More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_3076 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_3076  Acetylornithine transaminase  100 
 
 		 432 aa  863    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.25771  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4452  4-aminobutyrate aminotransferase  52.26 
 
 		 441 aa  452  1.0000000000000001e-126  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0214  4-aminobutyrate aminotransferase  53.1 
 
 		 431 aa  449  1e-125  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.144778  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3989  4-aminobutyrate aminotransferase  49.56 
 
 		 461 aa  427  1e-118  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.992424  normal  0.611425 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2649  aminotransferase class-III  52.85 
 
 		 441 aa  426  1e-118  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.856293 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0539  4-aminobutyrate aminotransferase  50.68 
 
 		 444 aa  421  1e-116  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1738  aminotransferase class-III  48.07 
 
 		 465 aa  415  9.999999999999999e-116  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.243066  normal  0.440114 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0139  aminotransferase class-III  47.35 
 
 		 452 aa  407  1.0000000000000001e-112  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000384602  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2019  aminotransferase class-III  47.61 
 
 		 465 aa  404  1e-111  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1796  Acetylornithine transaminase  50.79 
 
 		 439 aa  396  1e-109  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.778199  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0510  4-aminobutyrate aminotransferase  49.4 
 
 		 441 aa  393  1e-108  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0989  4-aminobutyrate aminotransferase  48.34 
 
 		 458 aa  394  1e-108  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.48801  normal  0.0598376 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0687  4-aminobutyrate aminotransferase  45.19 
 
 		 459 aa  391  1e-107  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00660505 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1743  4-aminobutyrate aminotransferase  48.05 
 
 		 447 aa  389  1e-107  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0759  4-aminobutyrate aminotransferase  48.17 
 
 		 446 aa  385  1e-105  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.174279  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0176  4-aminobutyrate aminotransferase  49.42 
 
 		 448 aa  376  1e-103  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.0769086 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1464  aminotransferase class-III  47.66 
 
 		 448 aa  370  1e-101  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000155661  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0566  4-aminobutyrate aminotransferase  45.77 
 
 		 428 aa  333  4e-90  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0949  aminotransferase class-III  40.71 
 
 		 418 aa  329  5.0000000000000004e-89  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2754  4-aminobutyrate aminotransferase  44.2 
 
 		 445 aa  327  4.0000000000000003e-88  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3219  aminotransferase class-III  45.15 
 
 		 442 aa  322  9.000000000000001e-87  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.338952 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2386  aminotransferase  43.63 
 
 		 471 aa  321  1.9999999999999998e-86  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.419585  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1957  4-aminobutyrate aminotransferase  42.12 
 
 		 427 aa  317  2e-85  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4758  Acetylornithine transaminase  48.63 
 
 		 418 aa  317  3e-85  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.569005 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0275  4-aminobutyrate aminotransferase  41.29 
 
 		 417 aa  314  1.9999999999999998e-84  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.0862859 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3926  aminotransferase class-III  44.44 
 
 		 442 aa  312  5.999999999999999e-84  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2400  4-aminobutyrate aminotransferase  40.85 
 
 		 430 aa  307  3e-82  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.681516  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2913  4-aminobutyrate aminotransferase  40.86 
 
 		 434 aa  306  4.0000000000000004e-82  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.976227 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0562  4-aminobutyrate aminotransferase  42.63 
 
 		 447 aa  305  1.0000000000000001e-81  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.921583 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2245  4-aminobutyrate aminotransferase  38.6 
 
 		 441 aa  302  7.000000000000001e-81  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.120834  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30190  aminotransferase  45.01 
 
 		 419 aa  300  3e-80  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.168399  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0344  4-aminobutyrate aminotransferase  40.05 
 
 		 426 aa  296  4e-79  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2755  4-aminobutyrate aminotransferase  37.61 
 
 		 448 aa  296  4e-79  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1618  4-aminobutyrate aminotransferase  42.17 
 
