More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TRQ2_1040 on replicon NC_010483
Organism: Thermotoga sp. RQ2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010483  TRQ2_1040  acetylornithine aminotransferase  100 
 
 
385 aa  790    Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.000111021  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1072  acetylornithine aminotransferase  98.7 
 
 
385 aa  783    Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0280572  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0660  acetylornithine aminotransferase  56.36 
 
 
394 aa  461  9.999999999999999e-129  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1698  acetylornithine aminotransferase  55.06 
 
 
394 aa  445  1.0000000000000001e-124  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1907  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  52.88 
 
 
387 aa  427  1e-118  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0119007  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0274  acetylornithine aminotransferase  49.87 
 
 
396 aa  416  9.999999999999999e-116  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.110157  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2287  acetylornithine aminotransferase  51.3 
 
 
402 aa  407  1.0000000000000001e-112  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.194315 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02850  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  51.17 
 
 
399 aa  404  1e-111  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.0000577952  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0772  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  51.82 
 
 
399 aa  401  9.999999999999999e-111  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.200689  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1566  acetylornithine aminotransferase  50.65 
 
 
395 aa  399  9.999999999999999e-111  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1866  acetylornithine aminotransferase  52.85 
 
 
400 aa  397  1e-109  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0353  acetylornithine aminotransferase  50.39 
 
 
395 aa  395  1e-109  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  hitchhiker  0.00220895 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2288  acetylornithine and succinylornithine aminotransferases  50.91 
 
 
396 aa  390  1e-107  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.37355  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0483  acetylornithine aminotransferase  49.87 
 
 
395 aa  383  1e-105  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0226  acetylornithine aminotransferase  47.41 
 
 
396 aa  380  1e-104  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1094  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  48.96 
 
 
387 aa  379  1e-104  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1830  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  49.09 
 
 
395 aa  380  1e-104  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.991221  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0569  acetylornithine aminotransferase  48.19 
 
 
400 aa  378  1e-103  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.160273  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2912  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  47.94 
 
 
400 aa  375  1e-103  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.386564  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0342  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  47.66 
 
 
417 aa  376  1e-103  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1258  acetylornithine aminotransferase  45.67 
 
 
398 aa  369  1e-101  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00185503  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0151  acetylornithine aminotransferase  45.74 
 
 
399 aa  371  1e-101  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0943  acetylornithine aminotransferase  46.31 
 
 
422 aa  371  1e-101  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0063  acetylornithine and succinylornithine aminotransferases  46.49 
 
 
396 aa  370  1e-101  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.857354  normal  0.372491 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0426  acetylornithine aminotransferase  46.49 
 
 
396 aa  370  1e-101  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0269327  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2493  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  47 
 
 
397 aa  366  1e-100  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5154  acetylornithine aminotransferase  45.92 
 
 
426 aa  363  2e-99  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000762221 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3150  acetylornithine aminotransferase  45.85 
 
 
399 aa  363  2e-99  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1069  acetylornithine aminotransferase  44.88 
 
 
398 aa  363  3e-99  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00131217  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1784  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  48.68 
 
 
385 aa  362  4e-99  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.74918  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3636  acetylornithine aminotransferase  45.22 
 
 
397 aa  362  5.0000000000000005e-99  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2414  acetylornithine aminotransferase  46.37 
 
 
396 aa  362  5.0000000000000005e-99  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1534  acetylornithine aminotransferase  44.62 
 
 
394 aa  362  8e-99  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.719069  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3741  acetylornithine aminotransferase  44.96 
 
 
397 aa  361  9e-99  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0867  acetylornithine aminotransferase  46.68 
 
 
393 aa  361  1e-98  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0204  acetylornithine aminotransferase  46.65 
 
 
399 aa  361  1e-98  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000412684 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0637  acetylornithine aminotransferase  44.67 
 
 
418 aa  361  1e-98  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00130856  normal  0.274942 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0640  acetylornithine aminotransferase  47.27 
 
 
403 aa  360  2e-98  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.41902  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0533  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  46.49 
 
 
394 aa  360  2e-98  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3173  acetylornithine aminotransferase  44.56 
 
