More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ajs_3002 on replicon NC_008782
Organism: Acidovorax sp. JS42



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008752  Aave_1164  acetylornithine aminotransferase  76.63 
 
 
398 aa  640    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.581434  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2179  acetylornithine aminotransferase  83.17 
 
 
398 aa  693    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.569965  normal  0.442274 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3002  acetylornithine aminotransferase  100 
 
 
398 aa  808    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.555766  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2429  acetylornithine aminotransferase  99.25 
 
 
398 aa  802    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1452  acetylornithine aminotransferase  74.12 
 
 
402 aa  618  1e-176  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1901  acetylornithine aminotransferase  73.62 
 
 
400 aa  607  9.999999999999999e-173  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.133726  normal  0.687258 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3572  acetylornithine aminotransferase  71.32 
 
 
404 aa  592  1e-168  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.331421 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3011  acetylornithine aminotransferase  71.32 
 
 
404 aa  590  1e-167  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2121  acetylornithine aminotransferase  69.67 
 
 
404 aa  583  1.0000000000000001e-165  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  decreased coverage  0.00994118  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0906  acetylornithine aminotransferase  67.76 
 
 
402 aa  568  1e-161  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3029  acetylornithine aminotransferase  68.54 
 
 
410 aa  550  1e-155  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.51469  normal  0.939431 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2676  acetylornithine aminotransferase  57.11 
 
 
391 aa  456  1e-127  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1041  acetylornithine aminotransferase  55.04 
 
 
390 aa  454  1.0000000000000001e-126  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.370932  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1710  acetylornithine aminotransferase  54.48 
 
 
392 aa  443  1e-123  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0925352  hitchhiker  0.00335003 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3033  acetylornithine aminotransferase  53.75 
 
 
390 aa  429  1e-119  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.850335  normal  0.390329 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2464  acetylornithine aminotransferase  52.97 
 
 
392 aa  425  1e-118  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1851  acetylornithine aminotransferase  54.87 
 
 
394 aa  423  1e-117  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1102  acetylornithine aminotransferase  54.66 
 
 
394 aa  416  9.999999999999999e-116  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0533  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  48.71 
 
 
394 aa  407  1.0000000000000001e-112  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2440  acetylornithine aminotransferase  50.52 
 
 
388 aa  400  9.999999999999999e-111  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.493949  normal  0.0446911 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0946  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  50.78 
 
 
398 aa  400  9.999999999999999e-111  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.104291  normal  0.0999204 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2079  acetylornithine aminotransferase  50.64 
 
 
391 aa  396  1e-109  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1346  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  50.39 
 
 
399 aa  396  1e-109  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0982  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  49.36 
 
 
410 aa  391  1e-107  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3708  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  48.73 
 
 
412 aa  386  1e-106  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.339324  normal  0.0114471 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0151  acetylornithine aminotransferase  48.22 
 
 
399 aa  382  1e-105  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0406  acetylornithine aminotransferase  50 
 
 
388 aa  382  1e-105  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3636  acetylornithine aminotransferase  49.11 
 
 
397 aa  382  1e-105  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2429  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  47.8 
 
 
393 aa  384  1e-105  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0570  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  50 
 
 
388 aa  382  1e-105  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3741  acetylornithine aminotransferase  48.85 
 
 
397 aa  378  1e-104  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0226  acetylornithine aminotransferase  48.19 
 
 
396 aa  377  1e-103  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0772  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  47.35 
 
 
399 aa  374  1e-102  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.200689  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0204  acetylornithine aminotransferase  48.21 
 
 
399 aa  374  1e-102  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000412684 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3150  acetylornithine aminotransferase  49.74 
 
 
399 aa  374  1e-102  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2287  acetylornithine aminotransferase  47.49 
 
 
402 aa  370  1e-101  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.194315 
 
 
-
 
NC_006368  lpp3040  acetylornithine aminotransferase  46.25 
 
 
389 aa  366  1e-100  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2898  acetylornithine aminotransferase  46.25 
 
 
389 aa  366  1e-100  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4636  acetylornithine aminotransferase  49.47 
 
 
395 aa  365  1e-100  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.621133  normal  0.175641 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2414  acetylornithine aminotransferase  48.21 
 
 
396 aa  362  9e-99  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2618  acetylornithine aminotransferase  50.4 
 
 
400 aa  360  3e-98  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00459682  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2358  acetylornithine aminotransferase  50.26 
 
 
400 aa  358  9.999999999999999e-98  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.284538  normal  0.840689 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0274  acetylornithine aminotransferase  47.76 
 
 
396 aa  356  3.9999999999999996e-97  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.110157  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1566  acetylornithine aminotransferase  45.38 
 
 
395 aa  355  5e-97  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3173  acetylornithine aminotransferase  45.85 
 
 
398 aa  355  5.999999999999999e-97  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.324258  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1698  acetylornithine aminotransferase  45.94 
 
 
394 aa  354  1e-96  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2493  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  45.36 
 
 
397 aa  351  2e-95  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0353  acetylornithine aminotransferase  45.91 
 
 
395 aa  350  2e-95  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  hitchhiker  0.00220895 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5154  acetylornithine aminotransferase  45.76 
 
 
426 aa  349  4e-95  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000762221 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2013  acetylornithine aminotransferase  45.24 
 
