More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mvan_1858 on replicon NC_008726
Organism: Mycobacterium vanbaalenii PYR-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008726  Mvan_1858  4-aminobutyrate aminotransferase  100 
 
 		 450 aa  901    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1034  4-aminobutyrate aminotransferase  64.06 
 
 		 453 aa  600  1e-170  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0355081 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1956  4-aminobutyrate aminotransferase  63.6 
 
 		 450 aa  576  1.0000000000000001e-163  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0690  4-aminobutyrate aminotransferase  63.04 
 
 		 448 aa  549  1e-155  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3205  4-aminobutyrate aminotransferase  63.51 
 
 		 450 aa  545  1e-154  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.620682  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3663  4-aminobutyrate aminotransferase  63.47 
 
 		 445 aa  539  9.999999999999999e-153  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2581  4-aminobutyrate aminotransferase  61.56 
 
 		 446 aa  536  1e-151  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.120886  normal  0.564644 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2313  4-aminobutyrate aminotransferase  60.55 
 
 		 446 aa  525  1e-148  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.233271  normal  0.897192 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2321  4-aminobutyrate aminotransferase  60.55 
 
 		 446 aa  525  1e-148  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.42867  normal  0.490264 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2274  4-aminobutyrate aminotransferase  60.55 
 
 		 446 aa  525  1e-148  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7835  4-aminobutyrate aminotransferase  58.86 
 
 		 443 aa  519  1e-146  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0486392 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0897  4-aminobutyrate aminotransferase  61.15 
 
 		 489 aa  512  1e-144  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.122318 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1723  4-aminobutyrate aminotransferase  62.19 
 
 		 451 aa  508  1e-143  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.577321  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3818  4-aminobutyrate aminotransferase  59.64 
 
 		 450 aa  508  9.999999999999999e-143  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.104054  normal  0.256716 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4960  4-aminobutyrate aminotransferase  59.58 
 
 		 432 aa  503  1e-141  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2798  4-aminobutyrate aminotransferase  58.68 
 
 		 456 aa  498  1e-139  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00539792 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3094  4-aminobutyrate aminotransferase  58.2 
 
 		 468 aa  493  9.999999999999999e-139  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0817591  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3824  4-aminobutyrate aminotransferase  62.47 
 
 		 475 aa  483  1e-135  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0707619  normal  0.0367563 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12609  4-aminobutyrate aminotransferase  58.41 
 
 		 449 aa  478  1e-134  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.20545  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0645  4-aminobutyrate aminotransferase  60.73 
 
 		 452 aa  475  1e-133  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_10360  4-aminobutyrate aminotransferase  55.51 
 
 		 440 aa  465  9.999999999999999e-131  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.70128  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1424  4-aminobutyrate aminotransferase  61.12 
 
 		 460 aa  436  1e-121  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0991772  normal  0.460573 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1308  4-aminobutyrate aminotransferase  58.43 
 
 		 450 aa  432  1e-120  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.518173  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2755  4-aminobutyrate aminotransferase  46.44 
 
 		 448 aa  424  1e-117  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1093  4-aminobutyrate aminotransferase  55.58 
 
 		 441 aa  421  1e-116  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0303  4-aminobutyrate aminotransferase  44.84 
 
 		 454 aa  410  1e-113  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0354  4-aminobutyrate aminotransferase  45.06 
 
 		 468 aa  406  1.0000000000000001e-112  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0293  4-aminobutyrate aminotransferase  45.06 
 
 		 454 aa  405  1.0000000000000001e-112  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0297  4-aminobutyrate aminotransferase  45.06 
 
 		 454 aa  405  1.0000000000000001e-112  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0399  4-aminobutyrate aminotransferase  45.06 
 
 		 454 aa  405  1.0000000000000001e-112  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0326575  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0357  4-aminobutyrate aminotransferase  45.48 
 
 		 478 aa  405  1.0000000000000001e-112  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0310  4-aminobutyrate aminotransferase  45.06 
 
