More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmar_0947 on replicon NC_013501
Organism: Rhodothermus marinus DSM 4252



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013501  Rmar_0947  aminotransferase class-III  100 
 
 		 395 aa  802    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0679656  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2767  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  44.67 
 
 		 403 aa  302  9e-81  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0321  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  42.82 
 
 		 391 aa  299  7e-80  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0871  acetylornithine aminotransferase  41.3 
 
 		 403 aa  291  1e-77  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2204  acetylornithine aminotransferase  39.38 
 
 		 390 aa  290  3e-77  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2287  acetylornithine aminotransferase  40.98 
 
 		 402 aa  288  1e-76  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.194315 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0151  acetylornithine aminotransferase  42.67 
 
 		 399 aa  286  4e-76  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0353  acetylornithine aminotransferase  38.64 
 
 		 395 aa  286  5e-76  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00220895 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0342  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  43.07 
 
 		 417 aa  281  1e-74  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1830  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  41.37 
 
 		 395 aa  281  2e-74  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.991221  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2288  acetylornithine and succinylornithine aminotransferases  39.38 
 
 		 396 aa  280  4e-74  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.37355  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0226  acetylornithine aminotransferase  38.94 
 
 		 396 aa  278  1e-73  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0274  acetylornithine aminotransferase  40.36 
 
 		 396 aa  278  1e-73  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.110157  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1566  acetylornithine aminotransferase  37.88 
 
 		 395 aa  278  2e-73  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2179  acetylornithine aminotransferase  41.05 
 
 		 398 aa  277  3e-73  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.569965  normal  0.442274 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1102  acetylornithine aminotransferase  44.24 
 
 		 394 aa  276  4e-73  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0569  acetylornithine aminotransferase  37.94 
 
 		 400 aa  276  5e-73  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.160273  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1866  acetylornithine aminotransferase  38.75 
 
 		 400 aa  275  1.0000000000000001e-72  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0204  acetylornithine aminotransferase  41.1 
 
 		 399 aa  275  1.0000000000000001e-72  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000412684 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3173  acetylornithine aminotransferase  39.54 
 
 		 398 aa  275  1.0000000000000001e-72  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.324258  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0313  acetylornithine aminotransferase  40.84 
 
 		 380 aa  273  3e-72  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0906  acetylornithine aminotransferase  42.74 
 
 		 402 aa  273  4.0000000000000004e-72  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1346  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  40.16 
 
 		 399 aa  273  5.000000000000001e-72  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0483  acetylornithine aminotransferase  37.63 
 
 		 395 aa  273  6e-72  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1164  acetylornithine aminotransferase  41.05 
 
 		 398 aa  272  8.000000000000001e-72  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.581434  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3962  acetylornithine aminotransferase  37.43 
 
 		 386 aa  272  9e-72  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00766837  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3029  acetylornithine aminotransferase  40.1 
 
 		 410 aa  271  1e-71  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.51469  normal  0.939431 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2526  acetylornithine and succinylornithine aminotransferases  42.61 
 
 		 356 aa  271  2e-71  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.645919  normal  0.731581 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1710  acetylornithine aminotransferase  44.47 
 
 		 392 aa  271  2e-71  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0925352  hitchhiker  0.00335003 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0772  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  38.04 
 
 		 399 aa  270  4e-71  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.200689  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2493  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  38.94 
 
 		 397 aa  269  5e-71  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0946  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  41.41 
 
 		 398 aa  269  8e-71  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.104291  normal  0.0999204 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3636  acetylornithine aminotransferase  36.84 
 
 		 397 aa  268  2e-70  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2464  acetylornithine aminotransferase  39.69 
 
 		 392 aa  267  2e-70  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1851  acetylornithine aminotransferase  42.75 
 
 		 394 aa  268  2e-70  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0660  acetylornithine aminotransferase  38.18 
 
 		 394 aa  266  2.9999999999999995e-70  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3150  acetylornithine aminotransferase  38.6 
 
 		 399 aa  267  2.9999999999999995e-70  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3741  acetylornithine aminotransferase  37.09 
 
 		 397 aa  267  2.9999999999999995e-70  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2429  acetylornithine aminotransferase  39.79 
 
 		 398 aa  266  5e-70  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2826  acetylornithine aminotransferase  35.06 
 
 		 386 aa  266  5e-70  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3572  acetylornithine aminotransferase  40.5 
 
 		 404 aa  266  5.999999999999999e-70  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.331421 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1260  acetylornithine aminotransferase  42.63 
 
 		 399 aa  266  5.999999999999999e-70  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.161601 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3002  acetylornithine aminotransferase  39.33 
 
 		 398 aa  266  5.999999999999999e-70  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.555766  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2676  acetylornithine aminotransferase  42.4 
 
 		 391 aa  265  8.999999999999999e-70  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0570  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  41.15 
 
 		 388 aa  265  1e-69  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2898  acetylornithine aminotransferase  38.6 
 
 		 389 aa  265  1e-69  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1291  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  34.44 
 
 		 393 aa  265  1e-69  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0338748 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0406  acetylornithine aminotransferase  41.15 
 
 		 388 aa  265  1e-69  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp3040  acetylornithine aminotransferase  38.86 
 
