More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Afer_0700 on replicon NC_013124
Organism: Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331



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Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013124  Afer_0700  aminotransferase class-III  100 
 
 		 421 aa  849    Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009767  Rcas_3219  aminotransferase class-III  49.18 
 
 		 442 aa  393  1e-108  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.338952 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30190  aminotransferase  51.1 
 
 		 419 aa  391  1e-107  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.168399  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0491  aminotransferase  49.28 
 
 		 427 aa  387  1e-106  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.809579 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1916  Acetylornithine transaminase  50.71 
 
 		 417 aa  385  1e-105  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0827  aminotransferase class-III  47.6 
 
 		 422 aa  377  1e-103  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3926  aminotransferase class-III  47.07 
 
 		 442 aa  377  1e-103  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2210  acetylornithine transaminase  49.04 
 
 		 419 aa  377  1e-103  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4758  Acetylornithine transaminase  48.9 
 
 		 418 aa  370  1e-101  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.569005 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1757  aminotransferase  47.34 
 
 		 425 aa  371  1e-101  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.744583  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4074  aminotransferase class-III  47.99 
 
 		 443 aa  345  7e-94  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1957  4-aminobutyrate aminotransferase  44.5 
 
 		 427 aa  340  2.9999999999999998e-92  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0566  4-aminobutyrate aminotransferase  41.35 
 
 		 428 aa  328  1.0000000000000001e-88  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2754  4-aminobutyrate aminotransferase  40.52 
 
 		 445 aa  322  9.000000000000001e-87  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006694  CNI00880  ornithine-oxo-acid aminotransferase, putative  42.11 
 
 		 476 aa  313  4.999999999999999e-84  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0214  4-aminobutyrate aminotransferase  44.39 
 
 		 431 aa  308  9e-83  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.144778  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0297  4-aminobutyrate aminotransferase  39.8 
 
 		 454 aa  305  1.0000000000000001e-81  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0357  4-aminobutyrate aminotransferase  39.56 
 
 		 478 aa  303  3.0000000000000004e-81  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
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NC_005957  BT9727_0293  4-aminobutyrate aminotransferase  39.56 
 
 		 454 aa  303  3.0000000000000004e-81  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_011658  BCAH187_A0399  4-aminobutyrate aminotransferase  39.56 
 
 		 454 aa  303  3.0000000000000004e-81  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0326575  n/a   
 
 
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NC_011725  BCB4264_A0371  4-aminobutyrate aminotransferase  39.23 
 
 		 479 aa  303  4.0000000000000003e-81  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_010184  BcerKBAB4_0305  4-aminobutyrate aminotransferase  38.83 
 
 		 454 aa  303  5.000000000000001e-81  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_003909  BCE_0354  4-aminobutyrate aminotransferase  39.56 
 
 		 468 aa  302  7.000000000000001e-81  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_005945  BAS0310  4-aminobutyrate aminotransferase  39.56 
 
 		 454 aa  301  2e-80  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0325  4-aminobutyrate aminotransferase  39.56 
 
 		 454 aa  301  2e-80  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2649  aminotransferase class-III  42.65 
 
 		 441 aa  298  9e-80  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.856293 
 
 
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NC_008698  Tpen_0539  4-aminobutyrate aminotransferase  40.92 
 
 		 444 aa  298  1e-79  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2913  4-aminobutyrate aminotransferase  40.62 
 
 		 434 aa  297  2e-79  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.976227 
 
 
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NC_011772  BCG9842_B4949  4-aminobutyrate aminotransferase  38.74 
 
 		 454 aa  297  2e-79  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_008781  Pnap_2630  4-aminobutyrate aminotransferase  38.99 
 
 		 430 aa  296  3e-79  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2259  4-aminobutyrate aminotransferase  41.85 
 
 		 426 aa  296  5e-79  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.418729  n/a   
 
 
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NC_009972  Haur_0139  aminotransferase class-III  39.14 
 
 		 452 aa  295  8e-79  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000384602  n/a   
 
 
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NC_014212  Mesil_2400  4-aminobutyrate aminotransferase  39.23 
 
 		 430 aa  294  3e-78  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.681516  normal  1 
 
 
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NC_012791  Vapar_4695  4-aminobutyrate aminotransferase  40.99 
 
 		 430 aa  293  4e-78  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4229  4-aminobutyrate aminotransferase  40.69 
 
 		 428 aa  291  1e-77  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.94603  normal  0.717078 
 
