More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acid345_1532 on replicon NC_008009
Organism: Candidatus Koribacter versatilis Ellin345



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008009  Acid345_1532  aminotransferase  100 
 
 
436 aa  895    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4056  Acetylornithine transaminase  48.26 
 
 
446 aa  401  9.999999999999999e-111  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14780  4-aminobutyrate aminotransferase  46.35 
 
 
437 aa  358  8e-98  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0539  4-aminobutyrate aminotransferase  45.13 
 
 
444 aa  355  7.999999999999999e-97  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0566  4-aminobutyrate aminotransferase  42.13 
 
 
428 aa  339  4e-92  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2755  4-aminobutyrate aminotransferase  42.65 
 
 
448 aa  327  2.0000000000000001e-88  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0139  aminotransferase class-III  40.24 
 
 
452 aa  317  4e-85  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000384602  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1957  4-aminobutyrate aminotransferase  40.68 
 
 
427 aa  316  5e-85  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2204  acetylornithine aminotransferase  42.03 
 
 
390 aa  313  2.9999999999999996e-84  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0305  4-aminobutyrate aminotransferase  39.51 
 
 
454 aa  312  9e-84  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0357  4-aminobutyrate aminotransferase  39.26 
 
 
478 aa  310  2.9999999999999997e-83  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0293  4-aminobutyrate aminotransferase  39.26 
 
 
454 aa  310  2.9999999999999997e-83  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0354  4-aminobutyrate aminotransferase  39.07 
 
 
468 aa  309  5.9999999999999995e-83  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0297  4-aminobutyrate aminotransferase  39.26 
 
 
454 aa  309  5.9999999999999995e-83  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0399  4-aminobutyrate aminotransferase  39.07 
 
 
454 aa  309  6.999999999999999e-83  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0326575  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0310  4-aminobutyrate aminotransferase  39.26 
 
 
454 aa  309  8e-83  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0325  4-aminobutyrate aminotransferase  39.26 
 
 
454 aa  309  8e-83  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0371  4-aminobutyrate aminotransferase  39.07 
 
 
479 aa  308  2.0000000000000002e-82  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4949  4-aminobutyrate aminotransferase  38.57 
 
 
454 aa  303  5.000000000000001e-81  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0119  4-aminobutyrate aminotransferase  40.67 
 
 
438 aa  303  6.000000000000001e-81  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0303  4-aminobutyrate aminotransferase  38.81 
 
 
454 aa  302  7.000000000000001e-81  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0871  acetylornithine aminotransferase  41.01 
 
 
403 aa  300  4e-80  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3989  4-aminobutyrate aminotransferase  39.27 
 
 
461 aa  298  2e-79  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.992424  normal  0.611425 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2754  4-aminobutyrate aminotransferase  38.98 
 
 
445 aa  293  4e-78  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2245  4-aminobutyrate aminotransferase  38.39 
 
 
441 aa  293  4e-78  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.120834  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3219  aminotransferase class-III  39.18 
 
 
442 aa  293  6e-78  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.338952 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3926  aminotransferase class-III  38.37 
 
 
442 aa  291  1e-77  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2903  4-aminobutyrate aminotransferase  40.24 
 
 
438 aa  291  2e-77  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.0048698  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0220  aminotransferase  40.24 
 
 
436 aa  290  3e-77  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2649  aminotransferase class-III  39.81 
 
 
441 aa  288  1e-76  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.856293 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30190  aminotransferase  36.87 
 
 
419 aa  288  2e-76  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.168399  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1034  4-aminobutyrate aminotransferase  39.9 
 
 
453 aa  288  2e-76  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.0355081 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2081  4-aminobutyrate aminotransferase  40.98 
 
 
439 aa  286  4e-76  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.703939  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1534  4-aminobutyrate aminotransferase  39.9 
 
 
453 aa  286  7e-76  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.46092  normal  0.55252 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1830  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  39.17 
 
 
395 aa  285  1.0000000000000001e-75  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.991221  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1738  aminotransferase class-III  39.02 
 
 
465 aa  285  2.0000000000000002e-75  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.243066  normal  0.440114 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1344  aminotransferase class-III  38.69 
 
 
445 aa  284  2.0000000000000002e-75  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.252611  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3076  Acetylornithine transaminase  39.76 
 
 
432 aa  283  3.0000000000000004e-75  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.25771  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2680  4-aminobutyrate aminotransferase  37.15 
 
 
445 aa  283  5.000000000000001e-75  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2626  4-aminobutyrate aminotransferase  37.15 
 
 
445 aa  283  5.000000000000001e-75  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.805613  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2000  4-aminobutyrate aminotransferase  41.69 
 
 
432 aa  283  6.000000000000001e-75  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0562  4-aminobutyrate aminotransferase  42.34 
 
 
447 aa  283  6.000000000000001e-75  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.921583 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2400  4-aminobutyrate aminotransferase  36.98 
 
 
430 aa  282  9e-75  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.681516  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0151  acetylornithine aminotransferase  39.68 
 
 
399 aa  281  2e-74  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4452  4-aminobutyrate aminotransferase  37.83 
 
 
441 aa  281  2e-74  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4998  4-aminobutyrate aminotransferase  39.56 
 
 
425 aa  280  4e-74  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.554548  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0188  4-aminobutyrate aminotransferase  39.71 
 
 
425 aa  280  5e-74  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0827  aminotransferase class-III  39.39 
 
 
422 aa  279  6e-74  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0949  aminotransferase class-III  39.63 
 
 
418 aa  279  8e-74  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2019  aminotransferase class-III  39.25 
 
 
465 aa  278  1e-73  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0238  4-aminobutyrate aminotransferase  38.83 
 
