More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sala_1359 on replicon NC_008048
Organism: Sphingopyxis alaskensis RB2256



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008048  Sala_1359  acetylornithine transaminase protein  100 
 
 
395 aa  808    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.592193  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1409  acetylornithine transaminase protein  75.38 
 
 
396 aa  619  1e-176  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.111439  normal  0.291313 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3141  acetylornithine transaminase protein  74.67 
 
 
397 aa  585  1e-166  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.759672  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0402  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  56.05 
 
 
446 aa  427  1e-118  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0394  acetylornithine transaminase protein  53.52 
 
 
403 aa  419  1e-116  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1218  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  54.05 
 
 
402 aa  418  1e-116  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.525687  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0185  acetylornithine transaminase protein  54.81 
 
 
399 aa  416  9.999999999999999e-116  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.372078 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6536  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  53.11 
 
 
397 aa  417  9.999999999999999e-116  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.396008  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7457  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  52.85 
 
 
397 aa  413  1e-114  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.484657  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0301  acetylornithine transaminase protein  52.82 
 
 
403 aa  409  1e-113  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.171719  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1024  acetylornithine transaminase protein  55.47 
 
 
395 aa  411  1e-113  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.433962  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5259  acetylornithine transaminase protein  53.14 
 
 
403 aa  410  1e-113  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2318  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  53.75 
 
 
396 aa  408  1e-113  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.156448 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0009  acetylornithine transaminase protein  53.26 
 
 
401 aa  409  1e-113  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0314  acetylornithine transaminase protein  52.82 
 
 
403 aa  409  1e-113  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0481  acetylornithine transaminase protein  54.33 
 
 
402 aa  406  1.0000000000000001e-112  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0175  acetylornithine transaminase protein  54.55 
 
 
399 aa  403  1e-111  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0150  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  53.63 
 
 
405 aa  402  1e-111  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4075  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  52.86 
 
 
396 aa  402  1e-111  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0665  acetylornithine transaminase protein  53.81 
 
 
391 aa  400  9.999999999999999e-111  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0127  acetylornithine transaminase protein  55.15 
 
 
399 aa  397  1e-109  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.383449 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0832  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  52.99 
 
 
400 aa  397  1e-109  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0150295 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4556  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  52.08 
 
 
396 aa  395  1e-109  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.974298 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0783  acetylornithine transaminase protein  54.5 
 
 
407 aa  395  1e-109  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0758378  normal  0.118298 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4442  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  53.12 
 
 
396 aa  394  1e-108  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.977458  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4916  acetylornithine transaminase protein  51.85 
 
 
405 aa  392  1e-108  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.0883749 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3105  acetylornithine transaminase protein  52.23 
 
 
393 aa  390  1e-107  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.546024  normal  0.0590877 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0513  acetylornithine transaminase protein  52.12 
 
 
403 aa  386  1e-106  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.508573 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1290  acetylornithine transaminase protein  48.58 
 
 
401 aa  383  1e-105  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1147  acetylornithine aminotransferase  49.74 
 
 
394 aa  382  1e-105  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.109776  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2541  acetylornithine transaminase protein  53.46 
 
 
398 aa  382  1e-105  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0895  acetylornithine transaminase protein  52.65 
 
 
403 aa  383  1e-105  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0759  acetylornithine transaminase protein  50.13 
 
 
403 aa  378  1e-104  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0803695 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0798  acetylornithine transaminase protein  51.06 
 
 
393 aa  376  1e-103  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2008  acetylornithine transaminase protein  50.65 
 
 
393 aa  375  1e-103  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3277  acetylornithine aminotransferase  51.94 
 
 
396 aa  375  1e-103  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0642  acetylornithine transaminase protein  52.07 
 
 
403 aa  374  1e-102  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0487  acetylornithine aminotransferase  51.31 
 
 
395 aa  375  1e-102  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.251081  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0718  acetylornithine transaminase protein  50.9 
 
