More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpal_0068 on replicon NC_011832
Organism: Methanosphaerula palustris E1-9c



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011832  Mpal_0068  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  100 
 
 
375 aa  770    Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.413029  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1901  acetylornithine and succinylornithine aminotransferases  75.34 
 
 
374 aa  595  1e-169  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2138  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  71.85 
 
 
383 aa  568  1e-161  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1129  acetylornithine aminotransferase  63.04 
 
 
375 aa  498  1e-140  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2526  acetylornithine and succinylornithine aminotransferases  66.86 
 
 
356 aa  494  9.999999999999999e-139  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.645919  normal  0.731581 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2204  acetylornithine aminotransferase  50.13 
 
 
390 aa  390  1e-107  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0871  acetylornithine aminotransferase  52.67 
 
 
403 aa  385  1e-106  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0313  acetylornithine aminotransferase  49.07 
 
 
380 aa  329  5.0000000000000004e-89  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0660  acetylornithine aminotransferase  45.79 
 
 
394 aa  326  4.0000000000000003e-88  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1566  acetylornithine aminotransferase  43.16 
 
 
395 aa  314  1.9999999999999998e-84  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0483  acetylornithine aminotransferase  43.54 
 
 
395 aa  312  4.999999999999999e-84  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0353  acetylornithine aminotransferase  43.41 
 
 
395 aa  312  6.999999999999999e-84  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  hitchhiker  0.00220895 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0426  acetylornithine aminotransferase  42.7 
 
 
396 aa  308  1.0000000000000001e-82  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0269327  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0274  acetylornithine aminotransferase  41.73 
 
 
396 aa  306  3e-82  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.110157  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1260  acetylornithine aminotransferase  44.89 
 
 
399 aa  306  5.0000000000000004e-82  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.161601 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2464  acetylornithine aminotransferase  43.98 
 
 
392 aa  303  2.0000000000000002e-81  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2288  acetylornithine and succinylornithine aminotransferases  42.9 
 
 
396 aa  303  4.0000000000000003e-81  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.37355  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1866  acetylornithine aminotransferase  43.9 
 
 
400 aa  301  9e-81  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1698  acetylornithine aminotransferase  42.52 
 
 
394 aa  301  1e-80  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1346  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  43.01 
 
 
399 aa  299  5e-80  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0063  acetylornithine and succinylornithine aminotransferases  42.05 
 
 
396 aa  299  5e-80  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.857354  normal  0.372491 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0813  acetylornithine aminotransferase  43.45 
 
 
431 aa  298  7e-80  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.470435  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1371  acetylornithine aminotransferase  40.98 
 
 
379 aa  298  1e-79  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1041  acetylornithine aminotransferase  43.01 
 
 
390 aa  298  1e-79  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.370932  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1740  acetylornithine aminotransferase  45.79 
 
 
414 aa  297  2e-79  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00212917 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3172  acetylornithine aminotransferase  45.74 
 
 
444 aa  297  2e-79  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.22064  normal  0.239102 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5468  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  46.61 
 
 
436 aa  297  2e-79  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0529885 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1041  acetylornithine aminotransferase  41.9 
 
 
398 aa  298  2e-79  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0101251  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1830  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  43.01 
 
 
395 aa  297  2e-79  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.991221  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0151  acetylornithine aminotransferase  44.1 
 
 
399 aa  296  4e-79  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0640  acetylornithine aminotransferase  40.63 
 
 
403 aa  296  5e-79  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.41902  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2440  acetylornithine aminotransferase  40.77 
 
 
388 aa  295  6e-79  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.493949  normal  0.0446911 
 
 
-
 
NC_002936  DET1258  acetylornithine aminotransferase  41.03 
 
 
398 aa  295  1e-78  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00185503  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4452  4-aminobutyrate aminotransferase  44.3 
 
 
441 aa  294  2e-78  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3150  acetylornithine aminotransferase  45.5 
 
 
399 aa  292  5e-78  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3065  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  45.9 
 
 
401 aa  292  6e-78  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.110355  normal  0.664029 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2287  acetylornithine aminotransferase  41.62 
 
 
402 aa  291  9e-78  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.194315 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1069  acetylornithine aminotransferase  41.71 
 
 
398 aa  291  1e-77  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00131217  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0982  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  42.06 
 
 
410 aa  290  2e-77  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2079  acetylornithine aminotransferase  42.98 
 
 
391 aa  289  4e-77  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0204  acetylornithine aminotransferase  44.1 
 
 
399 aa  289  6e-77  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000412684 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0569  acetylornithine aminotransferase  41.73 
 
 
400 aa  289  6e-77  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.160273  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2618  acetylornithine aminotransferase  42.02 
 
 
400 aa  288  8e-77  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00459682  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3146  aminotransferase class-III  43.62 
 
 
408 aa  288  8e-77  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.733649  normal  0.0499094 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3741  acetylornithine aminotransferase  42.48 
 
 
397 aa  288  1e-76  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3636  acetylornithine aminotransferase  42.48 
 
 
397 aa  288  1e-76  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4636  acetylornithine aminotransferase  41.69 
 
 
395 aa  286  5.999999999999999e-76  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.621133  normal  0.175641 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3173  acetylornithine aminotransferase  42.67 
 
 
398 aa  285  8e-76  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.324258  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3058  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  47.5 
 
 
402 aa  285  1.0000000000000001e-75  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  decreased coverage  0.00328868  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3311  acetylornithine aminotransferase  45.53 
 
