More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfum_2649 on replicon NC_008554
Organism: Syntrophobacter fumaroxidans MPOB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008554  Sfum_2649  aminotransferase class-III  100 
 
 		 441 aa  909    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.856293 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3989  4-aminobutyrate aminotransferase  54.57 
 
 		 461 aa  495  1e-139  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.992424  normal  0.611425 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0539  4-aminobutyrate aminotransferase  55.18 
 
 		 444 aa  486  1e-136  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0214  4-aminobutyrate aminotransferase  54.61 
 
 		 431 aa  475  1e-133  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.144778  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0139  aminotransferase class-III  50.34 
 
 		 452 aa  464  1e-129  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000384602  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4452  4-aminobutyrate aminotransferase  52.6 
 
 		 441 aa  456  1e-127  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1738  aminotransferase class-III  51.77 
 
 		 465 aa  453  1.0000000000000001e-126  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.243066  normal  0.440114 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2019  aminotransferase class-III  50.88 
 
 		 465 aa  441  9.999999999999999e-123  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1796  Acetylornithine transaminase  50.79 
 
 		 439 aa  430  1e-119  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.778199  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0687  4-aminobutyrate aminotransferase  47.96 
 
 		 459 aa  426  1e-118  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00660505 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3076  Acetylornithine transaminase  52.85 
 
 		 432 aa  425  1e-118  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.25771  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1464  aminotransferase class-III  52.3 
 
 		 448 aa  411  1e-113  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000155661  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0989  4-aminobutyrate aminotransferase  48.12 
 
 		 458 aa  411  1e-113  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.48801  normal  0.0598376 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1743  4-aminobutyrate aminotransferase  46.26 
 
 		 447 aa  392  1e-108  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0510  4-aminobutyrate aminotransferase  46.92 
 
 		 441 aa  387  1e-106  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0759  4-aminobutyrate aminotransferase  45.89 
 
 		 446 aa  382  1e-105  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.174279  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2386  aminotransferase  46.71 
 
 		 471 aa  381  1e-104  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.419585  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0176  4-aminobutyrate aminotransferase  45.79 
 
 		 448 aa  371  1e-101  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.0769086 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1957  4-aminobutyrate aminotransferase  44.39 
 
 		 427 aa  359  4e-98  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0949  aminotransferase class-III  43.43 
 
 		 418 aa  357  1.9999999999999998e-97  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0566  4-aminobutyrate aminotransferase  46.26 
 
 		 428 aa  357  2.9999999999999997e-97  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3219  aminotransferase class-III  47.67 
 
 		 442 aa  344  2e-93  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.338952 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0119  4-aminobutyrate aminotransferase  42.36 
 
 		 438 aa  343  2.9999999999999997e-93  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3926  aminotransferase class-III  46.12 
 
 		 442 aa  339  5e-92  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2000  4-aminobutyrate aminotransferase  43.9 
 
 		 432 aa  329  5.0000000000000004e-89  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0275  4-aminobutyrate aminotransferase  40.76 
 
 		 417 aa  329  5.0000000000000004e-89  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.0862859 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2754  4-aminobutyrate aminotransferase  44.26 
 
 		 445 aa  324  2e-87  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0310  4-aminobutyrate aminotransferase  37.73 
 
 		 454 aa  318  1e-85  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0325  4-aminobutyrate aminotransferase  37.73 
 
 		 454 aa  318  1e-85  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0303  4-aminobutyrate aminotransferase  38.32 
 
 		 454 aa  317  2e-85  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1344  aminotransferase class-III  40.77 
 
 		 445 aa  316  6e-85  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.252611  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2245  4-aminobutyrate aminotransferase  39.59 
 
 		 441 aa  316  7e-85  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.120834  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0371  4-aminobutyrate aminotransferase  37.41 
 
 		 479 aa  314  1.9999999999999998e-84  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2755  4-aminobutyrate aminotransferase  37.59 
 
