More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_3025 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013757  Gobs_3025  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  100 
 
 
393 aa  769    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.048422  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3311  acetylornithine aminotransferase  63.4 
 
 
390 aa  482  1e-135  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0246414  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3527  acetylornithine aminotransferase  61.64 
 
 
395 aa  472  1e-132  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.327175  normal  0.819815 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2969  acetylornithine aminotransferase  61.82 
 
 
402 aa  449  1e-125  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.435478  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3013  acetylornithine aminotransferase  61.82 
 
 
402 aa  449  1e-125  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.686794 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11673  acetylornithine aminotransferase  63.24 
 
 
400 aa  447  1.0000000000000001e-124  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000327992  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2984  acetylornithine aminotransferase  61.82 
 
 
402 aa  444  1e-123  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0590766 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2838  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  61.03 
 
 
393 aa  443  1e-123  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0375409  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3172  acetylornithine aminotransferase  58.17 
 
 
444 aa  437  1e-121  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.22064  normal  0.239102 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1740  acetylornithine aminotransferase  59.27 
 
 
414 aa  433  1e-120  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00212917 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2028  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  58.93 
 
 
399 aa  433  1e-120  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.832641  normal  0.501384 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4128  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  58.55 
 
 
396 aa  419  1e-116  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0278283  decreased coverage  0.00000134579 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3158  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  57.95 
 
 
416 aa  406  1.0000000000000001e-112  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3065  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  55.47 
 
 
401 aa  407  1.0000000000000001e-112  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.110355  normal  0.664029 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5468  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  55.09 
 
 
436 aa  405  1.0000000000000001e-112  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0529885 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2400  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  59.74 
 
 
393 aa  403  1e-111  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6074  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  56.35 
 
 
400 aa  404  1e-111  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.882536  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1891  acetylornithine aminotransferase  64.5 
 
 
429 aa  404  1e-111  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.177986 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1884  acetylornithine aminotransferase  66.12 
 
 
429 aa  400  9.999999999999999e-111  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0524658  normal  0.0363552 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2054  acetylornithine aminotransferase  54.8 
 
 
403 aa  385  1e-106  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.307045  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25600  acetylornithine aminotransferase  56.01 
 
 
395 aa  385  1e-106  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5453  acetylornithine aminotransferase  59.69 
 
 
387 aa  387  1e-106  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0392628  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2154  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  52.67 
 
 
401 aa  385  1e-106  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00000952275  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1260  acetylornithine aminotransferase  52.79 
 
 
399 aa  381  1e-104  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.161601 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_21710  acetylornithine/succinylornithine aminotransferase  52.44 
 
 
419 aa  360  2e-98  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3058  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  50.77 
 
 
402 aa  351  1e-95  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  decreased coverage  0.00328868  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1500  acetylornithine aminotransferase  50.51 
 
 
423 aa  348  7e-95  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000760659 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22300  acetylornithine/succinylornithine aminotransferase  51.02 
 
 
425 aa  343  4e-93  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.271521  normal  0.79569 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1499  acetylornithine aminotransferase  48.75 
 
 
426 aa  340  2e-92  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2471  acetylornithine aminotransferase  56.88 
 
 
411 aa  340  2.9999999999999998e-92  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2686  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  47.56 
 
 
402 aa  333  3e-90  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0960288 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2493  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  47.78 
 
 
397 aa  327  2.0000000000000001e-88  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2785  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  47.57 
 
 
401 aa  322  8e-87  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1566  acetylornithine aminotransferase  40.46 
 
 
395 aa  321  1.9999999999999998e-86  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2692  acetylornithine aminotransferase  47.57 
 
 
401 aa  320  1.9999999999999998e-86  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2878  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  47.31 
 
 
401 aa  320  1.9999999999999998e-86  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.675543  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1114  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  46.56 
 
 
420 aa  320  3e-86  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.922193  normal  0.423827 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1330  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  51.92 
 
 
430 aa  319  6e-86  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0110567  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2370  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  51.38 
 
 
425 aa  317  2e-85  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.0163259 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1830  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  47.15 
 
 
395 aa  317  2e-85  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.991221  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_14390  acetylornithine/succinylornithine aminotransferase  49.15 
 
 
428 aa  317  2e-85  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2204  acetylornithine aminotransferase  42.59 
 
 
390 aa  317  3e-85  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0353  acetylornithine aminotransferase  40.46 
 
 
395 aa  317  3e-85  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  hitchhiker  0.00220895 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0946  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  45.9 
 
 
398 aa  315  8e-85  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.104291  normal  0.0999204 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0483  acetylornithine aminotransferase  40.2 
 
 
395 aa  315  9e-85  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0274  acetylornithine aminotransferase  43.07 
 
 
396 aa  312  5.999999999999999e-84  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.110157  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0342  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  46.17 
 
 
417 aa  311  9e-84  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2287  acetylornithine aminotransferase  45.71 
 
 
402 aa  311  1e-83  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.194315 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1644  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  51.03 
 
 
442 aa  310  2e-83  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3770  bifunctional N-succinyldiaminopimelate-aminotransferase/ acetylornithine transaminase protein  44.47 
 
 
406 aa  309  5e-83  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0233516 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_34500  bifunctional N-succinyldiaminopimelate-aminotransferase/ acetylornithine transaminase protein  44.62 
 
 
406 aa  308  1.0000000000000001e-82  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0313  acetylornithine aminotransferase  47.89 
 
 
380 aa  307  2.0000000000000002e-82  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2079  acetylornithine aminotransferase  46.74 
 
 
391 aa  307  3e-82  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0871  acetylornithine aminotransferase  43 
 
