More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_0127 on replicon NC_009636
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009636  Smed_0127  acetylornithine transaminase protein  100 
 
 
399 aa  802    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.383449 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0185  acetylornithine transaminase protein  77.95 
 
 
399 aa  640    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.372078 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0175  acetylornithine transaminase protein  78.97 
 
 
399 aa  631  1e-180  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0481  acetylornithine transaminase protein  76.9 
 
 
402 aa  617  1e-175  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0394  acetylornithine transaminase protein  74.17 
 
 
403 aa  607  9.999999999999999e-173  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0301  acetylornithine transaminase protein  72.63 
 
 
403 aa  598  1e-170  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.171719  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0314  acetylornithine transaminase protein  72.63 
 
 
403 aa  598  1e-170  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0009  acetylornithine transaminase protein  68.61 
 
 
401 aa  572  1.0000000000000001e-162  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7457  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  67.18 
 
 
397 aa  543  1e-153  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.484657  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6536  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  66.41 
 
 
397 aa  535  1e-151  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.396008  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1218  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  65.54 
 
 
402 aa  525  1e-148  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.525687  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4556  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  65.63 
 
 
396 aa  518  1e-146  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.974298 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0402  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  67.67 
 
 
446 aa  517  1.0000000000000001e-145  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4075  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  65.37 
 
 
396 aa  517  1.0000000000000001e-145  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4442  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  65.37 
 
 
396 aa  511  1e-144  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.977458  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2318  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  66.49 
 
 
396 aa  507  9.999999999999999e-143  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.156448 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1290  acetylornithine transaminase protein  59.03 
 
 
401 aa  501  1e-141  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0150  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  62.31 
 
 
405 aa  496  1e-139  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5259  acetylornithine transaminase protein  60.55 
 
 
403 aa  497  1e-139  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0832  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  64.12 
 
 
400 aa  493  9.999999999999999e-139  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0150295 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4916  acetylornithine transaminase protein  61.28 
 
 
405 aa  487  1e-136  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.0883749 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0759  acetylornithine transaminase protein  60.71 
 
 
403 aa  486  1e-136  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0803695 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0513  acetylornithine transaminase protein  60.88 
 
 
403 aa  481  1e-135  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.508573 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0665  acetylornithine transaminase protein  62.93 
 
 
391 aa  478  1e-133  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0895  acetylornithine transaminase protein  59.05 
 
 
403 aa  468  1.0000000000000001e-131  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0783  acetylornithine transaminase protein  58.54 
 
 
407 aa  466  9.999999999999999e-131  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0758378  normal  0.118298 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0798  acetylornithine transaminase protein  60.22 
 
 
393 aa  461  9.999999999999999e-129  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2041  acetylornithine transaminase protein  59.27 
 
 
390 aa  457  1e-127  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.0188318 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0487  acetylornithine aminotransferase  60 
 
 
395 aa  457  1e-127  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.251081  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3105  acetylornithine transaminase protein  58.51 
 
 
393 aa  454  1.0000000000000001e-126  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.546024  normal  0.0590877 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2008  acetylornithine transaminase protein  59.06 
 
 
393 aa  449  1e-125  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3277  acetylornithine aminotransferase  58.21 
 
 
396 aa  449  1e-125  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0642  acetylornithine transaminase protein  58.52 
 
 
403 aa  447  1.0000000000000001e-124  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0718  acetylornithine transaminase protein  59.32 
 
 
393 aa  441  9.999999999999999e-123  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.759716  normal  0.261062 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1147  acetylornithine aminotransferase  55.73 
 
 
394 aa  432  1e-120  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.109776  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2300  acetylornithine and succinylornithine aminotransferases  55.3 
 
 
394 aa  429  1e-119  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1231  acetylornithine transaminase protein  54.31 
 
 
404 aa  425  1e-118  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.0141843 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1024  acetylornithine transaminase protein  55.12 
 
 
395 aa  423  1e-117  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.433962  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1359  acetylornithine transaminase protein  55.15 
 
