More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC7424_4452 on replicon NC_011729
Organism: Cyanothece sp. PCC 7424



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011729  PCC7424_4452  4-aminobutyrate aminotransferase  100 
 
 
441 aa  899    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0214  4-aminobutyrate aminotransferase  75.4 
 
 
431 aa  682    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.144778  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2649  aminotransferase class-III  52.6 
 
 
441 aa  456  1e-127  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.856293 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3076  Acetylornithine transaminase  53.15 
 
 
432 aa  449  1e-125  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.25771  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3989  4-aminobutyrate aminotransferase  50.57 
 
 
461 aa  445  1.0000000000000001e-124  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.992424  normal  0.611425 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0139  aminotransferase class-III  49.66 
 
 
452 aa  431  1e-119  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000384602  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0539  4-aminobutyrate aminotransferase  50 
 
 
444 aa  428  1e-119  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1738  aminotransferase class-III  46.6 
 
 
465 aa  407  1.0000000000000001e-112  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.243066  normal  0.440114 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0989  4-aminobutyrate aminotransferase  47.46 
 
 
458 aa  399  9.999999999999999e-111  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.48801  normal  0.0598376 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1796  Acetylornithine transaminase  48.75 
 
 
439 aa  396  1e-109  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.778199  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1464  aminotransferase class-III  51.26 
 
 
448 aa  395  1e-108  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000155661  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2019  aminotransferase class-III  46.46 
 
 
465 aa  394  1e-108  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1743  4-aminobutyrate aminotransferase  48.65 
 
 
447 aa  383  1e-105  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0510  4-aminobutyrate aminotransferase  47.99 
 
 
441 aa  378  1e-103  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0759  4-aminobutyrate aminotransferase  48.31 
 
 
446 aa  375  1e-102  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.174279  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0687  4-aminobutyrate aminotransferase  44.12 
 
 
459 aa  372  1e-102  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  hitchhiker  0.00660505 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0176  4-aminobutyrate aminotransferase  47.75 
 
 
448 aa  365  1e-100  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.0769086 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0949  aminotransferase class-III  41.92 
 
 
418 aa  339  7e-92  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3219  aminotransferase class-III  44.92 
 
 
442 aa  328  1.0000000000000001e-88  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.338952 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3926  aminotransferase class-III  44.7 
 
 
442 aa  324  2e-87  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0275  4-aminobutyrate aminotransferase  42.82 
 
 
417 aa  318  9e-86  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.0862859 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2245  4-aminobutyrate aminotransferase  40.45 
 
 
441 aa  315  9.999999999999999e-85  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.120834  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2755  4-aminobutyrate aminotransferase  39.14 
 
 
448 aa  312  9e-84  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1957  4-aminobutyrate aminotransferase  41.84 
 
 
427 aa  312  9e-84  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2386  aminotransferase  40 
 
 
471 aa  309  5.9999999999999995e-83  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.419585  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0660  acetylornithine aminotransferase  40.24 
 
 
394 aa  305  1.0000000000000001e-81  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0151  acetylornithine aminotransferase  41.41 
 
 
399 aa  304  2.0000000000000002e-81  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0566  4-aminobutyrate aminotransferase  40 
 
 
428 aa  301  1e-80  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2400  4-aminobutyrate aminotransferase  41.53 
 
 
430 aa  297  3e-79  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.681516  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0315  4-aminobutyrate aminotransferase  38.9 
 
 
440 aa  295  8e-79  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2754  4-aminobutyrate aminotransferase  42.03 
 
 
445 aa  295  1e-78  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4758  Acetylornithine transaminase  40.98 
 
 
418 aa  295  1e-78  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.569005 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0068  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  44.3 
 
 
375 aa  294  2e-78  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.413029  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30190  aminotransferase  39.47 
 
 
419 aa  294  2e-78  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.168399  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0357  4-aminobutyrate aminotransferase  37.53 
 
 
478 aa  294  2e-78  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0293  4-aminobutyrate aminotransferase  37.53 
 
 
454 aa  293  4e-78  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0297  4-aminobutyrate aminotransferase  37.53 
 
 
454 aa  293  4e-78  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0310  4-aminobutyrate aminotransferase  37.53 
 
 
454 aa  293  5e-78  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0325  4-aminobutyrate aminotransferase  37.53 
 
 
454 aa  293  5e-78  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2913  4-aminobutyrate aminotransferase  42.33 
 
 
434 aa  292  6e-78  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.976227 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0204  acetylornithine aminotransferase  39.53 
 
 
399 aa  292  6e-78  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000412684 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0399  4-aminobutyrate aminotransferase  37.05 
 
 
454 aa  292  7e-78  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0326575  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0305  4-aminobutyrate aminotransferase  37.19 
 
 
454 aa  292  9e-78  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0354  4-aminobutyrate aminotransferase  37.3 
 
 
468 aa  291  1e-77  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0226  acetylornithine aminotransferase  40.33 
 
 
396 aa  292  1e-77  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1618  4-aminobutyrate aminotransferase  40.76 
 
 
420 aa  291  2e-77  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.346531  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2138  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  42.3 
 
 
383 aa  290  3e-77  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3150  acetylornithine aminotransferase  40.43 
 
 
399 aa  290  4e-77  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0371  4-aminobutyrate aminotransferase  37.3 
 
 
479 aa  290  5.0000000000000004e-77  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0119  4-aminobutyrate aminotransferase  39.95 
 
 
438 aa  288  1e-76  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2210  acetylornithine transaminase  40.29 
 
 
419 aa  288  1e-76  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1830  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  40.79 
 
