More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_5453 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_5453  acetylornithine aminotransferase  100 
 
 		 387 aa  768    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0392628  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25600  acetylornithine aminotransferase  74.22 
 
 		 395 aa  543  1e-153  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2838  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  65.89 
 
 		 393 aa  496  1e-139  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0375409  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3527  acetylornithine aminotransferase  63.45 
 
 		 395 aa  477  1e-133  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.327175  normal  0.819815 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3311  acetylornithine aminotransferase  62.4 
 
 		 390 aa  470  1.0000000000000001e-131  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0246414  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5468  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  60.52 
 
 		 436 aa  464  1e-129  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0529885 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11673  acetylornithine aminotransferase  64.49 
 
 		 400 aa  463  1e-129  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000327992  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2969  acetylornithine aminotransferase  61.5 
 
 		 402 aa  459  9.999999999999999e-129  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.435478  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3013  acetylornithine aminotransferase  61.5 
 
 		 402 aa  459  9.999999999999999e-129  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.686794 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2984  acetylornithine aminotransferase  61.5 
 
 		 402 aa  454  1.0000000000000001e-126  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0590766 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3172  acetylornithine aminotransferase  60.52 
 
 		 444 aa  451  1e-125  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.22064  normal  0.239102 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3158  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  61.6 
 
 		 416 aa  449  1e-125  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1740  acetylornithine aminotransferase  60.32 
 
 		 414 aa  447  1.0000000000000001e-124  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00212917 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4128  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  61.36 
 
 		 396 aa  446  1.0000000000000001e-124  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0278283  decreased coverage  0.00000134579 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1891  acetylornithine aminotransferase  67.49 
 
 		 429 aa  430  1e-119  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.177986 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2400  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  60.88 
 
 		 393 aa  429  1e-119  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2028  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  58.76 
 
 		 399 aa  425  1e-118  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.832641  normal  0.501384 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3065  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  57.47 
 
 		 401 aa  421  1e-117  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.110355  normal  0.664029 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1884  acetylornithine aminotransferase  68.13 
 
 		 429 aa  419  1e-116  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0524658  normal  0.0363552 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3025  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  59.69 
 
 		 393 aa  413  1e-114  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.048422  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2154  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  54.43 
 
 		 401 aa  405  1.0000000000000001e-112  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00000952275  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1260  acetylornithine aminotransferase  54.43 
 
 		 399 aa  404  1e-111  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.161601 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22300  acetylornithine/succinylornithine aminotransferase  57.11 
 
 		 425 aa  393  1e-108  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.271521  normal  0.79569 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6074  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  55.81 
 
 		 400 aa  387  1e-106  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.882536  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2054  acetylornithine aminotransferase  54.52 
 
 		 403 aa  375  1e-103  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.307045  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_21710  acetylornithine/succinylornithine aminotransferase  53.23 
 
 		 419 aa  376  1e-103  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1500  acetylornithine aminotransferase  52.05 
 
 		 423 aa  371  1e-102  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000760659 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1114  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  50 
 
 		 420 aa  370  1e-101  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.922193  normal  0.423827 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2370  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  56.23 
 
 		 425 aa  370  1e-101  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0163259 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2471  acetylornithine aminotransferase  59.9 
 
 		 411 aa  370  1e-101  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1499  acetylornithine aminotransferase  50.88 
 
 		 426 aa  367  1e-100  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_14390  acetylornithine/succinylornithine aminotransferase  52.08 
 
 		 428 aa  361  1e-98  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1330  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  55.21 
 
 		 430 aa  359  5e-98  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0110567  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3058  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  51.42 
 
 		 402 aa  355  6.999999999999999e-97  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  decreased coverage  0.00328868  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2464  acetylornithine aminotransferase  47.93 
 
 		 392 aa  342  9e-93  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1644  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  54.35 
 
 		 442 aa  336  5e-91  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2686  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  49.61 
 
 		 402 aa  335  9e-91  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0960288 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2493  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  46.46 
 
 		 397 aa  330  2e-89  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1258  acetylornithine aminotransferase  43.37 
 
 		 398 aa  330  3e-89  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00185503  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1710  acetylornithine aminotransferase  46.21 
 
 		 392 aa  325  7e-88  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0925352  hitchhiker  0.00335003 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2440  acetylornithine aminotransferase  42.23 
 
 		 388 aa  324  1e-87  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.493949  normal  0.0446911 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0946  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  47.44 
 
 		 398 aa  323  3e-87  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.104291  normal  0.0999204 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1830  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  45.11 
 
 		 395 aa  323  3e-87  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.991221  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4636  acetylornithine aminotransferase  45.67 
 
 		 395 aa  322  7e-87  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.621133  normal  0.175641 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0813  acetylornithine aminotransferase  43.3 
 
 		 431 aa  322  7e-87  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.470435  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2878  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  49.23 
 
 		 401 aa  321  9.999999999999999e-87  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.675543  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1069  acetylornithine aminotransferase  42.09 
 
 		 398 aa  321  9.999999999999999e-87  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00131217  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0533  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  43.44 
 
 		 394 aa  319  3.9999999999999996e-86  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2618  acetylornithine aminotransferase  45.64 
 
 		 400 aa  319  6e-86  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00459682  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2785  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  48.97 
 
 		 401 aa  318  7e-86  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1041  acetylornithine aminotransferase  42.35 
 
 		 398 aa  318  9e-86  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0101251  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1566  acetylornithine aminotransferase  41.19 
 
 		 395 aa  317  2e-85  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0982  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  45.97 
 