 		 454 aa  404  1e-111  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0371  4-aminobutyrate aminotransferase  44.39 
 
 		 479 aa  402  1e-111  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0325  4-aminobutyrate aminotransferase  45.06 
 
 		 454 aa  404  1e-111  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0305  4-aminobutyrate aminotransferase  44.16 
 
 		 454 aa  403  1e-111  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4949  4-aminobutyrate aminotransferase  44.16 
 
 		 454 aa  400  9.999999999999999e-111  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2245  4-aminobutyrate aminotransferase  44.11 
 
 		 441 aa  397  1e-109  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.120834  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1534  4-aminobutyrate aminotransferase  48.06 
 
 		 453 aa  385  1e-106  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.46092  normal  0.55252 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2903  4-aminobutyrate aminotransferase  46.88 
 
 		 438 aa  377  1e-103  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.0048698  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2630  4-aminobutyrate aminotransferase  45.39 
 
 		 430 aa  370  1e-101  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0592  4-aminobutyrate aminotransferase  44.18 
 
 		 432 aa  369  1e-101  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0293  hypothetical protein  44.12 
 
 		 450 aa  363  3e-99  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0119  4-aminobutyrate aminotransferase  44.06 
 
 		 438 aa  363  3e-99  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2924  4-aminobutyrate aminotransferase  45.02 
 
 		 450 aa  362  5.0000000000000005e-99  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.647687 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0309  hypothetical protein  44.12 
 
 		 450 aa  362  6e-99  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1910  4-aminobutyrate aminotransferase  45.2 
 
 		 426 aa  362  9e-99  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.692445  normal  0.29202 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0562  4-aminobutyrate aminotransferase  47.93 
 
 		 447 aa  362  1e-98  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.921583 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4618  4-aminobutyrate aminotransferase  44.66 
 
 		 427 aa  361  2e-98  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.914156  normal  0.10828 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2405  aminotransferase class-III  45.27 
 
 		 450 aa  361  2e-98  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4711  4-aminobutyrate aminotransferase  44.31 
 
 		 446 aa  357  2.9999999999999997e-97  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5241  4-aminobutyrate aminotransferase  44.31 
 
 		 427 aa  356  3.9999999999999996e-97  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3172  4-aminobutyrate aminotransferase  47.07 
 
 		 426 aa  355  5.999999999999999e-97  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0029  4-aminobutyrate aminotransferase protein  46.43 
 
 		 426 aa  355  6.999999999999999e-97  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.717101 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3398  4-aminobutyrate aminotransferase  45.84 
 
 		 426 aa  355  8.999999999999999e-97  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3721  4-aminobutyrate aminotransferase  45.13 
 
 		 426 aa  355  1e-96  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0238  4-aminobutyrate aminotransferase  42.79 
 
 		 425 aa  355  1e-96  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2371  4-aminobutyrate aminotransferase  44.34 
 
 		 440 aa  354  2e-96  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0827884  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0280  4-aminobutyrate aminotransferase  44.08 
 
 		 429 aa  354  2e-96  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.969383  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2400  4-aminobutyrate aminotransferase  42.92 
 
 		 430 aa  353  2.9999999999999997e-96  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.681516  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4909  4-aminobutyrate aminotransferase  44.31 
 
 		 427 aa  353  4e-96  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3364  4-aminobutyrate aminotransferase  44.31 
 
 		 429 aa  353  4e-96  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.158842 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3005  4-aminobutyrate aminotransferase  44.08 
 
 		 429 aa  353  4e-96  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.742708  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5361  4-aminobutyrate aminotransferase  44.08 
 
 		 429 aa  353  4e-96  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.984164  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0229  4-aminobutyrate aminotransferase  42.32 
 
 		 425 aa  353  5e-96  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0214  4-aminobutyrate aminotransferase  42.32 
 
 		 425 aa  353  5e-96  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0174674 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2081  4-aminobutyrate aminotransferase  47.38 
 
 		 439 aa  353  5e-96  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.703939  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2338  4-aminobutyrate aminotransferase  46.17 
 
