More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_0897 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_0897  4-aminobutyrate aminotransferase  100 
 
 		 489 aa  976    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.122318 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1034  4-aminobutyrate aminotransferase  69.25 
 
 		 453 aa  610  1e-173  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0355081 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3824  4-aminobutyrate aminotransferase  76.82 
 
 		 475 aa  608  1e-173  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0707619  normal  0.0367563 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1956  4-aminobutyrate aminotransferase  66.96 
 
 		 450 aa  592  1e-168  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0690  4-aminobutyrate aminotransferase  69.04 
 
 		 448 aa  573  1.0000000000000001e-162  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2581  4-aminobutyrate aminotransferase  64.82 
 
 		 446 aa  563  1.0000000000000001e-159  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.120886  normal  0.564644 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3663  4-aminobutyrate aminotransferase  68.46 
 
 		 445 aa  559  1e-158  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2321  4-aminobutyrate aminotransferase  63.94 
 
 		 446 aa  546  1e-154  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.42867  normal  0.490264 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2313  4-aminobutyrate aminotransferase  63.94 
 
 		 446 aa  546  1e-154  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.233271  normal  0.897192 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3818  4-aminobutyrate aminotransferase  65.13 
 
 		 450 aa  545  1e-154  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.104054  normal  0.256716 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2274  4-aminobutyrate aminotransferase  63.94 
 
 		 446 aa  546  1e-154  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3205  4-aminobutyrate aminotransferase  63.3 
 
 		 450 aa  540  9.999999999999999e-153  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.620682  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4960  4-aminobutyrate aminotransferase  64.79 
 
 		 432 aa  535  1e-151  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7835  4-aminobutyrate aminotransferase  63.25 
 
 		 443 aa  533  1e-150  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0486392 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1723  4-aminobutyrate aminotransferase  66.22 
 
 		 451 aa  524  1e-147  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.577321  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2798  4-aminobutyrate aminotransferase  61.3 
 
 		 456 aa  515  1.0000000000000001e-145  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00539792 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1858  4-aminobutyrate aminotransferase  61.15 
 
 		 450 aa  513  1e-144  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3094  4-aminobutyrate aminotransferase  61.31 
 
 		 468 aa  514  1e-144  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0817591  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12609  4-aminobutyrate aminotransferase  63.96 
 
 		 449 aa  508  9.999999999999999e-143  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.20545  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0645  4-aminobutyrate aminotransferase  64.19 
 
 		 452 aa  492  9.999999999999999e-139  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_10360  4-aminobutyrate aminotransferase  57.81 
 
 		 440 aa  461  9.999999999999999e-129  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.70128  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1093  4-aminobutyrate aminotransferase  58.6 
 
 		 441 aa  456  1e-127  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1424  4-aminobutyrate aminotransferase  60.48 
 
 		 460 aa  436  1e-121  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0991772  normal  0.460573 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1308  4-aminobutyrate aminotransferase  60.31 
 
 		 450 aa  427  1e-118  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.518173  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2755  4-aminobutyrate aminotransferase  46.33 
 
 		 448 aa  422  1e-116  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0354  4-aminobutyrate aminotransferase  45.9 
 
 		 468 aa  413  1e-114  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0297  4-aminobutyrate aminotransferase  46.14 
 
 		 454 aa  413  1e-114  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0399  4-aminobutyrate aminotransferase  45.02 
 
 		 454 aa  415  1e-114  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0326575  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0303  4-aminobutyrate aminotransferase  44.89 
 
 		 454 aa  410  1e-113  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0310  4-aminobutyrate aminotransferase  45.91 
 
 		 454 aa  410  1e-113  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0293  4-aminobutyrate aminotransferase  45.91 
 
 		 454 aa  410  1e-113  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0305  4-aminobutyrate aminotransferase  45.68 
 
 		 454 aa  411  1e-113  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0371  4-aminobutyrate aminotransferase  45.91 
 
