More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rfer_2121 on replicon NC_007908
Organism: Rhodoferax ferrireducens T118



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008752  Aave_1164  acetylornithine aminotransferase  76.87 
 
 		 398 aa  645    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.581434  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3011  acetylornithine aminotransferase  82.87 
 
 		 404 aa  678    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2121  acetylornithine aminotransferase  100 
 
 		 404 aa  826    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  decreased coverage  0.00994118  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3572  acetylornithine aminotransferase  80.84 
 
 		 404 aa  676    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.331421 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1452  acetylornithine aminotransferase  79.04 
 
 		 402 aa  650    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3029  acetylornithine aminotransferase  73.91 
 
 		 410 aa  612  9.999999999999999e-175  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.51469  normal  0.939431 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0906  acetylornithine aminotransferase  73.1 
 
 		 402 aa  613  9.999999999999999e-175  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2179  acetylornithine aminotransferase  70.93 
 
 		 398 aa  598  1e-170  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.569965  normal  0.442274 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1901  acetylornithine aminotransferase  70 
 
 		 400 aa  597  1e-169  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.133726  normal  0.687258 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2429  acetylornithine aminotransferase  70.43 
 
 		 398 aa  591  1e-168  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3002  acetylornithine aminotransferase  70.43 
 
 		 398 aa  594  1e-168  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.555766  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3033  acetylornithine aminotransferase  58.35 
 
 		 390 aa  461  1e-129  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.850335  normal  0.390329 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2676  acetylornithine aminotransferase  55.24 
 
 		 391 aa  450  1e-125  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1041  acetylornithine aminotransferase  55.01 
 
 		 390 aa  450  1e-125  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.370932  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1710  acetylornithine aminotransferase  56.35 
 
 		 392 aa  445  1.0000000000000001e-124  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0925352  hitchhiker  0.00335003 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1851  acetylornithine aminotransferase  54.94 
 
 		 394 aa  429  1e-119  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1102  acetylornithine aminotransferase  52.19 
 
 		 394 aa  423  1e-117  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0533  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  49.1 
 
 		 394 aa  417  9.999999999999999e-116  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2464  acetylornithine aminotransferase  52.06 
 
 		 392 aa  416  9.999999999999999e-116  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2079  acetylornithine aminotransferase  50.76 
 
 		 391 aa  405  1.0000000000000001e-112  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1346  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  50.26 
 
 		 399 aa  407  1.0000000000000001e-112  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0946  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  50 
 
 		 398 aa  392  1e-108  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.104291  normal  0.0999204 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0982  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  48.47 
 
 		 410 aa  391  1e-107  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2429  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  48.85 
 
 		 393 aa  385  1e-106  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3636  acetylornithine aminotransferase  49.12 
 
 		 397 aa  386  1e-106  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2440  acetylornithine aminotransferase  48.71 
 
 		 388 aa  387  1e-106  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.493949  normal  0.0446911 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0406  acetylornithine aminotransferase  48.19 
 
 		 388 aa  377  1e-103  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0353  acetylornithine aminotransferase  48.35 
 
 		 395 aa  377  1e-103  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00220895 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0570  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  48.19 
 
 		 388 aa  377  1e-103  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3741  acetylornithine aminotransferase  48.12 
 
 		 397 aa  377  1e-103  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3708  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  47.55 
 
 		 412 aa  378  1e-103  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.339324  normal  0.0114471 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0226  acetylornithine aminotransferase  46.37 
 
 		 396 aa  374  1e-102  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3150  acetylornithine aminotransferase  48.75 
 
 		 399 aa  374  1e-102  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1566  acetylornithine aminotransferase  48.33 
 
 		 395 aa  374  1e-102  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp3040  acetylornithine aminotransferase  45.99 
 
 		 389 aa  372  1e-102  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2898  acetylornithine aminotransferase  45.99 
 
 		 389 aa  372  1e-102  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2358  acetylornithine aminotransferase  50.4 
 
 		 400 aa  372  1e-102  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.284538  normal  0.840689 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2287  acetylornithine aminotransferase  47 
 
 		 402 aa  374  1e-102  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.194315 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0151  acetylornithine aminotransferase  46.67 
 
 		 399 aa  369  1e-101  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4636  acetylornithine aminotransferase  49.47 
 
 		 395 aa  368  1e-101  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.621133  normal  0.175641 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2618  acetylornithine aminotransferase  49.08 
 
 		 400 aa  365  1e-99  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00459682  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0204  acetylornithine aminotransferase  46.5 
 
 		 399 aa  365  1e-99  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000412684 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0772  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  45.9 
 
 		 399 aa  364  1e-99  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.200689  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0274  acetylornithine aminotransferase  47.19 
 
 		 396 aa  363  3e-99  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.110157  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0426  acetylornithine aminotransferase  46.29 
 
 		 396 aa  361  1e-98  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0269327  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1866  acetylornithine aminotransferase  45.71 
 
 		 400 aa  359  5e-98  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0483  acetylornithine aminotransferase  48.07 
 
 		 395 aa  359  6e-98  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0640  acetylornithine aminotransferase  45.2 
 
 		 403 aa  357  1.9999999999999998e-97  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.41902  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3173  acetylornithine aminotransferase  46.45 
 
 		 398 aa  357  1.9999999999999998e-97  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.324258  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2414  acetylornithine aminotransferase  47.22 
 
