More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plav_0402 on replicon NC_009719
Organism: Parvibaculum lavamentivorans DS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009719  Plav_0402  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  100 
 
 
446 aa  895    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7457  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  66.33 
 
 
397 aa  548  1e-155  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.484657  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2318  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  67.68 
 
 
396 aa  543  1e-153  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.156448 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6536  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  64.8 
 
 
397 aa  532  1e-150  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.396008  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4556  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  64.8 
 
 
396 aa  531  1e-150  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.974298 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4075  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  65.31 
 
 
396 aa  533  1e-150  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1218  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  66.07 
 
 
402 aa  534  1e-150  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.525687  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR0301  acetylornithine transaminase protein  64.96 
 
 
403 aa  529  1e-149  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.171719  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0481  acetylornithine transaminase protein  66.23 
 
 
402 aa  528  1e-149  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0314  acetylornithine transaminase protein  64.96 
 
 
403 aa  529  1e-149  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0394  acetylornithine transaminase protein  64.19 
 
 
403 aa  528  1e-148  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0185  acetylornithine transaminase protein  64.43 
 
 
399 aa  525  1e-148  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.372078 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4442  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  65.31 
 
 
396 aa  521  1e-146  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.977458  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4916  acetylornithine transaminase protein  64.05 
 
 
405 aa  514  1e-144  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.0883749 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0009  acetylornithine transaminase protein  62.98 
 
 
401 aa  512  1e-144  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0175  acetylornithine transaminase protein  64.69 
 
 
399 aa  510  1e-143  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0759  acetylornithine transaminase protein  62.72 
 
 
403 aa  502  1e-141  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0803695 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5259  acetylornithine transaminase protein  62.18 
 
 
403 aa  501  1e-141  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0127  acetylornithine transaminase protein  63.96 
 
 
399 aa  491  1e-137  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.383449 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0832  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  60.05 
 
 
400 aa  486  1e-136  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0150295 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0513  acetylornithine transaminase protein  61.72 
 
 
403 aa  484  1e-135  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.508573 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0783  acetylornithine transaminase protein  60.31 
 
 
407 aa  484  1e-135  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0758378  normal  0.118298 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0895  acetylornithine transaminase protein  60.98 
 
 
403 aa  481  1e-135  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0150  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  58.79 
 
 
405 aa  480  1e-134  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3105  acetylornithine transaminase protein  60.89 
 
 
393 aa  462  1e-129  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.546024  normal  0.0590877 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0642  acetylornithine transaminase protein  60.41 
 
 
403 aa  462  1e-129  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2041  acetylornithine transaminase protein  59.38 
 
 
390 aa  464  1e-129  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.0188318 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1290  acetylornithine transaminase protein  56.96 
 
 
401 aa  461  9.999999999999999e-129  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2008  acetylornithine transaminase protein  58.72 
 
 
393 aa  455  1e-127  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0665  acetylornithine transaminase protein  59.06 
 
 
391 aa  455  1e-127  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2300  acetylornithine and succinylornithine aminotransferases  57.25 
 
 
394 aa  446  1.0000000000000001e-124  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0798  acetylornithine transaminase protein  57.18 
 
 
393 aa  441  1e-123  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1147  acetylornithine aminotransferase  56.62 
 
 
394 aa  444  1e-123  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.109776  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0718  acetylornithine transaminase protein  58.97 
 
 
393 aa  444  1e-123  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.759716  normal  0.261062 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1024  acetylornithine transaminase protein  56.28 
 
 
395 aa  442  1e-123  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.433962  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3141  acetylornithine transaminase protein  57.22 
 
 
397 aa  440  9.999999999999999e-123  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.759672  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3277  acetylornithine aminotransferase  55.61 
 
 
396 aa  435  1e-121  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1409  acetylornithine transaminase protein  56.62 
 
 
396 aa  433  1e-120  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.111439  normal  0.291313 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1359  acetylornithine transaminase protein  55.56 
 
 
395 aa  430  1e-119  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.592193  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0487  acetylornithine aminotransferase  56.27 
 
 
395 aa  427  1e-118  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.251081  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2165  acetylornithine transaminase protein  52.64 
 
 
401 aa  414  1e-114  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2541  acetylornithine transaminase protein  55.32 
 
 
398 aa  410  1e-113  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1231  acetylornithine transaminase protein  53.03 
 
 
404 aa  407  1.0000000000000001e-112  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.0141843 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0176  acetylornithine aminotransferase  60.4 
 
 
313 aa  388  1e-106  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1283  acetylornithine transaminase protein  49.74 
 
 
391 aa  381  1e-104  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3636  acetylornithine aminotransferase  49.34 
 
 
397 aa  359  6e-98  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3741  acetylornithine aminotransferase  48.81 
 
 
397 aa  357  1.9999999999999998e-97  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3744  acetylornithine aminotransferase  47.29 
 
 
391 aa  357  2.9999999999999997e-97  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000932106 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0226  acetylornithine aminotransferase  50.4 
 
 
396 aa  356  3.9999999999999996e-97  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0214  acetylornithine transaminase protein  47.51 
 
 
391 aa  352  5.9999999999999994e-96  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  hitchhiker  0.000000369674  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2287  acetylornithine aminotransferase  46.84 
 
 
402 aa  349  5e-95  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.194315 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0886  acetylornithine transaminase protein  45.77 
 
 
392 aa  346  5e-94  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.0996794  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0772  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  45.15 
 
 
399 aa  345  6e-94  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.200689  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3173  acetylornithine aminotransferase  47.93 
 
 
398 aa  345  1e-93  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.324258  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0342  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  48.02 
 
 
417 aa  345  1e-93  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0559  acetylornithine transaminase protein  45.67 
 
