More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrub_2924 on replicon NC_013946
Organism: Meiothermus ruber DSM 1279



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014212  Mesil_2405  aminotransferase class-III  86.67 
 
 		 450 aa  784    Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2924  4-aminobutyrate aminotransferase  100 
 
 		 450 aa  915    Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.647687 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0562  4-aminobutyrate aminotransferase  54.85 
 
 		 447 aa  450  1e-125  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.921583 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4570  aminotransferase class-III  54.34 
 
 		 447 aa  445  1.0000000000000001e-124  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.782068  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2755  4-aminobutyrate aminotransferase  50.57 
 
 		 448 aa  440  9.999999999999999e-123  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0117  aminotransferase class-III  53.17 
 
 		 453 aa  438  1e-121  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.457647  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0303  4-aminobutyrate aminotransferase  46.49 
 
 		 454 aa  411  1e-113  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2313  4-aminobutyrate aminotransferase  49.32 
 
 		 446 aa  405  1.0000000000000001e-112  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.233271  normal  0.897192 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2274  4-aminobutyrate aminotransferase  49.32 
 
 		 446 aa  405  1.0000000000000001e-112  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2903  4-aminobutyrate aminotransferase  49.54 
 
 		 438 aa  406  1.0000000000000001e-112  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.0048698  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2321  4-aminobutyrate aminotransferase  49.32 
 
 		 446 aa  405  1.0000000000000001e-112  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.42867  normal  0.490264 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0305  4-aminobutyrate aminotransferase  45.02 
 
 		 454 aa  402  1e-111  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0310  4-aminobutyrate aminotransferase  45.02 
 
 		 454 aa  402  1e-111  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0293  4-aminobutyrate aminotransferase  45.02 
 
 		 454 aa  402  1e-111  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0297  4-aminobutyrate aminotransferase  45.02 
 
 		 454 aa  402  1e-111  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0325  4-aminobutyrate aminotransferase  45.02 
 
 		 454 aa  402  1e-111  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0371  4-aminobutyrate aminotransferase  45.02 
 
 		 479 aa  402  1e-111  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0357  4-aminobutyrate aminotransferase  45.02 
 
 		 478 aa  404  1e-111  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2581  4-aminobutyrate aminotransferase  48.4 
 
 		 446 aa  403  1e-111  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.120886  normal  0.564644 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0354  4-aminobutyrate aminotransferase  44.8 
 
 		 468 aa  400  9.999999999999999e-111  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4949  4-aminobutyrate aminotransferase  44.8 
 
 		 454 aa  400  9.999999999999999e-111  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1534  4-aminobutyrate aminotransferase  48.55 
 
 		 453 aa  400  9.999999999999999e-111  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.46092  normal  0.55252 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0399  4-aminobutyrate aminotransferase  44.8 
 
 		 454 aa  401  9.999999999999999e-111  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0326575  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1034  4-aminobutyrate aminotransferase  46.83 
 
 		 453 aa  390  1e-107  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0355081 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2400  4-aminobutyrate aminotransferase  44.26 
 
 		 430 aa  378  1e-103  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.681516  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3818  4-aminobutyrate aminotransferase  46.38 
 
 		 450 aa  372  1e-102  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.104054  normal  0.256716 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2081  4-aminobutyrate aminotransferase  48.34 
 
 		 439 aa  371  1e-101  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.703939  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2245  4-aminobutyrate aminotransferase  42.47 
 
 		 441 aa  372  1e-101  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.120834  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0897  4-aminobutyrate aminotransferase  48.75 
 
 		 489 aa  370  1e-101  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.122318 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1956  4-aminobutyrate aminotransferase  46.68 
 
 		 450 aa  369  1e-101  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2913  4-aminobutyrate aminotransferase  44.76 
 
 		 434 aa  367  1e-100  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.976227 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0690  4-aminobutyrate aminotransferase  47.8 
 
 		 448 aa  365  1e-99  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1093  4-aminobutyrate aminotransferase  48.01 
 
