More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPB_0783 on replicon NC_007778
Organism: Rhodopseudomonas palustris HaA2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007406  Nwi_0513  acetylornithine transaminase protein  80.41 
 
 
403 aa  634    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.508573 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0783  acetylornithine transaminase protein  100 
 
 
407 aa  824    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0758378  normal  0.118298 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4916  acetylornithine transaminase protein  82.84 
 
 
405 aa  665    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.0883749 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0895  acetylornithine transaminase protein  90.3 
 
 
403 aa  728    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5259  acetylornithine transaminase protein  84.58 
 
 
403 aa  708    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0759  acetylornithine transaminase protein  79 
 
 
403 aa  630  1e-179  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0803695 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0642  acetylornithine transaminase protein  79.9 
 
 
403 aa  618  1e-176  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6536  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  65.12 
 
 
397 aa  528  1e-149  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.396008  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7457  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  64.6 
 
 
397 aa  527  1e-148  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.484657  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4075  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  63.59 
 
 
396 aa  513  1e-144  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1218  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  62.73 
 
 
402 aa  511  1e-144  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.525687  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0394  acetylornithine transaminase protein  61.95 
 
 
403 aa  508  1e-143  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4556  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  63.33 
 
 
396 aa  508  1e-143  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.974298 
 
 
-
 
NC_004310  BR0301  acetylornithine transaminase protein  61.89 
 
 
403 aa  505  9.999999999999999e-143  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.171719  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0314  acetylornithine transaminase protein  61.89 
 
 
403 aa  505  9.999999999999999e-143  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4442  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  63.59 
 
 
396 aa  502  1e-141  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.977458  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0402  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  60.52 
 
 
446 aa  499  1e-140  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0009  acetylornithine transaminase protein  62.3 
 
 
401 aa  498  1e-140  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2318  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  64.84 
 
 
396 aa  497  1e-139  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.156448 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0185  acetylornithine transaminase protein  59.55 
 
 
399 aa  495  1e-139  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.372078 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0150  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  60.26 
 
 
405 aa  488  1e-137  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0832  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  60.36 
 
 
400 aa  485  1e-136  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0150295 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0175  acetylornithine transaminase protein  59.8 
 
 
399 aa  484  1e-136  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0481  acetylornithine transaminase protein  59.11 
 
 
402 aa  480  1e-134  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1147  acetylornithine aminotransferase  59.23 
 
 
394 aa  466  9.999999999999999e-131  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.109776  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2300  acetylornithine and succinylornithine aminotransferases  58.78 
 
 
394 aa  466  9.999999999999999e-131  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1290  acetylornithine transaminase protein  55.89 
 
 
401 aa  466  9.999999999999999e-131  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0127  acetylornithine transaminase protein  58.54 
 
 
399 aa  463  1e-129  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.383449 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0487  acetylornithine aminotransferase  55.1 
 
 
395 aa  434  1e-120  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.251081  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1231  acetylornithine transaminase protein  53.55 
 
 
404 aa  426  1e-118  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.0141843 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2041  acetylornithine transaminase protein  52.58 
 
 
390 aa  427  1e-118  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.0188318 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3105  acetylornithine transaminase protein  53.81 
 
 
393 aa  422  1e-117  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.546024  normal  0.0590877 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2008  acetylornithine transaminase protein  52.69 
 
 
393 aa  417  9.999999999999999e-116  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3277  acetylornithine aminotransferase  52.91 
 
 
396 aa  417  9.999999999999999e-116  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1359  acetylornithine transaminase protein  54.5 
 
 
395 aa  414  1e-114  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.592193  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0718  acetylornithine transaminase protein  52.69 
 
 
393 aa  410  1e-113  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.759716  normal  0.261062 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0665  acetylornithine transaminase protein  52.91 
 
 
391 aa  409  1e-113  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1409  acetylornithine transaminase protein  52.6 
 
 
396 aa  407  1.0000000000000001e-112  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.111439  normal  0.291313 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2541  acetylornithine transaminase protein  54.84 
 
 
398 aa  407  1.0000000000000001e-112  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0176  acetylornithine aminotransferase  64.03 
 
