More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_1452 on replicon NC_012791
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008825  Mpe_A3029  acetylornithine aminotransferase  77.55 
 
 
410 aa  634    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.51469  normal  0.939431 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1164  acetylornithine aminotransferase  83.42 
 
 
398 aa  696    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.581434  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3011  acetylornithine aminotransferase  80.92 
 
 
404 aa  671    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0906  acetylornithine aminotransferase  79.05 
 
 
402 aa  652    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1452  acetylornithine aminotransferase  100 
 
 
402 aa  820    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2121  acetylornithine aminotransferase  78.54 
 
 
404 aa  640    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  decreased coverage  0.00994118  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3572  acetylornithine aminotransferase  81.09 
 
 
404 aa  674    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.331421 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1901  acetylornithine aminotransferase  74.87 
 
 
400 aa  620  1e-177  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.133726  normal  0.687258 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3002  acetylornithine aminotransferase  74.12 
 
 
398 aa  618  1e-176  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.555766  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2429  acetylornithine aminotransferase  74.12 
 
 
398 aa  619  1e-176  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2179  acetylornithine aminotransferase  72.36 
 
 
398 aa  607  1e-173  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.569965  normal  0.442274 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2676  acetylornithine aminotransferase  58.14 
 
 
391 aa  476  1e-133  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3033  acetylornithine aminotransferase  58.66 
 
 
390 aa  470  1.0000000000000001e-131  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.850335  normal  0.390329 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1041  acetylornithine aminotransferase  56.07 
 
 
390 aa  460  9.999999999999999e-129  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.370932  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1851  acetylornithine aminotransferase  57.25 
 
 
394 aa  452  1.0000000000000001e-126  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1710  acetylornithine aminotransferase  56.27 
 
 
392 aa  445  1.0000000000000001e-124  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0925352  hitchhiker  0.00335003 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2464  acetylornithine aminotransferase  54.59 
 
 
392 aa  439  9.999999999999999e-123  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1102  acetylornithine aminotransferase  54.1 
 
 
394 aa  436  1e-121  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1346  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  52.41 
 
 
399 aa  426  1e-118  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0533  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  50.26 
 
 
394 aa  417  9.999999999999999e-116  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2079  acetylornithine aminotransferase  51.41 
 
 
391 aa  410  1e-113  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0982  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  51.51 
 
 
410 aa  411  1e-113  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0946  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  52.33 
 
 
398 aa  410  1e-113  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.104291  normal  0.0999204 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2429  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  50.13 
 
 
393 aa  402  1e-111  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0570  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  50.26 
 
 
388 aa  390  1e-107  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0406  acetylornithine aminotransferase  50.26 
 
 
388 aa  390  1e-107  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3708  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  48.48 
 
 
412 aa  384  1e-105  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.339324  normal  0.0114471 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2440  acetylornithine aminotransferase  48.69 
 
 
388 aa  383  1e-105  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.493949  normal  0.0446911 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0226  acetylornithine aminotransferase  49.87 
 
 
396 aa  380  1e-104  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp3040  acetylornithine aminotransferase  47.03 
 
 
389 aa  377  1e-103  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2898  acetylornithine aminotransferase  47.03 
 
 
389 aa  377  1e-103  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2358  acetylornithine aminotransferase  51.32 
 
 
400 aa  369  1e-101  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.284538  normal  0.840689 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3636  acetylornithine aminotransferase  47.97 
 
 
397 aa  371  1e-101  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3741  acetylornithine aminotransferase  48.48 
 
 
397 aa  370  1e-101  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2618  acetylornithine aminotransferase  50.13 
 
 
400 aa  367  1e-100  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00459682  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3150  acetylornithine aminotransferase  50.52 
 
 
399 aa  365  1e-100  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0151  acetylornithine aminotransferase  48.16 
 
 
399 aa  363  2e-99  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4636  acetylornithine aminotransferase  50.27 
 
 
395 aa  363  2e-99  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.621133  normal  0.175641 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0204  acetylornithine aminotransferase  48.95 
 
 
399 aa  363  3e-99  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000412684 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1566  acetylornithine aminotransferase  48.81 
 
 
395 aa  362  7.0000000000000005e-99  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0353  acetylornithine aminotransferase  48.96 
 
 
395 aa  361  1e-98  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  hitchhiker  0.00220895 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2414  acetylornithine aminotransferase  49.6 
 
 
396 aa  359  4e-98  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2287  acetylornithine aminotransferase  45.76 
 
 
402 aa  355  5e-97  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.194315 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3744  acetylornithine aminotransferase  47.15 
 
 
391 aa  355  5.999999999999999e-97  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000932106 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0772  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  46.83 
 
 
399 aa  355  7.999999999999999e-97  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.200689  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0274  acetylornithine aminotransferase  47.49 
 
 
396 aa  350  2e-95  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.110157  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0943  acetylornithine aminotransferase  48.7 
 
 
422 aa  347  2e-94  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0640  acetylornithine aminotransferase  48.02 
 
 
403 aa  347  2e-94  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.41902  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0426  acetylornithine aminotransferase  46.72 
 
 
396 aa  347  2e-94  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0269327  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1698  acetylornithine aminotransferase  46.67 
 
 
394 aa  346  3e-94  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2493  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  47.07 
 