 		 441 aa  362  8e-99  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12609  4-aminobutyrate aminotransferase  48.28 
 
 		 449 aa  362  9e-99  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.20545  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0309  hypothetical protein  45.8 
 
 		 450 aa  360  3e-98  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0293  hypothetical protein  45.66 
 
 		 450 aa  359  6e-98  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7835  4-aminobutyrate aminotransferase  46.21 
 
 		 443 aa  359  7e-98  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0486392 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0119  4-aminobutyrate aminotransferase  45.09 
 
 		 438 aa  357  1.9999999999999998e-97  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1344  aminotransferase class-III  44.37 
 
 		 445 aa  358  1.9999999999999998e-97  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.252611  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3663  4-aminobutyrate aminotransferase  47.1 
 
 		 445 aa  355  6.999999999999999e-97  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3094  4-aminobutyrate aminotransferase  46.45 
 
 		 468 aa  354  1e-96  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0817591  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1858  4-aminobutyrate aminotransferase  45.71 
 
 		 450 aa  355  1e-96  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1910  4-aminobutyrate aminotransferase  45.2 
 
 		 426 aa  352  1e-95  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.692445  normal  0.29202 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2000  4-aminobutyrate aminotransferase  45.65 
 
 		 432 aa  351  2e-95  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2338  4-aminobutyrate aminotransferase  44.68 
 
 		 422 aa  350  3e-95  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.384271  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2798  4-aminobutyrate aminotransferase  45.48 
 
 		 456 aa  348  9e-95  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00539792 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0315  4-aminobutyrate aminotransferase  44.9 
 
 		 440 aa  347  2e-94  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2630  4-aminobutyrate aminotransferase  43.73 
 
 		 430 aa  346  4e-94  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1723  4-aminobutyrate aminotransferase  48.28 
 
 		 451 aa  346  6e-94  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.577321  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0592  4-aminobutyrate aminotransferase  41.71 
 
 		 432 aa  345  1e-93  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4909  4-aminobutyrate aminotransferase  41.96 
 
 		 427 aa  343  2.9999999999999997e-93  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3005  4-aminobutyrate aminotransferase  41.72 
 
 		 429 aa  343  2.9999999999999997e-93  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.742708  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5361  4-aminobutyrate aminotransferase  41.72 
 
 		 429 aa  343  2.9999999999999997e-93  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.984164  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1021  4-aminobutyrate aminotransferase  42.09 
 
 		 426 aa  342  8e-93  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5241  4-aminobutyrate aminotransferase  41.4 
 
 		 427 aa  341  1e-92  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3904  4-aminobutyrate aminotransferase  42.09 
 
 		 426 aa  342  1e-92  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.888156 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2942  4-aminobutyrate aminotransferase  41.86 
 
 		 426 aa  340  2e-92  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3364  4-aminobutyrate aminotransferase  41.96 
 
 		 429 aa  341  2e-92  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.158842 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0280  4-aminobutyrate aminotransferase  41.49 
 
 		 429 aa  340  2e-92  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.969383  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3824  4-aminobutyrate aminotransferase  48.69 
 
 		 475 aa  340  2e-92  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0707619  normal  0.0367563 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4618  4-aminobutyrate aminotransferase  41.26 
 
 		 427 aa  340  2e-92  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.914156  normal  0.10828 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4711  4-aminobutyrate aminotransferase  41.4 
 
 		 446 aa  340  2e-92  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02518  4-aminobutyrate aminotransferase  42.09 
 
 		 426 aa  340  2.9999999999999998e-92  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1044  4-aminobutyrate aminotransferase  41.86 
 
 		 426 aa  340  2.9999999999999998e-92  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02482  hypothetical protein  42.09 
 
 		 426 aa  340  2.9999999999999998e-92  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3864  4-aminobutyrate aminotransferase  42.02 
 
 		 421 aa  340  2.9999999999999998e-92  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0197143 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2797  4-aminobutyrate aminotransferase  41.86 
 
 		 426 aa  340  2.9999999999999998e-92  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4414  4-aminobutyrate aminotransferase  46.02 
 
