More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rxyl_2888 on replicon NC_008148
Organism: Rubrobacter xylanophilus DSM 9941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008148  Rxyl_2888  acetylornithine aminotransferase  100 
 
 		 397 aa  795    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0887768  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0274  acetylornithine aminotransferase  49.2 
 
 		 396 aa  375  1e-103  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.110157  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2287  acetylornithine aminotransferase  50.64 
 
 		 402 aa  372  1e-102  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.194315 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0009  acetylornithine transaminase protein  50.51 
 
 		 401 aa  373  1e-102  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1698  acetylornithine aminotransferase  47.31 
 
 		 394 aa  370  1e-101  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0660  acetylornithine aminotransferase  46.54 
 
 		 394 aa  365  1e-100  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0772  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  49.73 
 
 		 399 aa  368  1e-100  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.200689  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1830  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  51.97 
 
 		 395 aa  358  8e-98  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.991221  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1072  acetylornithine aminotransferase  49.6 
 
 		 385 aa  355  6.999999999999999e-97  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0280572  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1040  acetylornithine aminotransferase  49.6 
 
 		 385 aa  355  1e-96  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.000111021  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0394  acetylornithine transaminase protein  46.84 
 
 		 403 aa  352  5.9999999999999994e-96  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0301  acetylornithine transaminase protein  46.5 
 
 		 403 aa  352  7e-96  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.171719  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0314  acetylornithine transaminase protein  46.5 
 
 		 403 aa  352  7e-96  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0342  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  48.94 
 
 		 417 aa  352  7e-96  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0798  acetylornithine transaminase protein  48.13 
 
 		 393 aa  351  1e-95  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_19841  acetylornithine aminotransferase  48.96 
 
 		 418 aa  351  1e-95  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0786665 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1094  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  46.01 
 
 		 387 aa  349  4e-95  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3173  acetylornithine aminotransferase  46.7 
 
 		 398 aa  349  5e-95  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.324258  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5259  acetylornithine transaminase protein  47.73 
 
 		 403 aa  349  6e-95  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3744  acetylornithine aminotransferase  50 
 
 		 391 aa  348  8e-95  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000932106 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3141  acetylornithine transaminase protein  47.86 
 
 		 397 aa  348  1e-94  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.759672  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1024  acetylornithine transaminase protein  48.15 
 
 		 395 aa  347  2e-94  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.433962  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2493  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  47.84 
 
 		 397 aa  346  4e-94  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0151  acetylornithine aminotransferase  45.24 
 
 		 399 aa  344  1e-93  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2079  acetylornithine aminotransferase  45.88 
 
 		 391 aa  343  2e-93  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0226  acetylornithine aminotransferase  44.88 
 
 		 396 aa  344  2e-93  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6536  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  49.87 
 
 		 397 aa  342  5e-93  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.396008  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3150  acetylornithine aminotransferase  47.07 
 
 		 399 aa  342  5e-93  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02850  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  46.9 
 
 		 399 aa  342  5e-93  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.0000577952  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3636  acetylornithine aminotransferase  43.93 
 
 		 397 aa  341  1e-92  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0637  acetylornithine aminotransferase  46.88 
 
 		 418 aa  341  1e-92  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00130856  normal  0.274942 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0569  acetylornithine aminotransferase  47.58 
 
 		 400 aa  341  1e-92  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.160273  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1218  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  48 
 
 		 402 aa  340  2.9999999999999998e-92  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.525687  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2288  acetylornithine and succinylornithine aminotransferases  46.13 
 
 		 396 aa  340  2.9999999999999998e-92  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.37355  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0204  acetylornithine aminotransferase  45.24 
 
 		 399 aa  340  4e-92  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000412684 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2464  acetylornithine aminotransferase  48.11 
 
 		 392 aa  339  4e-92  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0665  acetylornithine transaminase protein  46.4 
 
 		 391 aa  340  4e-92  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0127  acetylornithine transaminase protein  48.7 
 
 		 399 aa  338  9.999999999999999e-92  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.383449 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0406  acetylornithine aminotransferase  46.31 
 
 		 388 aa  338  9.999999999999999e-92  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0570  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  46.31 
 
 		 388 aa  338  9.999999999999999e-92  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1359  acetylornithine transaminase protein  45.89 
 
 		 395 aa  338  9.999999999999999e-92  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.592193  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0063  acetylornithine and succinylornithine aminotransferases  47.3 
 
 		 396 aa  337  1.9999999999999998e-91  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.857354  normal  0.372491 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1986  acetylornithine aminotransferase  45.19 
 
 		 418 aa  337  2.9999999999999997e-91  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2013  acetylornithine aminotransferase  45.19 
 
 		 418 aa  337  2.9999999999999997e-91  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.152714 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3741  acetylornithine aminotransferase  43.41 
 
 		 397 aa  336  3.9999999999999995e-91  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0832  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  49.46 
 
 		 400 aa  336  3.9999999999999995e-91  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0150295 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1147  acetylornithine aminotransferase  49.86 
 
 		 394 aa  336  3.9999999999999995e-91  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.109776  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4481  bifunctional N-succinyldiaminopimelate-aminotransferase/ acetylornithine transaminase protein  47.67 
 
 		 406 aa  335  5.999999999999999e-91  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.593317 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7457  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  49.47 
 
 		 397 aa  335  5.999999999999999e-91  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.484657  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0946  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  45.9 
 
 		 398 aa  335  5.999999999999999e-91  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.104291  normal  0.0999204 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1409  acetylornithine transaminase protein  45.48 
 
 		 396 aa  335  7.999999999999999e-91  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.111439  normal  0.291313 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2300  acetylornithine and succinylornithine aminotransferases  48.8 
 