 
418 aa  349  5e-95  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.152714 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1986  acetylornithine aminotransferase  45.24 
 
 
418 aa  349  6e-95  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0660  acetylornithine aminotransferase  45.31 
 
 
394 aa  346  5e-94  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3730  acetylornithine aminotransferase  46.19 
 
 
427 aa  345  1e-93  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000174283  normal  0.451197 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0943  acetylornithine aminotransferase  48.21 
 
 
422 aa  344  2e-93  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2649  acetylornithine aminotransferase  45.62 
 
 
423 aa  344  2e-93  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.46775  normal  0.4632 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2912  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  42.09 
 
 
400 aa  343  4e-93  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.386564  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1423  acetylornithine aminotransferase  44.22 
 
 
398 aa  343  5e-93  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.050105  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3744  acetylornithine aminotransferase  47.35 
 
 
391 aa  343  5e-93  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000932106 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1866  acetylornithine aminotransferase  44.07 
 
 
400 aa  340  2e-92  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0483  acetylornithine aminotransferase  45.65 
 
 
395 aa  340  2.9999999999999998e-92  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0342  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  46.84 
 
 
417 aa  340  4e-92  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0640  acetylornithine aminotransferase  43.75 
 
 
403 aa  338  9.999999999999999e-92  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.41902  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0426  acetylornithine aminotransferase  43.83 
 
 
396 aa  338  9.999999999999999e-92  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0269327  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3003  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  44.33 
 
 
427 aa  337  1.9999999999999998e-91  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02850  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  42.86 
 
 
399 aa  333  3e-90  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.0000577952  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0569  acetylornithine aminotransferase  44.3 
 
 
400 aa  332  7.000000000000001e-90  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.160273  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1830  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  44.3 
 
 
395 aa  332  1e-89  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.991221  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0063  acetylornithine and succinylornithine aminotransferases  43.7 
 
 
396 aa  331  1e-89  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.857354  normal  0.372491 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0727  acetylornithine aminotransferase  49.74 
 
 
389 aa  328  1.0000000000000001e-88  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1405  acetylornithine aminotransferase  43.48 
 
 
393 aa  328  1.0000000000000001e-88  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.966648  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1596  acetylornithine aminotransferase  46.13 
 
 
386 aa  327  3e-88  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0739  acetylornithine aminotransferase  44.06 
 
 
386 aa  326  5e-88  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.791606  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1057  acetylornithine aminotransferase  43.22 
 
 
393 aa  326  5e-88  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.00148742  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0637  acetylornithine aminotransferase  45.17 
 
 
418 aa  325  9e-88  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00130856  normal  0.274942 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3962  acetylornithine aminotransferase  41.71 
 
 
386 aa  323  3e-87  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00766837  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_13491  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  43.3 
 
 
420 aa  322  9.000000000000001e-87  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3172  acetylornithine aminotransferase  46.73 
 
 
444 aa  318  1e-85  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.22064  normal  0.239102 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2204  acetylornithine aminotransferase  41.6 
 
 
390 aa  318  1e-85  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1040  acetylornithine aminotransferase  45.71 
 
 
385 aa  317  2e-85  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.000111021  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0481  acetylornithine transaminase protein  45.62 
 
 
402 aa  317  3e-85  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0185  acetylornithine transaminase protein  45.65 
 
 
399 aa  316  4e-85  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.372078 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2318  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  46.11 
 
 
396 aa  315  7e-85  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.156448 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2288  acetylornithine and succinylornithine aminotransferases  43.01 
 
 
396 aa  315  9e-85  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.37355  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1371  acetylornithine aminotransferase  41.19 
 
 
379 aa  315  9.999999999999999e-85  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1072  acetylornithine aminotransferase  45.19 
 
 
385 aa  315  9.999999999999999e-85  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0280572  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0871  acetylornithine aminotransferase  41.6 
 
 
403 aa  314  1.9999999999999998e-84  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4263  acetylornithine aminotransferase  41.45 
 
 
386 aa  313  2.9999999999999996e-84  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4200  acetylornithine aminotransferase  41.19 
 
 
386 aa  312  5.999999999999999e-84  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3884  acetylornithine aminotransferase  42.19 
 
 
386 aa  311  9e-84  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0175  acetylornithine transaminase protein  45.14 
 
 
399 aa  310  2.9999999999999997e-83  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2767  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  44.77 
 
 
403 aa  309  5.9999999999999995e-83  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2692  acetylornithine aminotransferase  45.76 
 
 
401 aa  308  8e-83  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011699  PHATRDRAFT_50577  acetylornithine aminotransferase  40.5 
 
 
476 aa  307  2.0000000000000002e-82  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0009  acetylornithine transaminase protein  43.2 
 
 
401 aa  307  2.0000000000000002e-82  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2686  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  46.42 
 
 
402 aa  307  2.0000000000000002e-82  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0960288 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0858  acetylornithine aminotransferase  42.89 
 
 
434 aa  306  3e-82  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1094  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  40.62 
 
 
387 aa  306  3e-82  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_17211  acetylornithine aminotransferase  41.58 
 
 
420 aa  306  4.0000000000000004e-82  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1024  acetylornithine transaminase protein  42.59 
 
 
395 aa  305  9.000000000000001e-82  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.433962  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0867  acetylornithine aminotransferase  41.71 
 
 
393 aa  305  1.0000000000000001e-81  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>