More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rru_A3277 on replicon NC_007643
Organism: Rhodospirillum rubrum ATCC 11170



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007643  Rru_A3277  acetylornithine aminotransferase  100 
 
 		 396 aa  787    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1218  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  62.98 
 
 		 402 aa  496  1e-139  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.525687  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6536  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  61.76 
 
 		 397 aa  475  1e-133  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.396008  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7457  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  60.72 
 
 		 397 aa  470  1.0000000000000001e-131  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.484657  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0009  acetylornithine transaminase protein  59.59 
 
 		 401 aa  465  9.999999999999999e-131  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0394  acetylornithine transaminase protein  57.95 
 
 		 403 aa  464  1e-129  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0301  acetylornithine transaminase protein  58.21 
 
 		 403 aa  460  9.999999999999999e-129  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.171719  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0314  acetylornithine transaminase protein  58.21 
 
 		 403 aa  460  9.999999999999999e-129  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4075  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  58.61 
 
 		 396 aa  451  1e-125  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2318  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  58.91 
 
 		 396 aa  446  1.0000000000000001e-124  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.156448 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4442  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  58.61 
 
 		 396 aa  446  1.0000000000000001e-124  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.977458  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0185  acetylornithine transaminase protein  56.41 
 
 		 399 aa  445  1.0000000000000001e-124  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.372078 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4556  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  58.1 
 
 		 396 aa  444  1e-123  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.974298 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2541  acetylornithine transaminase protein  60.43 
 
 		 398 aa  436  1e-121  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0481  acetylornithine transaminase protein  58.18 
 
 		 402 aa  434  1e-120  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0832  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  56.19 
 
 		 400 aa  433  1e-120  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0150295 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0402  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  56.28 
 
 		 446 aa  429  1e-119  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0127  acetylornithine transaminase protein  58.21 
 
 		 399 aa  429  1e-119  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.383449 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0175  acetylornithine transaminase protein  56.92 
 
 		 399 aa  430  1e-119  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0150  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  56.59 
 
 		 405 aa  428  1e-119  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5259  acetylornithine transaminase protein  54.36 
 
 		 403 aa  427  1e-118  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0759  acetylornithine transaminase protein  55.98 
 
 		 403 aa  426  1e-118  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0803695 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0513  acetylornithine transaminase protein  54.96 
 
 		 403 aa  417  9.999999999999999e-116  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.508573 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4916  acetylornithine transaminase protein  55.84 
 
 		 405 aa  415  9.999999999999999e-116  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0883749 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0798  acetylornithine transaminase protein  55.08 
 
 		 393 aa  411  1e-114  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0665  acetylornithine transaminase protein  55.35 
 
 		 391 aa  414  1e-114  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1024  acetylornithine transaminase protein  54.31 
 
 		 395 aa  410  1e-113  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.433962  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2165  acetylornithine transaminase protein  55.7 
 
 		 401 aa  405  1.0000000000000001e-112  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3105  acetylornithine transaminase protein  52.22 
 
 		 393 aa  400  9.999999999999999e-111  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.546024  normal  0.0590877 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1290  acetylornithine transaminase protein  50.89 
 
 		 401 aa  401  9.999999999999999e-111  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0783  acetylornithine transaminase protein  52.91 
 
 		 407 aa  395  1e-109  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0758378  normal  0.118298 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2008  acetylornithine transaminase protein  51.4 
 
 		 393 aa  393  1e-108  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0895  acetylornithine transaminase protein  52.82 
 
 		 403 aa  392  1e-108  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0487  acetylornithine aminotransferase  52.67 
 
 		 395 aa  390  1e-107  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.251081  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2041  acetylornithine transaminase protein  50.26 
 
 		 390 aa  389  1e-107  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0188318 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0718  acetylornithine transaminase protein  51.65 
 
 		 393 aa  386  1e-106  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.759716  normal  0.261062 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2300  acetylornithine and succinylornithine aminotransferases  50.26 
 