 		 410 aa  317  2e-85  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1041  acetylornithine aminotransferase  44.97 
 
 		 390 aa  317  2e-85  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.370932  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2692  acetylornithine aminotransferase  48.71 
 
 		 401 aa  317  2e-85  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0353  acetylornithine aminotransferase  41.51 
 
 		 395 aa  317  3e-85  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00220895 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2204  acetylornithine aminotransferase  41.91 
 
 		 390 aa  316  3e-85  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4481  bifunctional N-succinyldiaminopimelate-aminotransferase/ acetylornithine transaminase protein  44.33 
 
 		 406 aa  316  5e-85  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.593317 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2079  acetylornithine aminotransferase  44.94 
 
 		 391 aa  315  7e-85  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3986  bifunctional N-succinyldiaminopimelate-aminotransferase/ acetylornithine transaminase protein  44.59 
 
 		 406 aa  315  8e-85  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2287  acetylornithine aminotransferase  44.47 
 
 		 402 aa  315  9e-85  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.194315 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1434  bifunctional N-succinyldiaminopimelate-aminotransferase/ acetylornithine transaminase protein  44.33 
 
 		 406 aa  315  9.999999999999999e-85  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.845656 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3741  acetylornithine aminotransferase  41.98 
 
 		 397 aa  314  1.9999999999999998e-84  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_34500  bifunctional N-succinyldiaminopimelate-aminotransferase/ acetylornithine transaminase protein  43.27 
 
 		 406 aa  313  1.9999999999999998e-84  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1851  acetylornithine aminotransferase  48.27 
 
 		 394 aa  312  4.999999999999999e-84  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3636  acetylornithine aminotransferase  41.73 
 
 		 397 aa  312  4.999999999999999e-84  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1698  acetylornithine aminotransferase  40.74 
 
 		 394 aa  312  6.999999999999999e-84  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0226  acetylornithine aminotransferase  43.49 
 
 		 396 aa  311  9e-84  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0660  acetylornithine aminotransferase  42.01 
 
 		 394 aa  311  9e-84  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3770  bifunctional N-succinyldiaminopimelate-aminotransferase/ acetylornithine transaminase protein  43.54 
 
 		 406 aa  311  1e-83  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0233516 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2358  acetylornithine aminotransferase  44.85 
 
 		 400 aa  310  2.9999999999999997e-83  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.284538  normal  0.840689 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2912  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  39.75 
 
 		 400 aa  310  2.9999999999999997e-83  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.386564  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3708  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  44.04 
 
 		 412 aa  309  5e-83  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.339324  normal  0.0114471 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2429  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  44.22 
 
 		 393 aa  308  1.0000000000000001e-82  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1040  acetylornithine aminotransferase  42.78 
 
 		 385 aa  308  1.0000000000000001e-82  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.000111021  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0637  acetylornithine aminotransferase  43.15 
 
 		 418 aa  307  2.0000000000000002e-82  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00130856  normal  0.274942 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3277  acetylornithine aminotransferase  46.52 
 
 		 396 aa  307  2.0000000000000002e-82  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0009  acetylornithine transaminase protein  43.19 
 
 		 401 aa  306  3e-82  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1072  acetylornithine aminotransferase  41.71 
 
 		 385 aa  306  4.0000000000000004e-82  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0280572  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0569  acetylornithine aminotransferase  42.19 
 
 		 400 aa  306  5.0000000000000004e-82  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.160273  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0274  acetylornithine aminotransferase  42.71 
 
 		 396 aa  305  6e-82  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.110157  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0395  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  45.8 
 
 		 413 aa  305  8.000000000000001e-82  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.538676 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0638  acetylornithine aminotransferase  41.73 
 
 		 397 aa  305  8.000000000000001e-82  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1346  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  44.5 
 
 		 399 aa  305  1.0000000000000001e-81  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0483  acetylornithine aminotransferase  40.41 
 
 		 395 aa  304  2.0000000000000002e-81  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0151  acetylornithine aminotransferase  43.15 
 
 		 399 aa  303  3.0000000000000004e-81  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2911  bifunctional N-succinyldiaminopimelate-aminotransferase/ acetylornithine transaminase protein  42.49 
 
 		 406 aa  303  3.0000000000000004e-81  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.408245 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3003  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  42.49 
 
 		 427 aa  303  5.000000000000001e-81  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3173  acetylornithine aminotransferase  43.41 
 
 		 398 aa  303  5.000000000000001e-81  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.324258  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0426  acetylornithine aminotransferase  38.07 
 
 		 396 aa  300  2e-80  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0269327  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0342  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  45.33 
 
 		 417 aa  300  3e-80  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1907  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  39.95 
 
 		 387 aa  300  4e-80  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0119007  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2414  acetylornithine aminotransferase  44.42 
 
 		 396 aa  299  5e-80  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1164  acetylornithine aminotransferase  45.29 
 
 		 398 aa  298  9e-80  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.581434  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1901  acetylornithine aminotransferase  44.62 
 
 		 400 aa  298  9e-80  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.133726  normal  0.687258 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0906  acetylornithine aminotransferase  45.03 
 
 		 402 aa  297  2e-79  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0570  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  44.33 
 
 		 388 aa  296  3e-79  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0204  acetylornithine aminotransferase  41.86 
 
 		 399 aa  296  3e-79  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000412684 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0406  acetylornithine aminotransferase  44.33 
 
 		 388 aa  296  3e-79  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5154  acetylornithine aminotransferase  40.69 
 
 		 426 aa  296  4e-79  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000762221 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>