 
398 aa  358  7e-98  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.324258  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_17211  acetylornithine aminotransferase  46.56 
 
 
420 aa  358  9e-98  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1041  acetylornithine aminotransferase  44.88 
 
 
398 aa  357  1.9999999999999998e-97  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0101251  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_14621  acetylornithine aminotransferase  44.9 
 
 
417 aa  355  5e-97  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3704  bifunctional N-succinyldiaminopimelate-aminotransferase/ acetylornithine transaminase protein  46.19 
 
 
405 aa  355  7.999999999999999e-97  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0245  bifunctional N-succinyldiaminopimelate-aminotransferase/ acetylornithine transaminase protein  46.19 
 
 
405 aa  355  7.999999999999999e-97  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.110716  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2013  acetylornithine aminotransferase  44.56 
 
 
418 aa  355  1e-96  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.152714 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3003  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  43.77 
 
 
427 aa  354  1e-96  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1986  acetylornithine aminotransferase  44.56 
 
 
418 aa  355  1e-96  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3947  bifunctional N-succinyldiaminopimelate-aminotransferase/ acetylornithine transaminase protein  46.19 
 
 
405 aa  354  2e-96  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3730  acetylornithine aminotransferase  44.27 
 
 
427 aa  354  2e-96  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000174283  normal  0.451197 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1842  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  45.74 
 
 
399 aa  353  2e-96  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.716815  normal 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_52948  acetylornithine aminotransferase  46.7 
 
 
452 aa  353  2e-96  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.346975 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_34500  bifunctional N-succinyldiaminopimelate-aminotransferase/ acetylornithine transaminase protein  45.74 
 
 
406 aa  352  7e-96  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0368  bifunctional N-succinyldiaminopimelate-aminotransferase/ acetylornithine transaminase protein  46.72 
 
 
406 aa  351  1e-95  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_19841  acetylornithine aminotransferase  44.36 
 
 
418 aa  351  1e-95  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0786665 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01150  acetylornithine aminotransferase, ornithine transaminase (Eurofung)  43.6 
 
 
476 aa  350  2e-95  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.202493 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0858  acetylornithine aminotransferase  45.29 
 
 
434 aa  351  2e-95  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0225  acetylornithine aminotransferase  44.16 
 
 
393 aa  350  2e-95  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_13491  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  45.04 
 
 
420 aa  350  2e-95  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4620  bifunctional N-succinyldiaminopimelate-aminotransferase/ acetylornithine transaminase protein  44.87 
 
 
406 aa  349  4e-95  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0690  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  48.06 
 
 
405 aa  349  5e-95  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1359  acetylornithine transaminase protein  45.81 
 
 
395 aa  349  5e-95  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.592193  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0285  bifunctional N-succinyldiaminopimelate-aminotransferase/ acetylornithine transaminase protein  45.67 
 
 
413 aa  348  8e-95  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0739  acetylornithine aminotransferase  47 
 
 
386 aa  348  1e-94  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.791606  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2888  acetylornithine aminotransferase  48.04 
 
 
397 aa  347  2e-94  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0887768  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2541  acetylornithine transaminase protein  47.59 
 
 
398 aa  345  7e-94  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1397  acetylornithine aminotransferase  44.64 
 
 
417 aa  345  8.999999999999999e-94  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2649  acetylornithine aminotransferase  42.97 
 
 
423 aa  344  1e-93  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.46775  normal  0.4632 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4582  bifunctional N-succinyldiaminopimelate-aminotransferase/ acetylornithine transaminase protein  45.14 
 
 
405 aa  344  1e-93  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1951  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  44.5 
 
 
398 aa  343  2e-93  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.620278  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3854  bifunctional N-succinyldiaminopimelate-aminotransferase/ acetylornithine transaminase protein  46.59 
 
 
408 aa  344  2e-93  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_52720  bifunctional N-succinyldiaminopimelate-aminotransferase/ acetylornithine transaminase protein  44.1 
 
 
406 aa  344  2e-93  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2440  acetylornithine aminotransferase  44.79 
 
