More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_5468 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013131  Caci_5468  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  100 
 
 
436 aa  868    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0529885 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3158  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  69.29 
 
 
416 aa  533  1e-150  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22300  acetylornithine/succinylornithine aminotransferase  62.5 
 
 
425 aa  471  1e-132  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.271521  normal  0.79569 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1500  acetylornithine aminotransferase  61.94 
 
 
423 aa  464  1e-129  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000760659 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4128  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  63.68 
 
 
396 aa  461  9.999999999999999e-129  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0278283  decreased coverage  0.00000134579 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2838  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  60.26 
 
 
393 aa  454  1.0000000000000001e-126  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0375409  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3527  acetylornithine aminotransferase  57.84 
 
 
395 aa  449  1e-125  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.327175  normal  0.819815 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25600  acetylornithine aminotransferase  61.3 
 
 
395 aa  446  1.0000000000000001e-124  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1499  acetylornithine aminotransferase  59.32 
 
 
426 aa  443  1e-123  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11673  acetylornithine aminotransferase  59.33 
 
 
400 aa  441  9.999999999999999e-123  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000327992  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3172  acetylornithine aminotransferase  57.11 
 
 
444 aa  439  9.999999999999999e-123  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.22064  normal  0.239102 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2370  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  62.25 
 
 
425 aa  439  9.999999999999999e-123  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.0163259 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1114  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  57.61 
 
 
420 aa  436  1e-121  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.922193  normal  0.423827 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3311  acetylornithine aminotransferase  56.81 
 
 
390 aa  438  1e-121  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0246414  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1740  acetylornithine aminotransferase  56.22 
 
 
414 aa  433  1e-120  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00212917 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2984  acetylornithine aminotransferase  58.03 
 
 
402 aa  434  1e-120  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0590766 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2969  acetylornithine aminotransferase  57.73 
 
 
402 aa  434  1e-120  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.435478  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3013  acetylornithine aminotransferase  57.73 
 
 
402 aa  434  1e-120  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.686794 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5453  acetylornithine aminotransferase  60.52 
 
 
387 aa  428  1e-119  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0392628  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_21710  acetylornithine/succinylornithine aminotransferase  59.51 
 
 
419 aa  431  1e-119  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1330  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  59.41 
 
 
430 aa  424  1e-117  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0110567  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2471  acetylornithine aminotransferase  60.89 
 
 
411 aa  419  1e-116  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2028  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  54.62 
 
 
399 aa  407  1.0000000000000001e-112  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.832641  normal  0.501384 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1260  acetylornithine aminotransferase  55.38 
 
 
399 aa  406  1.0000000000000001e-112  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.161601 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6074  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  56.09 
 
 
400 aa  402  1e-111  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.882536  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2154  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  53.16 
 
 
401 aa  397  1e-109  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00000952275  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3025  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  55.09 
 
 
393 aa  396  1e-109  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.048422  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2054  acetylornithine aminotransferase  54.39 
 
 
403 aa  394  1e-108  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.307045  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1644  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  56.56 
 
 
442 aa  391  1e-107  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2400  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  56.35 
 
 
393 aa  389  1e-107  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3065  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  52.28 
 
 
401 aa  385  1e-106  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.110355  normal  0.664029 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_14390  acetylornithine/succinylornithine aminotransferase  55.26 
 
 
428 aa  385  1e-105  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3058  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  52.51 
 
 
402 aa  379  1e-104  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  decreased coverage  0.00328868  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1891  acetylornithine aminotransferase  57.95 
 
 
429 aa  377  1e-103  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.177986 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1884  acetylornithine aminotransferase  58.49 
 
 
429 aa  368  1e-100  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0524658  normal  0.0363552 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2464  acetylornithine aminotransferase  48.1 
 
 
392 aa  348  9e-95  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2686  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  50.26 
 
 
402 aa  346  5e-94  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0960288 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0813  acetylornithine aminotransferase  46.81 
 
 
431 aa  342  9e-93  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.470435  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2493  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  46.68 
 
 
397 aa  341  2e-92  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1258  acetylornithine aminotransferase  44.02 
 
 
398 aa  335  1e-90  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00185503  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1041  acetylornithine aminotransferase  44.02 
 
 
398 aa  330  3e-89  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0101251  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1069  acetylornithine aminotransferase  43.51 
 
 
398 aa  327  3e-88  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00131217  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0353  acetylornithine aminotransferase  43.19 
 
 
395 aa  327  3e-88  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  hitchhiker  0.00220895 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0151  acetylornithine aminotransferase  42.86 
 
 
399 aa  323  2e-87  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1566  acetylornithine aminotransferase  43.01 
 
 
395 aa  324  2e-87  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2440  acetylornithine aminotransferase  45.24 
 
 
388 aa  323  4e-87  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.493949  normal  0.0446911 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4636  acetylornithine aminotransferase  47.18 
 
 
395 aa  322  7e-87  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.621133  normal  0.175641 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1346  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  45.74 
 
 
399 aa  320  1.9999999999999998e-86  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0871  acetylornithine aminotransferase  43 
 
 
403 aa  320  3e-86  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1830  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  46.11 
 
 
395 aa  320  3.9999999999999996e-86  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.991221  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0660  acetylornithine aminotransferase  42.67 
 
 
394 aa  317  3e-85  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1041  acetylornithine aminotransferase  44.02 
 
 
390 aa  317  3e-85  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.370932  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1698  acetylornithine aminotransferase  42.59 
 