 
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NC_009674  Bcer98_0303  4-aminobutyrate aminotransferase  37.8 
 
 		 454 aa  291  2e-77  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_006685  CNC04690  aminotransferase, putative  40.14 
 
 		 479 aa  291  2e-77  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
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NC_013411  GYMC61_2755  4-aminobutyrate aminotransferase  38.88 
 
 		 448 aa  291  2e-77  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
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NC_007908  Rfer_0592  4-aminobutyrate aminotransferase  37.07 
 
 		 432 aa  289  5.0000000000000004e-77  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_007948  Bpro_2912  4-aminobutyrate aminotransferase  41.16 
 
 		 430 aa  289  8e-77  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.852765 
 
 
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NC_013093  Amir_3076  Acetylornithine transaminase  41.65 
 
 		 432 aa  288  1e-76  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.25771  n/a   
 
 
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NC_009523  RoseRS_1738  aminotransferase class-III  40.5 
 
 		 465 aa  287  2.9999999999999996e-76  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.243066  normal  0.440114 
 
 
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NC_008009  Acid345_3989  4-aminobutyrate aminotransferase  39.67 
 
 		 461 aa  285  1.0000000000000001e-75  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.992424  normal  0.611425 
 
 
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NC_009436  Ent638_3864  4-aminobutyrate aminotransferase  39.04 
 
 		 421 aa  284  2.0000000000000002e-75  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0197143 
 
 
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NC_007973  Rmet_1618  4-aminobutyrate aminotransferase  40.57 
 
 		 420 aa  284  2.0000000000000002e-75  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.346531  normal  1 
 
 
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NC_009512  Pput_0229  4-aminobutyrate aminotransferase  37.56 
 
 		 425 aa  283  3.0000000000000004e-75  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_002947  PP_0214  4-aminobutyrate aminotransferase  37.56 
 
 		 425 aa  283  3.0000000000000004e-75  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0174674 
 
 
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NC_011729  PCC7424_4452  4-aminobutyrate aminotransferase  39.52 
 
 		 441 aa  283  3.0000000000000004e-75  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
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NC_010184  BcerKBAB4_2245  4-aminobutyrate aminotransferase  36.78 
 
 		 441 aa  284  3.0000000000000004e-75  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.120834  n/a   
 
 
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NC_007802  Jann_3070  4-aminobutyrate aminotransferase  41.63 
 
 		 433 aa  283  4.0000000000000003e-75  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0281034 
 
 
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NC_008825  Mpe_A1910  4-aminobutyrate aminotransferase  41.75 
 
 		 426 aa  283  4.0000000000000003e-75  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.692445  normal  0.29202 
 
 
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NC_008687  Pden_4414  4-aminobutyrate aminotransferase  40.97 
 
 		 426 aa  283  4.0000000000000003e-75  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.877124 
 
 
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NC_008391  Bamb_4711  4-aminobutyrate aminotransferase  38.9 
 
 		 446 aa  282  8.000000000000001e-75  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_013421  Pecwa_2545  4-aminobutyrate aminotransferase  38.96 
 
 		 421 aa  281  1e-74  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.505618  n/a   
 
 
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NC_010623  Bphy_4851  4-aminobutyrate aminotransferase  38.81 
 
 		 430 aa  281  1e-74  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_010552  BamMC406_5241  4-aminobutyrate aminotransferase  39.29 
 
 		 427 aa  282  1e-74  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_010086  Bmul_3364  4-aminobutyrate aminotransferase  38.65 
 
 		 429 aa  282  1e-74  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.158842 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0238  4-aminobutyrate aminotransferase  37.32 
 
 		 425 aa  280  5e-74  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3721  4-aminobutyrate aminotransferase  38.99 
 
 		 426 aa  279  7e-74  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_010623  Bphy_4618  4-aminobutyrate aminotransferase  38.79 
 
 		 427 aa  279  7e-74  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.914156  normal  0.10828 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3005  4-aminobutyrate aminotransferase  38.15 
 
 		 429 aa  279  8e-74  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.742708  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5361  4-aminobutyrate aminotransferase  38.15 
 
 		 429 aa  279  8e-74  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.984164  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4909  4-aminobutyrate aminotransferase  38.4 
 
 		 427 aa  278  9e-74  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2233  4-aminobutyrate aminotransferase  39.22 
 
 		 421 aa  278  9e-74  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.4744  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3398  4-aminobutyrate aminotransferase  38.78 
 
