More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nham_0642 on replicon NC_007964
Organism: Nitrobacter hamburgensis X14



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007406  Nwi_0513  acetylornithine transaminase protein  90.82 
 
 
403 aa  707    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.508573 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0759  acetylornithine transaminase protein  80.35 
 
 
403 aa  644    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0803695 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4916  acetylornithine transaminase protein  80.45 
 
 
405 aa  646    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.0883749 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0895  acetylornithine transaminase protein  80.65 
 
 
403 aa  638    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5259  acetylornithine transaminase protein  77.89 
 
 
403 aa  643    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0642  acetylornithine transaminase protein  100 
 
 
403 aa  809    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0783  acetylornithine transaminase protein  79.9 
 
 
407 aa  634  1e-180  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0758378  normal  0.118298 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7457  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  64.77 
 
 
397 aa  526  1e-148  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.484657  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6536  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  63.99 
 
 
397 aa  516  1.0000000000000001e-145  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.396008  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0009  acetylornithine transaminase protein  59.95 
 
 
401 aa  498  1e-140  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0314  acetylornithine transaminase protein  59.7 
 
 
403 aa  497  1e-139  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0301  acetylornithine transaminase protein  59.7 
 
 
403 aa  497  1e-139  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.171719  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0394  acetylornithine transaminase protein  59.9 
 
 
403 aa  496  1e-139  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4075  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  61.5 
 
 
396 aa  496  1e-139  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1218  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  61.4 
 
 
402 aa  498  1e-139  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.525687  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4556  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  61.76 
 
 
396 aa  492  9.999999999999999e-139  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.974298 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0185  acetylornithine transaminase protein  59.35 
 
 
399 aa  492  9.999999999999999e-139  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.372078 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4442  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  61.5 
 
 
396 aa  490  1e-137  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.977458  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0402  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  60.58 
 
 
446 aa  488  1e-137  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2318  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  61.96 
 
 
396 aa  484  1e-136  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.156448 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0832  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  59.18 
 
 
400 aa  485  1e-136  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0150295 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0175  acetylornithine transaminase protein  58.85 
 
 
399 aa  478  1e-134  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1147  acetylornithine aminotransferase  60 
 
 
394 aa  477  1e-133  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.109776  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2300  acetylornithine and succinylornithine aminotransferases  58.72 
 
 
394 aa  469  1.0000000000000001e-131  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0481  acetylornithine transaminase protein  57.94 
 
 
402 aa  466  9.999999999999999e-131  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0150  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  58.29 
 
 
405 aa  468  9.999999999999999e-131  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1290  acetylornithine transaminase protein  53.25 
 
 
401 aa  459  9.999999999999999e-129  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0127  acetylornithine transaminase protein  58.52 
 
 
399 aa  459  9.999999999999999e-129  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.383449 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2041  acetylornithine transaminase protein  52.84 
 
 
390 aa  429  1e-119  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.0188318 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2541  acetylornithine transaminase protein  54.84 
 
 
398 aa  419  1e-116  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0176  acetylornithine aminotransferase  64.69 
 
 
313 aa  416  9.999999999999999e-116  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0487  acetylornithine aminotransferase  52.94 
 
 
395 aa  417  9.999999999999999e-116  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.251081  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2165  acetylornithine transaminase protein  53.12 
 
 
401 aa  412  1e-114  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3105  acetylornithine transaminase protein  52.49 
 
 
393 aa  410  1e-113  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.546024  normal  0.0590877 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0665  acetylornithine transaminase protein  52.38 
 
 
391 aa  409  1e-113  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2008  acetylornithine transaminase protein  51.66 
 
 
393 aa  405  1.0000000000000001e-112  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3277  acetylornithine aminotransferase  52.47 
 
 
396 aa  406  1.0000000000000001e-112  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1359  acetylornithine transaminase protein  52.07 
 
 
395 aa  407  1.0000000000000001e-112  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.592193  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0718  acetylornithine transaminase protein  51.66 
 
 
393 aa  396  1e-109  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.759716  normal  0.261062 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3141  acetylornithine transaminase protein  51.59 
 
