More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_2838 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013441  Gbro_2838  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  100 
 
 		 393 aa  781    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0375409  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4128  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  67.53 
 
 		 396 aa  502  1e-141  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0278283  decreased coverage  0.00000134579 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3311  acetylornithine aminotransferase  65.22 
 
 		 390 aa  503  1e-141  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0246414  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3527  acetylornithine aminotransferase  65.37 
 
 		 395 aa  500  1e-140  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.327175  normal  0.819815 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2969  acetylornithine aminotransferase  64.68 
 
 		 402 aa  494  9.999999999999999e-139  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.435478  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3013  acetylornithine aminotransferase  64.68 
 
 		 402 aa  494  9.999999999999999e-139  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.686794 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2984  acetylornithine aminotransferase  64.68 
 
 		 402 aa  486  1e-136  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0590766 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11673  acetylornithine aminotransferase  65.3 
 
 		 400 aa  474  1e-132  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000327992  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5468  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  60.26 
 
 		 436 aa  459  9.999999999999999e-129  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0529885 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25600  acetylornithine aminotransferase  64.43 
 
 		 395 aa  460  9.999999999999999e-129  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5453  acetylornithine aminotransferase  65.89 
 
 		 387 aa  456  1e-127  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0392628  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3158  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  62.09 
 
 		 416 aa  454  1.0000000000000001e-126  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2028  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  60.36 
 
 		 399 aa  449  1e-125  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.832641  normal  0.501384 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2400  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  62.98 
 
 		 393 aa  445  1.0000000000000001e-124  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1740  acetylornithine aminotransferase  58.02 
 
 		 414 aa  438  9.999999999999999e-123  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00212917 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3025  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  61.03 
 
 		 393 aa  436  1e-121  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.048422  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3172  acetylornithine aminotransferase  58.63 
 
 		 444 aa  434  1e-120  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.22064  normal  0.239102 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1891  acetylornithine aminotransferase  65.5 
 
 		 429 aa  430  1e-119  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.177986 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2154  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  56.39 
 
 		 401 aa  425  1e-118  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00000952275  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6074  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  59.9 
 
 		 400 aa  416  9.999999999999999e-116  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.882536  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3065  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  56.78 
 
 		 401 aa  416  9.999999999999999e-116  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.110355  normal  0.664029 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1884  acetylornithine aminotransferase  66.04 
 
 		 429 aa  416  9.999999999999999e-116  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0524658  normal  0.0363552 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2054  acetylornithine aminotransferase  57.25 
 
 		 403 aa  401  9.999999999999999e-111  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.307045  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_21710  acetylornithine/succinylornithine aminotransferase  56.63 
 
 		 419 aa  397  1e-109  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22300  acetylornithine/succinylornithine aminotransferase  57.88 
 
 		 425 aa  396  1e-109  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.271521  normal  0.79569 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1260  acetylornithine aminotransferase  55.73 
 
 		 399 aa  393  1e-108  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.161601 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3058  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  55.19 
 
 		 402 aa  388  1e-107  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  decreased coverage  0.00328868  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2471  acetylornithine aminotransferase  59.54 
 
 		 411 aa  390  1e-107  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2370  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  55.44 
 
 		 425 aa  377  1e-103  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0163259 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1500  acetylornithine aminotransferase  54.48 
 
 		 423 aa  375  1e-103  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000760659 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1114  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  51.15 
 
 		 420 aa  370  1e-101  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.922193  normal  0.423827 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1499  acetylornithine aminotransferase  51.99 
 
 		 426 aa  371  1e-101  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1330  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  55.87 
 
 		 430 aa  362  9e-99  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0110567  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_14390  acetylornithine/succinylornithine aminotransferase  53.14 
 
 		 428 aa  361  1e-98  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1644  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  54.29 
 
 		 442 aa  355  6.999999999999999e-97  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2686  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  51.46 
 
 		 402 aa  352  8.999999999999999e-96  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0960288 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2440  acetylornithine aminotransferase  46.35 
 
 		 388 aa  343  2.9999999999999997e-93  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.493949  normal  0.0446911 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0226  acetylornithine aminotransferase  47.57 
 
 		 396 aa  341  1e-92  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2079  acetylornithine aminotransferase  47.67 
 
 		 391 aa  338  9.999999999999999e-92  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3741  acetylornithine aminotransferase  45.78 
 
 		 397 aa  338  9.999999999999999e-92  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2464  acetylornithine aminotransferase  48.58 
 
 		 392 aa  337  1.9999999999999998e-91  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2878  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  50.93 
 
 		 401 aa  337  1.9999999999999998e-91  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.675543  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3636  acetylornithine aminotransferase  45.01 
 
 		 397 aa  337  2.9999999999999997e-91  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2692  acetylornithine aminotransferase  50.93 
 
 		 401 aa  336  3.9999999999999995e-91  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0151  acetylornithine aminotransferase  46.35 
 
 		 399 aa  335  7e-91  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2204  acetylornithine aminotransferase  47.55 
 
 		 390 aa  334  1e-90  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2785  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  50.66 
 
 		 401 aa  334  1e-90  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1698  acetylornithine aminotransferase  45.43 
 
 		 394 aa  333  4e-90  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2493  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  46.98 
 
 		 397 aa  331  1e-89  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1710  acetylornithine aminotransferase  48.44 
 
 		 392 aa  328  1.0000000000000001e-88  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0925352  hitchhiker  0.00335003 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2414  acetylornithine aminotransferase  46.46 
 
 		 396 aa  327  3e-88  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1566  acetylornithine aminotransferase  44.21 
 
