More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ava_0214 on replicon NC_007413
Organism: Anabaena variabilis ATCC 29413



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007413  Ava_0214  4-aminobutyrate aminotransferase  100 
 
 
431 aa  887    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.144778  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4452  4-aminobutyrate aminotransferase  75.4 
 
 
441 aa  682    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2649  aminotransferase class-III  54.61 
 
 
441 aa  475  1e-133  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.856293 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0539  4-aminobutyrate aminotransferase  52.64 
 
 
444 aa  452  1.0000000000000001e-126  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3076  Acetylornithine transaminase  52.97 
 
 
432 aa  449  1e-125  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.25771  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0139  aminotransferase class-III  49.1 
 
 
452 aa  445  1.0000000000000001e-124  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000384602  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3989  4-aminobutyrate aminotransferase  51.73 
 
 
461 aa  440  9.999999999999999e-123  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.992424  normal  0.611425 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1738  aminotransferase class-III  48.32 
 
 
465 aa  420  1e-116  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.243066  normal  0.440114 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1796  Acetylornithine transaminase  50.69 
 
 
439 aa  416  9.999999999999999e-116  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.778199  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2019  aminotransferase class-III  48.43 
 
 
465 aa  412  1e-114  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0989  4-aminobutyrate aminotransferase  48.78 
 
 
458 aa  411  1e-113  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.48801  normal  0.0598376 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1464  aminotransferase class-III  51.07 
 
 
448 aa  396  1e-109  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000155661  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1743  4-aminobutyrate aminotransferase  48.17 
 
 
447 aa  394  1e-108  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0510  4-aminobutyrate aminotransferase  48.75 
 
 
441 aa  390  1e-107  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0176  4-aminobutyrate aminotransferase  47.23 
 
 
448 aa  382  1e-105  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.0769086 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0759  4-aminobutyrate aminotransferase  47.49 
 
 
446 aa  384  1e-105  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.174279  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0687  4-aminobutyrate aminotransferase  42.95 
 
 
459 aa  370  1e-101  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  hitchhiker  0.00660505 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3219  aminotransferase class-III  46.59 
 
 
442 aa  344  2e-93  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.338952 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0949  aminotransferase class-III  40.87 
 
 
418 aa  342  8e-93  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3926  aminotransferase class-III  46.74 
 
 
442 aa  342  9e-93  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0275  4-aminobutyrate aminotransferase  41.93 
 
 
417 aa  328  1.0000000000000001e-88  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.0862859 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0566  4-aminobutyrate aminotransferase  43.94 
 
 
428 aa  323  4e-87  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2386  aminotransferase  41.94 
 
 
471 aa  319  6e-86  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.419585  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2755  4-aminobutyrate aminotransferase  39.26 
 
 
448 aa  316  5e-85  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1957  4-aminobutyrate aminotransferase  42.48 
 
 
427 aa  316  6e-85  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0151  acetylornithine aminotransferase  42.27 
 
 
399 aa  306  5.0000000000000004e-82  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0700  aminotransferase class-III  44.58 
 
 
421 aa  306  6e-82  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0660  acetylornithine aminotransferase  40.49 
 
 
394 aa  305  8.000000000000001e-82  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2754  4-aminobutyrate aminotransferase  42.17 
 
 
445 aa  305  9.000000000000001e-82  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2400  4-aminobutyrate aminotransferase  39.71 
 
 
430 aa  304  2.0000000000000002e-81  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.681516  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2245  4-aminobutyrate aminotransferase  39.02 
 
 
441 aa  303  4.0000000000000003e-81  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.120834  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2913  4-aminobutyrate aminotransferase  41.49 
 
 
434 aa  301  1e-80  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.976227 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0226  acetylornithine aminotransferase  40.96 
 
 
396 aa  300  2e-80  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0357  4-aminobutyrate aminotransferase  36.95 
 
 
478 aa  298  9e-80  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0399  4-aminobutyrate aminotransferase  37.27 
 
 
454 aa  298  1e-79  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0326575  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0297  4-aminobutyrate aminotransferase  37.04 
 
 
454 aa  298  1e-79  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0354  4-aminobutyrate aminotransferase  36.95 
 
 
468 aa  297  2e-79  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0293  4-aminobutyrate aminotransferase  36.95 
 
 
454 aa  298  2e-79  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0315  4-aminobutyrate aminotransferase  39.49 
 
 
440 aa  297  2e-79  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3150  acetylornithine aminotransferase  41.89 
 
 
399 aa  298  2e-79  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0310  4-aminobutyrate aminotransferase  37.04 
 
 
454 aa  297  3e-79  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0325  4-aminobutyrate aminotransferase  37.04 
 
 
454 aa  297  3e-79  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0305  4-aminobutyrate aminotransferase  36.81 
 
 
454 aa  296  7e-79  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0204  acetylornithine aminotransferase  40.53 
 
 
399 aa  295  1e-78  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000412684 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4758  Acetylornithine transaminase  41.73 
 
 
418 aa  293  3e-78  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.569005 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2287  acetylornithine aminotransferase  41.02 
 
 
402 aa  294  3e-78  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.194315 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0371  4-aminobutyrate aminotransferase  36.49 
 
 
479 aa  293  3e-78  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3741  acetylornithine aminotransferase  40.05 
 
 
397 aa  293  3e-78  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2313  4-aminobutyrate aminotransferase  38.01 
 
 
446 aa  293  4e-78  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.233271  normal  0.897192 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2274  4-aminobutyrate aminotransferase  38.01 
 