 
425 aa  277  2e-73  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2386  aminotransferase  40.05 
 
 
471 aa  277  3e-73  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.419585  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2313  4-aminobutyrate aminotransferase  39.57 
 
 
446 aa  276  4e-73  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.233271  normal  0.897192 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2274  4-aminobutyrate aminotransferase  39.57 
 
 
446 aa  276  4e-73  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2321  4-aminobutyrate aminotransferase  39.57 
 
 
446 aa  276  4e-73  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.42867  normal  0.490264 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2798  4-aminobutyrate aminotransferase  39.39 
 
 
456 aa  275  8e-73  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00539792 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0214  4-aminobutyrate aminotransferase  38.59 
 
 
425 aa  275  1.0000000000000001e-72  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0174674 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0204  acetylornithine aminotransferase  37.59 
 
 
399 aa  275  1.0000000000000001e-72  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000412684 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0229  4-aminobutyrate aminotransferase  38.59 
 
 
425 aa  275  1.0000000000000001e-72  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3094  4-aminobutyrate aminotransferase  39.86 
 
 
468 aa  275  1.0000000000000001e-72  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0817591  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0214  4-aminobutyrate aminotransferase  37.34 
 
 
431 aa  274  2.0000000000000002e-72  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.144778  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1866  acetylornithine aminotransferase  39.53 
 
 
400 aa  275  2.0000000000000002e-72  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1956  4-aminobutyrate aminotransferase  39.56 
 
 
450 aa  274  3e-72  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0510  4-aminobutyrate aminotransferase  38.82 
 
 
441 aa  273  4.0000000000000004e-72  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1048  aminotransferase class-III  37.63 
 
 
462 aa  273  5.000000000000001e-72  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0426  acetylornithine aminotransferase  37.3 
 
 
396 aa  272  7e-72  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0269327  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0687  4-aminobutyrate aminotransferase  36.26 
 
 
459 aa  272  8.000000000000001e-72  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  hitchhiker  0.00660505 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1743  4-aminobutyrate aminotransferase  39.91 
 
 
447 aa  271  1e-71  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4758  Acetylornithine transaminase  36.61 
 
 
418 aa  271  2e-71  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.569005 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3663  4-aminobutyrate aminotransferase  39.34 
 
 
445 aa  270  2.9999999999999997e-71  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1796  Acetylornithine transaminase  39.71 
 
 
439 aa  270  4e-71  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.778199  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2581  4-aminobutyrate aminotransferase  39.8 
 
 
446 aa  270  4e-71  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.120886  normal  0.564644 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2668  aminotransferase  36.96 
 
 
457 aa  270  5e-71  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0759  4-aminobutyrate aminotransferase  39.07 
 
 
446 aa  269  5.9999999999999995e-71  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.174279  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1291  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  38.46 
 
 
393 aa  269  5.9999999999999995e-71  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0338748 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2159  4-aminobutyrate aminotransferase  36.59 
 
 
445 aa  268  1e-70  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1723  4-aminobutyrate aminotransferase  39.95 
 
 
451 aa  268  1e-70  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.577321  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0989  4-aminobutyrate aminotransferase  36.3 
 
 
458 aa  268  1e-70  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.48801  normal  0.0598376 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0063  acetylornithine and succinylornithine aminotransferases  36.74 
 
 
396 aa  268  1e-70  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.857354  normal  0.372491 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0690  4-aminobutyrate aminotransferase  38.55 
 
 
448 aa  267  2.9999999999999995e-70  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3928  (S)-3-amino-2-methylpropionate transaminase  40.19 
 
 
427 aa  267  2.9999999999999995e-70  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03450  4-aminobutyrate aminotransferase  37.24 
 
 
426 aa  267  2.9999999999999995e-70  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  1.22305e-16 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2924  4-aminobutyrate aminotransferase  37.5 
 
 
450 aa  266  4e-70  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.647687 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1120  aminotransferase class-III  35.06 
 
 
446 aa  266  5e-70  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.020832  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2218  aminotransferase  38.59 
 
 
450 aa  266  5e-70  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0344  4-aminobutyrate aminotransferase  37.24 
 
 
426 aa  266  5e-70  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4960  4-aminobutyrate aminotransferase  38.42 
 
 
432 aa  266  5e-70  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0429  4-aminobutyrate aminotransferase  41.6 
 
 
433 aa  266  5e-70  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.286831  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1618  4-aminobutyrate aminotransferase  38.65 
 
 
420 aa  266  7e-70  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.346531  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4570  aminotransferase class-III  40.33 
 
 
447 aa  265  8e-70  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.782068  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0274  acetylornithine aminotransferase  36.64 
 
 
396 aa  265  1e-69  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.110157  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0592  4-aminobutyrate aminotransferase  37.84 
 
 
432 aa  265  1e-69  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0117  aminotransferase class-III  42.47 
 
 
453 aa  265  1e-69  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.457647  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0660  acetylornithine aminotransferase  36.64 
 
 
394 aa  265  1e-69  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1277  putrescine--2-oxoglutarate aminotransferase  36.36 
 
 
457 aa  264  3e-69  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0468315  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1870  aminotransferase class-III  34.69 
 
 
444 aa  263  4e-69  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2583  diaminobutyrate--2-oxoglutarate aminotransferase  37.32 
 
 
458 aa  263  4e-69  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.406627  hitchhiker  0.00247951 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1464  aminotransferase class-III  39.42 
 
 
448 aa  263  4e-69  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000155661  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2058  aminotransferase class-III  37.42 
 
 
475 aa  263  4.999999999999999e-69  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0166657  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0232  4-aminobutyrate aminotransferase  36.76 
 
 
440 aa  263  4.999999999999999e-69  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>