 
395 aa  424  1e-117  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.592193  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1409  acetylornithine transaminase protein  55.93 
 
 
396 aa  414  1e-114  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.111439  normal  0.291313 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3141  acetylornithine transaminase protein  56.28 
 
 
397 aa  412  1e-114  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.759672  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2165  acetylornithine transaminase protein  53.81 
 
 
401 aa  410  1e-113  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2541  acetylornithine transaminase protein  56.45 
 
 
398 aa  410  1e-113  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0176  acetylornithine aminotransferase  59.41 
 
 
313 aa  373  1e-102  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1283  acetylornithine transaminase protein  48.95 
 
 
391 aa  371  1e-101  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0214  acetylornithine transaminase protein  47.4 
 
 
391 aa  369  1e-101  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  hitchhiker  0.000000369674  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0559  acetylornithine transaminase protein  48.08 
 
 
392 aa  359  5e-98  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1866  acetylornithine aminotransferase  50.14 
 
 
400 aa  359  5e-98  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0886  acetylornithine transaminase protein  45.1 
 
 
392 aa  357  1.9999999999999998e-97  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.0996794  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3636  acetylornithine aminotransferase  48.81 
 
 
397 aa  354  2e-96  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0226  acetylornithine aminotransferase  49.6 
 
 
396 aa  353  2e-96  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3011  bifunctional N-succinyldiaminopimelate-aminotransferase/ acetylornithine transaminase protein  50.4 
 
 
404 aa  352  5e-96  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0772  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  47.11 
 
 
399 aa  352  8e-96  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.200689  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0651  bifunctional N-succinyldiaminopimelate-aminotransferase/ acetylornithine transaminase protein  47.09 
 
 
401 aa  350  3e-95  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.293343  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0809  bifunctional N-succinyldiaminopimelate-aminotransferase/ acetylornithine transaminase protein  49.6 
 
 
405 aa  349  5e-95  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000843342 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0645  bifunctional N-succinyldiaminopimelate-aminotransferase/ acetylornithine transaminase protein  48.14 
 
 
405 aa  348  1e-94  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3741  acetylornithine aminotransferase  47.48 
 
 
397 aa  348  1e-94  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2686  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  50.4 
 
 
402 aa  348  1e-94  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0960288 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3880  bifunctional N-succinyldiaminopimelate-aminotransferase/ acetylornithine transaminase protein  48.4 
 
 
405 aa  347  2e-94  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0617  bifunctional N-succinyldiaminopimelate-aminotransferase/ acetylornithine transaminase protein  48.4 
 
 
405 aa  347  3e-94  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3697  bifunctional N-succinyldiaminopimelate-aminotransferase/ acetylornithine transaminase protein  48.4 
 
 
405 aa  346  4e-94  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0571  bifunctional N-succinyldiaminopimelate-aminotransferase/ acetylornithine transaminase protein  48.4 
 
 
405 aa  346  4e-94  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2287  acetylornithine aminotransferase  46.35 
 
 
402 aa  346  4e-94  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.194315 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3754  bifunctional N-succinyldiaminopimelate-aminotransferase/ acetylornithine transaminase protein  48.4 
 
 
405 aa  346  4e-94  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3193  bifunctional N-succinyldiaminopimelate-aminotransferase/ acetylornithine transaminase protein  49.47 
 
 
405 aa  346  5e-94  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0610  bifunctional N-succinyldiaminopimelate-aminotransferase/ acetylornithine transaminase protein  48.4 
 
 
405 aa  345  6e-94  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.0636462 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3516  bifunctional N-succinyldiaminopimelate-aminotransferase/ acetylornithine transaminase protein  48.79 
 
 
405 aa  345  6e-94  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0611  bifunctional N-succinyldiaminopimelate-aminotransferase/ acetylornithine transaminase protein  48.4 
 
 
405 aa  345  6e-94  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.894863 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3419  bifunctional N-succinyldiaminopimelate-aminotransferase/ acetylornithine transaminase protein  48.4 
 
 
405 aa  345  6e-94  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.103737 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0151  acetylornithine aminotransferase  48.96 
 