 		 448 aa  314  1.9999999999999998e-84  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0297  4-aminobutyrate aminotransferase  37.5 
 
 		 454 aa  313  3.9999999999999997e-84  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0305  4-aminobutyrate aminotransferase  37.41 
 
 		 454 aa  313  3.9999999999999997e-84  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0399  4-aminobutyrate aminotransferase  37.5 
 
 		 454 aa  313  3.9999999999999997e-84  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0326575  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0357  4-aminobutyrate aminotransferase  37.5 
 
 		 478 aa  313  3.9999999999999997e-84  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0293  4-aminobutyrate aminotransferase  37.5 
 
 		 454 aa  313  4.999999999999999e-84  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0354  4-aminobutyrate aminotransferase  37.5 
 
 		 468 aa  312  9e-84  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4949  4-aminobutyrate aminotransferase  37.19 
 
 		 454 aa  310  4e-83  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0562  4-aminobutyrate aminotransferase  41.35 
 
 		 447 aa  308  1.0000000000000001e-82  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.921583 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0315  4-aminobutyrate aminotransferase  42.4 
 
 		 440 aa  308  2.0000000000000002e-82  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2400  4-aminobutyrate aminotransferase  40.33 
 
 		 430 aa  301  1e-80  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.681516  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1534  4-aminobutyrate aminotransferase  40.23 
 
 		 453 aa  301  1e-80  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.46092  normal  0.55252 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4758  Acetylornithine transaminase  42.96 
 
 		 418 aa  300  3e-80  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.569005 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1757  aminotransferase  41.75 
 
 		 425 aa  300  3e-80  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.744583  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30190  aminotransferase  41.05 
 
 		 419 aa  298  9e-80  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.168399  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2913  4-aminobutyrate aminotransferase  41.36 
 
 		 434 aa  297  2e-79  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.976227 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4570  aminotransferase class-III  40.64 
 
 		 447 aa  296  4e-79  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.782068  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0146  4-aminobutyrate aminotransferase  41.71 
 
 		 434 aa  295  1e-78  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0117  aminotransferase class-III  40.77 
 
 		 453 aa  294  2e-78  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.457647  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0700  aminotransferase class-III  43.28 
 
 		 421 aa  294  3e-78  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2081  4-aminobutyrate aminotransferase  40.96 
 
 		 439 aa  293  5e-78  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.703939  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0491  aminotransferase  41.57 
 
 		 427 aa  291  1e-77  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.809579 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2924  4-aminobutyrate aminotransferase  38.1 
 
 		 450 aa  289  8e-77  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.647687 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1532  aminotransferase  39.81 
 
 		 436 aa  288  1e-76  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1916  Acetylornithine transaminase  41.53 
 
 		 417 aa  287  2e-76  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2210  acetylornithine transaminase  40.47 
 
 		 419 aa  286  2.9999999999999996e-76  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0259  4-aminobutyrate aminotransferase  40.52 
 
 		 434 aa  285  1.0000000000000001e-75  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3862  4-aminobutyrate aminotransferase  41.83 
 
 		 427 aa  284  2.0000000000000002e-75  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.612157 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0387  4-aminobutyrate aminotransferase  35.5 
 
 		 450 aa  284  2.0000000000000002e-75  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0105989  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4695  4-aminobutyrate aminotransferase  39.44 
 
 		 430 aa  283  4.0000000000000003e-75  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0827  aminotransferase class-III  42 
 
 		 422 aa  283  5.000000000000001e-75  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2925  aminotransferase class-III  40.28 
 
 		 474 aa  283  5.000000000000001e-75  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4229  4-aminobutyrate aminotransferase  40.44 
 
 		 428 aa  281  2e-74  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.94603  normal  0.717078 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4618  4-aminobutyrate aminotransferase  41 
 
 		 427 aa  279  6e-74  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.914156  normal  0.10828 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2405  aminotransferase class-III  36.05 
 
