More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Memar_1901 on replicon NC_009051
Organism: Methanoculleus marisnigri JR1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009051  Memar_1901  acetylornithine and succinylornithine aminotransferases  100 
 
 
374 aa  764    Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0068  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  75.34 
 
 
375 aa  595  1e-169  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.413029  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2138  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  75.34 
 
 
383 aa  587  1e-166  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1129  acetylornithine aminotransferase  67.75 
 
 
375 aa  535  1e-151  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2526  acetylornithine and succinylornithine aminotransferases  67.81 
 
 
356 aa  496  1e-139  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.645919  normal  0.731581 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2204  acetylornithine aminotransferase  52.43 
 
 
390 aa  392  1e-108  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0871  acetylornithine aminotransferase  51.07 
 
 
403 aa  374  1e-102  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0313  acetylornithine aminotransferase  49.73 
 
 
380 aa  345  8.999999999999999e-94  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1260  acetylornithine aminotransferase  46.76 
 
 
399 aa  325  5e-88  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.161601 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0426  acetylornithine aminotransferase  42.3 
 
 
396 aa  320  3.9999999999999996e-86  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0269327  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0660  acetylornithine aminotransferase  43.75 
 
 
394 aa  318  7e-86  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1566  acetylornithine aminotransferase  42.38 
 
 
395 aa  317  1e-85  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0353  acetylornithine aminotransferase  42.06 
 
 
395 aa  311  1e-83  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  hitchhiker  0.00220895 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0483  acetylornithine aminotransferase  41.71 
 
 
395 aa  311  2e-83  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3172  acetylornithine aminotransferase  46.21 
 
 
444 aa  310  2e-83  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.22064  normal  0.239102 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0274  acetylornithine aminotransferase  43.19 
 
 
396 aa  310  2.9999999999999997e-83  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.110157  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1866  acetylornithine aminotransferase  43.41 
 
 
400 aa  309  5.9999999999999995e-83  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0151  acetylornithine aminotransferase  44.91 
 
 
399 aa  308  6.999999999999999e-83  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0640  acetylornithine aminotransferase  42.48 
 
 
403 aa  308  1.0000000000000001e-82  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.41902  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1698  acetylornithine aminotransferase  42.89 
 
 
394 aa  306  3e-82  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1258  acetylornithine aminotransferase  42.31 
 
 
398 aa  305  7e-82  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00185503  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1041  acetylornithine aminotransferase  42.49 
 
 
390 aa  305  9.000000000000001e-82  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.370932  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0982  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  44.71 
 
 
410 aa  305  1.0000000000000001e-81  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1346  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  43.12 
 
 
399 aa  304  2.0000000000000002e-81  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1069  acetylornithine aminotransferase  43.08 
 
 
398 aa  304  2.0000000000000002e-81  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00131217  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1041  acetylornithine aminotransferase  43.08 
 
 
398 aa  303  3.0000000000000004e-81  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0101251  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2079  acetylornithine aminotransferase  42.74 
 
 
391 aa  301  1e-80  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2440  acetylornithine aminotransferase  41.85 
 
 
388 aa  301  2e-80  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.493949  normal  0.0446911 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2288  acetylornithine and succinylornithine aminotransferases  43.16 
 
 
396 aa  300  2e-80  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.37355  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2287  acetylornithine aminotransferase  43.72 
 
 
402 aa  300  3e-80  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.194315 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0226  acetylornithine aminotransferase  43.6 
 
 
396 aa  299  4e-80  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2464  acetylornithine aminotransferase  43.98 
 
 
392 aa  298  7e-80  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0204  acetylornithine aminotransferase  44.39 
 
 
399 aa  298  1e-79  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000412684 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3173  acetylornithine aminotransferase  43.98 
 
 
398 aa  298  1e-79  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.324258  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4636  acetylornithine aminotransferase  43.05 
 
 
395 aa  296  3e-79  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.621133  normal  0.175641 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0063  acetylornithine and succinylornithine aminotransferases  41.28 
 
 
396 aa  296  3e-79  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.857354  normal  0.372491 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1740  acetylornithine aminotransferase  44.09 
 
 
414 aa  295  1e-78  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00212917 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3636  acetylornithine aminotransferase  41.67 
 
 
397 aa  294  2e-78  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3741  acetylornithine aminotransferase  42.19 
 
 
397 aa  294  2e-78  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2618  acetylornithine aminotransferase  43.05 
 
 
400 aa  292  8e-78  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00459682  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0342  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  44.13 
 
 
417 aa  292  8e-78  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1830  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  42.49 
 
 
395 aa  291  9e-78  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.991221  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2358  acetylornithine aminotransferase  43.05 
 
 
400 aa  291  2e-77  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.284538  normal  0.840689 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5468  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  45.36 
 
 
436 aa  290  2e-77  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0529885 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0569  acetylornithine aminotransferase  42.04 
 
 
400 aa  290  4e-77  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.160273  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0946  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  42.86 
 
 
398 aa  289  5.0000000000000004e-77  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.104291  normal  0.0999204 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3146  aminotransferase class-III  46.39 
 
 
408 aa  289  5.0000000000000004e-77  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.733649  normal  0.0499094 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1040  acetylornithine aminotransferase  42.52 
 
 
385 aa  289  6e-77  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.000111021  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1072  acetylornithine aminotransferase  41.99 
 
 
385 aa  288  1e-76  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0280572  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3150  acetylornithine aminotransferase  43.05 
 
