More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acry_2541 on replicon NC_009484
Organism: Acidiphilium cryptum JF-5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009484  Acry_2541  acetylornithine transaminase protein  100 
 
 
398 aa  798    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2165  acetylornithine transaminase protein  68.17 
 
 
401 aa  540  9.999999999999999e-153  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6536  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  61.06 
 
 
397 aa  480  1e-134  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.396008  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7457  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  60.8 
 
 
397 aa  480  1e-134  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.484657  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1218  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  58.1 
 
 
402 aa  450  1e-125  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.525687  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0832  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  57.25 
 
 
400 aa  445  1.0000000000000001e-124  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0150295 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4556  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  59.22 
 
 
396 aa  442  1e-123  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.974298 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4075  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  58.7 
 
 
396 aa  441  1e-123  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3277  acetylornithine aminotransferase  59.64 
 
 
396 aa  439  9.999999999999999e-123  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0150  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  57.58 
 
 
405 aa  439  9.999999999999999e-123  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4442  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  58.7 
 
 
396 aa  437  1e-121  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.977458  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR0301  acetylornithine transaminase protein  55.67 
 
 
403 aa  431  1e-119  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.171719  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0314  acetylornithine transaminase protein  55.67 
 
 
403 aa  431  1e-119  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0665  acetylornithine transaminase protein  55.5 
 
 
391 aa  428  1e-119  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0009  acetylornithine transaminase protein  54.36 
 
 
401 aa  430  1e-119  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0394  acetylornithine transaminase protein  55.13 
 
 
403 aa  430  1e-119  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0759  acetylornithine transaminase protein  54.71 
 
 
403 aa  427  1e-118  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0803695 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3105  acetylornithine transaminase protein  53.4 
 
 
393 aa  422  1e-117  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.546024  normal  0.0590877 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2318  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  56.88 
 
 
396 aa  424  1e-117  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.156448 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5259  acetylornithine transaminase protein  54.47 
 
 
403 aa  419  1e-116  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0185  acetylornithine transaminase protein  53.44 
 
 
399 aa  421  1e-116  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.372078 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2008  acetylornithine transaminase protein  54.03 
 
 
393 aa  416  9.999999999999999e-116  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4916  acetylornithine transaminase protein  54.29 
 
 
405 aa  417  9.999999999999999e-116  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.0883749 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0402  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  55 
 
 
446 aa  414  1e-114  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0513  acetylornithine transaminase protein  55.09 
 
 
403 aa  414  1e-114  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.508573 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0798  acetylornithine transaminase protein  54.79 
 
 
393 aa  414  1e-114  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0718  acetylornithine transaminase protein  54.29 
 
 
393 aa  409  1e-113  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.759716  normal  0.261062 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0175  acetylornithine transaminase protein  52.67 
 
 
399 aa  405  1.0000000000000001e-112  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1024  acetylornithine transaminase protein  52.22 
 
 
395 aa  405  1.0000000000000001e-112  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.433962  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2041  acetylornithine transaminase protein  51.8 
 
 
390 aa  406  1.0000000000000001e-112  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.0188318 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0127  acetylornithine transaminase protein  56.54 
 
 
399 aa  404  1e-111  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.383449 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1147  acetylornithine aminotransferase  54.05 
 
 
394 aa  402  1e-111  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.109776  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0481  acetylornithine transaminase protein  54.76 
 
 
402 aa  404  1e-111  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2300  acetylornithine and succinylornithine aminotransferases  52.67 
 
 
394 aa  404  1e-111  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1290  acetylornithine transaminase protein  51.44 
 
 
401 aa  400  9.999999999999999e-111  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0642  acetylornithine transaminase protein  53.67 
 
 
403 aa  397  1e-109  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0783  acetylornithine transaminase protein  54.74 
 
 
407 aa  394  1e-108  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0758378  normal  0.118298 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0895  acetylornithine transaminase protein  54.21 
 
 
403 aa  392  1e-108  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1359  acetylornithine transaminase protein  52.42 
 
 
395 aa  389  1e-107  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.592193  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1409  acetylornithine transaminase protein  51.26 
 
 
396 aa  378  1e-103  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.111439  normal  0.291313 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3141  acetylornithine transaminase protein  51.71 
 
 
397 aa  372  1e-102  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.759672  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0226  acetylornithine aminotransferase  50 
 
 
396 aa  360  3e-98  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0487  acetylornithine aminotransferase  50.13 
 
 
395 aa  358  7e-98  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.251081  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3150  acetylornithine aminotransferase  47.67 
 
 
399 aa  353  2.9999999999999997e-96  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3636  acetylornithine aminotransferase  47.48 
 
 
397 aa  352  4e-96  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0274  acetylornithine aminotransferase  45.53 
 
 
396 aa  352  1e-95  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.110157  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3741  acetylornithine aminotransferase  46.42 
 
 
397 aa  350  3e-95  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3744  acetylornithine aminotransferase  47.63 
 
 
391 aa  350  3e-95  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000932106 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0151  acetylornithine aminotransferase  48.95 
 
 
399 aa  348  7e-95  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1866  acetylornithine aminotransferase  46.17 
 
 
400 aa  348  8e-95  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0176  acetylornithine aminotransferase  56.35 
 
 
313 aa  348  1e-94  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0772  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  43.23 
 
 
399 aa  347  3e-94  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.200689  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3173  acetylornithine aminotransferase  48.81 
 
 
398 aa  345  1e-93  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.324258  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0559  acetylornithine transaminase protein  45.07 
 
 
392 aa  343  4e-93  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1072  acetylornithine aminotransferase  47.15 
 
