More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfum_0063 on replicon NC_008554
Organism: Syntrophobacter fumaroxidans MPOB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008554  Sfum_0063  acetylornithine and succinylornithine aminotransferases  100 
 
 
396 aa  813    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.857354  normal  0.372491 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2493  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  58.95 
 
 
397 aa  465  9.999999999999999e-131  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3150  acetylornithine aminotransferase  59.17 
 
 
399 aa  466  9.999999999999999e-131  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3173  acetylornithine aminotransferase  57.65 
 
 
398 aa  466  9.999999999999999e-131  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.324258  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0151  acetylornithine aminotransferase  57.61 
 
 
399 aa  462  1e-129  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0226  acetylornithine aminotransferase  57.18 
 
 
396 aa  461  1e-129  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3741  acetylornithine aminotransferase  56.85 
 
 
397 aa  459  9.999999999999999e-129  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3636  acetylornithine aminotransferase  56.59 
 
 
397 aa  461  9.999999999999999e-129  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0204  acetylornithine aminotransferase  56.46 
 
 
399 aa  452  1.0000000000000001e-126  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000412684 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0274  acetylornithine aminotransferase  52.07 
 
 
396 aa  439  9.999999999999999e-123  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.110157  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0353  acetylornithine aminotransferase  52.99 
 
 
395 aa  440  9.999999999999999e-123  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  hitchhiker  0.00220895 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1566  acetylornithine aminotransferase  53.25 
 
 
395 aa  439  9.999999999999999e-123  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2414  acetylornithine aminotransferase  55.91 
 
 
396 aa  432  1e-120  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0660  acetylornithine aminotransferase  51.04 
 
 
394 aa  425  1e-118  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0483  acetylornithine aminotransferase  52.47 
 
 
395 aa  424  1e-117  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0640  acetylornithine aminotransferase  52.07 
 
 
403 aa  424  1e-117  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.41902  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0426  acetylornithine aminotransferase  49.09 
 
 
396 aa  423  1e-117  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0269327  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0569  acetylornithine aminotransferase  50.26 
 
 
400 aa  419  1e-116  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.160273  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2287  acetylornithine aminotransferase  52.99 
 
 
402 aa  420  1e-116  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.194315 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1830  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  52.33 
 
 
395 aa  416  9.999999999999999e-116  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.991221  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1698  acetylornithine aminotransferase  49.22 
 
 
394 aa  414  1e-114  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2151  acetylornithine aminotransferase  52.48 
 
 
405 aa  407  1.0000000000000001e-112  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.0731978 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3744  acetylornithine aminotransferase  52.62 
 
 
391 aa  405  1.0000000000000001e-112  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000932106 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0533  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  49.49 
 
 
394 aa  403  1e-111  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2872  acetylornithine aminotransferase  50.26 
 
 
397 aa  397  1e-109  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0772  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  49.87 
 
 
399 aa  394  1e-108  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.200689  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02850  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  48.96 
 
 
399 aa  391  1e-108  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.0000577952  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1041  acetylornithine aminotransferase  49.74 
 
 
390 aa  394  1e-108  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.370932  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0342  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  51.81 
 
 
417 aa  393  1e-108  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2288  acetylornithine and succinylornithine aminotransferases  50.25 
 
 
396 aa  395  1e-108  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.37355  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2464  acetylornithine aminotransferase  50.65 
 
 
392 aa  394  1e-108  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0946  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  51.72 
 
 
398 aa  390  1e-107  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.104291  normal  0.0999204 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1866  acetylornithine aminotransferase  49.37 
 
 
400 aa  385  1e-106  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2079  acetylornithine aminotransferase  50.79 
 
 
391 aa  378  1e-104  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1094  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  46.79 
 
 
387 aa  372  1e-102  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2912  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  46.51 
 
 
400 aa  369  1e-101  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.386564  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1346  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  48.57 
 
 
399 aa  369  1e-101  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1426  acetylornithine aminotransferase  47.22 
 
 
400 aa  369  1e-101  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1958  acetylornithine aminotransferase  49.74 
 
 
401 aa  370  1e-101  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1258  acetylornithine aminotransferase  44.39 
 
 
398 aa  367  1e-100  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00185503  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3149  acetylornithine aminotransferase  46.72 
 
 
402 aa  367  1e-100  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.457305 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1069  acetylornithine aminotransferase  43.88 
 
 
398 aa  366  1e-100  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00131217  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2440  acetylornithine aminotransferase  47.03 
 
 
388 aa  367  1e-100  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.493949  normal  0.0446911 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0914  acetylornithine aminotransferase  46.94 
 
 
399 aa  364  1e-99  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1102  acetylornithine aminotransferase  51.05 
 
 
394 aa  363  4e-99  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0009  acetylornithine transaminase protein  48.96 
 
 
401 aa  360  2e-98  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0842  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  47.83 
 
 
399 aa  360  3e-98  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0215856 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1072  acetylornithine aminotransferase  46.49 
 
 
385 aa  358  8e-98  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0280572  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0982  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  49.08 
 
 
410 aa  356  3.9999999999999996e-97  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5154  acetylornithine aminotransferase  47.22 
 
 
426 aa  354  2e-96  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000762221 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1040  acetylornithine aminotransferase  46.23 
 
 
385 aa  353  2e-96  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.000111021  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1164  acetylornithine aminotransferase  47.64 
 
 
398 aa  353  2e-96  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.581434  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2898  acetylornithine aminotransferase  46.51 
 
 
389 aa  353  2.9999999999999997e-96  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3003  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  46.84 
 
 
427 aa  353  2.9999999999999997e-96  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1837  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  48.57 
 
 
401 aa  352  7e-96  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1224  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  47.06 
 
 
399 aa  351  1e-95  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.803293  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp3040  acetylornithine aminotransferase  46.25 
 
