More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sde_2440 on replicon NC_007912
Organism: Saccharophagus degradans 2-40



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007912  Sde_2440  acetylornithine aminotransferase  100 
 
 
388 aa  803    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.493949  normal  0.0446911 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1041  acetylornithine aminotransferase  56.85 
 
 
390 aa  468  1.0000000000000001e-131  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.370932  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2079  acetylornithine aminotransferase  53.4 
 
 
391 aa  448  1e-125  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0533  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  54.78 
 
 
394 aa  449  1e-125  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1710  acetylornithine aminotransferase  55.18 
 
 
392 aa  450  1e-125  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0925352  hitchhiker  0.00335003 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2464  acetylornithine aminotransferase  52.88 
 
 
392 aa  437  1e-121  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1102  acetylornithine aminotransferase  54.55 
 
 
394 aa  437  1e-121  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0946  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  52.22 
 
 
398 aa  427  1e-118  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.104291  normal  0.0999204 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2676  acetylornithine aminotransferase  52.45 
 
 
391 aa  426  1e-118  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1346  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  52.08 
 
 
399 aa  419  1e-116  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1164  acetylornithine aminotransferase  52.93 
 
 
398 aa  417  9.999999999999999e-116  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.581434  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2429  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  49.35 
 
 
393 aa  417  9.999999999999999e-116  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1851  acetylornithine aminotransferase  51.42 
 
 
394 aa  412  1e-114  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0982  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  50.52 
 
 
410 aa  414  1e-114  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3572  acetylornithine aminotransferase  51.3 
 
 
404 aa  411  1e-113  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.331421 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3011  acetylornithine aminotransferase  50.65 
 
 
404 aa  401  1e-111  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3002  acetylornithine aminotransferase  50.52 
 
 
398 aa  400  9.999999999999999e-111  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.555766  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2429  acetylornithine aminotransferase  50.52 
 
 
398 aa  400  9.999999999999999e-111  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2179  acetylornithine aminotransferase  49.87 
 
 
398 aa  400  9.999999999999999e-111  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.569965  normal  0.442274 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2287  acetylornithine aminotransferase  49.09 
 
 
402 aa  397  1e-109  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.194315 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1901  acetylornithine aminotransferase  49.74 
 
 
400 aa  397  1e-109  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.133726  normal  0.687258 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0906  acetylornithine aminotransferase  49.21 
 
 
402 aa  395  1e-109  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1423  acetylornithine aminotransferase  48.23 
 
 
398 aa  392  1e-108  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.050105  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp3040  acetylornithine aminotransferase  47.79 
 
 
389 aa  392  1e-108  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2898  acetylornithine aminotransferase  47.79 
 
 
389 aa  392  1e-108  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4636  acetylornithine aminotransferase  49.34 
 
 
395 aa  394  1e-108  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.621133  normal  0.175641 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1405  acetylornithine aminotransferase  49.75 
 
 
393 aa  392  1e-108  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.966648  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3708  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  48.57 
 
 
412 aa  392  1e-108  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.339324  normal  0.0114471 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3033  acetylornithine aminotransferase  49.1 
 
 
390 aa  389  1e-107  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.850335  normal  0.390329 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0406  acetylornithine aminotransferase  49.35 
 
 
388 aa  390  1e-107  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3029  acetylornithine aminotransferase  49.87 
 
 
410 aa  389  1e-107  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.51469  normal  0.939431 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0570  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  49.35 
 
 
388 aa  390  1e-107  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0274  acetylornithine aminotransferase  49.35 
 
 
396 aa  390  1e-107  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.110157  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1057  acetylornithine aminotransferase  48.99 
 
 
393 aa  388  1e-106  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.00148742  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1452  acetylornithine aminotransferase  48.69 
 
 
402 aa  383  1e-105  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2121  acetylornithine aminotransferase  48.71 
 
 
404 aa  382  1e-105  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  decreased coverage  0.00994118  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0342  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  50.66 
 
 
417 aa  376  1e-103  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0569  acetylornithine aminotransferase  50 
 
 
400 aa  374  1e-102  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.160273  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2618  acetylornithine aminotransferase  46.19 
 
 
400 aa  370  1e-101  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00459682  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0727  acetylornithine aminotransferase  49.22 
 
 
389 aa  368  1e-101  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3173  acetylornithine aminotransferase  48.44 
 
 
398 aa  369  1e-101  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.324258  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2358  acetylornithine aminotransferase  46.98 
 
 
400 aa  368  1e-100  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.284538  normal  0.840689 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3636  acetylornithine aminotransferase  48.18 
 
 
397 aa  366  1e-100  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0226  acetylornithine aminotransferase  46.74 
 
 
396 aa  365  1e-100  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0063  acetylornithine and succinylornithine aminotransferases  47.03 
 
 
396 aa  367  1e-100  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.857354  normal  0.372491 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0353  acetylornithine aminotransferase  47.64 
 
 
395 aa  368  1e-100  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  hitchhiker  0.00220895 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3741  acetylornithine aminotransferase  46.88 
 
 
397 aa  363  2e-99  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2493  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  45.97 
 
 
397 aa  362  7.0000000000000005e-99  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3150  acetylornithine aminotransferase  47.56 
 
 
399 aa  362  7.0000000000000005e-99  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1566  acetylornithine aminotransferase  45.81 
 
