More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpe_A3029 on replicon NC_008825
Organism: Methylibium petroleiphilum PM1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012791  Vapar_1452  acetylornithine aminotransferase  77 
 
 		 402 aa  640    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3029  acetylornithine aminotransferase  100 
 
 		 410 aa  827    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.51469  normal  0.939431 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0906  acetylornithine aminotransferase  81.33 
 
 		 402 aa  655    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3572  acetylornithine aminotransferase  75.13 
 
 		 404 aa  621  1e-177  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.331421 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1164  acetylornithine aminotransferase  73.43 
 
 		 398 aa  619  1e-176  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.581434  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3011  acetylornithine aminotransferase  74.81 
 
 		 404 aa  617  1e-175  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2121  acetylornithine aminotransferase  74.05 
 
 		 404 aa  606  9.999999999999999e-173  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  decreased coverage  0.00994118  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1901  acetylornithine aminotransferase  70.48 
 
 		 400 aa  577  1.0000000000000001e-163  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.133726  normal  0.687258 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2179  acetylornithine aminotransferase  68.7 
 
 		 398 aa  562  1.0000000000000001e-159  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.569965  normal  0.442274 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2429  acetylornithine aminotransferase  69.21 
 
 		 398 aa  557  1e-157  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3002  acetylornithine aminotransferase  68.7 
 
 		 398 aa  554  1e-156  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.555766  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3033  acetylornithine aminotransferase  59.59 
 
 		 390 aa  478  1e-134  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.850335  normal  0.390329 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2676  acetylornithine aminotransferase  58.42 
 
 		 391 aa  473  1e-132  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1041  acetylornithine aminotransferase  58.72 
 
 		 390 aa  469  1.0000000000000001e-131  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.370932  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1710  acetylornithine aminotransferase  57.87 
 
 		 392 aa  456  1e-127  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0925352  hitchhiker  0.00335003 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2464  acetylornithine aminotransferase  57.36 
 
 		 392 aa  447  1.0000000000000001e-124  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1851  acetylornithine aminotransferase  57.51 
 
 		 394 aa  443  1e-123  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1102  acetylornithine aminotransferase  56.7 
 
 		 394 aa  432  1e-120  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2079  acetylornithine aminotransferase  54.73 
 
 		 391 aa  426  1e-118  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1346  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  53.57 
 
 		 399 aa  423  1e-117  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0946  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  54.59 
 
 		 398 aa  419  1e-116  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.104291  normal  0.0999204 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0982  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  54.12 
 
 		 410 aa  418  1e-116  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0533  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  52.32 
 
 		 394 aa  414  1e-114  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2429  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  52.96 
 
 		 393 aa  406  1.0000000000000001e-112  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0406  acetylornithine aminotransferase  53.51 
 
 		 388 aa  398  1e-109  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0570  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  53.51 
 
 		 388 aa  398  1e-109  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2440  acetylornithine aminotransferase  49.87 
 
 		 388 aa  389  1e-107  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.493949  normal  0.0446911 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3708  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  51.28 
 
 		 412 aa  390  1e-107  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.339324  normal  0.0114471 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4636  acetylornithine aminotransferase  51.98 
 
 		 395 aa  375  1e-103  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.621133  normal  0.175641 
 
 
-
 
NC_006368  lpp3040  acetylornithine aminotransferase  47.55 
 
 		 389 aa  372  1e-102  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2898  acetylornithine aminotransferase  47.31 
 
 		 389 aa  372  1e-102  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3636  acetylornithine aminotransferase  47.3 
 
 		 397 aa  373  1e-102  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0226  acetylornithine aminotransferase  47.68 
 
 		 396 aa  372  1e-102  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3150  acetylornithine aminotransferase  49.49 
 
 		 399 aa  371  1e-101  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2358  acetylornithine aminotransferase  52.24 
 
 		 400 aa  371  1e-101  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.284538  normal  0.840689 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3741  acetylornithine aminotransferase  46.55 
 
 		 397 aa  367  1e-100  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0204  acetylornithine aminotransferase  47.79 
 
 		 399 aa  364  1e-99  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000412684 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0151  acetylornithine aminotransferase  47.93 
 
 		 399 aa  362  5.0000000000000005e-99  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2287  acetylornithine aminotransferase  46.48 
 
 		 402 aa  362  7.0000000000000005e-99  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.194315 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2618  acetylornithine aminotransferase  49.6 
 
 		 400 aa  356  3.9999999999999996e-97  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00459682  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0943  acetylornithine aminotransferase  50.52 
 
 		 422 aa  354  1e-96  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3173  acetylornithine aminotransferase  47.66 
 
 		 398 aa  355  1e-96  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.324258  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0274  acetylornithine aminotransferase  47.38 
 
 		 396 aa  353  2e-96  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.110157  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1566  acetylornithine aminotransferase  47 
 
 		 395 aa  352  5e-96  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0353  acetylornithine aminotransferase  46.86 
 
 		 395 aa  352  5.9999999999999994e-96  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00220895 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1698  acetylornithine aminotransferase  46.39 
 
 		 394 aa  351  2e-95  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5154  acetylornithine aminotransferase  44.12 
 
 		 426 aa  349  5e-95  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000762221 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0772  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  45.93 
 
 		 399 aa  348  8e-95  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.200689  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2649  acetylornithine aminotransferase  44.95 
 
 		 423 aa  348  9e-95  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.46775  normal  0.4632 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2013  acetylornithine aminotransferase  45.06 
 