 
395 aa  288  1e-76  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.991221  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1566  acetylornithine aminotransferase  39 
 
 
395 aa  288  2e-76  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1757  aminotransferase  41.36 
 
 
425 aa  288  2e-76  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.744583  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0303  4-aminobutyrate aminotransferase  36.02 
 
 
454 aa  286  4e-76  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4851  4-aminobutyrate aminotransferase  41.04 
 
 
430 aa  286  5e-76  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0353  acetylornithine aminotransferase  37.32 
 
 
395 aa  286  5e-76  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  hitchhiker  0.00220895 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4949  4-aminobutyrate aminotransferase  37.33 
 
 
454 aa  286  5e-76  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0426  acetylornithine aminotransferase  36.56 
 
 
396 aa  285  1.0000000000000001e-75  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0269327  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1916  Acetylornithine transaminase  39.62 
 
 
417 aa  284  3.0000000000000004e-75  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3636  acetylornithine aminotransferase  39.06 
 
 
397 aa  283  4.0000000000000003e-75  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1072  acetylornithine aminotransferase  38.92 
 
 
385 aa  282  7.000000000000001e-75  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0280572  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3721  4-aminobutyrate aminotransferase  42.11 
 
 
426 aa  282  7.000000000000001e-75  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2287  acetylornithine aminotransferase  38.63 
 
 
402 aa  282  8.000000000000001e-75  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.194315 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3741  acetylornithine aminotransferase  38.35 
 
 
397 aa  281  1e-74  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0637  acetylornithine aminotransferase  40.64 
 
 
418 aa  281  1e-74  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00130856  normal  0.274942 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3146  aminotransferase class-III  42.75 
 
 
408 aa  281  2e-74  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.733649  normal  0.0499094 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1532  aminotransferase  37.83 
 
 
436 aa  281  2e-74  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0772  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  38.44 
 
 
399 aa  281  2e-74  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.200689  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2338  4-aminobutyrate aminotransferase  40.43 
 
 
422 aa  281  2e-74  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.384271  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0700  aminotransferase class-III  40.4 
 
 
421 aa  280  4e-74  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0483  acetylornithine aminotransferase  37.84 
 
 
395 aa  279  8e-74  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3398  4-aminobutyrate aminotransferase  41.35 
 
 
426 aa  278  1e-73  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2204  acetylornithine aminotransferase  36.71 
 
 
390 aa  278  1e-73  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3173  acetylornithine aminotransferase  38.53 
 
 
398 aa  278  1e-73  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.324258  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4167  4-aminobutyrate aminotransferase  40.93 
 
 
434 aa  277  2e-73  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.130001  normal  0.207789 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2414  acetylornithine aminotransferase  39.81 
 
 
396 aa  277  2e-73  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1040  acetylornithine aminotransferase  38.67 
 
 
385 aa  278  2e-73  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.000111021  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3962  acetylornithine aminotransferase  39.69 
 
 
386 aa  277  3e-73  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00766837  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3364  4-aminobutyrate aminotransferase  40.28 
 
 
429 aa  276  7e-73  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.158842 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0562  4-aminobutyrate aminotransferase  40.41 
 
 
447 aa  275  9e-73  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.921583 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0280  4-aminobutyrate aminotransferase  40.28 
 
 
429 aa  275  1.0000000000000001e-72  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.969383  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3070  4-aminobutyrate aminotransferase  41.72 
 
 
433 aa  275  1.0000000000000001e-72  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.0281034 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4056  Acetylornithine transaminase  39.9 
 
 
446 aa  275  1.0000000000000001e-72  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2313  4-aminobutyrate aminotransferase  38.14 
 
 
446 aa  275  1.0000000000000001e-72  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.233271  normal  0.897192 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3262  4-aminobutyrate aminotransferase  39.23 
 
 
425 aa  275  1.0000000000000001e-72  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.129895 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3005  4-aminobutyrate aminotransferase  40.52 
 
 
429 aa  275  1.0000000000000001e-72  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.742708  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2274  4-aminobutyrate aminotransferase  38.14 
 
 
446 aa  275  1.0000000000000001e-72  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5361  4-aminobutyrate aminotransferase  40.52 
 
 
429 aa  275  1.0000000000000001e-72  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.984164  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5241  4-aminobutyrate aminotransferase  40.52 
 
 
427 aa  275  1.0000000000000001e-72  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4909  4-aminobutyrate aminotransferase  40.28 
 
 
427 aa  275  1.0000000000000001e-72  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2321  4-aminobutyrate aminotransferase  38.14 
 
 
446 aa  275  1.0000000000000001e-72  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.42867  normal  0.490264 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1069  acetylornithine aminotransferase  38.79 
 
 
398 aa  275  2.0000000000000002e-72  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00131217  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1901  acetylornithine and succinylornithine aminotransferases  41 
 
 
374 aa  273  3e-72  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0259  4-aminobutyrate aminotransferase  40.34 
 
 
434 aa  273  3e-72  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0232  4-aminobutyrate aminotransferase  37.06 
 
 
440 aa  273  3e-72  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0640  acetylornithine aminotransferase  37.41 
 
 
403 aa  274  3e-72  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.41902  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4618  4-aminobutyrate aminotransferase  39.63 
 
 
427 aa  273  4.0000000000000004e-72  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.914156  normal  0.10828 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0491  aminotransferase  38.11 
 
 
427 aa  273  4.0000000000000004e-72  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.809579 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3950  aminotransferase class-III  36.93 
 
 
452 aa  273  4.0000000000000004e-72  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>