 
397 aa  397  1e-109  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.759672  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1231  acetylornithine transaminase protein  49.75 
 
 
404 aa  397  1e-109  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.0141843 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1024  acetylornithine transaminase protein  50.92 
 
 
395 aa  391  1e-108  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.433962  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1409  acetylornithine transaminase protein  51.58 
 
 
396 aa  390  1e-107  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.111439  normal  0.291313 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0798  acetylornithine transaminase protein  51.61 
 
 
393 aa  389  1e-107  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002978  WD1283  acetylornithine transaminase protein  46.65 
 
 
391 aa  369  1e-101  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0226  acetylornithine aminotransferase  48.19 
 
 
396 aa  360  2e-98  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3636  acetylornithine aminotransferase  46.98 
 
 
397 aa  356  3.9999999999999996e-97  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1866  acetylornithine aminotransferase  48.53 
 
 
400 aa  352  5e-96  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0214  acetylornithine transaminase protein  45.81 
 
 
391 aa  351  1e-95  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  hitchhiker  0.000000369674  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3741  acetylornithine aminotransferase  45.93 
 
 
397 aa  351  1e-95  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0274  acetylornithine aminotransferase  45.03 
 
 
396 aa  349  5e-95  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.110157  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2493  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  47.91 
 
 
397 aa  348  9e-95  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0151  acetylornithine aminotransferase  46.74 
 
 
399 aa  345  7e-94  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0559  acetylornithine transaminase protein  42.16 
 
 
392 aa  345  8e-94  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3173  acetylornithine aminotransferase  47.23 
 
 
398 aa  344  1e-93  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.324258  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0204  acetylornithine aminotransferase  47.51 
 
 
399 aa  343  2e-93  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000412684 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3150  acetylornithine aminotransferase  47.76 
 
 
399 aa  343  4e-93  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2287  acetylornithine aminotransferase  45.92 
 
 
402 aa  341  2e-92  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.194315 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3744  acetylornithine aminotransferase  46.79 
 
 
391 aa  340  2.9999999999999998e-92  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000932106 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0772  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  43.73 
 
 
399 aa  340  4e-92  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.200689  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1698  acetylornithine aminotransferase  43.6 
 
 
394 aa  339  5e-92  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0809  bifunctional N-succinyldiaminopimelate-aminotransferase/ acetylornithine transaminase protein  45.23 
 
 
405 aa  339  5.9999999999999996e-92  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000843342 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2079  acetylornithine aminotransferase  48.57 
 
 
391 aa  338  8e-92  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0353  acetylornithine aminotransferase  42.86 
 
 
395 aa  338  9.999999999999999e-92  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  hitchhiker  0.00220895 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2414  acetylornithine aminotransferase  47.89 
 
 
396 aa  337  1.9999999999999998e-91  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0655  bifunctional N-succinyldiaminopimelate-aminotransferase/ acetylornithine transaminase protein  44.47 
 
 
405 aa  337  1.9999999999999998e-91  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000579113 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3011  bifunctional N-succinyldiaminopimelate-aminotransferase/ acetylornithine transaminase protein  45.41 
 
 
404 aa  335  5.999999999999999e-91  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1566  acetylornithine aminotransferase  42.34 
 
 
395 aa  335  7.999999999999999e-91  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3641  bifunctional N-succinyldiaminopimelate-aminotransferase/ acetylornithine transaminase protein  44.56 
 
 
407 aa  334  1e-90  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000165169 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4669  bifunctional N-succinyldiaminopimelate-aminotransferase/ acetylornithine transaminase protein  44.44 
 
 
406 aa  335  1e-90  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.160127  normal  0.232002 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03210  bifunctional acetylornithine aminotransferase/ succinyldiaminopimelate aminotransferase  44.44 
 
 
406 aa  334  2e-90  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.411441  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0353  succinylornithine transaminase family  44.44 
 
 
406 aa  334  2e-90  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.124803  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03162  hypothetical protein  44.44 
 
 
406 aa  334  2e-90  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.514946  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0353  bifunctional N-succinyldiaminopimelate-aminotransferase/ acetylornithine transaminase protein  44.44 
 
