850335  normal  0.390329 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2722  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  45.43 
 
 
389 aa  308  1.0000000000000001e-82  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.601213  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0313  acetylornithine aminotransferase  43.44 
 
 
380 aa  308  1.0000000000000001e-82  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0503  acetylornithine aminotransferase  42.97 
 
 
398 aa  307  2.0000000000000002e-82  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3311  acetylornithine aminotransferase  40.36 
 
 
390 aa  307  2.0000000000000002e-82  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0246414  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0395  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  41.91 
 
 
413 aa  306  3e-82  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.538676 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1409  acetylornithine transaminase protein  45.43 
 
 
396 aa  306  3e-82  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.111439  normal  0.291313 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5259  acetylornithine transaminase protein  42.78 
 
 
403 aa  306  4.0000000000000004e-82  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0593  acetylornithine aminotransferase  41.42 
 
 
397 aa  306  5.0000000000000004e-82  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.642559  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1346  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  42.71 
 
 
399 aa  306  6e-82  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3172  acetylornithine aminotransferase  45.36 
 
 
444 aa  306  6e-82  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.22064  normal  0.239102 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4200  acetylornithine aminotransferase  40.74 
 
 
386 aa  305  1.0000000000000001e-81  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0734  acetylornithine aminotransferase  42.26 
 
 
405 aa  303  2.0000000000000002e-81  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2526  acetylornithine and succinylornithine aminotransferases  45.73 
 
 
356 aa  303  2.0000000000000002e-81  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.645919  normal  0.731581 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7457  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  43.77 
 
 
397 aa  304  2.0000000000000002e-81  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.484657  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>