 		 426 aa  340  2.9999999999999998e-92  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.877124 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2782  4-aminobutyrate aminotransferase  42.15 
 
 		 426 aa  339  5e-92  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.480055 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1289  4-aminobutyrate aminotransferase  43.36 
 
 		 426 aa  339  5.9999999999999996e-92  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2912  4-aminobutyrate aminotransferase  43.81 
 
 		 430 aa  339  7e-92  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.852765 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0232  4-aminobutyrate aminotransferase  42.39 
 
 		 440 aa  338  9e-92  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_10360  4-aminobutyrate aminotransferase  46.1 
 
 		 440 aa  337  1.9999999999999998e-91  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.70128  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4229  4-aminobutyrate aminotransferase  44.68 
 
 		 428 aa  337  1.9999999999999998e-91  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.94603  normal  0.717078 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0344  4-aminobutyrate aminotransferase  41.45 
 
 		 426 aa  337  1.9999999999999998e-91  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0214  4-aminobutyrate aminotransferase  41.81 
 
 		 425 aa  337  3.9999999999999995e-91  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0174674 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03450  4-aminobutyrate aminotransferase  41.45 
 
 		 426 aa  337  3.9999999999999995e-91  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  1.22305e-16 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0229  4-aminobutyrate aminotransferase  41.81 
 
 		 425 aa  337  3.9999999999999995e-91  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0238  4-aminobutyrate aminotransferase  41.57 
 
 		 425 aa  336  5e-91  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0834  4-aminobutyrate aminotransferase  42.42 
 
 		 429 aa  336  5.999999999999999e-91  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.379614 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0645  4-aminobutyrate aminotransferase  46 
 
 		 452 aa  336  5.999999999999999e-91  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4960  4-aminobutyrate aminotransferase  43.55 
 
 		 432 aa  335  1e-90  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4695  4-aminobutyrate aminotransferase  42.25 
 
 		 430 aa  333  3e-90  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3862  4-aminobutyrate aminotransferase  43.44 
 
 		 427 aa  333  4e-90  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.612157 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0007  aminotransferase class-III  41.45 
 
 		 425 aa  331  1e-89  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.383992  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3928  (S)-3-amino-2-methylpropionate transaminase  42.96 
 
 		 427 aa  331  2e-89  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3205  4-aminobutyrate aminotransferase  45.21 
 
 		 450 aa  330  4e-89  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.620682  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4998  4-aminobutyrate aminotransferase  40.88 
 
 		 425 aa  330  4e-89  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.554548  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3070  4-aminobutyrate aminotransferase  44.81 
 
 		 433 aa  329  7e-89  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0281034 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2371  4-aminobutyrate aminotransferase  43.68 
 
 		 440 aa  329  7e-89  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0827884  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2972  4-aminobutyrate aminotransferase  40.93 
 
 		 427 aa  327  3e-88  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.109466  normal  0.025416 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4851  4-aminobutyrate aminotransferase  40.65 
 
 		 430 aa  327  3e-88  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1978  4-aminobutyrate aminotransferase  41.12 
 
 		 425 aa  327  3e-88  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.514602 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1618  4-aminobutyrate aminotransferase  42.32 
 
 		 420 aa  327  3e-88  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.346531  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2937  4-aminobutyrate aminotransferase  40.93 
 
 		 427 aa  327  3e-88  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.735836  normal  0.115833 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2259  4-aminobutyrate aminotransferase  42.99 
 
 		 426 aa  326  4.0000000000000003e-88  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.418729  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3172  4-aminobutyrate aminotransferase  42.93 
 
 		 426 aa  326  4.0000000000000003e-88  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0188  4-aminobutyrate aminotransferase  40.28 
 
 		 425 aa  326  5e-88  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2905  4-aminobutyrate aminotransferase  40.93 
 
 		 427 aa  326  6e-88  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4519  4-aminobutyrate aminotransferase  41.26 
 
 		 427 aa  326  6e-88  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>