More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dshi_0798 on replicon NC_009952
Organism: Dinoroseobacter shibae DFL 12



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009952  Dshi_0798  acetylornithine transaminase protein  100 
 
 
393 aa  791    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0665  acetylornithine transaminase protein  78.74 
 
 
391 aa  626  1e-178  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3105  acetylornithine transaminase protein  72.32 
 
 
393 aa  581  1.0000000000000001e-165  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.546024  normal  0.0590877 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2008  acetylornithine transaminase protein  71.76 
 
 
393 aa  581  1.0000000000000001e-165  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0718  acetylornithine transaminase protein  71.76 
 
 
393 aa  568  1e-161  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.759716  normal  0.261062 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2041  acetylornithine transaminase protein  68.12 
 
 
390 aa  551  1e-156  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.0188318 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1024  acetylornithine transaminase protein  66.75 
 
 
395 aa  541  1e-153  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.433962  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7457  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  59.38 
 
 
397 aa  475  1e-133  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.484657  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6536  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  58.46 
 
 
397 aa  471  1e-132  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.396008  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4075  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  58.82 
 
 
396 aa  471  1.0000000000000001e-131  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4556  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  59.08 
 
 
396 aa  469  1.0000000000000001e-131  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.974298 
 
 
-
 
NC_004310  BR0301  acetylornithine transaminase protein  58.16 
 
 
403 aa  466  9.999999999999999e-131  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.171719  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0394  acetylornithine transaminase protein  58.22 
 
 
403 aa  468  9.999999999999999e-131  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0314  acetylornithine transaminase protein  58.16 
 
 
403 aa  466  9.999999999999999e-131  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4442  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  58.97 
 
 
396 aa  466  9.999999999999999e-131  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.977458  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0185  acetylornithine transaminase protein  56.99 
 
 
399 aa  462  1e-129  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.372078 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0009  acetylornithine transaminase protein  56.67 
 
 
401 aa  462  1e-129  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2318  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  58.97 
 
 
396 aa  456  1e-127  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.156448 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1218  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  57.84 
 
 
402 aa  453  1.0000000000000001e-126  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.525687  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0175  acetylornithine transaminase protein  56.99 
 
 
399 aa  448  1e-125  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0127  acetylornithine transaminase protein  60.37 
 
 
399 aa  450  1e-125  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.383449 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0481  acetylornithine transaminase protein  56.35 
 
 
402 aa  449  1e-125  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0402  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  56.84 
 
 
446 aa  445  1.0000000000000001e-124  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0150  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  54.36 
 
 
405 aa  428  1e-118  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0832  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  53.98 
 
 
400 aa  425  1e-118  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0150295 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2165  acetylornithine transaminase protein  54.2 
 
 
401 aa  424  1e-117  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1290  acetylornithine transaminase protein  50.92 
 
 
401 aa  419  1e-116  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2541  acetylornithine transaminase protein  54.79 
 
 
398 aa  415  9.999999999999999e-116  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3277  acetylornithine aminotransferase  53.44 
 
 
396 aa  414  1e-114  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5259  acetylornithine transaminase protein  50.39 
 
 
403 aa  405  1.0000000000000001e-112  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0759  acetylornithine transaminase protein  52.62 
 
 
403 aa  405  1.0000000000000001e-112  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0803695 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4916  acetylornithine transaminase protein  53.37 
 
 
405 aa  406  1.0000000000000001e-112  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.0883749 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0513  acetylornithine transaminase protein  53.95 
 
 
403 aa  402  1e-111  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.508573 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1147  acetylornithine aminotransferase  53.46 
 
 
394 aa  404  1e-111  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.109776  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1231  acetylornithine transaminase protein  53.54 
 
 
404 aa  400  9.999999999999999e-111  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.0141843 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0783  acetylornithine transaminase protein  51.41 
 
 
407 aa  396  1e-109  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0758378  normal  0.118298 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2300  acetylornithine and succinylornithine aminotransferases  51.52 
 