 
399 aa  288  1e-76  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0533  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  39.52 
 
 
394 aa  287  2e-76  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2493  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  42.52 
 
 
397 aa  287  2.9999999999999996e-76  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3058  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  46.85 
 
 
402 aa  286  2.9999999999999996e-76  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  decreased coverage  0.00328868  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2429  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  40.79 
 
 
393 aa  285  5.999999999999999e-76  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1500  acetylornithine aminotransferase  46.07 
 
 
423 aa  285  1.0000000000000001e-75  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000760659 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0772  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  41.22 
 
 
399 aa  285  1.0000000000000001e-75  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.200689  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3527  acetylornithine aminotransferase  45.43 
 
 
395 aa  284  1.0000000000000001e-75  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.327175  normal  0.819815 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3065  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  44.27 
 
 
401 aa  285  1.0000000000000001e-75  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.110355  normal  0.664029 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0813  acetylornithine aminotransferase  42.09 
 
 
431 aa  283  3.0000000000000004e-75  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.470435  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1102  acetylornithine aminotransferase  44.47 
 
 
394 aa  283  3.0000000000000004e-75  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3311  acetylornithine aminotransferase  44.88 
 
 
390 aa  283  3.0000000000000004e-75  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0246414  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1371  acetylornithine aminotransferase  39.57 
 
 
379 aa  283  5.000000000000001e-75  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1094  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  39.9 
 
 
387 aa  282  5.000000000000001e-75  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2028  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  44.1 
 
 
399 aa  282  6.000000000000001e-75  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.832641  normal  0.501384 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1710  acetylornithine aminotransferase  40.73 
 
 
392 aa  281  1e-74  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0925352  hitchhiker  0.00335003 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6074  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  43.81 
 
 
400 aa  281  1e-74  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.882536  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3158  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  42.67 
 
 
416 aa  281  1e-74  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2872  acetylornithine aminotransferase  41.41 
 
 
397 aa  281  2e-74  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3744  acetylornithine aminotransferase  42.23 
 
 
391 aa  281  2e-74  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000932106 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1114  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  43.15 
 
 
420 aa  280  4e-74  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.922193  normal  0.423827 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3708  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  39.79 
 
 
412 aa  279  7e-74  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.339324  normal  0.0114471 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2826  acetylornithine aminotransferase  38.69 
 
 
386 aa  278  1e-73  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2969  acetylornithine aminotransferase  44.88 
 
 
402 aa  278  1e-73  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.435478  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2912  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  39.53 
 
 
400 aa  278  1e-73  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.386564  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3013  acetylornithine aminotransferase  44.88 
 
 
402 aa  278  1e-73  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.686794 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0406  acetylornithine aminotransferase  41.11 
 
 
388 aa  277  2e-73  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0570  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  41.11 
 
 
388 aa  277  2e-73  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2054  acetylornithine aminotransferase  46.49 
 
 
403 aa  276  3e-73  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.307045  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2414  acetylornithine aminotransferase  43.05 
 
 
396 aa  276  3e-73  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_21710  acetylornithine/succinylornithine aminotransferase  44.59 
 
 
419 aa  276  4e-73  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2984  acetylornithine aminotransferase  44.09 
 
 
402 aa  276  4e-73  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0590766 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2154  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  41.84 
 
 
401 aa  276  4e-73  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00000952275  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1851  acetylornithine aminotransferase  42.06 
 
 
394 aa  276  5e-73  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3962  acetylornithine aminotransferase  38.69 
 
 
386 aa  275  1.0000000000000001e-72  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00766837  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3033  acetylornithine aminotransferase  42.47 
 
 
390 aa  275  1.0000000000000001e-72  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.850335  normal  0.390329 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3730  acetylornithine aminotransferase  40.31 
 
 
427 aa  274  1.0000000000000001e-72  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000174283  normal  0.451197 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0739  acetylornithine aminotransferase  41.29 
 
 
386 aa  275  1.0000000000000001e-72  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.791606  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22300  acetylornithine/succinylornithine aminotransferase  45.04 
 
 
425 aa  275  1.0000000000000001e-72  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.271521  normal  0.79569 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1596  acetylornithine aminotransferase  42.63 
 
 
386 aa  274  2.0000000000000002e-72  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3612  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  43.01 
 
 
382 aa  274  2.0000000000000002e-72  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.98573  normal  0.143334 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2888  acetylornithine aminotransferase  43.21 
 
 
397 aa  274  2.0000000000000002e-72  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0887768  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4452  4-aminobutyrate aminotransferase  41 
 
 
441 aa  273  2.0000000000000002e-72  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4200  acetylornithine aminotransferase  38.69 
 
 
386 aa  273  3e-72  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02850  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  40 
 
 
399 aa  273  3e-72  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.0000577952  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11673  acetylornithine aminotransferase  44.96 
 
 
400 aa  273  3e-72  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000327992  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0637  acetylornithine aminotransferase  40.05 
 
 
418 aa  273  4.0000000000000004e-72  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00130856  normal  0.274942 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3572  acetylornithine aminotransferase  40.9 
 
 
404 aa  273  5.000000000000001e-72  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.331421 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1499  acetylornithine aminotransferase  43.67 
 
 
426 aa  272  6e-72  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0566  4-aminobutyrate aminotransferase  40.19 
 
 
428 aa  272  8.000000000000001e-72  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2686  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  43.32 
 
 
402 aa  271  1e-71  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0960288 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>