 		 418 aa  348  1e-94  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.152714 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1986  acetylornithine aminotransferase  45.06 
 
 		 418 aa  348  1e-94  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2493  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  46.7 
 
 		 397 aa  347  3e-94  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2414  acetylornithine aminotransferase  47.4 
 
 		 396 aa  345  7e-94  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3730  acetylornithine aminotransferase  45.12 
 
 		 427 aa  343  4e-93  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000174283  normal  0.451197 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0483  acetylornithine aminotransferase  46.09 
 
 		 395 aa  339  5e-92  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0637  acetylornithine aminotransferase  47.03 
 
 		 418 aa  337  1.9999999999999998e-91  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00130856  normal  0.274942 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0063  acetylornithine and succinylornithine aminotransferases  46.04 
 
 		 396 aa  337  2.9999999999999997e-91  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.857354  normal  0.372491 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0660  acetylornithine aminotransferase  45.6 
 
 		 394 aa  336  3.9999999999999995e-91  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1057  acetylornithine aminotransferase  44.53 
 
 		 393 aa  335  5.999999999999999e-91  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.00148742  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1423  acetylornithine aminotransferase  43.54 
 
 		 398 aa  335  5.999999999999999e-91  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.050105  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1405  acetylornithine aminotransferase  44.02 
 
 		 393 aa  332  7.000000000000001e-90  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.966648  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1866  acetylornithine aminotransferase  43.22 
 
 		 400 aa  331  1e-89  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02850  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  43.19 
 
 		 399 aa  331  2e-89  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.0000577952  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3744  acetylornithine aminotransferase  47.77 
 
 		 391 aa  331  2e-89  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000932106 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0426  acetylornithine aminotransferase  43.11 
 
 		 396 aa  330  2e-89  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0269327  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0727  acetylornithine aminotransferase  51.81 
 
 		 389 aa  330  3e-89  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2912  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  42.31 
 
 		 400 aa  328  1.0000000000000001e-88  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.386564  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2288  acetylornithine and succinylornithine aminotransferases  45.03 
 
 		 396 aa  327  3e-88  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.37355  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3003  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  43.49 
 
 		 427 aa  325  8.000000000000001e-88  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2204  acetylornithine aminotransferase  42.82 
 
 		 390 aa  324  1e-87  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1830  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  45.29 
 
 		 395 aa  324  2e-87  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.991221  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0640  acetylornithine aminotransferase  43.75 
 
 		 403 aa  323  3e-87  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.41902  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1040  acetylornithine aminotransferase  46.04 
 
 		 385 aa  322  6e-87  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.000111021  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1072  acetylornithine aminotransferase  45.52 
 
 		 385 aa  321  1.9999999999999998e-86  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0280572  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_13491  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  42.61 
 
 		 420 aa  319  6e-86  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2541  acetylornithine transaminase protein  46.42 
 
 		 398 aa  319  7e-86  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0569  acetylornithine aminotransferase  43.6 
 
 		 400 aa  319  7e-86  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.160273  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1371  acetylornithine aminotransferase  39.33 
 
 		 379 aa  318  7.999999999999999e-86  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0342  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  46.34 
 
 		 417 aa  318  1e-85  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2872  acetylornithine aminotransferase  43.96 
 
 		 397 aa  318  1e-85  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0858  acetylornithine aminotransferase  45.78 
 
 		 434 aa  317  3e-85  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3172  acetylornithine aminotransferase  48.38 
 
 		 444 aa  314  1.9999999999999998e-84  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.22064  normal  0.239102 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0759  acetylornithine transaminase protein  44.5 
 
 		 403 aa  314  1.9999999999999998e-84  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0803695 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0009  acetylornithine transaminase protein  46.32 
 
 		 401 aa  313  3.9999999999999997e-84  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1094  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  41.41 
 
 		 387 aa  313  3.9999999999999997e-84  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1218  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  43.14 
 
 		 402 aa  310  2.9999999999999997e-83  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.525687  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3962  acetylornithine aminotransferase  40.57 
 
 		 386 aa  310  2.9999999999999997e-83  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00766837  n/a   
 
 
-
 
NC_011699  PHATRDRAFT_50577  acetylornithine aminotransferase  40.65 
 
 		 476 aa  310  2.9999999999999997e-83  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1596  acetylornithine aminotransferase  44.13 
 
 		 386 aa  310  4e-83  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0832  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  45.45 
 
 		 400 aa  309  5e-83  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0150295 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3158  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  47.19 
 
 		 416 aa  309  5e-83  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22300  acetylornithine/succinylornithine aminotransferase  45.73 
 
 		 425 aa  308  1.0000000000000001e-82  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.271521  normal  0.79569 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0481  acetylornithine transaminase protein  45.36 
 
 		 402 aa  308  1.0000000000000001e-82  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4075  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  46.48 
 
 		 396 aa  306  3e-82  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1951  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  41.21 
 
 		 398 aa  306  4.0000000000000004e-82  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.620278  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5259  acetylornithine transaminase protein  43.96 
 
 		 403 aa  306  4.0000000000000004e-82  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4263  acetylornithine aminotransferase  40.46 
 
 		 386 aa  305  9.000000000000001e-82  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0185  acetylornithine transaminase protein  44.27 
 
 		 399 aa  305  1.0000000000000001e-81  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.372078 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4442  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  46.48 
 
 		 396 aa  305  1.0000000000000001e-81  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.977458  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4556  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  46.74 
 
 		 396 aa  305  1.0000000000000001e-81  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.974298 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>