 
385 aa  341  1e-92  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0280572  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1566  acetylornithine aminotransferase  45.03 
 
 
395 aa  340  2e-92  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3565  bifunctional N-succinyldiaminopimelate-aminotransferase/ acetylornithine transaminase protein  45.57 
 
 
405 aa  338  8e-92  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.209353  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2493  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  47.34 
 
 
397 aa  338  9.999999999999999e-92  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1094  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  43.95 
 
 
387 aa  338  9.999999999999999e-92  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0204  acetylornithine aminotransferase  48.06 
 
 
399 aa  337  2.9999999999999997e-91  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000412684 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1040  acetylornithine aminotransferase  46.63 
 
 
385 aa  336  3.9999999999999995e-91  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.000111021  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2287  acetylornithine aminotransferase  46.98 
 
 
402 aa  336  5e-91  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.194315 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0483  acetylornithine aminotransferase  45.12 
 
 
395 aa  335  5.999999999999999e-91  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1832  acetylornithine delta-aminotransferase  45.05 
 
 
405 aa  334  1e-90  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3730  acetylornithine aminotransferase  45.52 
 
 
427 aa  335  1e-90  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000174283  normal  0.451197 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0569  acetylornithine aminotransferase  46.05 
 
 
400 aa  335  1e-90  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.160273  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5154  acetylornithine aminotransferase  43.91 
 
 
426 aa  334  2e-90  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000762221 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4481  bifunctional N-succinyldiaminopimelate-aminotransferase/ acetylornithine transaminase protein  44.53 
 
 
406 aa  333  4e-90  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.593317 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0637  acetylornithine aminotransferase  44.95 
 
 
418 aa  331  1e-89  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00130856  normal  0.274942 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1434  bifunctional N-succinyldiaminopimelate-aminotransferase/ acetylornithine transaminase protein  44.53 
 
 
406 aa  332  1e-89  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.845656 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0353  acetylornithine aminotransferase  43.8 
 
 
395 aa  332  1e-89  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  hitchhiker  0.00220895 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4620  bifunctional N-succinyldiaminopimelate-aminotransferase/ acetylornithine transaminase protein  44.33 
 
 
406 aa  331  1e-89  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4285  bifunctional N-succinyldiaminopimelate-aminotransferase/ acetylornithine transaminase protein  44.25 
 
 
406 aa  331  2e-89  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0943  acetylornithine aminotransferase  48.09 
 
 
422 aa  331  2e-89  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0660  acetylornithine aminotransferase  44.85 
 
 
394 aa  330  2e-89  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3770  bifunctional N-succinyldiaminopimelate-aminotransferase/ acetylornithine transaminase protein  43.48 
 
 
406 aa  330  3e-89  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0233516 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3986  bifunctional N-succinyldiaminopimelate-aminotransferase/ acetylornithine transaminase protein  44.01 
 
 
406 aa  330  4e-89  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1231  acetylornithine transaminase protein  46.32 
 
 
404 aa  329  5.0000000000000004e-89  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.0141843 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0342  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  49.87 
 
 
417 aa  328  7e-89  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3319  bifunctional N-succinyldiaminopimelate-aminotransferase/ acetylornithine transaminase protein  46.13 
 
 
404 aa  328  9e-89  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1283  acetylornithine transaminase protein  44.62 
 
 
391 aa  327  2.0000000000000001e-88  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_34500  bifunctional N-succinyldiaminopimelate-aminotransferase/ acetylornithine transaminase protein  44.96 
 
 
406 aa  327  3e-88  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2414  acetylornithine aminotransferase  47.47 
 
 
396 aa  326  3e-88  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_13491  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  44.19 
 
 
420 aa  326  5e-88  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_52720  bifunctional N-succinyldiaminopimelate-aminotransferase/ acetylornithine transaminase protein  43.81 
 
 
406 aa  326  5e-88  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0214  acetylornithine transaminase protein  44.79 
 
 
391 aa  325  1e-87  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  hitchhiker  0.000000369674  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1698  acetylornithine aminotransferase  42.22 
 
 
394 aa  324  2e-87  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2911  bifunctional N-succinyldiaminopimelate-aminotransferase/ acetylornithine transaminase protein  44.7 
 
 
406 aa  324  2e-87  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.408245 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_19841  acetylornithine aminotransferase  45.15 
 
 
418 aa  323  3e-87  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0786665 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0570  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  47.77 
 
 
388 aa  323  3e-87  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0406  acetylornithine aminotransferase  47.77 
 
 
388 aa  323  3e-87  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2288  acetylornithine and succinylornithine aminotransferases  44.47 
 
 
396 aa  323  3e-87  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.37355  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3011  acetylornithine aminotransferase  45.22 
 
 
404 aa  323  4e-87  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2079  acetylornithine aminotransferase  44.88 
 
 
391 aa  322  5e-87  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3029  acetylornithine aminotransferase  45.99 
 
 
410 aa  321  9.999999999999999e-87  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.51469  normal  0.939431 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0886  acetylornithine transaminase protein  44.36 
 
 
392 aa  322  9.999999999999999e-87  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.0996794  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02850  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  44.06 
 
 
399 aa  321  9.999999999999999e-87  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.0000577952  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2686  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  48.28 
 
 
402 aa  320  1.9999999999999998e-86  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0960288 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1164  acetylornithine aminotransferase  45.14 
 
 
398 aa  321  1.9999999999999998e-86  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.581434  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2649  acetylornithine aminotransferase  43.33 
 
 
423 aa  321  1.9999999999999998e-86  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.46775  normal  0.4632 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>