 
313 aa  407  1.0000000000000001e-112  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2165  acetylornithine transaminase protein  53.16 
 
 
401 aa  405  1.0000000000000001e-112  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1024  acetylornithine transaminase protein  51.44 
 
 
395 aa  402  1e-111  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.433962  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0798  acetylornithine transaminase protein  52.15 
 
 
393 aa  402  1e-111  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3141  acetylornithine transaminase protein  52.38 
 
 
397 aa  399  9.999999999999999e-111  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.759672  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1283  acetylornithine transaminase protein  49.48 
 
 
391 aa  380  1e-104  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0226  acetylornithine aminotransferase  47.83 
 
 
396 aa  372  1e-102  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3636  acetylornithine aminotransferase  45.9 
 
 
397 aa  360  2e-98  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2414  acetylornithine aminotransferase  49.1 
 
 
396 aa  360  2e-98  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0559  acetylornithine transaminase protein  43.95 
 
 
392 aa  358  9.999999999999999e-98  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3741  acetylornithine aminotransferase  45.38 
 
 
397 aa  358  9.999999999999999e-98  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0214  acetylornithine transaminase protein  45.83 
 
 
391 aa  357  1.9999999999999998e-97  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  hitchhiker  0.000000369674  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2287  acetylornithine aminotransferase  46.9 
 
 
402 aa  357  2.9999999999999997e-97  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.194315 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0274  acetylornithine aminotransferase  45.29 
 
 
396 aa  349  4e-95  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.110157  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0772  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  46.7 
 
 
399 aa  349  5e-95  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.200689  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2493  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  47.51 
 
 
397 aa  349  6e-95  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4582  bifunctional N-succinyldiaminopimelate-aminotransferase/ acetylornithine transaminase protein  45.73 
 
 
405 aa  349  6e-95  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3880  bifunctional N-succinyldiaminopimelate-aminotransferase/ acetylornithine transaminase protein  46.55 
 
 
405 aa  347  2e-94  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3754  bifunctional N-succinyldiaminopimelate-aminotransferase/ acetylornithine transaminase protein  46.55 
 
 
405 aa  347  2e-94  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0571  bifunctional N-succinyldiaminopimelate-aminotransferase/ acetylornithine transaminase protein  46.55 
 
 
405 aa  347  2e-94  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3697  bifunctional N-succinyldiaminopimelate-aminotransferase/ acetylornithine transaminase protein  46.55 
 
 
405 aa  347  2e-94  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0151  acetylornithine aminotransferase  45.15 
 
 
399 aa  347  3e-94  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0645  bifunctional N-succinyldiaminopimelate-aminotransferase/ acetylornithine transaminase protein  46.8 
 
 
405 aa  347  3e-94  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3011  bifunctional N-succinyldiaminopimelate-aminotransferase/ acetylornithine transaminase protein  47.19 
 
 
404 aa  347  3e-94  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3744  acetylornithine aminotransferase  47.63 
 
 
391 aa  346  5e-94  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000932106 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0886  acetylornithine transaminase protein  45.05 
 
 
392 aa  345  6e-94  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.0996794  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1180  bifunctional N-succinyldiaminopimelate-aminotransferase/ acetylornithine transaminase protein  45.69 
 
 
410 aa  345  8e-94  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0611  bifunctional N-succinyldiaminopimelate-aminotransferase/ acetylornithine transaminase protein  46.29 
 
 
405 aa  345  1e-93  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.894863 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3419  bifunctional N-succinyldiaminopimelate-aminotransferase/ acetylornithine transaminase protein  46.29 
 
 
405 aa  345  1e-93  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.103737 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0610  bifunctional N-succinyldiaminopimelate-aminotransferase/ acetylornithine transaminase protein  46.29 
 
 
405 aa  345  1e-93  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.0636462 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0655  bifunctional N-succinyldiaminopimelate-aminotransferase/ acetylornithine transaminase protein  45.83 
 
 
405 aa  344  2e-93  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000579113 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0617  bifunctional N-succinyldiaminopimelate-aminotransferase/ acetylornithine transaminase protein  45.78 
 
 
405 aa  343  2.9999999999999997e-93  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0651  bifunctional N-succinyldiaminopimelate-aminotransferase/ acetylornithine transaminase protein  45.83 
 