 		 395 aa  326  5e-88  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0871  acetylornithine aminotransferase  47.21 
 
 		 403 aa  325  9e-88  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0204  acetylornithine aminotransferase  46.37 
 
 		 399 aa  325  9e-88  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000412684 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0353  acetylornithine aminotransferase  42.82 
 
 		 395 aa  323  2e-87  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00220895 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1830  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  47.71 
 
 		 395 aa  321  9.999999999999999e-87  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.991221  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1069  acetylornithine aminotransferase  42.97 
 
 		 398 aa  321  1.9999999999999998e-86  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00131217  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0533  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  43.6 
 
 		 394 aa  320  3e-86  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0660  acetylornithine aminotransferase  43.67 
 
 		 394 aa  319  6e-86  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0342  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  47.45 
 
 		 417 aa  319  6e-86  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3173  acetylornithine aminotransferase  45.8 
 
 		 398 aa  319  6e-86  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.324258  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1851  acetylornithine aminotransferase  51.5 
 
 		 394 aa  318  9e-86  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2912  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  40.55 
 
 		 400 aa  318  1e-85  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.386564  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2287  acetylornithine aminotransferase  46.79 
 
 		 402 aa  318  1e-85  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.194315 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1164  acetylornithine aminotransferase  47.03 
 
 		 398 aa  318  1e-85  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.581434  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0569  acetylornithine aminotransferase  45.74 
 
 		 400 aa  316  5e-85  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.160273  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0274  acetylornithine aminotransferase  45.14 
 
 		 396 aa  315  8e-85  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.110157  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1258  acetylornithine aminotransferase  43.24 
 
 		 398 aa  314  1.9999999999999998e-84  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00185503  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1041  acetylornithine aminotransferase  42.46 
 
 		 398 aa  314  1.9999999999999998e-84  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0101251  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0906  acetylornithine aminotransferase  46.7 
 
 		 402 aa  314  1.9999999999999998e-84  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0483  acetylornithine aminotransferase  43.16 
 
 		 395 aa  314  1.9999999999999998e-84  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0946  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  45.74 
 
 		 398 aa  312  6.999999999999999e-84  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.104291  normal  0.0999204 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0395  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  46.72 
 
 		 413 aa  311  2e-83  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.538676 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1901  acetylornithine aminotransferase  46.07 
 
 		 400 aa  310  2.9999999999999997e-83  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.133726  normal  0.687258 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3150  acetylornithine aminotransferase  44.5 
 
 		 399 aa  310  2.9999999999999997e-83  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2121  acetylornithine aminotransferase  45.71 
 
 		 404 aa  309  6.999999999999999e-83  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  decreased coverage  0.00994118  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1041  acetylornithine aminotransferase  44.96 
 
 		 390 aa  308  9e-83  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.370932  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3003  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  43.67 
 
 		 427 aa  308  1.0000000000000001e-82  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0842  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  44.67 
 
 		 399 aa  308  1.0000000000000001e-82  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0215856 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2618  acetylornithine aminotransferase  44.5 
 
 		 400 aa  307  2.0000000000000002e-82  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00459682  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1102  acetylornithine aminotransferase  49.46 
 
 		 394 aa  307  3e-82  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2013  acetylornithine aminotransferase  41.21 
 
 		 418 aa  305  9.000000000000001e-82  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.152714 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_34500  bifunctional N-succinyldiaminopimelate-aminotransferase/ acetylornithine transaminase protein  45.01 
 
 		 406 aa  305  9.000000000000001e-82  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1986  acetylornithine aminotransferase  41.21 
 
 		 418 aa  305  1.0000000000000001e-81  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2358  acetylornithine aminotransferase  44.76 
 
 		 400 aa  305  1.0000000000000001e-81  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.284538  normal  0.840689 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2288  acetylornithine and succinylornithine aminotransferases  41.6 
 
 		 396 aa  304  2.0000000000000002e-81  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.37355  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0772  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  41.48 
 
 		 399 aa  304  2.0000000000000002e-81  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.200689  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0982  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  43.54 
 
 		 410 aa  303  3.0000000000000004e-81  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3708  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  43.91 
 
 		 412 aa  303  3.0000000000000004e-81  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.339324  normal  0.0114471 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02850  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  42.51 
 
 		 399 aa  303  4.0000000000000003e-81  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.0000577952  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1866  acetylornithine aminotransferase  42.05 
 
 		 400 aa  303  4.0000000000000003e-81  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0426  acetylornithine aminotransferase  40.47 
 
 		 396 aa  302  6.000000000000001e-81  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0269327  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4636  acetylornithine aminotransferase  45.6 
 
 		 395 aa  302  7.000000000000001e-81  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.621133  normal  0.175641 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5154  acetylornithine aminotransferase  40.9 
 
 		 426 aa  302  8.000000000000001e-81  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000762221 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0637  acetylornithine aminotransferase  44.1 
 
 		 418 aa  302  8.000000000000001e-81  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00130856  normal  0.274942 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1224  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  44.39 
 
 		 399 aa  301  9e-81  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.803293  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2179  acetylornithine aminotransferase  44.68 
 
 		 398 aa  301  1e-80  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.569965  normal  0.442274 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2649  acetylornithine aminotransferase  42.75 
 
 		 423 aa  301  1e-80  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.46775  normal  0.4632 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2872  acetylornithine aminotransferase  42.89 
 
 		 397 aa  300  2e-80  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1784  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  44.88 
 
 		 385 aa  300  2e-80  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.74918  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>