 
393 aa  368  1e-101  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.759716  normal  0.261062 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2041  acetylornithine transaminase protein  49.09 
 
 
390 aa  371  1e-101  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.0188318 
 
 
-
 
NC_002978  WD1283  acetylornithine transaminase protein  47.53 
 
 
391 aa  366  1e-100  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2300  acetylornithine and succinylornithine aminotransferases  48.04 
 
 
394 aa  362  5.0000000000000005e-99  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2165  acetylornithine transaminase protein  48.83 
 
 
401 aa  357  1.9999999999999998e-97  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0274  acetylornithine aminotransferase  45.29 
 
 
396 aa  346  4e-94  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.110157  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0660  acetylornithine aminotransferase  46.13 
 
 
394 aa  345  1e-93  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1443  bifunctional succinylornithine transaminase/acetylornithine transaminase  45.01 
 
 
406 aa  342  7e-93  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.656199 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0214  acetylornithine transaminase protein  46.09 
 
 
391 aa  342  8e-93  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  hitchhiker  0.000000369674  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01717  succinylornithine transaminase, PLP-dependent  44.76 
 
 
406 aa  340  2e-92  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01705  hypothetical protein  44.76 
 
 
406 aa  340  2e-92  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1696  bifunctional succinylornithine transaminase/acetylornithine transaminase  44.79 
 
 
406 aa  340  2.9999999999999998e-92  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3150  acetylornithine aminotransferase  46.98 
 
 
399 aa  339  5e-92  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2288  acetylornithine and succinylornithine aminotransferases  45.74 
 
 
396 aa  339  5e-92  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.37355  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2844  bifunctional succinylornithine transaminase/acetylornithine transaminase  45.08 
 
 
404 aa  339  5e-92  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.285049  hitchhiker  0.00544631 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1894  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  44.76 
 
 
406 aa  339  5.9999999999999996e-92  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.433032  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1970  bifunctional succinylornithine transaminase/acetylornithine transaminase  44.76 
 
 
406 aa  339  5.9999999999999996e-92  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1072  acetylornithine aminotransferase  45.55 
 
 
385 aa  339  5.9999999999999996e-92  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0280572  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1884  bifunctional succinylornithine transaminase/acetylornithine transaminase  44.76 
 
 
406 aa  339  5.9999999999999996e-92  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00408684 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1831  bifunctional succinylornithine transaminase/acetylornithine transaminase  44.62 
 
 
406 aa  339  5.9999999999999996e-92  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2466  bifunctional succinylornithine transaminase/acetylornithine transaminase  44.76 
 
 
406 aa  338  7e-92  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.841609 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1040  acetylornithine aminotransferase  45.81 
 
 
385 aa  338  7e-92  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.000111021  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4481  bifunctional N-succinyldiaminopimelate-aminotransferase/ acetylornithine transaminase protein  44.22 
 
 
406 aa  335  5.999999999999999e-91  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.593317 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02850  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  47.28 
 
 
399 aa  335  5.999999999999999e-91  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.0000577952  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1434  bifunctional N-succinyldiaminopimelate-aminotransferase/ acetylornithine transaminase protein  44.13 
 
 
406 aa  335  5.999999999999999e-91  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.845656 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1566  acetylornithine aminotransferase  45.38 
 
 
395 aa  335  5.999999999999999e-91  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1231  acetylornithine transaminase protein  46.05 
 
 
404 aa  335  5.999999999999999e-91  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.0141843 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0842  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  46.05 
 
 
399 aa  334  1e-90  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0215856 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3986  bifunctional N-succinyldiaminopimelate-aminotransferase/ acetylornithine transaminase protein  44.47 
 
 
406 aa  335  1e-90  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2287  acetylornithine aminotransferase  47.11 
 
 
402 aa  333  4e-90  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.194315 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3770  bifunctional N-succinyldiaminopimelate-aminotransferase/ acetylornithine transaminase protein  44.39 
 