 
392 aa  344  2e-93  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2414  acetylornithine aminotransferase  48.72 
 
 
396 aa  342  5.999999999999999e-93  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1866  acetylornithine aminotransferase  47.85 
 
 
400 aa  342  5.999999999999999e-93  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2079  acetylornithine aminotransferase  46.19 
 
 
391 aa  342  8e-93  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0274  acetylornithine aminotransferase  46.58 
 
 
396 aa  339  5e-92  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.110157  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0569  acetylornithine aminotransferase  47.27 
 
 
400 aa  338  9.999999999999999e-92  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.160273  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0204  acetylornithine aminotransferase  49.08 
 
 
399 aa  337  1.9999999999999998e-91  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000412684 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2912  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  44.74 
 
 
400 aa  337  1.9999999999999998e-91  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.386564  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0151  acetylornithine aminotransferase  48.1 
 
 
399 aa  336  3.9999999999999995e-91  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3150  acetylornithine aminotransferase  46.77 
 
 
399 aa  334  2e-90  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4033  bifunctional N-succinyldiaminopimelate-aminotransferase/ acetylornithine transaminase protein  46.27 
 
 
408 aa  333  3e-90  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.327701  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3854  bifunctional N-succinyldiaminopimelate-aminotransferase/ acetylornithine transaminase protein  46.02 
 
 
408 aa  332  8e-90  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2493  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  46.65 
 
 
397 aa  328  1.0000000000000001e-88  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4582  bifunctional N-succinyldiaminopimelate-aminotransferase/ acetylornithine transaminase protein  45.5 
 
 
405 aa  327  2.0000000000000001e-88  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1434  bifunctional N-succinyldiaminopimelate-aminotransferase/ acetylornithine transaminase protein  42.13 
 
 
406 aa  327  2.0000000000000001e-88  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.845656 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2288  acetylornithine and succinylornithine aminotransferases  46.79 
 
 
396 aa  327  3e-88  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.37355  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4620  bifunctional N-succinyldiaminopimelate-aminotransferase/ acetylornithine transaminase protein  43.56 
 
 
406 aa  326  4.0000000000000003e-88  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4481  bifunctional N-succinyldiaminopimelate-aminotransferase/ acetylornithine transaminase protein  42.09 
 
 
406 aa  326  5e-88  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.593317 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2686  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  47.48 
 
 
402 aa  325  8.000000000000001e-88  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0960288 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1566  acetylornithine aminotransferase  45.05 
 
 
395 aa  325  1e-87  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2826  acetylornithine aminotransferase  44.71 
 
 
386 aa  325  1e-87  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0353  acetylornithine aminotransferase  44.53 
 
 
395 aa  325  1e-87  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  hitchhiker  0.00220895 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3986  bifunctional N-succinyldiaminopimelate-aminotransferase/ acetylornithine transaminase protein  42.13 
 
 
406 aa  325  1e-87  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4285  bifunctional N-succinyldiaminopimelate-aminotransferase/ acetylornithine transaminase protein  44.53 
 
 
406 aa  324  2e-87  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0426  acetylornithine aminotransferase  43.75 
 
 
396 aa  324  2e-87  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0269327  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0637  acetylornithine aminotransferase  46.84 
 
 
418 aa  323  3e-87  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00130856  normal  0.274942 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_52720  bifunctional N-succinyldiaminopimelate-aminotransferase/ acetylornithine transaminase protein  43.56 
 
 
406 aa  323  3e-87  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0660  acetylornithine aminotransferase  45.19 
 
 
394 aa  323  4e-87  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3565  bifunctional N-succinyldiaminopimelate-aminotransferase/ acetylornithine transaminase protein  43.85 
 
 
405 aa  323  4e-87  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.209353  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0395  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  45.9 
 
 
413 aa  323  4e-87  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.538676 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2649  acetylornithine aminotransferase  46.19 
 
 
423 aa  323  4e-87  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.46775  normal  0.4632 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_34500  bifunctional N-succinyldiaminopimelate-aminotransferase/ acetylornithine transaminase protein  44.33 
 
 
406 aa  322  7e-87  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0063  acetylornithine and succinylornithine aminotransferases  45.29 
 
 
396 aa  322  7e-87  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.857354  normal  0.372491 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3770  bifunctional N-succinyldiaminopimelate-aminotransferase/ acetylornithine transaminase protein  41.83 
 
 
406 aa  322  9.000000000000001e-87  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0233516 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1698  acetylornithine aminotransferase  43.04 
 
 
394 aa  322  9.999999999999999e-87  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1830  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  44.04 
 
 
395 aa  321  9.999999999999999e-87  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.991221  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0982  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  45.43 
 
 
410 aa  321  9.999999999999999e-87  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3962  acetylornithine aminotransferase  42.35 
 
 
386 aa  320  3.9999999999999996e-86  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00766837  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1832  acetylornithine delta-aminotransferase  43.62 
 
 
405 aa  320  5e-86  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2911  bifunctional N-succinyldiaminopimelate-aminotransferase/ acetylornithine transaminase protein  44.36 
 
 
406 aa  319  5e-86  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.408245 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2872  acetylornithine aminotransferase  44.68 
 
 
397 aa  319  6e-86  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0285  bifunctional N-succinyldiaminopimelate-aminotransferase/ acetylornithine transaminase protein  45.1 
 
 
413 aa  318  1e-85  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3773  bifunctional N-succinyldiaminopimelate-aminotransferase/ acetylornithine transaminase protein  43.23 
 
 
405 aa  317  2e-85  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.504324 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3319  bifunctional N-succinyldiaminopimelate-aminotransferase/ acetylornithine transaminase protein  44.76 
 
 
404 aa  317  2e-85  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1986  acetylornithine aminotransferase  44.06 
 
 
418 aa  317  3e-85  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>