 		 420 aa  296  4e-79  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.346531  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0226  acetylornithine aminotransferase  40.89 
 
 		 396 aa  295  1e-78  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1534  4-aminobutyrate aminotransferase  39.73 
 
 		 453 aa  295  1e-78  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.46092  normal  0.55252 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03450  4-aminobutyrate aminotransferase  39.81 
 
 		 426 aa  295  1e-78  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  1.22305e-16 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1757  aminotransferase  44.31 
 
 		 425 aa  293  3e-78  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.744583  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2210  acetylornithine transaminase  41.46 
 
 		 419 aa  293  4e-78  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0491  aminotransferase  41.88 
 
 		 427 aa  293  4e-78  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.809579 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2581  4-aminobutyrate aminotransferase  40.78 
 
 		 446 aa  293  4e-78  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.120886  normal  0.564644 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0214  4-aminobutyrate aminotransferase  39.38 
 
 		 425 aa  292  7e-78  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0174674 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0229  4-aminobutyrate aminotransferase  39.38 
 
 		 425 aa  292  7e-78  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2338  4-aminobutyrate aminotransferase  41.93 
 
 		 422 aa  292  9e-78  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.384271  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4229  4-aminobutyrate aminotransferase  41.25 
 
 		 428 aa  291  1e-77  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.94603  normal  0.717078 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3364  4-aminobutyrate aminotransferase  40.86 
 
 		 429 aa  292  1e-77  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.158842 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0117  aminotransferase class-III  40.85 
 
 		 453 aa  291  1e-77  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.457647  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0151  acetylornithine aminotransferase  43.15 
 
 		 399 aa  291  2e-77  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4570  aminotransferase class-III  40.94 
 
 		 447 aa  291  2e-77  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.782068  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4618  4-aminobutyrate aminotransferase  40.38 
 
 		 427 aa  289  7e-77  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.914156  normal  0.10828 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2630  4-aminobutyrate aminotransferase  39.61 
 
 		 430 aa  289  7e-77  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0119  4-aminobutyrate aminotransferase  39.16 
 
 		 438 aa  289  8e-77  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006685  CNC04690  aminotransferase, putative  40.37 
 
 		 479 aa  288  9e-77  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0660  acetylornithine aminotransferase  40.86 
 
 		 394 aa  288  9e-77  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0238  4-aminobutyrate aminotransferase  39.33 
 
 		 425 aa  288  2e-76  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0280  4-aminobutyrate aminotransferase  40.38 
 
 		 429 aa  287  2e-76  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.969383  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5241  4-aminobutyrate aminotransferase  40.14 
 
 		 427 aa  287  2.9999999999999996e-76  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3005  4-aminobutyrate aminotransferase  40.38 
 
 		 429 aa  287  2.9999999999999996e-76  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.742708  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5361  4-aminobutyrate aminotransferase  40.38 
 
 		 429 aa  287  2.9999999999999996e-76  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.984164  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4909  4-aminobutyrate aminotransferase  40.38 
 
 		 427 aa  286  2.9999999999999996e-76  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2313  4-aminobutyrate aminotransferase  39.81 
 
 		 446 aa  286  5e-76  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.233271  normal  0.897192 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1916  Acetylornithine transaminase  44.28 
 
 		 417 aa  286  5e-76  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2274  4-aminobutyrate aminotransferase  39.81 
 
 		 446 aa  286  5e-76  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4167  4-aminobutyrate aminotransferase  41.53 
 
 		 434 aa  286  5e-76  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.130001  normal  0.207789 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2321  4-aminobutyrate aminotransferase  39.81 
 
 		 446 aa  286  5e-76  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.42867  normal  0.490264 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0232  4-aminobutyrate aminotransferase  38.85 
 
 		 440 aa  286  5.999999999999999e-76  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0188  4-aminobutyrate aminotransferase  38.52 
 