 		 396 aa  357  2.9999999999999997e-97  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3744  acetylornithine aminotransferase  46.55 
 
 		 391 aa  352  5.9999999999999994e-96  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000932106 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1698  acetylornithine aminotransferase  47.04 
 
 		 394 aa  351  1e-95  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2493  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  45.29 
 
 		 397 aa  351  2e-95  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0342  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  46.08 
 
 		 417 aa  348  1e-94  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0660  acetylornithine aminotransferase  46.41 
 
 		 394 aa  348  1e-94  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2013  acetylornithine aminotransferase  43.72 
 
 		 418 aa  347  3e-94  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.152714 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1986  acetylornithine aminotransferase  43.72 
 
 		 418 aa  346  4e-94  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0063  acetylornithine and succinylornithine aminotransferases  45.45 
 
 		 396 aa  344  1e-93  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.857354  normal  0.372491 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2649  acetylornithine aminotransferase  44.16 
 
 		 423 aa  342  5e-93  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.46775  normal  0.4632 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1830  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  44.5 
 
 		 395 aa  341  1e-92  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.991221  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2288  acetylornithine and succinylornithine aminotransferases  44.07 
 
 		 396 aa  341  1e-92  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.37355  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2912  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  43.18 
 
 		 400 aa  338  7e-92  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.386564  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0569  acetylornithine aminotransferase  45.15 
 
 		 400 aa  338  9e-92  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.160273  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5154  acetylornithine aminotransferase  43.48 
 
 		 426 aa  337  1.9999999999999998e-91  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000762221 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0943  acetylornithine aminotransferase  46.65 
 
 		 422 aa  337  2.9999999999999997e-91  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02850  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  41.5 
 
 		 399 aa  336  3.9999999999999995e-91  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.0000577952  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1423  acetylornithine aminotransferase  43 
 
 		 398 aa  336  3.9999999999999995e-91  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.050105  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3730  acetylornithine aminotransferase  44.22 
 
 		 427 aa  334  2e-90  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000174283  normal  0.451197 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3003  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  44.64 
 
 		 427 aa  333  3e-90  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2204  acetylornithine aminotransferase  42.67 
 
 		 390 aa  333  4e-90  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1040  acetylornithine aminotransferase  45.38 
 
 		 385 aa  333  5e-90  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.000111021  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1072  acetylornithine aminotransferase  44.87 
 
 		 385 aa  331  1e-89  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0280572  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0637  acetylornithine aminotransferase  43.97 
 
 		 418 aa  329  4e-89  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00130856  normal  0.274942 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0727  acetylornithine aminotransferase  48.34 
 
 		 389 aa  326  4.0000000000000003e-88  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1094  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  43.19 
 
 		 387 aa  324  1e-87  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1371  acetylornithine aminotransferase  41.9 
 
 		 379 aa  323  3e-87  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2872  acetylornithine aminotransferase  42.78 
 
 		 397 aa  322  9.999999999999999e-87  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0858  acetylornithine aminotransferase  42.42 
 
 		 434 aa  319  3.9999999999999996e-86  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2541  acetylornithine transaminase protein  45.26 
 
 		 398 aa  319  5e-86  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1951  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  42.52 
 
 		 398 aa  318  1e-85  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.620278  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_13491  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  43.96 
 
 		 420 aa  318  1e-85  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0739  acetylornithine aminotransferase  42.82 
 
 		 386 aa  317  2e-85  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.791606  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1596  acetylornithine aminotransferase  44.56 
 
 		 386 aa  318  2e-85  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1405  acetylornithine aminotransferase  41.88 
 
 		 393 aa  316  4e-85  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.966648  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0690  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  43 
 
 		 405 aa  315  7e-85  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1057  acetylornithine aminotransferase  41.62 
 
 		 393 aa  314  9.999999999999999e-85  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.00148742  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22300  acetylornithine/succinylornithine aminotransferase  44.81 
 
 		 425 aa  314  9.999999999999999e-85  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.271521  normal  0.79569 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1837  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  41.52 
 
 		 401 aa  313  2.9999999999999996e-84  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0481  acetylornithine transaminase protein  43.54 
 
 		 402 aa  313  2.9999999999999996e-84  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3172  acetylornithine aminotransferase  43.45 
 
 		 444 aa  312  5.999999999999999e-84  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.22064  normal  0.239102 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0394  acetylornithine transaminase protein  42.05 
 
 		 403 aa  311  1e-83  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2838  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  45.97 
 
 		 393 aa  311  1e-83  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0375409  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0871  acetylornithine aminotransferase  42.56 
 
 		 403 aa  310  2.9999999999999997e-83  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2165  acetylornithine transaminase protein  44.71 
 
 		 401 aa  310  2.9999999999999997e-83  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0009  acetylornithine transaminase protein  40.97 
 
 		 401 aa  310  4e-83  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0301  acetylornithine transaminase protein  41.77 
 
 		 403 aa  309  5e-83  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.171719  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0314  acetylornithine transaminase protein  41.77 
 
 		 403 aa  309  5e-83  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011699  PHATRDRAFT_50577  acetylornithine aminotransferase  40.92 
 
 		 476 aa  309  5.9999999999999995e-83  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0185  acetylornithine transaminase protein  42.3 
 
 		 399 aa  308  9e-83  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.372078 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2878  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  44.16 
 
 		 401 aa  308  2.0000000000000002e-82  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.675543  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>