More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dbac_2000 on replicon NC_013173
Organism: Desulfomicrobium baculatum DSM 4028



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013173  Dbac_2000  4-aminobutyrate aminotransferase  100 
 
 		 432 aa  884    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0119  4-aminobutyrate aminotransferase  56.38 
 
 		 438 aa  490  1e-137  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0371  4-aminobutyrate aminotransferase  51.54 
 
 		 479 aa  461  9.999999999999999e-129  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0310  4-aminobutyrate aminotransferase  50.82 
 
 		 454 aa  459  9.999999999999999e-129  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0305  4-aminobutyrate aminotransferase  52 
 
 		 454 aa  458  9.999999999999999e-129  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2755  4-aminobutyrate aminotransferase  51.3 
 
 		 448 aa  459  9.999999999999999e-129  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0325  4-aminobutyrate aminotransferase  50.82 
 
 		 454 aa  459  9.999999999999999e-129  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0354  4-aminobutyrate aminotransferase  51.3 
 
 		 468 aa  456  1e-127  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0399  4-aminobutyrate aminotransferase  51.06 
 
 		 454 aa  456  1e-127  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0326575  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0293  4-aminobutyrate aminotransferase  50.58 
 
 		 454 aa  455  1e-127  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0297  4-aminobutyrate aminotransferase  50.82 
 
 		 454 aa  457  1e-127  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0357  4-aminobutyrate aminotransferase  50.58 
 
 		 478 aa  456  1e-127  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4949  4-aminobutyrate aminotransferase  51.06 
 
 		 454 aa  456  1e-127  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0303  4-aminobutyrate aminotransferase  50 
 
 		 454 aa  449  1e-125  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1534  4-aminobutyrate aminotransferase  51.77 
 
 		 453 aa  446  1.0000000000000001e-124  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.46092  normal  0.55252 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2400  4-aminobutyrate aminotransferase  51.06 
 
 		 430 aa  441  9.999999999999999e-123  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.681516  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2081  4-aminobutyrate aminotransferase  53.18 
 
 		 439 aa  426  1e-118  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.703939  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2903  4-aminobutyrate aminotransferase  51.17 
 
 		 438 aa  418  9.999999999999999e-116  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.0048698  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2245  4-aminobutyrate aminotransferase  46.82 
 
 		 441 aa  417  9.999999999999999e-116  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.120834  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0188  4-aminobutyrate aminotransferase  48.83 
 
 		 425 aa  412  1e-114  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1034  4-aminobutyrate aminotransferase  49.3 
 
 		 453 aa  412  1e-114  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0355081 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0344  4-aminobutyrate aminotransferase  47.76 
 
 		 426 aa  409  1e-113  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03450  4-aminobutyrate aminotransferase  48 
 
 		 426 aa  410  1e-113  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  1.22305e-16 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0229  4-aminobutyrate aminotransferase  47.33 
 
 		 425 aa  407  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0214  4-aminobutyrate aminotransferase  47.33 
 
 		 425 aa  407  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0174674 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0232  4-aminobutyrate aminotransferase  48.58 
 
 		 440 aa  407  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2912  4-aminobutyrate aminotransferase  50.23 
 
 		 430 aa  405  1.0000000000000001e-112  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.852765 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4998  4-aminobutyrate aminotransferase  48.36 
 
 		 425 aa  407  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.554548  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2905  4-aminobutyrate aminotransferase  48.58 
 
 		 427 aa  405  1.0000000000000001e-112  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0238  4-aminobutyrate aminotransferase  47.43 
 
 		 425 aa  405  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2972  4-aminobutyrate aminotransferase  47.88 
 
 		 427 aa  402  1e-111  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.109466  normal  0.025416 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0592  4-aminobutyrate aminotransferase  46.42 
 
 		 432 aa  402  1e-111  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2989  4-aminobutyrate aminotransferase  48.11 
 
 		 427 aa  403  1e-111  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0883038 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2937  4-aminobutyrate aminotransferase  47.88 
 
 		 427 aa  402  1e-111  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.735836  normal  0.115833 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2581  4-aminobutyrate aminotransferase  48.95 
 
 		 446 aa  404  1e-111  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.120886  normal  0.564644 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02518  4-aminobutyrate aminotransferase  47.44 
 
 		 426 aa  400  9.999999999999999e-111  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2913  4-aminobutyrate aminotransferase  49.3 
 
 		 434 aa  400  9.999999999999999e-111  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.976227 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1021  4-aminobutyrate aminotransferase  47.54 
 
 		 426 aa  399  9.999999999999999e-111  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0301  4-aminobutyrate aminotransferase  48.72 
 
 		 426 aa  399  9.999999999999999e-111  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0090  4-aminobutyrate aminotransferase  48.49 
 
 		 426 aa  400  9.999999999999999e-111  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2782  4-aminobutyrate aminotransferase  47.44 
 
 		 426 aa  400  9.999999999999999e-111  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.480055 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02482  hypothetical protein  47.44 
 
 		 426 aa  400  9.999999999999999e-111  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4695  4-aminobutyrate aminotransferase  47.32 
 
 		 430 aa  401  9.999999999999999e-111  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3904  4-aminobutyrate aminotransferase  47.44 
 
 		 426 aa  400  9.999999999999999e-111  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.888156 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0293  hypothetical protein  50.58 
 
 		 450 aa  396  1e-109  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2797  4-aminobutyrate aminotransferase  47.31 
 
 		 426 aa  397  1e-109  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2942  4-aminobutyrate aminotransferase  47.31 
 
 		 426 aa  397  1e-109  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2313  4-aminobutyrate aminotransferase  48.02 
 
 		 446 aa  396  1e-109  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.233271  normal  0.897192 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2274  4-aminobutyrate aminotransferase  48.02 
 