 		 422 aa  352  5.9999999999999994e-96  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.384271  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4998  4-aminobutyrate aminotransferase  42.65 
 
 		 425 aa  352  8e-96  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.554548  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0188  4-aminobutyrate aminotransferase  44.13 
 
 		 425 aa  350  4e-95  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1618  4-aminobutyrate aminotransferase  44.89 
 
 		 420 aa  350  4e-95  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.346531  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0117  aminotransferase class-III  47 
 
 		 453 aa  348  1e-94  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.457647  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4229  4-aminobutyrate aminotransferase  45.75 
 
 		 428 aa  348  1e-94  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.94603  normal  0.717078 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2912  4-aminobutyrate aminotransferase  43.33 
 
 		 430 aa  347  2e-94  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.852765 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0834  4-aminobutyrate aminotransferase  44.63 
 
 		 429 aa  347  2e-94  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.379614 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1978  4-aminobutyrate aminotransferase  46.04 
 
 		 425 aa  348  2e-94  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.514602 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4851  4-aminobutyrate aminotransferase  43.71 
 
 		 430 aa  348  2e-94  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2545  4-aminobutyrate aminotransferase  44.63 
 
 		 421 aa  346  5e-94  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.505618  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4570  aminotransferase class-III  46.28 
 
 		 447 aa  346  5e-94  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.782068  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5049  4-aminobutyrate aminotransferase  46.56 
 
 		 436 aa  346  6e-94  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.96187  normal  0.62875 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4519  4-aminobutyrate aminotransferase  44.66 
 
 		 427 aa  345  8.999999999999999e-94  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2233  4-aminobutyrate aminotransferase  44.24 
 
 		 421 aa  345  1e-93  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.4744  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4695  4-aminobutyrate aminotransferase  43.49 
 
 		 430 aa  344  2e-93  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3864  4-aminobutyrate aminotransferase  44.29 
 
 		 421 aa  343  2.9999999999999997e-93  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0197143 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2259  4-aminobutyrate aminotransferase  47.07 
 
 		 426 aa  341  1e-92  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.418729  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3862  4-aminobutyrate aminotransferase  46.67 
 
 		 427 aa  340  4e-92  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.612157 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3928  (S)-3-amino-2-methylpropionate transaminase  43.59 
 
 		 427 aa  339  5e-92  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2000  4-aminobutyrate aminotransferase  42.55 
 
 		 432 aa  339  5.9999999999999996e-92  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0232  4-aminobutyrate aminotransferase  41.71 
 
 		 440 aa  337  2.9999999999999997e-91  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4414  4-aminobutyrate aminotransferase  47.46 
 
 		 426 aa  336  3.9999999999999995e-91  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.877124 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0344  4-aminobutyrate aminotransferase  42.59 
 
 		 426 aa  336  5e-91  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3262  4-aminobutyrate aminotransferase  45.82 
 
 		 425 aa  336  5.999999999999999e-91  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.129895 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03450  4-aminobutyrate aminotransferase  42.59 
 
 		 426 aa  336  5.999999999999999e-91  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  1.22305e-16 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4306  4-aminobutyrate aminotransferase  44.03 
 
 		 421 aa  335  9e-91  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0301  4-aminobutyrate aminotransferase  44.92 
 
 		 426 aa  335  9e-91  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4664  4-aminobutyrate aminotransferase  45.24 
 
 		 428 aa  335  1e-90  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02518  4-aminobutyrate aminotransferase  42.12 
 
 		 426 aa  334  2e-90  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4167  4-aminobutyrate aminotransferase  45.54 
 
 		 434 aa  334  2e-90  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.130001  normal  0.207789 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0809  4-aminobutyrate aminotransferase  41.9 
 
 		 419 aa  334  2e-90  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.615332  normal  0.0671712 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02482  hypothetical protein  42.12 
 
 		 426 aa  334  2e-90  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1021  4-aminobutyrate aminotransferase  42.08 
 
 		 426 aa  333  3e-90  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>