 		 425 aa  286  5.999999999999999e-76  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0315  4-aminobutyrate aminotransferase  40.93 
 
 		 440 aa  286  5.999999999999999e-76  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4711  4-aminobutyrate aminotransferase  40.14 
 
 		 446 aa  286  5.999999999999999e-76  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0834  4-aminobutyrate aminotransferase  40.62 
 
 		 429 aa  286  7e-76  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.379614 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0429  4-aminobutyrate aminotransferase  43.54 
 
 		 433 aa  285  8e-76  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.286831  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2204  acetylornithine aminotransferase  39.2 
 
 		 390 aa  285  1.0000000000000001e-75  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0690  4-aminobutyrate aminotransferase  40.77 
 
 		 448 aa  285  2.0000000000000002e-75  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2903  4-aminobutyrate aminotransferase  41.84 
 
 		 438 aa  284  2.0000000000000002e-75  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.0048698  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3636  acetylornithine aminotransferase  40.16 
 
 		 397 aa  284  3.0000000000000004e-75  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1532  aminotransferase  39.76 
 
 		 436 aa  283  3.0000000000000004e-75  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0305  4-aminobutyrate aminotransferase  36.16 
 
 		 454 aa  283  3.0000000000000004e-75  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02518  4-aminobutyrate aminotransferase  37.14 
 
 		 426 aa  283  4.0000000000000003e-75  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02482  hypothetical protein  37.14 
 
 		 426 aa  283  4.0000000000000003e-75  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0592  4-aminobutyrate aminotransferase  38.81 
 
 		 432 aa  283  4.0000000000000003e-75  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2782  4-aminobutyrate aminotransferase  37.14 
 
 		 426 aa  283  4.0000000000000003e-75  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.480055 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3904  4-aminobutyrate aminotransferase  37.14 
 
 		 426 aa  283  5.000000000000001e-75  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.888156 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3730  acetylornithine aminotransferase  40.6 
 
 		 427 aa  282  7.000000000000001e-75  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000174283  normal  0.451197 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3741  acetylornithine aminotransferase  39.64 
 
 		 397 aa  282  7.000000000000001e-75  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4851  4-aminobutyrate aminotransferase  39.09 
 
 		 430 aa  282  8.000000000000001e-75  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1021  4-aminobutyrate aminotransferase  36.99 
 
 		 426 aa  281  1e-74  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4519  4-aminobutyrate aminotransferase  40.14 
 
 		 427 aa  281  1e-74  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2924  4-aminobutyrate aminotransferase  37.87 
 
 		 450 aa  281  2e-74  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.647687 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0357  4-aminobutyrate aminotransferase  35.59 
 
 		 478 aa  281  2e-74  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0354  4-aminobutyrate aminotransferase  35.36 
 
 		 468 aa  280  3e-74  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0293  4-aminobutyrate aminotransferase  35.86 
 
 		 454 aa  280  3e-74  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0297  4-aminobutyrate aminotransferase  35.86 
 
 		 454 aa  280  3e-74  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1034  4-aminobutyrate aminotransferase  38.19 
 
 		 453 aa  280  3e-74  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0355081 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3137  4-aminobutyrate aminotransferase  41.09 
 
 		 424 aa  280  3e-74  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.213623 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2344  4-aminobutyrate aminotransferase  38.76 
 
 		 421 aa  280  4e-74  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.00720647  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01290  hypothetical protein  38.76 
 
 		 421 aa  280  4e-74  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3070  4-aminobutyrate aminotransferase  42.42 
 
 		 433 aa  280  4e-74  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0281034 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0371  4-aminobutyrate aminotransferase  35.47 
 
 		 479 aa  280  4e-74  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0399  4-aminobutyrate aminotransferase  35.63 
 
 		 454 aa  280  4e-74  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0326575  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2323  4-aminobutyrate transaminase  38.76 
 
 		 421 aa  280  4e-74  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>