More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpen_0539 on replicon NC_008698
Organism: Thermofilum pendens Hrk 5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008698  Tpen_0539  4-aminobutyrate aminotransferase  100 
 
 		 444 aa  904    Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0687  4-aminobutyrate aminotransferase  58.56 
 
 		 459 aa  536  1e-151  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00660505 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0510  4-aminobutyrate aminotransferase  62.56 
 
 		 441 aa  525  1e-148  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1743  4-aminobutyrate aminotransferase  59.63 
 
 		 447 aa  523  1e-147  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0759  4-aminobutyrate aminotransferase  58.72 
 
 		 446 aa  518  1.0000000000000001e-145  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.174279  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0176  4-aminobutyrate aminotransferase  60 
 
 		 448 aa  496  1e-139  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.0769086 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2649  aminotransferase class-III  55.18 
 
 		 441 aa  486  1e-136  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.856293 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3989  4-aminobutyrate aminotransferase  53.78 
 
 		 461 aa  473  1e-132  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.992424  normal  0.611425 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0214  4-aminobutyrate aminotransferase  52.64 
 
 		 431 aa  452  1.0000000000000001e-126  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.144778  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4452  4-aminobutyrate aminotransferase  50 
 
 		 441 aa  428  1e-119  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0949  aminotransferase class-III  51.64 
 
 		 418 aa  428  1e-118  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3076  Acetylornithine transaminase  50.92 
 
 		 432 aa  420  1e-116  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.25771  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0275  4-aminobutyrate aminotransferase  51.06 
 
 		 417 aa  409  1e-113  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.0862859 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0139  aminotransferase class-III  46.22 
 
 		 452 aa  407  1.0000000000000001e-112  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000384602  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1738  aminotransferase class-III  47.12 
 
 		 465 aa  408  1.0000000000000001e-112  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.243066  normal  0.440114 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1464  aminotransferase class-III  52.15 
 
 		 448 aa  404  1e-111  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000155661  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0989  4-aminobutyrate aminotransferase  47.44 
 
 		 458 aa  404  1e-111  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.48801  normal  0.0598376 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1796  Acetylornithine transaminase  48.86 
 
 		 439 aa  404  1e-111  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.778199  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2019  aminotransferase class-III  47.12 
 
 		 465 aa  399  9.999999999999999e-111  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1957  4-aminobutyrate aminotransferase  48.18 
 
 		 427 aa  386  1e-106  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0566  4-aminobutyrate aminotransferase  45.99 
 
 		 428 aa  382  1e-105  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2386  aminotransferase  46.39 
 
 		 471 aa  375  1e-103  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.419585  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0119  4-aminobutyrate aminotransferase  46.32 
 
 		 438 aa  371  1e-101  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3926  aminotransferase class-III  47.24 
 
 		 442 aa  367  1e-100  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1344  aminotransferase class-III  45.23 
 
 		 445 aa  364  2e-99  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.252611  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3219  aminotransferase class-III  46.61 
 
 		 442 aa  358  8e-98  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.338952 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2245  4-aminobutyrate aminotransferase  42.69 
 
 		 441 aa  357  1.9999999999999998e-97  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.120834  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0310  4-aminobutyrate aminotransferase  40.32 
 
 		 454 aa  356  5e-97  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0325  4-aminobutyrate aminotransferase  40.32 
 
 		 454 aa  356  5e-97  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1532  aminotransferase  45.13 
 
 		 436 aa  355  7.999999999999999e-97  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0305  4-aminobutyrate aminotransferase  40.09 
 
 		 454 aa  355  1e-96  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2755  4-aminobutyrate aminotransferase  42.4 
 
 		 448 aa  355  1e-96  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2754  4-aminobutyrate aminotransferase  46.15 
 
 		 445 aa  354  1e-96  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1534  4-aminobutyrate aminotransferase  42.36 
 
 		 453 aa  353  2.9999999999999997e-96  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.46092  normal  0.55252 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2400  4-aminobutyrate aminotransferase  44.06 
 
 		 430 aa  353  4e-96  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.681516  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0371  4-aminobutyrate aminotransferase  39.78 
 
 		 479 aa  352  7e-96  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0357  4-aminobutyrate aminotransferase  40.09 
 
 		 478 aa  352  8e-96  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0293  4-aminobutyrate aminotransferase  40.09 
 
 		 454 aa  351  1e-95  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0297  4-aminobutyrate aminotransferase  40.09 
 
 		 454 aa  351  1e-95  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0399  4-aminobutyrate aminotransferase  40.09 
 
 		 454 aa  351  1e-95  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0326575  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0354  4-aminobutyrate aminotransferase  39.86 
 
 		 468 aa  350  3e-95  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4949  4-aminobutyrate aminotransferase  39.33 
 
 		 454 aa  347  2e-94  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2000  4-aminobutyrate aminotransferase  45.83 
 
 		 432 aa  345  8e-94  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0303  4-aminobutyrate aminotransferase  39.78 
 
 		 454 aa  344  2e-93  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2903  4-aminobutyrate aminotransferase  44.17 
 
 		 438 aa  343  5e-93  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.0048698  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0562  4-aminobutyrate aminotransferase  44.24 
 
 		 447 aa  340  4e-92  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.921583 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2913  4-aminobutyrate aminotransferase  43.57 
 
 		 434 aa  333  5e-90  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.976227 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4758  Acetylornithine transaminase  43.53 
 
 		 418 aa  327  3e-88  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.569005 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2159  4-aminobutyrate aminotransferase  39.35 
 
 		 445 aa  324  2e-87  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2626  4-aminobutyrate aminotransferase  39.29 
 
 		 445 aa  322  9.999999999999999e-87  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.805613  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2680  4-aminobutyrate aminotransferase  39.29 
 
