More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_22300 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013521  Sked_22300  acetylornithine/succinylornithine aminotransferase  100 
 
 		 425 aa  829    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.271521  normal  0.79569 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1644  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  75.38 
 
 		 442 aa  538  9.999999999999999e-153  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1330  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  70.95 
 
 		 430 aa  535  1e-151  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0110567  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1114  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  66.67 
 
 		 420 aa  522  1e-147  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.922193  normal  0.423827 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3158  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  66.58 
 
 		 416 aa  498  1e-140  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2370  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  67.85 
 
 		 425 aa  500  1e-140  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0163259 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5468  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  61.52 
 
 		 436 aa  469  1.0000000000000001e-131  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0529885 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1500  acetylornithine aminotransferase  61.76 
 
 		 423 aa  469  1.0000000000000001e-131  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000760659 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1499  acetylornithine aminotransferase  60.77 
 
 		 426 aa  464  9.999999999999999e-131  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_21710  acetylornithine/succinylornithine aminotransferase  62.47 
 
 		 419 aa  461  9.999999999999999e-129  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4128  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  59.85 
 
 		 396 aa  414  1e-114  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0278283  decreased coverage  0.00000134579 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_14390  acetylornithine/succinylornithine aminotransferase  56.76 
 
 		 428 aa  397  1e-109  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2838  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  57.88 
 
 		 393 aa  395  1e-109  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0375409  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0813  acetylornithine aminotransferase  48.44 
 
 		 431 aa  387  1e-106  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.470435  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3172  acetylornithine aminotransferase  51.11 
 
 		 444 aa  372  1e-102  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.22064  normal  0.239102 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3527  acetylornithine aminotransferase  53.33 
 
 		 395 aa  373  1e-102  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.327175  normal  0.819815 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3311  acetylornithine aminotransferase  51.65 
 
 		 390 aa  367  1e-100  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0246414  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25600  acetylornithine aminotransferase  53.65 
 
 		 395 aa  364  2e-99  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2984  acetylornithine aminotransferase  53.33 
 
 		 402 aa  362  9e-99  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0590766 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2969  acetylornithine aminotransferase  53.2 
 
 		 402 aa  362  1e-98  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.435478  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3013  acetylornithine aminotransferase  53.2 
 
 		 402 aa  362  1e-98  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.686794 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5453  acetylornithine aminotransferase  57.11 
 
 		 387 aa  361  1e-98  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0392628  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2471  acetylornithine aminotransferase  58.21 
 
 		 411 aa  359  5e-98  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6074  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  53.73 
 
 		 400 aa  357  1.9999999999999998e-97  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.882536  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11673  acetylornithine aminotransferase  52.41 
 
 		 400 aa  356  3.9999999999999996e-97  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000327992  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2028  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  52.53 
 
 		 399 aa  354  2e-96  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.832641  normal  0.501384 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1740  acetylornithine aminotransferase  50.63 
 
 		 414 aa  352  5.9999999999999994e-96  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00212917 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2400  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  54.24 
 
 		 393 aa  344  2e-93  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2054  acetylornithine aminotransferase  51.13 
 
 		 403 aa  342  7e-93  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.307045  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3025  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  51.02 
 
 		 393 aa  342  1e-92  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.048422  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2154  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  49.01 
 
 		 401 aa  340  2.9999999999999998e-92  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00000952275  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1260  acetylornithine aminotransferase  48.09 
 
 		 399 aa  337  1.9999999999999998e-91  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.161601 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3065  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  50.13 
 
 		 401 aa  335  1e-90  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.110355  normal  0.664029 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3058  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  49.13 
 
 		 402 aa  332  8e-90  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  decreased coverage  0.00328868  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1164  acetylornithine aminotransferase  47.58 
 
 		 398 aa  332  8e-90  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.581434  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2179  acetylornithine aminotransferase  46.33 
 
 		 398 aa  327  2.0000000000000001e-88  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.569965  normal  0.442274 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1566  acetylornithine aminotransferase  43.3 
 
 		 395 aa  323  5e-87  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1891  acetylornithine aminotransferase  53.03 
 
 		 429 aa  318  1e-85  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.177986 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0353  acetylornithine aminotransferase  42.53 
 
 		 395 aa  316  4e-85  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00220895 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1884  acetylornithine aminotransferase  54.62 
 
 		 429 aa  316  4e-85  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0524658  normal  0.0363552 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1901  acetylornithine aminotransferase  47.19 
 
 		 400 aa  316  5e-85  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.133726  normal  0.687258 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2204  acetylornithine aminotransferase  42.01 
 
 		 390 aa  316  6e-85  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2121  acetylornithine aminotransferase  44.56 
 
 		 404 aa  314  1.9999999999999998e-84  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  decreased coverage  0.00994118  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3029  acetylornithine aminotransferase  45.73 
 
 		 410 aa  313  4.999999999999999e-84  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.51469  normal  0.939431 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0871  acetylornithine aminotransferase  44.3 
 
 		 403 aa  312  6.999999999999999e-84  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0483  acetylornithine aminotransferase  42.78 
 
 		 395 aa  312  7.999999999999999e-84  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1710  acetylornithine aminotransferase  44.72 
 
 		 392 aa  311  1e-83  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0925352  hitchhiker  0.00335003 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0226  acetylornithine aminotransferase  42.18 
 
 		 396 aa  311  1e-83  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3636  acetylornithine aminotransferase  41.52 
 
 		 397 aa  310  2.9999999999999997e-83  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3572  acetylornithine aminotransferase  44.78 
 