 
403 aa  306  3e-82  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3986  bifunctional N-succinyldiaminopimelate-aminotransferase/ acetylornithine transaminase protein  44.36 
 
 
406 aa  306  3e-82  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2464  acetylornithine aminotransferase  46.46 
 
 
392 aa  306  4.0000000000000004e-82  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1434  bifunctional N-succinyldiaminopimelate-aminotransferase/ acetylornithine transaminase protein  44.21 
 
 
406 aa  305  8.000000000000001e-82  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.845656 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4481  bifunctional N-succinyldiaminopimelate-aminotransferase/ acetylornithine transaminase protein  44.21 
 
 
406 aa  305  9.000000000000001e-82  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.593317 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_52720  bifunctional N-succinyldiaminopimelate-aminotransferase/ acetylornithine transaminase protein  43.56 
 
 
406 aa  301  1e-80  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4285  bifunctional N-succinyldiaminopimelate-aminotransferase/ acetylornithine transaminase protein  44.62 
 
 
406 aa  300  4e-80  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4620  bifunctional N-succinyldiaminopimelate-aminotransferase/ acetylornithine transaminase protein  43.95 
 
 
406 aa  299  4e-80  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0426  acetylornithine aminotransferase  37.82 
 
 
396 aa  299  5e-80  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0269327  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2414  acetylornithine aminotransferase  44.7 
 
 
396 aa  299  7e-80  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1698  acetylornithine aminotransferase  41.67 
 
 
394 aa  298  1e-79  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1258  acetylornithine aminotransferase  40.25 
 
 
398 aa  298  1e-79  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00185503  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0813  acetylornithine aminotransferase  43.88 
 
 
431 aa  298  1e-79  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.470435  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2911  bifunctional N-succinyldiaminopimelate-aminotransferase/ acetylornithine transaminase protein  42.53 
 
 
406 aa  298  2e-79  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.408245 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0569  acetylornithine aminotransferase  42 
 
 
400 aa  297  2e-79  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.160273  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0772  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  41.94 
 
 
399 aa  296  3e-79  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.200689  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2288  acetylornithine and succinylornithine aminotransferases  38.11 
 
 
396 aa  296  4e-79  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.37355  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0660  acetylornithine aminotransferase  40.05 
 
 
394 aa  295  7e-79  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1069  acetylornithine aminotransferase  40 
 
 
398 aa  295  8e-79  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00131217  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1832  acetylornithine delta-aminotransferase  44.04 
 
 
405 aa  295  1e-78  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2618  acetylornithine aminotransferase  43.7 
 
 
400 aa  295  1e-78  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00459682  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3565  bifunctional N-succinyldiaminopimelate-aminotransferase/ acetylornithine transaminase protein  43.52 
 
 
405 aa  293  3e-78  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.209353  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4636  acetylornithine aminotransferase  42.46 
 
 
395 aa  293  4e-78  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.621133  normal  0.175641 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0395  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  43.17 
 
 
413 aa  292  7e-78  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.538676 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1346  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  44.91 
 
 
399 aa  291  1e-77  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00079  bifunctional N-succinyldiaminopimelate-aminotransferase/ acetylornithine transaminase protein  40.2 
 
 
403 aa  290  3e-77  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3708  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  43.38 
 
 
412 aa  290  4e-77  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.339324  normal  0.0114471 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0982  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  45.67 
 
 
410 aa  290  4e-77  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1710  acetylornithine aminotransferase  43.86 
 
 
392 aa  289  5.0000000000000004e-77  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0925352  hitchhiker  0.00335003 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2912  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  39.11 
 
 
400 aa  289  5.0000000000000004e-77  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.386564  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1041  acetylornithine aminotransferase  39.49 
 
 
398 aa  289  5.0000000000000004e-77  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0101251  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2872  acetylornithine aminotransferase  41.77 
 
 
397 aa  288  1e-76  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0914  acetylornithine aminotransferase  42.86 
 
 
399 aa  288  1e-76  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0637  acetylornithine aminotransferase  42.17 
 
 
418 aa  285  7e-76  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00130856  normal  0.274942 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02850  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  39.59 
 
 
399 aa  285  7e-76  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.0000577952  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002275  acetylornithine aminotransferase/N-succinyl-L,L-diaminopimelate aminotransferase/succinylornithine transaminase  39.69 
 
 
403 aa  285  9e-76  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1866  acetylornithine aminotransferase  39.1 
 
 
400 aa  285  9e-76  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2358  acetylornithine aminotransferase  43 
 
 
400 aa  285  1.0000000000000001e-75  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.284538  normal  0.840689 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0533  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  39.85 
 
 
394 aa  285  1.0000000000000001e-75  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0226  acetylornithine aminotransferase  41.98 
 
 
396 aa  284  2.0000000000000002e-75  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0063  acetylornithine and succinylornithine aminotransferases  41.88 
 
 
396 aa  284  2.0000000000000002e-75  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.857354  normal  0.372491 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0484  succinylornithine transaminase family  42.75 
 
 
406 aa  283  3.0000000000000004e-75  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.631225  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1851  acetylornithine aminotransferase  45.5 
 
 
394 aa  283  4.0000000000000003e-75  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1164  acetylornithine aminotransferase  42.74 
 
 
398 aa  283  5.000000000000001e-75  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.581434  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0151  acetylornithine aminotransferase  41.96 
 
 
399 aa  282  8.000000000000001e-75  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1094  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  37.89 
 
 
387 aa  281  1e-74  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1901  acetylornithine aminotransferase  42.74 
 
 
400 aa  281  2e-74  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.133726  normal  0.687258 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>