 		 394 aa  385  1e-106  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1147  acetylornithine aminotransferase  51.02 
 
 		 394 aa  382  1e-105  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.109776  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3141  acetylornithine transaminase protein  53.23 
 
 		 397 aa  385  1e-105  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.759672  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1409  acetylornithine transaminase protein  52.59 
 
 		 396 aa  376  1e-103  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.111439  normal  0.291313 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1359  acetylornithine transaminase protein  51.94 
 
 		 395 aa  375  1e-103  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.592193  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0642  acetylornithine transaminase protein  52.47 
 
 		 403 aa  370  1e-101  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0226  acetylornithine aminotransferase  50 
 
 		 396 aa  352  5e-96  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1231  acetylornithine transaminase protein  48.17 
 
 		 404 aa  349  5e-95  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0141843 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3744  acetylornithine aminotransferase  49.73 
 
 		 391 aa  348  8e-95  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000932106 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0274  acetylornithine aminotransferase  46.46 
 
 		 396 aa  346  4e-94  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.110157  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1283  acetylornithine transaminase protein  45.19 
 
 		 391 aa  345  7e-94  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2287  acetylornithine aminotransferase  47.77 
 
 		 402 aa  341  1e-92  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.194315 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0342  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  51.17 
 
 		 417 aa  340  2.9999999999999998e-92  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1830  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  46.63 
 
 		 395 aa  340  2.9999999999999998e-92  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.991221  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0559  acetylornithine transaminase protein  44.47 
 
 		 392 aa  339  5e-92  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4620  bifunctional N-succinyldiaminopimelate-aminotransferase/ acetylornithine transaminase protein  46.29 
 
 		 406 aa  339  5e-92  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0772  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  44.47 
 
 		 399 aa  339  5e-92  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.200689  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2493  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  48.91 
 
 		 397 aa  338  7e-92  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0151  acetylornithine aminotransferase  47.63 
 
 		 399 aa  338  9.999999999999999e-92  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0214  acetylornithine transaminase protein  45.91 
 
 		 391 aa  338  9.999999999999999e-92  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  hitchhiker  0.000000369674  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3741  acetylornithine aminotransferase  46.44 
 
 		 397 aa  337  1.9999999999999998e-91  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0943  acetylornithine aminotransferase  48.87 
 
 		 422 aa  337  2.9999999999999997e-91  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2079  acetylornithine aminotransferase  48.07 
 
 		 391 aa  336  3.9999999999999995e-91  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_52720  bifunctional N-succinyldiaminopimelate-aminotransferase/ acetylornithine transaminase protein  45.78 
 
 		 406 aa  336  5e-91  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1698  acetylornithine aminotransferase  44.04 
 
 		 394 aa  335  7e-91  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3150  acetylornithine aminotransferase  47.15 
 
 		 399 aa  335  7e-91  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0886  acetylornithine transaminase protein  44.85 
 
 		 392 aa  335  7.999999999999999e-91  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.0996794  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3636  acetylornithine aminotransferase  46.17 
 
 		 397 aa  335  1e-90  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0176  acetylornithine aminotransferase  55.26 
 
 		 313 aa  334  1e-90  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0204  acetylornithine aminotransferase  47.76 
 
 		 399 aa  334  2e-90  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000412684 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0406  acetylornithine aminotransferase  50.53 
 
 		 388 aa  333  4e-90  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0570  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  50.53 
 
 		 388 aa  333  4e-90  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3730  acetylornithine aminotransferase  47.07 
 
 		 427 aa  332  6e-90  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000174283  normal  0.451197 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0660  acetylornithine aminotransferase  45.41 
 
 		 394 aa  330  2e-89  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0063  acetylornithine and succinylornithine aminotransferases  47.24 
 
 		 396 aa  330  2e-89  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.857354  normal  0.372491 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4481  bifunctional N-succinyldiaminopimelate-aminotransferase/ acetylornithine transaminase protein  45.27 
 