 
394 aa  317  4e-85  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0226  acetylornithine aminotransferase  43.29 
 
 
396 aa  315  9.999999999999999e-85  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2079  acetylornithine aminotransferase  44.82 
 
 
391 aa  314  1.9999999999999998e-84  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0533  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  42.93 
 
 
394 aa  314  1.9999999999999998e-84  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2878  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  48.03 
 
 
401 aa  314  1.9999999999999998e-84  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.675543  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0946  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  45.2 
 
 
398 aa  313  2.9999999999999996e-84  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.104291  normal  0.0999204 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1901  acetylornithine aminotransferase  45.3 
 
 
400 aa  313  2.9999999999999996e-84  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.133726  normal  0.687258 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2618  acetylornithine aminotransferase  44.53 
 
 
400 aa  313  3.9999999999999997e-84  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00459682  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2692  acetylornithine aminotransferase  48.03 
 
 
401 aa  313  3.9999999999999997e-84  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2414  acetylornithine aminotransferase  43.97 
 
 
396 aa  313  4.999999999999999e-84  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3636  acetylornithine aminotransferase  40.81 
 
 
397 aa  312  6.999999999999999e-84  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0274  acetylornithine aminotransferase  42.11 
 
 
396 aa  311  1e-83  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.110157  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2912  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  39.35 
 
 
400 aa  311  1e-83  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.386564  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0842  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  45.59 
 
 
399 aa  311  1e-83  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0215856 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0483  acetylornithine aminotransferase  42.49 
 
 
395 aa  311  2e-83  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2785  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  47.77 
 
 
401 aa  311  2e-83  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1907  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  40.31 
 
 
387 aa  311  2e-83  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0119007  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2358  acetylornithine aminotransferase  45.71 
 
 
400 aa  309  5.9999999999999995e-83  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.284538  normal  0.840689 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0204  acetylornithine aminotransferase  42.42 
 
 
399 aa  309  5.9999999999999995e-83  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000412684 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2287  acetylornithine aminotransferase  42.86 
 
 
402 aa  309  8e-83  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.194315 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0569  acetylornithine aminotransferase  42.93 
 
 
400 aa  308  1.0000000000000001e-82  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.160273  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1784  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  45.73 
 
 
385 aa  306  3e-82  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.74918  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2179  acetylornithine aminotransferase  43.43 
 
 
398 aa  306  3e-82  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.569965  normal  0.442274 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2204  acetylornithine aminotransferase  42.11 
 
 
390 aa  307  3e-82  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3741  acetylornithine aminotransferase  40.55 
 
 
397 aa  306  4.0000000000000004e-82  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3173  acetylornithine aminotransferase  41.92 
 
 
398 aa  306  4.0000000000000004e-82  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.324258  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3708  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  45.76 
 
 
412 aa  306  6e-82  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.339324  normal  0.0114471 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0943  acetylornithine aminotransferase  43.83 
 
 
422 aa  305  7e-82  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0313  acetylornithine aminotransferase  43.95 
 
 
380 aa  304  2.0000000000000002e-81  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1851  acetylornithine aminotransferase  48.04 
 
 
394 aa  304  3.0000000000000004e-81  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1710  acetylornithine aminotransferase  44.72 
 
 
392 aa  303  4.0000000000000003e-81  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0925352  hitchhiker  0.00335003 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3029  acetylornithine aminotransferase  45.38 
 
 
410 aa  302  6.000000000000001e-81  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.51469  normal  0.939431 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0068  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  46.61 
 
 
375 aa  302  7.000000000000001e-81  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.413029  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0982  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  44.39 
 
 
410 aa  301  2e-80  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1164  acetylornithine aminotransferase  43.83 
 
 
398 aa  301  2e-80  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.581434  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0342  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  43.25 
 
 
417 aa  300  4e-80  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3003  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  40.79 
 
 
427 aa  300  5e-80  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0637  acetylornithine aminotransferase  41.5 
 
 
418 aa  300  5e-80  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00130856  normal  0.274942 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00079  bifunctional N-succinyldiaminopimelate-aminotransferase/ acetylornithine transaminase protein  40 
 
 
403 aa  299  6e-80  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3730  acetylornithine aminotransferase  41.91 
 
 
427 aa  299  6e-80  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000174283  normal  0.451197 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002275  acetylornithine aminotransferase/N-succinyl-L,L-diaminopimelate aminotransferase/succinylornithine transaminase  39.75 
 
 
403 aa  299  6e-80  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0426  acetylornithine aminotransferase  38.7 
 
 
396 aa  299  7e-80  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0269327  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3150  acetylornithine aminotransferase  40.45 
 
 
399 aa  299  8e-80  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4481  bifunctional N-succinyldiaminopimelate-aminotransferase/ acetylornithine transaminase protein  42 
 
 
406 aa  298  9e-80  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.593317 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3770  bifunctional N-succinyldiaminopimelate-aminotransferase/ acetylornithine transaminase protein  42.25 
 
 
406 aa  298  1e-79  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0233516 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2429  acetylornithine aminotransferase  44.28 
 
 
398 aa  298  1e-79  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3002  acetylornithine aminotransferase  44.47 
 
 
398 aa  298  1e-79  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.555766  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1434  bifunctional N-succinyldiaminopimelate-aminotransferase/ acetylornithine transaminase protein  42 
 
 
406 aa  298  2e-79  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.845656 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>