 		 426 aa  278  2e-73  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0280  4-aminobutyrate aminotransferase  38.29 
 
 		 429 aa  276  5e-73  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.969383  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1784  4-aminobutyrate aminotransferase  38.64 
 
 		 421 aa  276  5e-73  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.988641  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3928  (S)-3-amino-2-methylpropionate transaminase  38.33 
 
 		 427 aa  276  7e-73  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0232  4-aminobutyrate aminotransferase  37.31 
 
 		 440 aa  275  7e-73  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1889  4-aminobutyrate aminotransferase  39.08 
 
 		 435 aa  275  9e-73  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.148357  normal  0.0202633 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1534  4-aminobutyrate aminotransferase  40.15 
 
 		 453 aa  275  1.0000000000000001e-72  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.46092  normal  0.55252 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3172  4-aminobutyrate aminotransferase  39.45 
 
 		 426 aa  275  1.0000000000000001e-72  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4998  4-aminobutyrate aminotransferase  36.43 
 
 		 425 aa  275  1.0000000000000001e-72  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.554548  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0029  4-aminobutyrate aminotransferase protein  38.85 
 
 		 426 aa  274  2.0000000000000002e-72  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.717101 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1867  4-aminobutyrate aminotransferase  38.56 
 
 		 421 aa  274  2.0000000000000002e-72  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2002  4-aminobutyrate aminotransferase  41.42 
 
 		 434 aa  274  2.0000000000000002e-72  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000607298 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2019  aminotransferase class-III  39.36 
 
 		 465 aa  273  5.000000000000001e-72  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2581  4-aminobutyrate aminotransferase  38.83 
 
 		 446 aa  273  5.000000000000001e-72  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.120886  normal  0.564644 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3862  4-aminobutyrate aminotransferase  39.8 
 
 		 427 aa  272  9e-72  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.612157 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0429  4-aminobutyrate aminotransferase  39.5 
 
 		 433 aa  272  9e-72  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.286831  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0007  aminotransferase class-III  36.97 
 
 		 425 aa  272  9e-72  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.383992  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3904  4-aminobutyrate aminotransferase  37.09 
 
 		 426 aa  271  1e-71  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.888156 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2782  4-aminobutyrate aminotransferase  37.09 
 
 		 426 aa  270  2e-71  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.480055 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0834  4-aminobutyrate aminotransferase  39.85 
 
 		 429 aa  270  2e-71  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.379614 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4519  4-aminobutyrate aminotransferase  39.69 
 
 		 427 aa  270  2.9999999999999997e-71  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1021  4-aminobutyrate aminotransferase  37.03 
 
 		 426 aa  270  2.9999999999999997e-71  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0315  4-aminobutyrate aminotransferase  37.77 
 
 		 440 aa  270  2.9999999999999997e-71  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02518  4-aminobutyrate aminotransferase  37.09 
 
 		 426 aa  270  4e-71  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02482  hypothetical protein  37.09 
 
 		 426 aa  270  4e-71  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2313  4-aminobutyrate aminotransferase  39.15 
 
 		 446 aa  270  5e-71  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.233271  normal  0.897192 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2321  4-aminobutyrate aminotransferase  39.15 
 
 		 446 aa  270  5e-71  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.42867  normal  0.490264 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2274  4-aminobutyrate aminotransferase  39.15 
 
 		 446 aa  270  5e-71  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1044  4-aminobutyrate aminotransferase  36.59 
 
 		 426 aa  269  5.9999999999999995e-71  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2797  4-aminobutyrate aminotransferase  36.59 
 
 		 426 aa  269  5.9999999999999995e-71  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1289  4-aminobutyrate aminotransferase  37.59 
 
 		 426 aa  269  5.9999999999999995e-71  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4356  4-aminobutyrate aminotransferase  39.51 
 
 		 426 aa  269  7e-71  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00363071 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2338  4-aminobutyrate aminotransferase  38.02 
 
 		 422 aa  269  8e-71  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.384271  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4664  4-aminobutyrate aminotransferase  39.7 
 
 		 428 aa  269  8.999999999999999e-71  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009511  Swit_4167  4-aminobutyrate aminotransferase  38.35 
 
 		 434 aa  268  1e-70  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.130001  normal  0.207789 
 
 
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NC_010002  Daci_5049  4-aminobutyrate aminotransferase  42.15 
 
 		 436 aa  268  1e-70  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.96187  normal  0.62875 
 
 
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