 
394 aa  397  1e-109  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0895  acetylornithine transaminase protein  50.39 
 
 
403 aa  388  1e-106  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1359  acetylornithine transaminase protein  50.52 
 
 
395 aa  382  1e-105  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.592193  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1409  acetylornithine transaminase protein  50.75 
 
 
396 aa  382  1e-105  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.111439  normal  0.291313 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3141  acetylornithine transaminase protein  50.66 
 
 
397 aa  379  1e-104  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.759672  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0487  acetylornithine aminotransferase  50.25 
 
 
395 aa  375  1e-103  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.251081  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0642  acetylornithine transaminase protein  50.64 
 
 
403 aa  368  1e-101  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0226  acetylornithine aminotransferase  48.94 
 
 
396 aa  360  2e-98  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0176  acetylornithine aminotransferase  55.7 
 
 
313 aa  350  2e-95  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2686  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  48.55 
 
 
402 aa  347  2e-94  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0960288 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2287  acetylornithine aminotransferase  47.11 
 
 
402 aa  347  3e-94  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.194315 
 
 
-
 
NC_002978  WD1283  acetylornithine transaminase protein  44.25 
 
 
391 aa  346  5e-94  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3636  acetylornithine aminotransferase  46.03 
 
 
397 aa  345  5e-94  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3770  bifunctional N-succinyldiaminopimelate-aminotransferase/ acetylornithine transaminase protein  45.27 
 
 
406 aa  344  2e-93  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0233516 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1434  bifunctional N-succinyldiaminopimelate-aminotransferase/ acetylornithine transaminase protein  45.34 
 
 
406 aa  343  2e-93  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.845656 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3741  acetylornithine aminotransferase  45.5 
 
 
397 aa  344  2e-93  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4481  bifunctional N-succinyldiaminopimelate-aminotransferase/ acetylornithine transaminase protein  45.34 
 
 
406 aa  342  5e-93  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.593317 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3986  bifunctional N-succinyldiaminopimelate-aminotransferase/ acetylornithine transaminase protein  45.08 
 
 
406 aa  341  1e-92  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3150  acetylornithine aminotransferase  45.48 
 
 
399 aa  341  2e-92  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0342  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  49.09 
 
 
417 aa  340  2e-92  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2888  acetylornithine aminotransferase  45.91 
 
 
397 aa  340  2e-92  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0887768  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0151  acetylornithine aminotransferase  46.56 
 
 
399 aa  340  2.9999999999999998e-92  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0274  acetylornithine aminotransferase  44.27 
 
 
396 aa  336  2.9999999999999997e-91  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.110157  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3744  acetylornithine aminotransferase  45.93 
 
 
391 aa  336  2.9999999999999997e-91  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000932106 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0660  acetylornithine aminotransferase  44.71 
 
 
394 aa  336  3.9999999999999995e-91  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0772  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  42.93 
 
 
399 aa  336  5e-91  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.200689  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0204  acetylornithine aminotransferase  46.7 
 
 
399 aa  335  7.999999999999999e-91  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000412684 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0637  acetylornithine aminotransferase  46.04 
 
 
418 aa  335  9e-91  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00130856  normal  0.274942 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0739  acetylornithine aminotransferase  43.57 
 
 
386 aa  335  1e-90  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.791606  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2414  acetylornithine aminotransferase  46.79 
 
 
396 aa  333  3e-90  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3173  acetylornithine aminotransferase  45.22 
 
 
398 aa  333  3e-90  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.324258  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1040  acetylornithine aminotransferase  44.09 
 
 
385 aa  332  8e-90  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.000111021  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0886  acetylornithine transaminase protein  43.68 
 
 
392 aa  332  9e-90  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.0996794  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3616  acetylornithine and succinylornithine aminotransferases  43.9 
 
 
403 aa  331  1e-89  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_34500  bifunctional N-succinyldiaminopimelate-aminotransferase/ acetylornithine transaminase protein  44.79 
 