 
406 aa  334  2e-90  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3735  bifunctional N-succinyldiaminopimelate-aminotransferase/ acetylornithine transaminase protein  44.44 
 
 
406 aa  334  2e-90  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0886  acetylornithine transaminase protein  43.46 
 
 
392 aa  332  5e-90  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.0996794  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3516  bifunctional N-succinyldiaminopimelate-aminotransferase/ acetylornithine transaminase protein  44.42 
 
 
405 aa  332  5e-90  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0245  bifunctional N-succinyldiaminopimelate-aminotransferase/ acetylornithine transaminase protein  43.81 
 
 
405 aa  331  1e-89  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.110716  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3704  bifunctional N-succinyldiaminopimelate-aminotransferase/ acetylornithine transaminase protein  43.81 
 
 
405 aa  331  1e-89  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0569  acetylornithine aminotransferase  44.3 
 
 
400 aa  331  1e-89  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.160273  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3947  bifunctional N-succinyldiaminopimelate-aminotransferase/ acetylornithine transaminase protein  43.81 
 
 
405 aa  330  2e-89  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3880  bifunctional N-succinyldiaminopimelate-aminotransferase/ acetylornithine transaminase protein  44.02 
 
 
405 aa  331  2e-89  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3556  bifunctional N-succinyldiaminopimelate-aminotransferase/ acetylornithine transaminase protein  44.19 
 
 
406 aa  330  2e-89  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4033  bifunctional N-succinyldiaminopimelate-aminotransferase/ acetylornithine transaminase protein  42.93 
 
 
408 aa  330  2e-89  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.327701  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0651  bifunctional N-succinyldiaminopimelate-aminotransferase/ acetylornithine transaminase protein  42.46 
 
 
401 aa  330  2e-89  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.293343  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3829  bifunctional N-succinyldiaminopimelate-aminotransferase/ acetylornithine transaminase protein  44.19 
 
 
406 aa  330  2e-89  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3697  bifunctional N-succinyldiaminopimelate-aminotransferase/ acetylornithine transaminase protein  44.02 
 
 
405 aa  330  3e-89  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0660  acetylornithine aminotransferase  43 
 
 
394 aa  330  3e-89  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3754  bifunctional N-succinyldiaminopimelate-aminotransferase/ acetylornithine transaminase protein  44.02 
 
 
405 aa  330  3e-89  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0571  bifunctional N-succinyldiaminopimelate-aminotransferase/ acetylornithine transaminase protein  44.02 
 
 
405 aa  330  3e-89  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_34500  bifunctional N-succinyldiaminopimelate-aminotransferase/ acetylornithine transaminase protein  43.56 
 
 
406 aa  328  7e-89  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0578  bifunctional N-succinyldiaminopimelate-aminotransferase/ acetylornithine transaminase protein  43.91 
 
 
405 aa  328  8e-89  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0342  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  47.41 
 
 
417 aa  328  8e-89  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4620  bifunctional N-succinyldiaminopimelate-aminotransferase/ acetylornithine transaminase protein  42.93 
 
 
406 aa  328  9e-89  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0617  bifunctional N-succinyldiaminopimelate-aminotransferase/ acetylornithine transaminase protein  43.51 
 
 
405 aa  328  1.0000000000000001e-88  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00499  bifunctional N-succinyldiaminopimelate-aminotransferase/ acetylornithine transaminase protein  41.43 
 
 
402 aa  328  1.0000000000000001e-88  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3854  bifunctional N-succinyldiaminopimelate-aminotransferase/ acetylornithine transaminase protein  42.75 
 
 
408 aa  328  1.0000000000000001e-88  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0611  bifunctional N-succinyldiaminopimelate-aminotransferase/ acetylornithine transaminase protein  43.51 
 
 
405 aa  328  1.0000000000000001e-88  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.894863 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3419  bifunctional N-succinyldiaminopimelate-aminotransferase/ acetylornithine transaminase protein  43.51 
 
 
405 aa  328  1.0000000000000001e-88  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.103737 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0610  bifunctional N-succinyldiaminopimelate-aminotransferase/ acetylornithine transaminase protein  43.51 
 
 
405 aa  328  1.0000000000000001e-88  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.0636462 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>