More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pfl01_4636 on replicon NC_007492
Organism: Pseudomonas fluorescens Pf0-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007492  Pfl01_4636  acetylornithine aminotransferase  100 
 
 
395 aa  797    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.621133  normal  0.175641 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2618  acetylornithine aminotransferase  76.41 
 
 
400 aa  614  9.999999999999999e-175  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00459682  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2358  acetylornithine aminotransferase  77.12 
 
 
400 aa  608  1e-173  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.284538  normal  0.840689 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3708  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  60.79 
 
 
412 aa  459  9.999999999999999e-129  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.339324  normal  0.0114471 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0982  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  58.21 
 
 
410 aa  453  1.0000000000000001e-126  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1346  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  55.84 
 
 
399 aa  440  9.999999999999999e-123  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2429  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  55.84 
 
 
393 aa  432  1e-120  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1041  acetylornithine aminotransferase  57.29 
 
 
390 aa  433  1e-120  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.370932  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0946  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  56.14 
 
 
398 aa  427  1e-118  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.104291  normal  0.0999204 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1851  acetylornithine aminotransferase  56.54 
 
 
394 aa  422  1e-117  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2464  acetylornithine aminotransferase  55.26 
 
 
392 aa  422  1e-117  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1710  acetylornithine aminotransferase  55.24 
 
 
392 aa  414  1e-114  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0925352  hitchhiker  0.00335003 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1102  acetylornithine aminotransferase  57.44 
 
 
394 aa  414  1e-114  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2079  acetylornithine aminotransferase  53.95 
 
 
391 aa  410  1e-113  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0533  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  53.05 
 
 
394 aa  409  1e-113  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp3040  acetylornithine aminotransferase  48.59 
 
 
389 aa  392  1e-108  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2898  acetylornithine aminotransferase  48.59 
 
 
389 aa  391  1e-108  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3033  acetylornithine aminotransferase  52.91 
 
 
390 aa  392  1e-108  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.850335  normal  0.390329 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2440  acetylornithine aminotransferase  49.34 
 
 
388 aa  394  1e-108  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.493949  normal  0.0446911 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0906  acetylornithine aminotransferase  51.68 
 
 
402 aa  384  1e-105  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3572  acetylornithine aminotransferase  51.6 
 
 
404 aa  381  1e-104  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.331421 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3029  acetylornithine aminotransferase  51.98 
 
 
410 aa  375  1e-103  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.51469  normal  0.939431 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0570  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  52.19 
 
 
388 aa  373  1e-102  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0406  acetylornithine aminotransferase  52.19 
 
 
388 aa  373  1e-102  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2179  acetylornithine aminotransferase  48.67 
 
 
398 aa  372  1e-102  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.569965  normal  0.442274 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1423  acetylornithine aminotransferase  48.05 
 
 
398 aa  372  1e-102  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.050105  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1164  acetylornithine aminotransferase  50.8 
 
 
398 aa  372  1e-102  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.581434  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2676  acetylornithine aminotransferase  48.94 
 
 
391 aa  369  1e-101  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3011  acetylornithine aminotransferase  50 
 
 
404 aa  369  1e-101  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2429  acetylornithine aminotransferase  49.47 
 
 
398 aa  365  1e-100  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3002  acetylornithine aminotransferase  49.47 
 
 
398 aa  365  1e-100  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.555766  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1452  acetylornithine aminotransferase  50.27 
 
 
402 aa  363  2e-99  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2121  acetylornithine aminotransferase  49.08 
 
 
404 aa  362  8e-99  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  decreased coverage  0.00994118  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1057  acetylornithine aminotransferase  47.77 
 
 
393 aa  355  5.999999999999999e-97  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.00148742  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1405  acetylornithine aminotransferase  47.78 
 
 
393 aa  355  1e-96  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.966648  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1901  acetylornithine aminotransferase  48.67 
 
 
400 aa  348  1e-94  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.133726  normal  0.687258 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2287  acetylornithine aminotransferase  44.9 
 
 
402 aa  343  2.9999999999999997e-93  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.194315 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0063  acetylornithine and succinylornithine aminotransferases  45.45 
 
 
396 aa  342  7e-93  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.857354  normal  0.372491 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1566  acetylornithine aminotransferase  44.04 
 
 
395 aa  342  9e-93  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0353  acetylornithine aminotransferase  43.78 
 
 
395 aa  340  2e-92  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  hitchhiker  0.00220895 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0640  acetylornithine aminotransferase  43.52 
 
 
403 aa  334  2e-90  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.41902  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0274  acetylornithine aminotransferase  44.27 
 
 
396 aa  330  3e-89  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.110157  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0772  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  45.45 
 
 
399 aa  328  1.0000000000000001e-88  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.200689  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0426  acetylornithine aminotransferase  42.23 
 
 
396 aa  327  2.0000000000000001e-88  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0269327  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0483  acetylornithine aminotransferase  43.52 
 
 
395 aa  324  1e-87  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0727  acetylornithine aminotransferase  51.84 
 
 
389 aa  324  2e-87  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1830  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  47.59 
 
 
395 aa  323  2e-87  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.991221  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2414  acetylornithine aminotransferase  46.01 
 
 
396 aa  321  9.999999999999999e-87  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3150  acetylornithine aminotransferase  45.12 
 
 
399 aa  320  3e-86  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0342  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  45.64 
 