 		 406 aa  330  3e-89  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.593317 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3986  bifunctional N-succinyldiaminopimelate-aminotransferase/ acetylornithine transaminase protein  45.52 
 
 		 406 aa  330  3e-89  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0946  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  50.41 
 
 		 398 aa  330  4e-89  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.104291  normal  0.0999204 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_34500  bifunctional N-succinyldiaminopimelate-aminotransferase/ acetylornithine transaminase protein  46.8 
 
 		 406 aa  330  4e-89  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2872  acetylornithine aminotransferase  49.6 
 
 		 397 aa  329  5.0000000000000004e-89  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0637  acetylornithine aminotransferase  47.09 
 
 		 418 aa  329  5.0000000000000004e-89  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00130856  normal  0.274942 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1434  bifunctional N-succinyldiaminopimelate-aminotransferase/ acetylornithine transaminase protein  45.01 
 
 		 406 aa  328  9e-89  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.845656 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0533  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  44.71 
 
 		 394 aa  327  2.0000000000000001e-88  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2464  acetylornithine aminotransferase  48.43 
 
 		 392 aa  326  4.0000000000000003e-88  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3770  bifunctional N-succinyldiaminopimelate-aminotransferase/ acetylornithine transaminase protein  45.27 
 
 		 406 aa  326  5e-88  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0233516 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1072  acetylornithine aminotransferase  45.03 
 
 		 385 aa  325  9e-88  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0280572  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4285  bifunctional N-succinyldiaminopimelate-aminotransferase/ acetylornithine transaminase protein  45.78 
 
 		 406 aa  325  1e-87  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2121  bifunctional succinylornithine transaminase/acetylornithine transaminase  47.37 
 
 		 414 aa  324  1e-87  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1443  bifunctional succinylornithine transaminase/acetylornithine transaminase  45.24 
 
 		 406 aa  324  2e-87  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.656199 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2520  bifunctional succinylornithine transaminase/acetylornithine transaminase  47.37 
 
 		 414 aa  324  2e-87  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2229  bifunctional succinylornithine transaminase/acetylornithine transaminase  47.37 
 
 		 446 aa  323  3e-87  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5154  acetylornithine aminotransferase  43.48 
 
 		 426 aa  322  6e-87  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000762221 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0569  acetylornithine aminotransferase  44.47 
 
 		 400 aa  322  7e-87  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.160273  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2440  acetylornithine aminotransferase  44.39 
 
 		 388 aa  322  7e-87  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.493949  normal  0.0446911 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2466  bifunctional succinylornithine transaminase/acetylornithine transaminase  44.99 
 
 		 406 aa  322  7e-87  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.841609 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2414  acetylornithine aminotransferase  46.44 
 
 		 396 aa  322  8e-87  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2844  bifunctional succinylornithine transaminase/acetylornithine transaminase  46.13 
 
 		 404 aa  322  8e-87  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.285049  hitchhiker  0.00544631 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1596  acetylornithine aminotransferase  44.47 
 
 		 386 aa  321  9.999999999999999e-87  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2898  acetylornithine aminotransferase  47.14 
 
 		 389 aa  320  1.9999999999999998e-86  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3565  bifunctional N-succinyldiaminopimelate-aminotransferase/ acetylornithine transaminase protein  45.5 
 
 		 405 aa  320  1.9999999999999998e-86  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.209353  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2013  acetylornithine aminotransferase  42.61 
 
 		 418 aa  320  1.9999999999999998e-86  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.152714 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1986  acetylornithine aminotransferase  42.61 
 
 		 418 aa  321  1.9999999999999998e-86  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02850  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  46.17 
 
 		 399 aa  320  1.9999999999999998e-86  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.0000577952  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2826  acetylornithine aminotransferase  43.95 
 
 		 386 aa  321  1.9999999999999998e-86  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>