 		 450 aa  278  1e-73  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0564  Acetylornithine transaminase  37.25 
 
 		 461 aa  278  1e-73  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.129985 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2626  4-aminobutyrate aminotransferase  33.87 
 
 		 445 aa  278  2e-73  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.805613  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2680  4-aminobutyrate aminotransferase  33.87 
 
 		 445 aa  278  2e-73  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4056  Acetylornithine transaminase  39.64 
 
 		 446 aa  277  3e-73  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1830  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  40.74 
 
 		 395 aa  276  5e-73  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.991221  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14780  4-aminobutyrate aminotransferase  38.14 
 
 		 437 aa  276  6e-73  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4851  4-aminobutyrate aminotransferase  40.1 
 
 		 430 aa  275  1.0000000000000001e-72  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006685  CNC04690  aminotransferase, putative  38.85 
 
 		 479 aa  274  2.0000000000000002e-72  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3172  4-aminobutyrate aminotransferase  41.63 
 
 		 426 aa  274  2.0000000000000002e-72  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3928  (S)-3-amino-2-methylpropionate transaminase  39.66 
 
 		 427 aa  275  2.0000000000000002e-72  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2630  4-aminobutyrate aminotransferase  38.65 
 
 		 430 aa  274  3e-72  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1072  acetylornithine aminotransferase  37.05 
 
 		 385 aa  272  1e-71  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0280572  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2313  4-aminobutyrate aminotransferase  40.32 
 
 		 446 aa  271  1e-71  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.233271  normal  0.897192 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2274  4-aminobutyrate aminotransferase  40.32 
 
 		 446 aa  271  1e-71  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4074  aminotransferase class-III  41.22 
 
 		 443 aa  272  1e-71  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0926  diaminobutyrate--2-oxoglutarate aminotransferase  37.03 
 
 		 454 aa  272  1e-71  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0888484  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1870  aminotransferase class-III  38.6 
 
 		 444 aa  272  1e-71  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2321  4-aminobutyrate aminotransferase  40.32 
 
 		 446 aa  271  1e-71  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.42867  normal  0.490264 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1910  4-aminobutyrate aminotransferase  41.28 
 
 		 426 aa  271  2e-71  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.692445  normal  0.29202 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2583  diaminobutyrate--2-oxoglutarate aminotransferase  38.95 
 
 		 458 aa  271  2e-71  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.406627  hitchhiker  0.00247951 
 
 
-
 
NC_006694  CNI00880  ornithine-oxo-acid aminotransferase, putative  38.04 
 
 		 476 aa  270  2.9999999999999997e-71  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2581  4-aminobutyrate aminotransferase  39.41 
 
 		 446 aa  270  5e-71  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.120886  normal  0.564644 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1040  acetylornithine aminotransferase  37.29 
 
 		 385 aa  269  8e-71  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.000111021  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3070  4-aminobutyrate aminotransferase  41.88 
 
 		 433 aa  269  8.999999999999999e-71  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0281034 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0151  acetylornithine aminotransferase  38.76 
 
 		 399 aa  268  1e-70  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5241  4-aminobutyrate aminotransferase  40.5 
 
 		 427 aa  268  1e-70  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3364  4-aminobutyrate aminotransferase  40.75 
 
 		 429 aa  268  1e-70  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.158842 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0834  4-aminobutyrate aminotransferase  41.5 
 
 		 429 aa  268  1e-70  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.379614 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2903  4-aminobutyrate aminotransferase  39.42 
 
 		 438 aa  268  1e-70  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.0048698  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4711  4-aminobutyrate aminotransferase  40.25 
 
 		 446 aa  268  1e-70  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2259  4-aminobutyrate aminotransferase  40.05 
 
 		 426 aa  267  2e-70  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.418729  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2338  4-aminobutyrate aminotransferase  40.29 
 
 		 422 aa  268  2e-70  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.384271  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>