 
417 aa  320  3e-86  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0660  acetylornithine aminotransferase  43.16 
 
 
394 aa  318  7.999999999999999e-86  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2493  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  41.9 
 
 
397 aa  318  1e-85  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3744  acetylornithine aminotransferase  44.25 
 
 
391 aa  318  1e-85  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000932106 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5468  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  47.18 
 
 
436 aa  317  2e-85  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0529885 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1866  acetylornithine aminotransferase  44.06 
 
 
400 aa  314  9.999999999999999e-85  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1986  acetylornithine aminotransferase  40.91 
 
 
418 aa  315  9.999999999999999e-85  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2013  acetylornithine aminotransferase  40.91 
 
 
418 aa  315  9.999999999999999e-85  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.152714 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0204  acetylornithine aminotransferase  43.39 
 
 
399 aa  314  1.9999999999999998e-84  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000412684 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1698  acetylornithine aminotransferase  43.7 
 
 
394 aa  313  2.9999999999999996e-84  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0226  acetylornithine aminotransferase  44.3 
 
 
396 aa  313  2.9999999999999996e-84  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0395  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  46.19 
 
 
413 aa  311  9e-84  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.538676 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2028  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  45.87 
 
 
399 aa  311  1e-83  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.832641  normal  0.501384 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3636  acetylornithine aminotransferase  43.85 
 
 
397 aa  311  1e-83  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1740  acetylornithine aminotransferase  45.65 
 
 
414 aa  310  2e-83  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00212917 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0569  acetylornithine aminotransferase  41.65 
 
 
400 aa  311  2e-83  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.160273  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3962  acetylornithine aminotransferase  43.62 
 
 
386 aa  311  2e-83  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00766837  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3527  acetylornithine aminotransferase  43.48 
 
 
395 aa  310  4e-83  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.327175  normal  0.819815 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2288  acetylornithine and succinylornithine aminotransferases  43.77 
 
 
396 aa  310  4e-83  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.37355  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2649  acetylornithine aminotransferase  43.83 
 
 
423 aa  309  5e-83  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.46775  normal  0.4632 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2204  acetylornithine aminotransferase  40.68 
 
 
390 aa  309  5.9999999999999995e-83  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3311  acetylornithine aminotransferase  44.95 
 
 
390 aa  309  6.999999999999999e-83  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0246414  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0151  acetylornithine aminotransferase  43.12 
 
 
399 aa  308  9e-83  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3172  acetylornithine aminotransferase  45.76 
 
 
444 aa  308  9e-83  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.22064  normal  0.239102 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3741  acetylornithine aminotransferase  43.39 
 
 
397 aa  308  9e-83  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3277  acetylornithine aminotransferase  45.55 
 
 
396 aa  307  2.0000000000000002e-82  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1907  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  41.44 
 
 
387 aa  306  3e-82  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0119007  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0009  acetylornithine transaminase protein  43 
 
 
401 aa  306  3e-82  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1260  acetylornithine aminotransferase  46.15 
 
 
399 aa  306  3e-82  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.161601 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4200  acetylornithine aminotransferase  42.55 
 
 
386 aa  306  5.0000000000000004e-82  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1218  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  44.3 
 
 
402 aa  305  7e-82  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.525687  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11673  acetylornithine aminotransferase  45.89 
 
 
400 aa  305  8.000000000000001e-82  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000327992  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0637  acetylornithine aminotransferase  43.72 
 
 
418 aa  304  1.0000000000000001e-81  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00130856  normal  0.274942 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1040  acetylornithine aminotransferase  41.86 
 
 
385 aa  303  4.0000000000000003e-81  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.000111021  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3173  acetylornithine aminotransferase  42.18 
 
 
398 aa  303  4.0000000000000003e-81  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.324258  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0858  acetylornithine aminotransferase  44.33 
 
 
434 aa  302  6.000000000000001e-81  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1072  acetylornithine aminotransferase  41.6 
 
 
385 aa  302  8.000000000000001e-81  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0280572  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2872  acetylornithine aminotransferase  43.81 
 
 
397 aa  302  9e-81  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2888  acetylornithine aminotransferase  44.21 
 
 
397 aa  301  1e-80  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0887768  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1258  acetylornithine aminotransferase  40.87 
 
 
398 aa  301  2e-80  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00185503  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3730  acetylornithine aminotransferase  41.25 
 
 
427 aa  300  3e-80  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000174283  normal  0.451197 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6074  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  43.83 
 
 
400 aa  300  3e-80  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.882536  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0871  acetylornithine aminotransferase  42.22 
 
 
403 aa  299  5e-80  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1069  acetylornithine aminotransferase  40.87 
 
 
398 aa  299  7e-80  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00131217  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1024  acetylornithine transaminase protein  41.8 
 
 
395 aa  298  8e-80  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.433962  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2912  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  43.2 
 
 
400 aa  298  9e-80  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.386564  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02850  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  44.51 
 
 
399 aa  298  1e-79  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.0000577952  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5154  acetylornithine aminotransferase  40 
 
 
426 aa  298  1e-79  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000762221 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2838  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  45.6 
 
 
393 aa  298  1e-79  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0375409  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7457  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  44.74 
 
 
397 aa  297  2e-79  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.484657  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2826  acetylornithine aminotransferase  40.96 
 
 
386 aa  297  2e-79  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>