 		 479 aa  409  1e-113  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0325  4-aminobutyrate aminotransferase  45.91 
 
 		 454 aa  410  1e-113  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0357  4-aminobutyrate aminotransferase  45.91 
 
 		 478 aa  410  1e-113  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4949  4-aminobutyrate aminotransferase  45.68 
 
 		 454 aa  407  1.0000000000000001e-112  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2903  4-aminobutyrate aminotransferase  50.79 
 
 		 438 aa  400  9.999999999999999e-111  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.0048698  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2245  4-aminobutyrate aminotransferase  44.84 
 
 		 441 aa  397  1e-109  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.120834  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1534  4-aminobutyrate aminotransferase  49.55 
 
 		 453 aa  397  1e-109  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.46092  normal  0.55252 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2924  4-aminobutyrate aminotransferase  48.75 
 
 		 450 aa  392  1e-108  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.647687 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2000  4-aminobutyrate aminotransferase  48.85 
 
 		 432 aa  384  1e-105  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0309  hypothetical protein  46.8 
 
 		 450 aa  379  1e-104  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0293  hypothetical protein  46.58 
 
 		 450 aa  382  1e-104  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2405  aminotransferase class-III  46.28 
 
 		 450 aa  380  1e-104  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2400  4-aminobutyrate aminotransferase  46.42 
 
 		 430 aa  367  1e-100  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.681516  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3172  4-aminobutyrate aminotransferase  48.28 
 
 		 426 aa  366  1e-100  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0562  4-aminobutyrate aminotransferase  48.88 
 
 		 447 aa  361  2e-98  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.921583 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3862  4-aminobutyrate aminotransferase  47.24 
 
 		 427 aa  360  3e-98  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.612157 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0119  4-aminobutyrate aminotransferase  46.03 
 
 		 438 aa  360  4e-98  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3928  (S)-3-amino-2-methylpropionate transaminase  46.21 
 
 		 427 aa  358  9.999999999999999e-98  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4414  4-aminobutyrate aminotransferase  50.71 
 
 		 426 aa  356  5.999999999999999e-97  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.877124 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1344  aminotransferase class-III  44.04 
 
 		 445 aa  355  6.999999999999999e-97  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.252611  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2081  4-aminobutyrate aminotransferase  48.25 
 
 		 439 aa  355  8.999999999999999e-97  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.703939  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1910  4-aminobutyrate aminotransferase  46.45 
 
 		 426 aa  350  2e-95  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.692445  normal  0.29202 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2338  4-aminobutyrate aminotransferase  47.31 
 
 		 422 aa  351  2e-95  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.384271  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2912  4-aminobutyrate aminotransferase  44.99 
 
 		 430 aa  350  5e-95  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.852765 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0229  4-aminobutyrate aminotransferase  45.14 
 
 		 425 aa  348  1e-94  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0214  4-aminobutyrate aminotransferase  45.14 
 
 		 425 aa  348  1e-94  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0174674 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4664  4-aminobutyrate aminotransferase  46.47 
 
 		 428 aa  348  1e-94  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0592  4-aminobutyrate aminotransferase  43.91 
 
 		 432 aa  348  1e-94  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4998  4-aminobutyrate aminotransferase  43.98 
 
 		 425 aa  348  2e-94  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.554548  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0117  aminotransferase class-III  47.1 
 
 		 453 aa  347  2e-94  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.457647  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02518  4-aminobutyrate aminotransferase  44.32 
 
 		 426 aa  347  3e-94  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02482  hypothetical protein  44.32 
 
 		 426 aa  347  3e-94  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2782  4-aminobutyrate aminotransferase  44.78 
 
 		 426 aa  347  3e-94  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.480055 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3904  4-aminobutyrate aminotransferase  44.32 
 
 		 426 aa  346  6e-94  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.888156 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1044  4-aminobutyrate aminotransferase  44.29 
 
 		 426 aa  345  8e-94  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2797  4-aminobutyrate aminotransferase  44.29 
 