 
406 aa  331  1e-89  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2079  acetylornithine aminotransferase  45.98 
 
 
391 aa  330  2e-89  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0559  acetylornithine transaminase protein  43.01 
 
 
392 aa  331  2e-89  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1072  acetylornithine aminotransferase  43.83 
 
 
385 aa  330  2e-89  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0280572  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0214  acetylornithine transaminase protein  43.86 
 
 
391 aa  330  2e-89  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  hitchhiker  0.000000369674  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1832  acetylornithine delta-aminotransferase  44.3 
 
 
405 aa  330  3e-89  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2911  bifunctional N-succinyldiaminopimelate-aminotransferase/ acetylornithine transaminase protein  44.53 
 
 
406 aa  330  4e-89  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.408245 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4620  bifunctional N-succinyldiaminopimelate-aminotransferase/ acetylornithine transaminase protein  43.52 
 
 
406 aa  329  5.0000000000000004e-89  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2288  acetylornithine and succinylornithine aminotransferases  44.47 
 
 
396 aa  329  6e-89  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.37355  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1866  acetylornithine aminotransferase  45.9 
 
 
400 aa  328  8e-89  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2649  acetylornithine aminotransferase  42.6 
 
 
423 aa  328  9e-89  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.46775  normal  0.4632 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_52720  bifunctional N-succinyldiaminopimelate-aminotransferase/ acetylornithine transaminase protein  43.26 
 
 
406 aa  328  9e-89  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3565  bifunctional N-succinyldiaminopimelate-aminotransferase/ acetylornithine transaminase protein  43.78 
 
 
405 aa  327  2.0000000000000001e-88  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.209353  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0946  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  45.95 
 
 
398 aa  327  3e-88  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.104291  normal  0.0999204 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2493  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  45.45 
 
 
397 aa  325  8.000000000000001e-88  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0943  acetylornithine aminotransferase  45.64 
 
 
422 aa  325  9e-88  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3730  acetylornithine aminotransferase  43.83 
 
 
427 aa  324  1e-87  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000174283  normal  0.451197 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1596  acetylornithine aminotransferase  44.53 
 
 
386 aa  324  1e-87  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1628  bifunctional N-succinyldiaminopimelate-aminotransferase/ acetylornithine transaminase protein  44.3 
 
 
405 aa  323  2e-87  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.325985 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2464  acetylornithine aminotransferase  45.59 
 
 
392 aa  323  4e-87  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0571  bifunctional N-succinyldiaminopimelate-aminotransferase/ acetylornithine transaminase protein  44.1 
 
 
405 aa  322  9.000000000000001e-87  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3754  bifunctional N-succinyldiaminopimelate-aminotransferase/ acetylornithine transaminase protein  44.1 
 
 
405 aa  322  9.000000000000001e-87  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3697  bifunctional N-succinyldiaminopimelate-aminotransferase/ acetylornithine transaminase protein  44.1 
 
 
405 aa  322  9.000000000000001e-87  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2692  acetylornithine aminotransferase  46.7 
 
 
401 aa  322  9.000000000000001e-87  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00079  bifunctional N-succinyldiaminopimelate-aminotransferase/ acetylornithine transaminase protein  43.78 
 
 
403 aa  320  1.9999999999999998e-86  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1830  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  43.78 
 
 
395 aa  321  1.9999999999999998e-86  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.991221  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3880  bifunctional N-succinyldiaminopimelate-aminotransferase/ acetylornithine transaminase protein  43.85 
 
 
405 aa  320  1.9999999999999998e-86  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002275  acetylornithine aminotransferase/N-succinyl-L,L-diaminopimelate aminotransferase/succinylornithine transaminase  44.04 
 
 
403 aa  321  1.9999999999999998e-86  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1784  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  42.78 
 
 
385 aa  320  3e-86  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.74918  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0645  bifunctional N-succinyldiaminopimelate-aminotransferase/ acetylornithine transaminase protein  43.59 
 
 
405 aa  320  3e-86  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>