 
389 aa  351  1e-95  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3730  acetylornithine aminotransferase  46.84 
 
 
427 aa  350  2e-95  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000174283  normal  0.451197 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2429  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  46.34 
 
 
393 aa  351  2e-95  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1041  acetylornithine aminotransferase  42.86 
 
 
398 aa  350  3e-95  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0101251  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2649  acetylornithine aminotransferase  46.06 
 
 
423 aa  349  5e-95  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.46775  normal  0.4632 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3770  bifunctional N-succinyldiaminopimelate-aminotransferase/ acetylornithine transaminase protein  45.95 
 
 
406 aa  348  6e-95  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0233516 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2013  acetylornithine aminotransferase  46.12 
 
 
418 aa  349  6e-95  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.152714 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1710  acetylornithine aminotransferase  49.61 
 
 
392 aa  348  1e-94  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0925352  hitchhiker  0.00335003 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1851  acetylornithine aminotransferase  47.7 
 
 
394 aa  347  2e-94  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1986  acetylornithine aminotransferase  45.86 
 
 
418 aa  347  2e-94  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3986  bifunctional N-succinyldiaminopimelate-aminotransferase/ acetylornithine transaminase protein  46.21 
 
 
406 aa  347  3e-94  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01717  succinylornithine transaminase, PLP-dependent  47.06 
 
 
406 aa  346  4e-94  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01705  hypothetical protein  47.06 
 
 
406 aa  346  4e-94  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1831  bifunctional succinylornithine transaminase/acetylornithine transaminase  47.06 
 
 
406 aa  345  5e-94  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1951  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  42.6 
 
 
398 aa  346  5e-94  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.620278  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1894  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  47.06 
 
 
406 aa  345  7e-94  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.433032  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1970  bifunctional succinylornithine transaminase/acetylornithine transaminase  47.06 
 
 
406 aa  345  7e-94  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1884  bifunctional succinylornithine transaminase/acetylornithine transaminase  47.06 
 
 
406 aa  345  7e-94  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00408684 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_52720  bifunctional N-succinyldiaminopimelate-aminotransferase/ acetylornithine transaminase protein  44.19 
 
 
406 aa  345  7e-94  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_34500  bifunctional N-succinyldiaminopimelate-aminotransferase/ acetylornithine transaminase protein  45.67 
 
 
406 aa  345  8.999999999999999e-94  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4620  bifunctional N-succinyldiaminopimelate-aminotransferase/ acetylornithine transaminase protein  44.85 
 
 
406 aa  345  1e-93  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1434  bifunctional N-succinyldiaminopimelate-aminotransferase/ acetylornithine transaminase protein  45.69 
 
 
406 aa  345  1e-93  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.845656 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2618  acetylornithine aminotransferase  46.23 
 
 
400 aa  344  2e-93  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00459682  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3033  acetylornithine aminotransferase  48.28 
 
 
390 aa  344  2e-93  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.850335  normal  0.390329 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1157  bifunctional N-succinyldiaminopimelate-aminotransferase/ acetylornithine transaminase protein  46.84 
 
 
410 aa  344  2e-93  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.861166  normal  0.0351204 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6536  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  49.47 
 
 
397 aa  343  2.9999999999999997e-93  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.396008  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1907  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  44.24 
 
 
387 aa  343  4e-93  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0119007  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0406  acetylornithine aminotransferase  46.74 
 
 
388 aa  343  4e-93  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3962  acetylornithine aminotransferase  44.65 
 
 
386 aa  343  4e-93  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00766837  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1180  bifunctional N-succinyldiaminopimelate-aminotransferase/ acetylornithine transaminase protein  47.11 
 
 
410 aa  343  4e-93  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0570  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  46.74 
 
 
388 aa  343  4e-93  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1901  acetylornithine aminotransferase  45.76 
 
 
400 aa  342  5.999999999999999e-93  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.133726  normal  0.687258 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1443  bifunctional succinylornithine transaminase/acetylornithine transaminase  46.8 
 
 
406 aa  342  5.999999999999999e-93  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.656199 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4636  acetylornithine aminotransferase  45.45 
 
 
395 aa  342  7e-93  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.621133  normal  0.175641 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1061  bifunctional N-succinyldiaminopimelate-aminotransferase/ acetylornithine transaminase protein  46.58 
 
 
410 aa  342  9e-93  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.964628  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1061  bifunctional N-succinyldiaminopimelate-aminotransferase/ acetylornithine transaminase protein  46.49 
 
 
410 aa  342  9e-93  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.637479  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1452  acetylornithine aminotransferase  46.6 
 
 
402 aa  342  9e-93  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4481  bifunctional N-succinyldiaminopimelate-aminotransferase/ acetylornithine transaminase protein  45.17 
 
 
406 aa  342  1e-92  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.593317 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1787  bifunctional N-succinyldiaminopimelate-aminotransferase/ acetylornithine transaminase protein  45.53 
 
 
409 aa  341  1e-92  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1558  bifunctional N-succinyldiaminopimelate-aminotransferase/ acetylornithine transaminase protein  46.3 
 
 
411 aa  341  1e-92  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.751074  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0701  bifunctional N-succinyldiaminopimelate-aminotransferase/ acetylornithine transaminase protein  46.84 
 
 
410 aa  341  1e-92  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0520056  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4582  bifunctional N-succinyldiaminopimelate-aminotransferase/ acetylornithine transaminase protein  46.79 
 
 
405 aa  341  1e-92  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2124  bifunctional N-succinyldiaminopimelate-aminotransferase/ acetylornithine transaminase protein  46.32 
 
 
410 aa  341  1e-92  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.975893  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4200  acetylornithine aminotransferase  43.83 
 
 
386 aa  340  2e-92  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>