 		 426 aa  345  8e-94  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1021  4-aminobutyrate aminotransferase  44.29 
 
 		 426 aa  345  1e-93  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0238  4-aminobutyrate aminotransferase  44.68 
 
 		 425 aa  345  1e-93  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3398  4-aminobutyrate aminotransferase  45.96 
 
 		 426 aa  344  2.9999999999999997e-93  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2942  4-aminobutyrate aminotransferase  44.06 
 
 		 426 aa  342  7e-93  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4570  aminotransferase class-III  46.85 
 
 		 447 aa  342  7e-93  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.782068  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4229  4-aminobutyrate aminotransferase  47.33 
 
 		 428 aa  342  1e-92  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.94603  normal  0.717078 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2630  4-aminobutyrate aminotransferase  44.98 
 
 		 430 aa  342  1e-92  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3070  4-aminobutyrate aminotransferase  47.81 
 
 		 433 aa  340  2.9999999999999998e-92  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0281034 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3864  4-aminobutyrate aminotransferase  44.06 
 
 		 421 aa  340  4e-92  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0197143 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3721  4-aminobutyrate aminotransferase  44.8 
 
 		 426 aa  339  7e-92  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6300  4-aminobutyrate aminotransferase  45.64 
 
 		 426 aa  338  9.999999999999999e-92  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.437284  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1978  4-aminobutyrate aminotransferase  44.21 
 
 		 425 aa  338  9.999999999999999e-92  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.514602 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4695  4-aminobutyrate aminotransferase  44.95 
 
 		 430 aa  337  1.9999999999999998e-91  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1889  4-aminobutyrate aminotransferase  45.45 
 
 		 435 aa  337  1.9999999999999998e-91  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.148357  normal  0.0202633 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4851  4-aminobutyrate aminotransferase  42.53 
 
 		 430 aa  338  1.9999999999999998e-91  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0029  4-aminobutyrate aminotransferase protein  46.17 
 
 		 426 aa  337  2.9999999999999997e-91  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.717101 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0188  4-aminobutyrate aminotransferase  43.32 
 
 		 425 aa  337  2.9999999999999997e-91  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0047  4-aminobutyrate aminotransferase  46.33 
 
 		 425 aa  337  2.9999999999999997e-91  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0232  4-aminobutyrate aminotransferase  42.59 
 
 		 440 aa  337  2.9999999999999997e-91  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2371  4-aminobutyrate aminotransferase  45.48 
 
 		 440 aa  336  3.9999999999999995e-91  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0827884  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1618  4-aminobutyrate aminotransferase  44.39 
 
 		 420 aa  337  3.9999999999999995e-91  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.346531  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0315  4-aminobutyrate aminotransferase  46.44 
 
 		 440 aa  337  3.9999999999999995e-91  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0344  4-aminobutyrate aminotransferase  43.98 
 
 		 426 aa  336  5e-91  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3262  4-aminobutyrate aminotransferase  46.26 
 
 		 425 aa  336  5.999999999999999e-91  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.129895 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03450  4-aminobutyrate aminotransferase  43.98 
 
 		 426 aa  336  5.999999999999999e-91  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  1.22305e-16 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0952  4-aminobutyrate aminotransferase  45.09 
 
 		 425 aa  333  5e-90  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0910  4-aminobutyrate aminotransferase  44.8 
 
 		 425 aa  332  7.000000000000001e-90  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.0000169324  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0090  4-aminobutyrate aminotransferase  44.68 
 
 		 426 aa  332  8e-90  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4306  4-aminobutyrate aminotransferase  44.47 
 
 		 421 aa  332  1e-89  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01279  GABA aminotransferase, PLP-dependent  43.29 
 
 		 421 aa  330  4e-89  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1512  4-aminobutyrate transaminase  43.29 
 
 		 421 aa  330  4e-89  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2323  4-aminobutyrate transaminase  43.29 
 
 		 421 aa  330  4e-89  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>