 		 445 aa  322  9.999999999999999e-87  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6300  4-aminobutyrate aminotransferase  41.34 
 
 		 426 aa  321  1.9999999999999998e-86  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.437284  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30190  aminotransferase  41.44 
 
 		 419 aa  319  7.999999999999999e-86  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.168399  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0259  4-aminobutyrate aminotransferase  43.3 
 
 		 434 aa  318  9e-86  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0146  4-aminobutyrate aminotransferase  43.3 
 
 		 434 aa  318  1e-85  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2081  4-aminobutyrate aminotransferase  42 
 
 		 439 aa  318  1e-85  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.703939  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14780  4-aminobutyrate aminotransferase  42.66 
 
 		 437 aa  318  2e-85  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1757  aminotransferase  41.34 
 
 		 425 aa  317  2e-85  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.744583  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0491  aminotransferase  43.47 
 
 		 427 aa  317  3e-85  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.809579 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0315  4-aminobutyrate aminotransferase  41.65 
 
 		 440 aa  316  5e-85  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7694  4-aminobutyrate aminotransferase  41.24 
 
 		 426 aa  313  3.9999999999999997e-84  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.788415  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1034  4-aminobutyrate aminotransferase  40 
 
 		 453 aa  312  9e-84  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0355081 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3172  4-aminobutyrate aminotransferase  42.39 
 
 		 426 aa  311  1e-83  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3364  4-aminobutyrate aminotransferase  41.95 
 
 		 429 aa  310  2e-83  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.158842 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0280  4-aminobutyrate aminotransferase  41.22 
 
 		 429 aa  310  4e-83  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.969383  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0199  4-aminobutyrate aminotransferase  37.35 
 
 		 453 aa  310  4e-83  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00118095  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2210  acetylornithine transaminase  42.76 
 
 		 419 aa  310  4e-83  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2912  4-aminobutyrate aminotransferase  39.81 
 
 		 430 aa  309  5e-83  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.852765 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1618  4-aminobutyrate aminotransferase  41.69 
 
 		 420 aa  309  5.9999999999999995e-83  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.346531  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4695  4-aminobutyrate aminotransferase  39.54 
 
 		 430 aa  309  6.999999999999999e-83  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2924  4-aminobutyrate aminotransferase  38.72 
 
 		 450 aa  309  8e-83  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.647687 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0690  4-aminobutyrate aminotransferase  41.86 
 
 		 448 aa  308  9e-83  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4711  4-aminobutyrate aminotransferase  41.22 
 
 		 446 aa  308  9e-83  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5241  4-aminobutyrate aminotransferase  41.46 
 
 		 427 aa  308  1.0000000000000001e-82  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4909  4-aminobutyrate aminotransferase  41.22 
 
 		 427 aa  308  1.0000000000000001e-82  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3005  4-aminobutyrate aminotransferase  41.22 
 
 		 429 aa  308  2.0000000000000002e-82  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.742708  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3094  4-aminobutyrate aminotransferase  40.74 
 
 		 468 aa  308  2.0000000000000002e-82  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0817591  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5361  4-aminobutyrate aminotransferase  41.22 
 
 		 429 aa  308  2.0000000000000002e-82  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.984164  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0429  4-aminobutyrate aminotransferase  42.25 
 
 		 433 aa  307  3e-82  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.286831  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2338  4-aminobutyrate aminotransferase  40.42 
 
 		 422 aa  306  4.0000000000000004e-82  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.384271  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4664  4-aminobutyrate aminotransferase  40.73 
 
 		 428 aa  306  6e-82  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3862  4-aminobutyrate aminotransferase  42.22 
 
 		 427 aa  306  7e-82  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.612157 
 
 
-
 
NC_006694  CNI00880  ornithine-oxo-acid aminotransferase, putative  40.83 
 
 		 476 aa  304  2.0000000000000002e-81  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1916  Acetylornithine transaminase  41.16 
 
 		 417 aa  304  3.0000000000000004e-81  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2581  4-aminobutyrate aminotransferase  40.09 
 
 		 446 aa  302  7.000000000000001e-81  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.120886  normal  0.564644 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0232  4-aminobutyrate aminotransferase  38.05 
 
 		 440 aa  301  1e-80  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4570  aminotransferase class-III  40.55 
 
 		 447 aa  301  1e-80  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.782068  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0344  4-aminobutyrate aminotransferase  38.52 
 
 		 426 aa  300  2e-80  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1021  4-aminobutyrate aminotransferase  39.63 
 
 		 426 aa  301  2e-80  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0214  4-aminobutyrate aminotransferase  39.49 
 
 		 425 aa  300  2e-80  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0174674 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2797  4-aminobutyrate aminotransferase  39.63 
 
 		 426 aa  301  2e-80  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0229  4-aminobutyrate aminotransferase  39.49 
 
 		 425 aa  300  2e-80  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1044  4-aminobutyrate aminotransferase  39.63 
 
 		 426 aa  301  2e-80  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0188  4-aminobutyrate aminotransferase  39.03 
 
 		 425 aa  301  2e-80  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0238  4-aminobutyrate aminotransferase  39.49 
 
 		 425 aa  300  2e-80  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2972  4-aminobutyrate aminotransferase  40.48 
 
 		 427 aa  300  3e-80  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.109466  normal  0.025416 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3904  4-aminobutyrate aminotransferase  39.63 
 
 		 426 aa  300  3e-80  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.888156 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0871  acetylornithine aminotransferase  41.11 
 
 		 403 aa  300  3e-80  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2937  4-aminobutyrate aminotransferase  40.48 
 
 		 427 aa  300  4e-80  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.735836  normal  0.115833 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4056  Acetylornithine transaminase  41.48 
 
 		 446 aa  300  4e-80  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>