 
388 aa  343  2.9999999999999997e-93  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.493949  normal  0.0446911 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4481  bifunctional N-succinyldiaminopimelate-aminotransferase/ acetylornithine transaminase protein  44.18 
 
 
406 aa  343  4e-93  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.593317 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4033  bifunctional N-succinyldiaminopimelate-aminotransferase/ acetylornithine transaminase protein  46.59 
 
 
408 aa  343  4e-93  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.327701  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3770  bifunctional N-succinyldiaminopimelate-aminotransferase/ acetylornithine transaminase protein  44.22 
 
 
406 aa  342  5e-93  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0233516 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1434  bifunctional N-succinyldiaminopimelate-aminotransferase/ acetylornithine transaminase protein  44.18 
 
 
406 aa  342  7e-93  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.845656 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3986  bifunctional N-succinyldiaminopimelate-aminotransferase/ acetylornithine transaminase protein  44.18 
 
 
406 aa  342  7e-93  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3616  acetylornithine and succinylornithine aminotransferases  42.86 
 
 
403 aa  342  7e-93  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_14871  acetylornithine aminotransferase  44.64 
 
 
417 aa  342  8e-93  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.387015  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03210  bifunctional acetylornithine aminotransferase/ succinyldiaminopimelate aminotransferase  44.62 
 
 
406 aa  341  1e-92  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.411441  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0353  succinylornithine transaminase family  44.62 
 
 
406 aa  341  1e-92  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.124803  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03162  hypothetical protein  44.62 
 
 
406 aa  341  1e-92  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.514946  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0353  bifunctional N-succinyldiaminopimelate-aminotransferase/ acetylornithine transaminase protein  44.62 
 
 
406 aa  341  1e-92  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4669  bifunctional N-succinyldiaminopimelate-aminotransferase/ acetylornithine transaminase protein  44.62 
 
 
406 aa  341  1e-92  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.160127  normal  0.232002 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3641  bifunctional N-succinyldiaminopimelate-aminotransferase/ acetylornithine transaminase protein  44.62 
 
 
407 aa  341  2e-92  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000165169 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_15001  acetylornithine aminotransferase  43.48 
 
 
391 aa  340  2e-92  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3735  bifunctional N-succinyldiaminopimelate-aminotransferase/ acetylornithine transaminase protein  44.62 
 
 
406 aa  340  2.9999999999999998e-92  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0278  acetylornithine aminotransferase  44.16 
 
 
393 aa  340  2.9999999999999998e-92  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.368086  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3836  bifunctional N-succinyldiaminopimelate-aminotransferase/ acetylornithine transaminase protein  44.62 
 
 
405 aa  340  2.9999999999999998e-92  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2121  acetylornithine aminotransferase  45.13 
 
 
404 aa  340  2.9999999999999998e-92  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  decreased coverage  0.00994118  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3665  bifunctional N-succinyldiaminopimelate-aminotransferase/ acetylornithine transaminase protein  44.62 
 
 
405 aa  339  5e-92  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.451233  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3829  bifunctional N-succinyldiaminopimelate-aminotransferase/ acetylornithine transaminase protein  44.36 
 
 
406 aa  339  5.9999999999999996e-92  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4285  bifunctional N-succinyldiaminopimelate-aminotransferase/ acetylornithine transaminase protein  46.54 
 
 
406 aa  339  5.9999999999999996e-92  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2911  bifunctional N-succinyldiaminopimelate-aminotransferase/ acetylornithine transaminase protein  44.1 
 
 
406 aa  339  5.9999999999999996e-92  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.408245 
 
 
-
 
NC_006368  lpp3040  acetylornithine aminotransferase  44.7 
 
 
389 aa  338  7e-92  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3739  bifunctional N-succinyldiaminopimelate-aminotransferase/ acetylornithine transaminase protein  44.62 
 
 
405 aa  338  8e-92  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.0111513 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2898  acetylornithine aminotransferase  44.7 
 
 
389 aa  338  8e-92  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2179  acetylornithine aminotransferase  46.09 
 
 
398 aa  338  9e-92  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.569965  normal  0.442274 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0252  acetylornithine aminotransferase  43.64 
 
 
393 aa  338  9e-92  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>