 		 446 aa  396  1e-109  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1044  4-aminobutyrate aminotransferase  47.31 
 
 		 426 aa  397  1e-109  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2321  4-aminobutyrate aminotransferase  48.02 
 
 		 446 aa  396  1e-109  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.42867  normal  0.490264 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0309  hypothetical protein  50.35 
 
 		 450 aa  392  1e-108  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2798  4-aminobutyrate aminotransferase  50.81 
 
 		 456 aa  392  1e-108  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00539792 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1978  4-aminobutyrate aminotransferase  46.84 
 
 		 425 aa  395  1e-108  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.514602 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1344  aminotransferase class-III  47.93 
 
 		 445 aa  394  1e-108  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.252611  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3094  4-aminobutyrate aminotransferase  51.64 
 
 		 468 aa  395  1e-108  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0817591  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3818  4-aminobutyrate aminotransferase  48.72 
 
 		 450 aa  389  1e-107  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.104054  normal  0.256716 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1956  4-aminobutyrate aminotransferase  48.6 
 
 		 450 aa  389  1e-107  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4851  4-aminobutyrate aminotransferase  45.92 
 
 		 430 aa  391  1e-107  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2630  4-aminobutyrate aminotransferase  47.42 
 
 		 430 aa  388  1e-106  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1618  4-aminobutyrate aminotransferase  45.35 
 
 		 420 aa  388  1e-106  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.346531  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1910  4-aminobutyrate aminotransferase  47.32 
 
 		 426 aa  387  1e-106  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.692445  normal  0.29202 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4570  aminotransferase class-III  50 
 
 		 447 aa  385  1e-106  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.782068  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0117  aminotransferase class-III  49.65 
 
 		 453 aa  382  1e-105  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.457647  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46670  4-aminobutyrate transaminase  47.78 
 
 		 426 aa  382  1e-105  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01279  GABA aminotransferase, PLP-dependent  45.79 
 
 		 421 aa  381  1e-104  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2344  4-aminobutyrate aminotransferase  45.79 
 
 		 421 aa  381  1e-104  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.00720647  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1417  4-aminobutyrate transaminase  46.03 
 
 		 421 aa  380  1e-104  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2323  4-aminobutyrate transaminase  45.79 
 
 		 421 aa  381  1e-104  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5241  4-aminobutyrate aminotransferase  46.05 
 
 		 427 aa  379  1e-104  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2567  4-aminobutyrate aminotransferase  47.21 
 
 		 424 aa  381  1e-104  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.78639  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01290  hypothetical protein  45.79 
 
 		 421 aa  381  1e-104  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4618  4-aminobutyrate aminotransferase  45.35 
 
 		 427 aa  380  1e-104  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.914156  normal  0.10828 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0429  4-aminobutyrate aminotransferase  48.21 
 
 		 433 aa  380  1e-104  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.286831  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1512  4-aminobutyrate transaminase  45.79 
 
 		 421 aa  381  1e-104  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1944  4-aminobutyrate transaminase  45.9 
 
 		 421 aa  379  1e-104  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.991898 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3364  4-aminobutyrate aminotransferase  45.9 
 
 		 429 aa  379  1e-104  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.158842 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1538  4-aminobutyrate transaminase  45.79 
 
 		 421 aa  377  1e-103  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.535334  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1820  4-aminobutyrate transaminase  45.67 
 
 		 421 aa  376  1e-103  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.144249 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0146  4-aminobutyrate aminotransferase  46.73 
 
 		 434 aa  378  1e-103  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0690  4-aminobutyrate aminotransferase  48.83 
 
 		 448 aa  378  1e-103  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3137  4-aminobutyrate aminotransferase  47.44 
 
 		 424 aa  377  1e-103  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.213623 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7835  4-aminobutyrate aminotransferase  48.24 
 
 		 443 aa  376  1e-103  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0486392 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0834  4-aminobutyrate aminotransferase  46.05 
 
 		 429 aa  378  1e-103  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.379614 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2259  4-aminobutyrate aminotransferase  45.85 
 
 		 426 aa  375  1e-103  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.418729  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3398  4-aminobutyrate aminotransferase  46.3 
 
 		 426 aa  375  1e-102  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0259  4-aminobutyrate aminotransferase  46.14 
 
 		 434 aa  374  1e-102  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4229  4-aminobutyrate aminotransferase  45.2 
 
 		 428 aa  372  1e-102  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.94603  normal  0.717078 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3721  4-aminobutyrate aminotransferase  46.3 
 
 		 426 aa  374  1e-102  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4909  4-aminobutyrate aminotransferase  45.2 
 
 		 427 aa  373  1e-102  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3005  4-aminobutyrate aminotransferase  45.2 
 
 		 429 aa  372  1e-102  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.742708  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3003  4-aminobutyrate aminotransferase  47.45 
 
 		 424 aa  375  1e-102  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.48796  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4711  4-aminobutyrate aminotransferase  45.58 
 
 		 446 aa  374  1e-102  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5361  4-aminobutyrate aminotransferase  45.2 
 
 		 429 aa  372  1e-102  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.984164  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3864  4-aminobutyrate aminotransferase  45.43 
 
 		 421 aa  372  1e-102  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0197143 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2636  4-aminobutyrate aminotransferase  47.25 
 
 		 425 aa  374  1e-102  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0897  4-aminobutyrate aminotransferase  48.62 
 
 		 489 aa  370  1e-101  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.122318 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0280  4-aminobutyrate aminotransferase  45.24 
 
 		 429 aa  371  1e-101  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.969383  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3663  4-aminobutyrate aminotransferase  47.65 
 
 		 445 aa  369  1e-101  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0007  aminotransferase class-III  43.06 
 
 		 425 aa  369  1e-101  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.383992  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>