 
446 aa  293  4e-78  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2321  4-aminobutyrate aminotransferase  38.01 
 
 
446 aa  293  4e-78  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.42867  normal  0.490264 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0303  4-aminobutyrate aminotransferase  36.57 
 
 
454 aa  293  5e-78  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3636  acetylornithine aminotransferase  39.95 
 
 
397 aa  293  6e-78  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0637  acetylornithine aminotransferase  40.79 
 
 
418 aa  291  1e-77  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00130856  normal  0.274942 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2581  4-aminobutyrate aminotransferase  38.69 
 
 
446 aa  291  2e-77  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.120886  normal  0.564644 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4949  4-aminobutyrate aminotransferase  36.26 
 
 
454 aa  290  4e-77  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1618  4-aminobutyrate aminotransferase  40.92 
 
 
420 aa  290  4e-77  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.346531  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4167  4-aminobutyrate aminotransferase  40.5 
 
 
434 aa  289  6e-77  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.130001  normal  0.207789 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0491  aminotransferase  40.29 
 
 
427 aa  288  9e-77  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.809579 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0119  4-aminobutyrate aminotransferase  40.53 
 
 
438 aa  288  1e-76  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30190  aminotransferase  40.98 
 
 
419 aa  288  1e-76  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.168399  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3173  acetylornithine aminotransferase  41.12 
 
 
398 aa  288  1e-76  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.324258  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1830  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  40.05 
 
 
395 aa  285  1.0000000000000001e-75  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.991221  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1291  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  39.95 
 
 
393 aa  284  2.0000000000000002e-75  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0338748 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2210  acetylornithine transaminase  41.5 
 
 
419 aa  284  2.0000000000000002e-75  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3862  4-aminobutyrate aminotransferase  41.52 
 
 
427 aa  283  3.0000000000000004e-75  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.612157 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0068  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  44.36 
 
 
375 aa  284  3.0000000000000004e-75  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.413029  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2493  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  38.69 
 
 
397 aa  283  4.0000000000000003e-75  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1757  aminotransferase  40.89 
 
 
425 aa  283  6.000000000000001e-75  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.744583  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1916  Acetylornithine transaminase  41.4 
 
 
417 aa  281  1e-74  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3146  aminotransferase class-III  43.49 
 
 
408 aa  281  1e-74  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.733649  normal  0.0499094 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1910  4-aminobutyrate aminotransferase  39.09 
 
 
426 aa  281  2e-74  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.692445  normal  0.29202 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0809  4-aminobutyrate aminotransferase  36.78 
 
 
419 aa  279  7e-74  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.615332  normal  0.0671712 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2138  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  41.54 
 
 
383 aa  279  9e-74  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1021  4-aminobutyrate aminotransferase  38.39 
 
 
426 aa  278  1e-73  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2797  4-aminobutyrate aminotransferase  38.39 
 
 
426 aa  278  1e-73  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1044  4-aminobutyrate aminotransferase  38.39 
 
 
426 aa  278  1e-73  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0819  4-aminobutyrate aminotransferase  36.78 
 
 
446 aa  278  1e-73  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.798552  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0827  aminotransferase class-III  41.26 
 
 
422 aa  278  1e-73  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4851  4-aminobutyrate aminotransferase  39.57 
 
 
430 aa  277  2e-73  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1566  acetylornithine aminotransferase  38.35 
 
 
395 aa  278  2e-73  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3904  4-aminobutyrate aminotransferase  38.39 
 
 
426 aa  278  2e-73  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.888156 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02518  4-aminobutyrate aminotransferase  38.39 
 
 
426 aa  277  3e-73  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0274  acetylornithine aminotransferase  39.65 
 
 
396 aa  277  3e-73  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.110157  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02482  hypothetical protein  38.39 
 
 
426 aa  277  3e-73  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0426  acetylornithine aminotransferase  37.5 
 
 
396 aa  277  3e-73  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0269327  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1820  4-aminobutyrate transaminase  40.56 
 
 
421 aa  276  4e-73  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.144249 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4711  4-aminobutyrate aminotransferase  41.12 
 
 
446 aa  276  4e-73  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3950  aminotransferase class-III  36.96 
 
 
452 aa  276  5e-73  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2626  4-aminobutyrate aminotransferase  34.19 
 
 
445 aa  276  6e-73  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.805613  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1069  acetylornithine aminotransferase  38.78 
 
 
398 aa  276  6e-73  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00131217  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0280  4-aminobutyrate aminotransferase  40.61 
 
 
429 aa  276  6e-73  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.969383  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2680  4-aminobutyrate aminotransferase  34.19 
 
 
445 aa  276  6e-73  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2649  acetylornithine aminotransferase  39.7 
 
 
423 aa  276  6e-73  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.46775  normal  0.4632 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2782  4-aminobutyrate aminotransferase  38.39 
 
 
426 aa  276  7e-73  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.480055 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1534  4-aminobutyrate aminotransferase  37.7 
 
 
453 aa  276  7e-73  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.46092  normal  0.55252 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2942  4-aminobutyrate aminotransferase  38.15 
 
 
426 aa  276  7e-73  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3721  4-aminobutyrate aminotransferase  41.62 
 
 
426 aa  275  8e-73  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5241  4-aminobutyrate aminotransferase  40.86 
 
 
427 aa  275  8e-73  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2344  4-aminobutyrate aminotransferase  40.66 
 
 
421 aa  275  9e-73  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.00720647  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>