 		 389 aa  264  2e-69  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0426  acetylornithine aminotransferase  37.4 
 
 		 396 aa  264  3e-69  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0269327  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1842  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  37.63 
 
 		 399 aa  263  4.999999999999999e-69  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.716815  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1837  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  38.35 
 
 		 401 aa  263  4.999999999999999e-69  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1416  acetylornithine aminotransferase  40.16 
 
 		 415 aa  263  4.999999999999999e-69  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.0956406 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3309  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  39.3 
 
 		 393 aa  262  6e-69  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2722  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  41.75 
 
 		 389 aa  262  8e-69  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.601213  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1951  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  36.11 
 
 		 398 aa  262  1e-68  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.620278  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1901  acetylornithine aminotransferase  37.53 
 
 		 400 aa  261  1e-68  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.133726  normal  0.687258 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3172  acetylornithine aminotransferase  41.41 
 
 		 444 aa  261  2e-68  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.22064  normal  0.239102 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5259  acetylornithine transaminase protein  41.33 
 
 		 403 aa  261  2e-68  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0566  4-aminobutyrate aminotransferase  39.86 
 
 		 428 aa  261  2e-68  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1740  acetylornithine aminotransferase  42.75 
 
 		 414 aa  260  3e-68  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00212917 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4200  acetylornithine aminotransferase  36.34 
 
 		 386 aa  260  3e-68  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1596  acetylornithine aminotransferase  39.47 
 
 		 386 aa  260  3e-68  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1041  acetylornithine aminotransferase  40 
 
 		 390 aa  260  3e-68  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.370932  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0348  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  39.33 
 
 		 395 aa  258  1e-67  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.276087 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0982  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  39.03 
 
 		 410 aa  258  1e-67  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1069  acetylornithine aminotransferase  38.89 
 
 		 398 aa  258  2e-67  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00131217  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3279  aminotransferase  36.29 
 
 		 401 aa  257  2e-67  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.507465 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3460  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  42.38 
 
 		 388 aa  258  2e-67  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00640133 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4419  aminotransferase class-III  38.54 
 
 		 378 aa  257  2e-67  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2686  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  39.9 
 
 		 402 aa  258  2e-67  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0960288 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2912  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  35.16 
 
 		 400 aa  257  3e-67  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.386564  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02850  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  38.74 
 
 		 399 aa  256  4e-67  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.0000577952  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2838  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  46.52 
 
 		 393 aa  256  4e-67  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0375409  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1698  acetylornithine aminotransferase  35.26 
 
 		 394 aa  256  4e-67  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1452  acetylornithine aminotransferase  37.89 
 
 		 402 aa  256  5e-67  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4263  acetylornithine aminotransferase  36.34 
 
 		 386 aa  256  6e-67  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0647  aminotransferase  35.56 
 
 		 410 aa  256  6e-67  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0175  ornithine aminotransferase  36.66 
 
 		 394 aa  256  7e-67  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3708  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  38.8 
 
 		 412 aa  256  7e-67  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.339324  normal  0.0114471 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0170  ornithine aminotransferase  36.66 
 
 		 394 aa  256  7e-67  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1277  putrescine--2-oxoglutarate aminotransferase  37.87 
 
 		 457 aa  255  9e-67  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0468315  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0068  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  41.03 
 
 		 375 aa  255  1.0000000000000001e-66  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.413029  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3011  acetylornithine aminotransferase  38.29 
 
 		 404 aa  254  1.0000000000000001e-66  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3612  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  41.98 
 
 		 382 aa  255  1.0000000000000001e-66  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.98573  normal  0.143334 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2414  acetylornithine aminotransferase  37.59 
 
 		 396 aa  254  2.0000000000000002e-66  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2013  acetylornithine aminotransferase  35.75 
 
 		 418 aa  254  2.0000000000000002e-66  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.152714 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1986  acetylornithine aminotransferase  35.75 
 
 		 418 aa  254  2.0000000000000002e-66  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2138  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  39.57 
 
 		 383 aa  253  3e-66  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0842  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  37.09 
 
 		 399 aa  253  4.0000000000000004e-66  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0215856 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4636  acetylornithine aminotransferase  40.43 
 
 		 395 aa  253  5.000000000000001e-66  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.621133  normal  0.175641 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4916  acetylornithine transaminase protein  41.37 
 
 		 405 aa  253  6e-66  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0883749 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0063  acetylornithine and succinylornithine aminotransferases  37.22 
 
 		 396 aa  252  6e-66  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.857354  normal  0.372491 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2079  acetylornithine aminotransferase  38.38 
 
 		 391 aa  251  1e-65  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0009  acetylornithine transaminase protein  40.68 
 
 		 401 aa  252  1e-65  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1500  acetylornithine aminotransferase  42.86 
 
 		 423 aa  251  2e-65  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000760659 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0739  acetylornithine aminotransferase  38.32 
 
 		 386 aa  251  2e-65  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.791606  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0759  acetylornithine transaminase protein  40.62 
 
 		 403 aa  251  2e-65  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0803695 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3884  acetylornithine aminotransferase  36.61 
 
 		 386 aa  251  2e-65  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0626  acetylornithine aminotransferase  36.96 
 
 		 426 aa  251  2e-65  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.882273  normal  0.369402 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>