 
390 aa  285  1.0000000000000001e-75  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0246414  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0214  4-aminobutyrate aminotransferase  44.36 
 
 
431 aa  284  2.0000000000000002e-75  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.144778  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3744  acetylornithine aminotransferase  43.53 
 
 
391 aa  284  2.0000000000000002e-75  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000932106 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2358  acetylornithine aminotransferase  42.02 
 
 
400 aa  283  4.0000000000000003e-75  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.284538  normal  0.840689 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1710  acetylornithine aminotransferase  42.2 
 
 
392 aa  282  5.000000000000001e-75  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0925352  hitchhiker  0.00335003 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0946  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  40.22 
 
 
398 aa  282  7.000000000000001e-75  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.104291  normal  0.0999204 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0690  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  42.35 
 
 
405 aa  282  8.000000000000001e-75  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6074  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  44.44 
 
 
400 aa  281  1e-74  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.882536  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0226  acetylornithine aminotransferase  41.9 
 
 
396 aa  281  1e-74  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2154  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  43 
 
 
401 aa  280  2e-74  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00000952275  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3158  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  42.67 
 
 
416 aa  280  3e-74  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2028  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  42.71 
 
 
399 aa  280  3e-74  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.832641  normal  0.501384 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2686  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  42.37 
 
 
402 aa  280  4e-74  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0960288 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4200  acetylornithine aminotransferase  38.36 
 
 
386 aa  279  5e-74  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2767  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  42.93 
 
 
403 aa  279  5e-74  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2888  acetylornithine aminotransferase  42.28 
 
 
397 aa  279  6e-74  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0887768  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2493  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  42.66 
 
 
397 aa  279  7e-74  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0772  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  40.6 
 
 
399 aa  278  8e-74  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.200689  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0637  acetylornithine aminotransferase  40.82 
 
 
418 aa  278  1e-73  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00130856  normal  0.274942 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3309  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  41.3 
 
 
393 aa  278  1e-73  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3730  acetylornithine aminotransferase  41.21 
 
 
427 aa  278  1e-73  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000174283  normal  0.451197 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2429  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  40.39 
 
 
393 aa  278  1e-73  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3527  acetylornithine aminotransferase  44.72 
 
 
395 aa  278  1e-73  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.327175  normal  0.819815 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1040  acetylornithine aminotransferase  39.37 
 
 
385 aa  277  2e-73  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.000111021  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1500  acetylornithine aminotransferase  45.98 
 
 
423 aa  277  2e-73  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000760659 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3962  acetylornithine aminotransferase  38.79 
 
 
386 aa  277  3e-73  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00766837  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1842  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  40.41 
 
 
399 aa  276  6e-73  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.716815  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0533  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  38.69 
 
 
394 aa  275  6e-73  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1596  acetylornithine aminotransferase  42.51 
 
 
386 aa  276  6e-73  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1072  acetylornithine aminotransferase  38.85 
 
 
385 aa  275  7e-73  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0280572  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2414  acetylornithine aminotransferase  42.23 
 
 
396 aa  275  8e-73  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3003  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  39.9 
 
 
427 aa  275  1.0000000000000001e-72  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2826  acetylornithine aminotransferase  39.78 
 
 
386 aa  274  1.0000000000000001e-72  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0570  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  40.17 
 
 
388 aa  274  2.0000000000000002e-72  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0342  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  42.47 
 
 
417 aa  274  2.0000000000000002e-72  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0406  acetylornithine aminotransferase  40.17 
 
 
388 aa  274  2.0000000000000002e-72  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2912  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  38.54 
 
 
400 aa  273  3e-72  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.386564  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1102  acetylornithine aminotransferase  41.64 
 
 
394 aa  273  3e-72  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3947  bifunctional N-succinyldiaminopimelate-aminotransferase/ acetylornithine transaminase protein  41.19 
 
 
405 aa  273  3e-72  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3033  acetylornithine aminotransferase  43.7 
 
 
390 aa  273  4.0000000000000004e-72  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.850335  normal  0.390329 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3708  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  36.62 
 
 
412 aa  273  5.000000000000001e-72  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.339324  normal  0.0114471 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1851  acetylornithine aminotransferase  43.61 
 
 
394 aa  273  5.000000000000001e-72  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00079  bifunctional N-succinyldiaminopimelate-aminotransferase/ acetylornithine transaminase protein  40.63 
 
 
403 aa  273  5.000000000000001e-72  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0739  acetylornithine aminotransferase  40.81 
 
 
386 aa  272  8.000000000000001e-72  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.791606  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0163  bifunctional N-succinyldiaminopimelate-aminotransferase/ acetylornithine transaminase protein  41.99 
 
 
401 aa  272  9e-72  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002275  acetylornithine aminotransferase/N-succinyl-L,L-diaminopimelate aminotransferase/succinylornithine transaminase  40.63 
 
 
403 aa  272  9e-72  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2054  acetylornithine aminotransferase  46.09 
 
 
403 aa  271  1e-71  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.307045  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0842  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  41.41 
 
 
399 aa  271  1e-71  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0215856 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0245  bifunctional N-succinyldiaminopimelate-aminotransferase/ acetylornithine transaminase protein  40.93 
 
 
405 aa  271  1e-71  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.110716  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3704  bifunctional N-succinyldiaminopimelate-aminotransferase/ acetylornithine transaminase protein  40.93 
 
 
405 aa  271  1e-71  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1114  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  42.98 
 
 
420 aa  271  2e-71  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.922193  normal  0.423827 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>