 
395 aa  358  6e-98  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3744  acetylornithine aminotransferase  48.52 
 
 
391 aa  358  9e-98  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000932106 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0151  acetylornithine aminotransferase  45.05 
 
 
399 aa  358  9.999999999999999e-98  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2912  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  47.8 
 
 
400 aa  358  9.999999999999999e-98  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.386564  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1866  acetylornithine aminotransferase  47.15 
 
 
400 aa  356  5e-97  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2414  acetylornithine aminotransferase  48.03 
 
 
396 aa  355  1e-96  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0204  acetylornithine aminotransferase  45.62 
 
 
399 aa  353  2.9999999999999997e-96  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000412684 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0660  acetylornithine aminotransferase  45.31 
 
 
394 aa  350  3e-95  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02850  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  47.52 
 
 
399 aa  350  3e-95  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.0000577952  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0640  acetylornithine aminotransferase  44.76 
 
 
403 aa  348  1e-94  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.41902  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1094  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  46.23 
 
 
387 aa  346  5e-94  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0483  acetylornithine aminotransferase  45.69 
 
 
395 aa  343  2e-93  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0426  acetylornithine aminotransferase  43.46 
 
 
396 aa  343  4e-93  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0269327  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0637  acetylornithine aminotransferase  44.67 
 
 
418 aa  340  2e-92  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00130856  normal  0.274942 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5154  acetylornithine aminotransferase  44.13 
 
 
426 aa  338  7e-92  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000762221 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0772  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  44.24 
 
 
399 aa  337  1.9999999999999998e-91  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.200689  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1069  acetylornithine aminotransferase  46.7 
 
 
398 aa  337  1.9999999999999998e-91  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00131217  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1698  acetylornithine aminotransferase  46.38 
 
 
394 aa  337  1.9999999999999998e-91  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2013  acetylornithine aminotransferase  43.18 
 
 
418 aa  335  5e-91  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.152714 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1986  acetylornithine aminotransferase  43.18 
 
 
418 aa  335  5e-91  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2838  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  46.35 
 
 
393 aa  334  1e-90  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0375409  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1040  acetylornithine aminotransferase  44.79 
 
 
385 aa  334  1e-90  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.000111021  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1072  acetylornithine aminotransferase  44.27 
 
 
385 aa  333  3e-90  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0280572  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3962  acetylornithine aminotransferase  43.19 
 
 
386 aa  332  5e-90  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00766837  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1258  acetylornithine aminotransferase  46.58 
 
 
398 aa  332  6e-90  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00185503  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3730  acetylornithine aminotransferase  43.69 
 
 
427 aa  332  1e-89  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000174283  normal  0.451197 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2288  acetylornithine and succinylornithine aminotransferases  46.92 
 
 
396 aa  331  1e-89  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.37355  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1041  acetylornithine aminotransferase  45.55 
 
 
398 aa  330  2e-89  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0101251  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2649  acetylornithine aminotransferase  44.13 
 
 
423 aa  330  3e-89  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.46775  normal  0.4632 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2204  acetylornithine aminotransferase  41.8 
 
 
390 aa  330  4e-89  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4200  acetylornithine aminotransferase  42.26 
 
 
386 aa  328  7e-89  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0739  acetylornithine aminotransferase  45.48 
 
 
386 aa  328  9e-89  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.791606  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3003  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  43.67 
 
 
427 aa  328  1.0000000000000001e-88  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2872  acetylornithine aminotransferase  44.77 
 
 
397 aa  327  2.0000000000000001e-88  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4263  acetylornithine aminotransferase  42.67 
 
 
386 aa  327  2.0000000000000001e-88  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0593  acetylornithine aminotransferase  41.62 
 
 
397 aa  327  3e-88  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.642559  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1371  acetylornithine aminotransferase  43.9 
 
 
379 aa  325  6e-88  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1596  acetylornithine aminotransferase  44.13 
 
 
386 aa  325  9e-88  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0871  acetylornithine aminotransferase  43.39 
 
 
403 aa  325  1e-87  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1218  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  43.04 
 
 
402 aa  324  2e-87  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.525687  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6536  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  44.24 
 
 
397 aa  323  2e-87  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.396008  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3884  acetylornithine aminotransferase  43.6 
 
 
386 aa  323  3e-87  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3527  acetylornithine aminotransferase  43.9 
 
 
395 aa  323  4e-87  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.327175  normal  0.819815 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7457  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  44.06 
 
 
397 aa  322  6e-87  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.484657  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3311  acetylornithine aminotransferase  43.9 
 
 
390 aa  322  6e-87  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0246414  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3277  acetylornithine aminotransferase  44.39 
 
 
396 aa  322  7e-87  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3172  acetylornithine aminotransferase  43.26 
 
 
444 aa  322  9.000000000000001e-87  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.22064  normal  0.239102 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1830  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  42.82 
 
 
395 aa  320  3e-86  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.991221  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2526  acetylornithine and succinylornithine aminotransferases  43.94 
 
 
356 aa  319  5e-86  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.645919  normal  0.731581 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4153  acetylornithine aminotransferase  43.34 
 
 
386 aa  318  7.999999999999999e-86  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0481  acetylornithine transaminase protein  43.58 
 
 
402 aa  318  1e-85  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>