 		 404 aa  309  5e-83  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.331421 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2493  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  44.99 
 
 		 397 aa  309  5.9999999999999995e-83  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3011  acetylornithine aminotransferase  44.9 
 
 		 404 aa  309  6.999999999999999e-83  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2429  acetylornithine aminotransferase  44.9 
 
 		 398 aa  308  1.0000000000000001e-82  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1452  acetylornithine aminotransferase  45.18 
 
 		 402 aa  308  1.0000000000000001e-82  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0274  acetylornithine aminotransferase  42.82 
 
 		 396 aa  308  2.0000000000000002e-82  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.110157  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2464  acetylornithine aminotransferase  44.84 
 
 		 392 aa  307  2.0000000000000002e-82  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3741  acetylornithine aminotransferase  41.52 
 
 		 397 aa  307  3e-82  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1698  acetylornithine aminotransferase  40.05 
 
 		 394 aa  306  6e-82  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3002  acetylornithine aminotransferase  44.39 
 
 		 398 aa  305  1.0000000000000001e-81  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.555766  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0151  acetylornithine aminotransferase  42.14 
 
 		 399 aa  303  3.0000000000000004e-81  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2079  acetylornithine aminotransferase  45.69 
 
 		 391 aa  303  3.0000000000000004e-81  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0204  acetylornithine aminotransferase  42.08 
 
 		 399 aa  303  5.000000000000001e-81  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000412684 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1346  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  44.67 
 
 		 399 aa  302  6.000000000000001e-81  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1041  acetylornithine aminotransferase  43.11 
 
 		 390 aa  301  1e-80  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.370932  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1830  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  44.5 
 
 		 395 aa  301  2e-80  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.991221  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2414  acetylornithine aminotransferase  43.03 
 
 		 396 aa  301  2e-80  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0660  acetylornithine aminotransferase  39.74 
 
 		 394 aa  300  3e-80  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2649  acetylornithine aminotransferase  39.76 
 
 		 423 aa  299  6e-80  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.46775  normal  0.4632 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2912  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  38.67 
 
 		 400 aa  298  1e-79  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.386564  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0569  acetylornithine aminotransferase  43.08 
 
 		 400 aa  297  2e-79  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.160273  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2287  acetylornithine aminotransferase  43.58 
 
 		 402 aa  297  3e-79  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.194315 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0946  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  44.56 
 
 		 398 aa  296  5e-79  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.104291  normal  0.0999204 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0906  acetylornithine aminotransferase  44.3 
 
 		 402 aa  296  5e-79  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0637  acetylornithine aminotransferase  42.39 
 
 		 418 aa  294  2e-78  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00130856  normal  0.274942 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0313  acetylornithine aminotransferase  46.09 
 
 		 380 aa  294  2e-78  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0982  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  43.32 
 
 		 410 aa  293  4e-78  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1258  acetylornithine aminotransferase  39.95 
 
 		 398 aa  293  4e-78  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00185503  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2686  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  48.27 
 
 		 402 aa  293  5e-78  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0960288 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2440  acetylornithine aminotransferase  41.52 
 
 		 388 aa  292  9e-78  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.493949  normal  0.0446911 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2013  acetylornithine aminotransferase  39.8 
 
 		 418 aa  290  3e-77  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.152714 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1986  acetylornithine aminotransferase  39.8 
 
 		 418 aa  290  3e-77  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3033  acetylornithine aminotransferase  43.78 
 
 		 390 aa  289  7e-77  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.850335  normal  0.390329 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3150  acetylornithine aminotransferase  41.03 
 
 		 399 aa  289  8e-77  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5154  acetylornithine aminotransferase  39.55 
 
 		 426 aa  288  1e-76  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000762221 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4636  acetylornithine aminotransferase  40.87 
 
 		 395 aa  288  1e-76  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.621133  normal  0.175641 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1866  acetylornithine aminotransferase  40.98 
 
 		 400 aa  288  1e-76  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0342  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  45.41 
 
 		 417 aa  286  2.9999999999999996e-76  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3003  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  40.25 
 
 		 427 aa  287  2.9999999999999996e-76  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0943  acetylornithine aminotransferase  43.81 
 
 		 422 aa  286  4e-76  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1069  acetylornithine aminotransferase  39.6 
 
 		 398 aa  286  5e-76  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00131217  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1851  acetylornithine aminotransferase  45.13 
 
 		 394 aa  286  5.999999999999999e-76  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3173  acetylornithine aminotransferase  41.29 
 
 		 398 aa  285  8e-76  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.324258  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3730  acetylornithine aminotransferase  39.45 
 
 		 427 aa  285  1.0000000000000001e-75  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000174283  normal  0.451197 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0406  acetylornithine aminotransferase  43.62 
 
 		 388 aa  284  2.0000000000000002e-75  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1901  acetylornithine and succinylornithine aminotransferases  45.04 
 
 		 374 aa  284  2.0000000000000002e-75  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0570  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  43.62 
 
 		 388 aa  284  2.0000000000000002e-75  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3708  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  43.46 
 
 		 412 aa  283  6.000000000000001e-75  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.339324  normal  0.0114471 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0426  acetylornithine aminotransferase  38.42 
 
 		 396 aa  283  6.000000000000001e-75  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0269327  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1041  acetylornithine aminotransferase  39.21 
 
 		 398 aa  281  1e-74  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0101251  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0533  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  40.05 
 
 		 394 aa  281  1e-74  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>