 		 394 aa  335  7.999999999999999e-91  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01717  succinylornithine transaminase, PLP-dependent  47.31 
 
 		 406 aa  334  1e-90  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3105  acetylornithine transaminase protein  46.58 
 
 		 393 aa  335  1e-90  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.546024  normal  0.0590877 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2041  acetylornithine transaminase protein  45.62 
 
 		 390 aa  335  1e-90  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0188318 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3277  acetylornithine aminotransferase  48.81 
 
 		 396 aa  335  1e-90  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01705  hypothetical protein  47.31 
 
 		 406 aa  334  1e-90  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3986  bifunctional N-succinyldiaminopimelate-aminotransferase/ acetylornithine transaminase protein  47.04 
 
 		 406 aa  334  1e-90  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1258  acetylornithine aminotransferase  45.36 
 
 		 398 aa  334  2e-90  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00185503  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1434  bifunctional N-succinyldiaminopimelate-aminotransferase/ acetylornithine transaminase protein  47.67 
 
 		 406 aa  334  2e-90  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.845656 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1831  bifunctional succinylornithine transaminase/acetylornithine transaminase  48.01 
 
 		 406 aa  333  2e-90  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1894  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  48.01 
 
 		 406 aa  333  3e-90  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.433032  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1884  bifunctional succinylornithine transaminase/acetylornithine transaminase  48.01 
 
 		 406 aa  333  3e-90  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00408684 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2466  bifunctional succinylornithine transaminase/acetylornithine transaminase  49.05 
 
 		 406 aa  333  3e-90  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.841609 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1970  bifunctional succinylornithine transaminase/acetylornithine transaminase  48.01 
 
 		 406 aa  333  3e-90  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0487  acetylornithine aminotransferase  44.85 
 
 		 395 aa  333  3e-90  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.251081  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2414  acetylornithine aminotransferase  46.97 
 
 		 396 aa  333  4e-90  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1866  acetylornithine aminotransferase  47.18 
 
 		 400 aa  333  4e-90  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3770  bifunctional N-succinyldiaminopimelate-aminotransferase/ acetylornithine transaminase protein  46.77 
 
 		 406 aa  332  5e-90  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0233516 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0185  acetylornithine transaminase protein  45.34 
 
 		 399 aa  332  5e-90  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.372078 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0353  acetylornithine aminotransferase  45.33 
 
 		 395 aa  332  5e-90  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00220895 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1443  bifunctional succinylornithine transaminase/acetylornithine transaminase  48.01 
 
 		 406 aa  332  6e-90  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.656199 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0481  acetylornithine transaminase protein  47.07 
 
 		 402 aa  332  6e-90  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1995  bifunctional succinylornithine transaminase/acetylornithine transaminase  47.75 
 
 		 406 aa  332  9e-90  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4916  acetylornithine transaminase protein  46.56 
 
 		 405 aa  332  1e-89  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0883749 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3730  acetylornithine aminotransferase  45.83 
 
 		 427 aa  330  3e-89  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000174283  normal  0.451197 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0943  acetylornithine aminotransferase  46.88 
 
 		 422 aa  330  3e-89  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2440  acetylornithine aminotransferase  43.01 
 
 		 388 aa  330  3e-89  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.493949  normal  0.0446911 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0739  acetylornithine aminotransferase  44.59 
 
 		 386 aa  330  3e-89  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.791606  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2318  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  49.47 
 
 		 396 aa  329  5.0000000000000004e-89  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.156448 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5154  acetylornithine aminotransferase  44.64 
 
 		 426 aa  328  7e-89  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000762221 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2649  acetylornithine aminotransferase  44.01 
 
 		 423 aa  328  7e-89  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.46775  normal  0.4632 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00499  bifunctional N-succinyldiaminopimelate-aminotransferase/ acetylornithine transaminase protein  44.19 
 
 		 402 aa  328  1.0000000000000001e-88  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0759  acetylornithine transaminase protein  47.75 
 
 		 403 aa  328  1.0000000000000001e-88  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0803695 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1069  acetylornithine aminotransferase  45.62 
 
 		 398 aa  327  2.0000000000000001e-88  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00131217  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2912  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  42.27 
 
 		 400 aa  327  2.0000000000000001e-88  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.386564  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1596  acetylornithine aminotransferase  46.42 
 
 		 386 aa  327  2.0000000000000001e-88  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0513  acetylornithine transaminase protein  47.07 
 
 		 403 aa  327  3e-88  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.508573 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3962  acetylornithine aminotransferase  44.06 
 
 		 386 aa  327  3e-88  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00766837  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0651  bifunctional N-succinyldiaminopimelate-aminotransferase/ acetylornithine transaminase protein  44.19 
 
 		 401 aa  327  3e-88  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.293343  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1041  acetylornithine aminotransferase  44.95 
 
 		 390 aa  326  5e-88  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.370932  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2541  acetylornithine transaminase protein  48.26 
 
 		 398 aa  325  6e-88  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4200  acetylornithine aminotransferase  45.07 
 
 		 386 aa  325  7e-88  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3003  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  43.49 
 
 		 427 aa  325  7e-88  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1566  acetylornithine aminotransferase  44.53 
 
 		 395 aa  325  9e-88  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4075  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  48.01 
 
 		 396 aa  324  1e-87  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0783  acetylornithine transaminase protein  46.85 
 
 		 407 aa  325  1e-87  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0758378  normal  0.118298 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1696  bifunctional succinylornithine transaminase/acetylornithine transaminase  45 
 
 		 406 aa  325  1e-87  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1290  acetylornithine transaminase protein  42.71 
 
 		 401 aa  324  1e-87  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0640  acetylornithine aminotransferase  44.09 
 
 		 403 aa  325  1e-87  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.41902  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>