 
399 aa  343  2e-93  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2414  acetylornithine aminotransferase  48 
 
 
396 aa  343  2e-93  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3744  acetylornithine aminotransferase  46.84 
 
 
391 aa  343  2.9999999999999997e-93  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000932106 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3704  bifunctional N-succinyldiaminopimelate-aminotransferase/ acetylornithine transaminase protein  47.01 
 
 
405 aa  343  2.9999999999999997e-93  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0245  bifunctional N-succinyldiaminopimelate-aminotransferase/ acetylornithine transaminase protein  47.01 
 
 
405 aa  343  2.9999999999999997e-93  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.110716  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3299  bifunctional N-succinyldiaminopimelate-aminotransferase/ acetylornithine transaminase protein  48.41 
 
 
405 aa  342  5e-93  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1698  acetylornithine aminotransferase  45.38 
 
 
394 aa  343  5e-93  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0655  bifunctional N-succinyldiaminopimelate-aminotransferase/ acetylornithine transaminase protein  48.25 
 
 
405 aa  342  7e-93  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000579113 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0342  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  50 
 
 
417 aa  341  1e-92  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2826  acetylornithine aminotransferase  45.69 
 
 
386 aa  341  1e-92  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2288  acetylornithine and succinylornithine aminotransferases  46.03 
 
 
396 aa  341  1e-92  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.37355  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00499  bifunctional N-succinyldiaminopimelate-aminotransferase/ acetylornithine transaminase protein  46.11 
 
 
402 aa  340  2e-92  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2649  acetylornithine aminotransferase  45.29 
 
 
423 aa  340  2e-92  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.46775  normal  0.4632 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0578  bifunctional N-succinyldiaminopimelate-aminotransferase/ acetylornithine transaminase protein  47.62 
 
 
405 aa  340  2.9999999999999998e-92  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0285  bifunctional N-succinyldiaminopimelate-aminotransferase/ acetylornithine transaminase protein  46.19 
 
 
413 aa  339  4e-92  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0569  acetylornithine aminotransferase  48.16 
 
 
400 aa  340  4e-92  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.160273  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0660  acetylornithine aminotransferase  47.49 
 
 
394 aa  339  5e-92  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0637  acetylornithine aminotransferase  47.44 
 
 
418 aa  339  5e-92  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00130856  normal  0.274942 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1109  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  48 
 
 
411 aa  339  5e-92  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3947  bifunctional N-succinyldiaminopimelate-aminotransferase/ acetylornithine transaminase protein  46.49 
 
 
405 aa  339  5.9999999999999996e-92  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2888  acetylornithine aminotransferase  47.27 
 
 
397 aa  338  7e-92  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0887768  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002275  acetylornithine aminotransferase/N-succinyl-L,L-diaminopimelate aminotransferase/succinylornithine transaminase  46.02 
 
 
403 aa  338  8e-92  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00079  bifunctional N-succinyldiaminopimelate-aminotransferase/ acetylornithine transaminase protein  46.02 
 
 
403 aa  338  9.999999999999999e-92  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3730  acetylornithine aminotransferase  46.19 
 
 
427 aa  338  9.999999999999999e-92  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000174283  normal  0.451197 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3150  acetylornithine aminotransferase  48.02 
 
 
399 aa  338  9.999999999999999e-92  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2912  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  44.59 
 
 
400 aa  338  9.999999999999999e-92  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.386564  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2079  acetylornithine aminotransferase  45.79 
 
 
391 aa  336  3.9999999999999995e-91  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1566  acetylornithine aminotransferase  46.41 
 
 
395 aa  336  3.9999999999999995e-91  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1710  acetylornithine aminotransferase  48.96 
 
 
392 aa  336  5e-91  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0925352  hitchhiker  0.00335003 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0368  bifunctional N-succinyldiaminopimelate-aminotransferase/ acetylornithine transaminase protein  45.43 
 
 
406 aa  336  5e-91  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1784  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  44.65 
 
 
385 aa  335  7e-91  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.74918  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>