 
406 aa  333  4e-90  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0233516 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1995  bifunctional succinylornithine transaminase/acetylornithine transaminase  43.99 
 
 
406 aa  332  5e-90  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3741  acetylornithine aminotransferase  45.38 
 
 
397 aa  332  6e-90  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0226  acetylornithine aminotransferase  46.56 
 
 
396 aa  331  1e-89  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0342  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  47.4 
 
 
417 aa  330  2e-89  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0176  acetylornithine aminotransferase  52.63 
 
 
313 aa  330  3e-89  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3636  acetylornithine aminotransferase  45.12 
 
 
397 aa  329  4e-89  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0690  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  47.09 
 
 
405 aa  328  7e-89  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0285  bifunctional N-succinyldiaminopimelate-aminotransferase/ acetylornithine transaminase protein  44.56 
 
 
413 aa  328  8e-89  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0353  acetylornithine aminotransferase  44.06 
 
 
395 aa  328  8e-89  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  hitchhiker  0.00220895 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0483  acetylornithine aminotransferase  44.85 
 
 
395 aa  327  2.0000000000000001e-88  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0368  bifunctional N-succinyldiaminopimelate-aminotransferase/ acetylornithine transaminase protein  44.06 
 
 
406 aa  327  2.0000000000000001e-88  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4620  bifunctional N-succinyldiaminopimelate-aminotransferase/ acetylornithine transaminase protein  42.64 
 
 
406 aa  327  2.0000000000000001e-88  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3854  bifunctional N-succinyldiaminopimelate-aminotransferase/ acetylornithine transaminase protein  43.93 
 
 
408 aa  327  3e-88  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_52720  bifunctional N-succinyldiaminopimelate-aminotransferase/ acetylornithine transaminase protein  42.64 
 
 
406 aa  326  4.0000000000000003e-88  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0886  acetylornithine transaminase protein  43.27 
 
 
392 aa  325  6e-88  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.0996794  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1698  acetylornithine aminotransferase  43.4 
 
 
394 aa  325  6e-88  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4033  bifunctional N-succinyldiaminopimelate-aminotransferase/ acetylornithine transaminase protein  43.41 
 
 
408 aa  325  9e-88  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.327701  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1094  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  46.54 
 
 
387 aa  325  9e-88  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1907  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  43.95 
 
 
387 aa  325  9e-88  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0119007  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0151  acetylornithine aminotransferase  45.65 
 
 
399 aa  325  1e-87  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2888  acetylornithine aminotransferase  50.64 
 
 
397 aa  325  1e-87  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0887768  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3319  bifunctional N-succinyldiaminopimelate-aminotransferase/ acetylornithine transaminase protein  43.73 
 
 
404 aa  323  2e-87  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0772  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  43.92 
 
 
399 aa  323  3e-87  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.200689  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0484  succinylornithine transaminase family  44.85 
 
 
406 aa  323  4e-87  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.631225  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3744  acetylornithine aminotransferase  44.3 
 
 
391 aa  323  4e-87  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000932106 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0245  bifunctional N-succinyldiaminopimelate-aminotransferase/ acetylornithine transaminase protein  43.81 
 
 
405 aa  322  5e-87  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.110716  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3704  bifunctional N-succinyldiaminopimelate-aminotransferase/ acetylornithine transaminase protein  43.81 
 
 
405 aa  322  5e-87  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4285  bifunctional N-succinyldiaminopimelate-aminotransferase/ acetylornithine transaminase protein  42.86 
 
 
406 aa  322  7e-87  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0204  acetylornithine aminotransferase  45.65 
 
 
399 aa  322  9.999999999999999e-87  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000412684 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1830  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  44.85 
 
 
395 aa  320  1.9999999999999998e-86  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.991221  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2911  bifunctional N-succinyldiaminopimelate-aminotransferase/ acetylornithine transaminase protein  43.57 
 
 
406 aa  320  1.9999999999999998e-86  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.408245 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>