 
401 aa  343  2.9999999999999997e-93  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.293343  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0701  bifunctional N-succinyldiaminopimelate-aminotransferase/ acetylornithine transaminase protein  45.43 
 
 
410 aa  343  4e-93  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0520056  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0245  bifunctional N-succinyldiaminopimelate-aminotransferase/ acetylornithine transaminase protein  46.09 
 
 
405 aa  342  5e-93  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.110716  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3704  bifunctional N-succinyldiaminopimelate-aminotransferase/ acetylornithine transaminase protein  46.09 
 
 
405 aa  342  5e-93  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0809  bifunctional N-succinyldiaminopimelate-aminotransferase/ acetylornithine transaminase protein  46.35 
 
 
405 aa  342  7e-93  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000843342 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1566  acetylornithine aminotransferase  43.86 
 
 
395 aa  342  7e-93  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3854  bifunctional N-succinyldiaminopimelate-aminotransferase/ acetylornithine transaminase protein  44.28 
 
 
408 aa  342  8e-93  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1866  acetylornithine aminotransferase  47.45 
 
 
400 aa  342  8e-93  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1157  bifunctional N-succinyldiaminopimelate-aminotransferase/ acetylornithine transaminase protein  45.43 
 
 
410 aa  342  1e-92  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.861166  normal  0.0351204 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00499  bifunctional N-succinyldiaminopimelate-aminotransferase/ acetylornithine transaminase protein  44.53 
 
 
402 aa  341  1e-92  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2079  acetylornithine aminotransferase  49.35 
 
 
391 aa  341  1e-92  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0570  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  50 
 
 
388 aa  341  1e-92  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0406  acetylornithine aminotransferase  50 
 
 
388 aa  341  1e-92  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4291  bifunctional N-succinyldiaminopimelate-aminotransferase/ acetylornithine transaminase protein  45.43 
 
 
410 aa  341  1e-92  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1596  acetylornithine aminotransferase  46.17 
 
 
386 aa  341  1e-92  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3947  bifunctional N-succinyldiaminopimelate-aminotransferase/ acetylornithine transaminase protein  46.09 
 
 
405 aa  341  1e-92  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2124  bifunctional N-succinyldiaminopimelate-aminotransferase/ acetylornithine transaminase protein  45.69 
 
 
410 aa  341  1e-92  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.975893  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0353  acetylornithine aminotransferase  44.39 
 
 
395 aa  341  2e-92  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  hitchhiker  0.00220895 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0660  acetylornithine aminotransferase  45.41 
 
 
394 aa  340  2e-92  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2195  bifunctional N-succinyldiaminopimelate-aminotransferase/ acetylornithine transaminase protein  45.62 
 
 
403 aa  341  2e-92  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4033  bifunctional N-succinyldiaminopimelate-aminotransferase/ acetylornithine transaminase protein  43.78 
 
 
408 aa  340  2e-92  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.327701  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0578  bifunctional N-succinyldiaminopimelate-aminotransferase/ acetylornithine transaminase protein  45.85 
 
 
405 aa  340  4e-92  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3516  bifunctional N-succinyldiaminopimelate-aminotransferase/ acetylornithine transaminase protein  45.6 
 
 
405 aa  339  5e-92  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3319  bifunctional N-succinyldiaminopimelate-aminotransferase/ acetylornithine transaminase protein  45.9 
 
 
404 aa  338  8e-92  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0204  acetylornithine aminotransferase  45.15 
 
 
399 aa  338  9.999999999999999e-92  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000412684 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3150  acetylornithine aminotransferase  45.66 
 
 
399 aa  338  9.999999999999999e-92  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3173  acetylornithine aminotransferase  45.27 
 
 
398 aa  338  9.999999999999999e-92  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.324258  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1787  bifunctional N-succinyldiaminopimelate-aminotransferase/ acetylornithine transaminase protein  45.04 
 
 
409 aa  337  1.9999999999999998e-91  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0368  bifunctional N-succinyldiaminopimelate-aminotransferase/ acetylornithine transaminase protein  43.73 
 
 
406 aa  337  1.9999999999999998e-91  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>