 
397 aa  345  8e-94  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2013  acetylornithine aminotransferase  44.78 
 
 
418 aa  344  1e-93  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.152714 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0483  acetylornithine aminotransferase  47.76 
 
 
395 aa  345  1e-93  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1986  acetylornithine aminotransferase  44.78 
 
 
418 aa  344  1e-93  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3173  acetylornithine aminotransferase  45.57 
 
 
398 aa  343  5e-93  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.324258  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0660  acetylornithine aminotransferase  46.61 
 
 
394 aa  342  5.999999999999999e-93  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5154  acetylornithine aminotransferase  44.33 
 
 
426 aa  342  7e-93  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000762221 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02850  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  43.9 
 
 
399 aa  342  8e-93  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.0000577952  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1866  acetylornithine aminotransferase  44.33 
 
 
400 aa  341  1e-92  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0063  acetylornithine and succinylornithine aminotransferases  46.6 
 
 
396 aa  342  1e-92  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.857354  normal  0.372491 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1423  acetylornithine aminotransferase  43.62 
 
 
398 aa  340  2.9999999999999998e-92  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.050105  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2649  acetylornithine aminotransferase  43.86 
 
 
423 aa  337  2.9999999999999997e-91  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.46775  normal  0.4632 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2912  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  43.15 
 
 
400 aa  334  1e-90  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.386564  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0727  acetylornithine aminotransferase  49.48 
 
 
389 aa  331  1e-89  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0342  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  46.17 
 
 
417 aa  331  2e-89  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3730  acetylornithine aminotransferase  44.01 
 
 
427 aa  328  1.0000000000000001e-88  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000174283  normal  0.451197 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2288  acetylornithine and succinylornithine aminotransferases  45.38 
 
 
396 aa  327  3e-88  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.37355  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1405  acetylornithine aminotransferase  42.71 
 
 
393 aa  325  7e-88  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.966648  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1371  acetylornithine aminotransferase  42.23 
 
 
379 aa  324  2e-87  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0569  acetylornithine aminotransferase  45.38 
 
 
400 aa  323  3e-87  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.160273  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1057  acetylornithine aminotransferase  42.2 
 
 
393 aa  322  6e-87  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.00148742  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_13491  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  44.19 
 
 
420 aa  322  6e-87  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3003  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  44.24 
 
 
427 aa  322  7e-87  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1830  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  45 
 
 
395 aa  320  3e-86  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.991221  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2872  acetylornithine aminotransferase  44.33 
 
 
397 aa  319  6e-86  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0858  acetylornithine aminotransferase  43.15 
 
 
434 aa  319  6e-86  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2204  acetylornithine aminotransferase  41.07 
 
 
390 aa  319  7e-86  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1596  acetylornithine aminotransferase  44.92 
 
 
386 aa  317  3e-85  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0637  acetylornithine aminotransferase  44.79 
 
 
418 aa  317  3e-85  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00130856  normal  0.274942 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1951  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  42.41 
 
 
398 aa  313  1.9999999999999998e-84  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.620278  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1040  acetylornithine aminotransferase  44.94 
 
 
385 aa  313  2.9999999999999996e-84  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.000111021  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3962  acetylornithine aminotransferase  41.71 
 
 
386 aa  312  6.999999999999999e-84  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00766837  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2541  acetylornithine transaminase protein  45.38 
 
 
398 aa  312  6.999999999999999e-84  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1072  acetylornithine aminotransferase  44.42 
 
 
385 aa  312  6.999999999999999e-84  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0280572  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0481  acetylornithine transaminase protein  43.6 
 
 
402 aa  309  5e-83  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1534  acetylornithine aminotransferase  44.53 
 
 
394 aa  308  9e-83  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.719069  n/a   
 
 
-
 
NC_011699  PHATRDRAFT_50577  acetylornithine aminotransferase  40.72 
 
 
476 aa  307  2.0000000000000002e-82  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1094  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  40.87 
 
 
387 aa  307  2.0000000000000002e-82  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0739  acetylornithine aminotransferase  42.22 
 
 
386 aa  306  6e-82  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.791606  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1500  acetylornithine aminotransferase  43.73 
 
 
423 aa  306  6e-82  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000760659 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3172  acetylornithine aminotransferase  45.23 
 
 
444 aa  305  1.0000000000000001e-81  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.22064  normal  0.239102 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22300  acetylornithine/succinylornithine aminotransferase  45.18 
 
 
425 aa  303  3.0000000000000004e-81  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.271521  normal  0.79569 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2041  acetylornithine transaminase protein  44.68 
 
 
390 aa  302  6.000000000000001e-81  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.0188318 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4200  acetylornithine aminotransferase  41.19 
 
 
386 aa  301  1e-80  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3884  acetylornithine aminotransferase  42.19 
 
 
386 aa  301  1e-80  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_19841  acetylornithine aminotransferase  41.29 
 
 
418 aa  301  1e-80  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0786665 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0593  acetylornithine aminotransferase  39.64 
 
 
397 aa  301  1e-80  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.642559  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2318  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  45.22 
 
 
396 aa  300  2e-80  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.156448 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1218  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  42.32 
 
 
402 aa  300  4e-80  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.525687  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0871  acetylornithine aminotransferase  41.34 
 
 
403 aa  299  5e-80  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>