More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcer98_0303 on replicon NC_009674
Organism: Bacillus cytotoxicus NVH 391-98



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011772  BCG9842_B4949  4-aminobutyrate aminotransferase  90.09 
 
 
454 aa  857    Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0354  4-aminobutyrate aminotransferase  90.53 
 
 
468 aa  860    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0399  4-aminobutyrate aminotransferase  90.97 
 
 
454 aa  864    Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0326575  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0310  4-aminobutyrate aminotransferase  89.87 
 
 
454 aa  852    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0293  4-aminobutyrate aminotransferase  90.09 
 
 
454 aa  853    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0297  4-aminobutyrate aminotransferase  90.31 
 
 
454 aa  857    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0325  4-aminobutyrate aminotransferase  89.87 
 
 
454 aa  852    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0357  4-aminobutyrate aminotransferase  90.31 
 
 
478 aa  857    Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0371  4-aminobutyrate aminotransferase  90.31 
 
 
479 aa  859    Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0303  4-aminobutyrate aminotransferase  100 
 
 
454 aa  936    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0305  4-aminobutyrate aminotransferase  90.09 
 
 
454 aa  859    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2755  4-aminobutyrate aminotransferase  61.73 
 
 
448 aa  587  1e-166  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2245  4-aminobutyrate aminotransferase  51.51 
 
 
441 aa  473  1e-132  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.120834  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0119  4-aminobutyrate aminotransferase  52.57 
 
 
438 aa  456  1e-127  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0592  4-aminobutyrate aminotransferase  49.07 
 
 
432 aa  450  1e-125  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2630  4-aminobutyrate aminotransferase  50.48 
 
 
430 aa  446  1.0000000000000001e-124  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2400  4-aminobutyrate aminotransferase  49.3 
 
 
430 aa  441  9.999999999999999e-123  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.681516  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4695  4-aminobutyrate aminotransferase  50.7 
 
 
430 aa  439  9.999999999999999e-123  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2000  4-aminobutyrate aminotransferase  50 
 
 
432 aa  431  1e-120  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2903  4-aminobutyrate aminotransferase  50.23 
 
 
438 aa  432  1e-120  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.0048698  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2912  4-aminobutyrate aminotransferase  49.77 
 
 
430 aa  424  1e-117  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.852765 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1034  4-aminobutyrate aminotransferase  47.33 
 
 
453 aa  419  1e-116  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.0355081 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1534  4-aminobutyrate aminotransferase  47.36 
 
 
453 aa  419  1e-116  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.46092  normal  0.55252 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4851  4-aminobutyrate aminotransferase  48 
 
 
430 aa  417  9.999999999999999e-116  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2913  4-aminobutyrate aminotransferase  49.31 
 
 
434 aa  417  9.999999999999999e-116  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.976227 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0344  4-aminobutyrate aminotransferase  48.46 
 
 
426 aa  412  1e-114  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03450  4-aminobutyrate aminotransferase  48.46 
 
 
426 aa  412  1e-114  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  1.22305e-16 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0214  4-aminobutyrate aminotransferase  46.62 
 
 
425 aa  407  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0174674 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2081  4-aminobutyrate aminotransferase  49.41 
 
 
439 aa  408  1.0000000000000001e-112  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.703939  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0229  4-aminobutyrate aminotransferase  46.62 
 
 
425 aa  407  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0232  4-aminobutyrate aminotransferase  47.98 
 
 
440 aa  408  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0238  4-aminobutyrate aminotransferase  46.39 
 
 
425 aa  405  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2924  4-aminobutyrate aminotransferase  46.49 
 
 
450 aa  403  1e-111  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.647687 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4618  4-aminobutyrate aminotransferase  46.6 
 
 
427 aa  404  1e-111  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.914156  normal  0.10828 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1618  4-aminobutyrate aminotransferase  47.89 
 
 
420 aa  402  1e-111  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.346531  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3364  4-aminobutyrate aminotransferase  47.07 
 
 
429 aa  402  1e-111  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.158842 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0280  4-aminobutyrate aminotransferase  46.6 
 
 
429 aa  399  9.999999999999999e-111  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.969383  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1289  4-aminobutyrate aminotransferase  45.01 
 
 
426 aa  400  9.999999999999999e-111  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3005  4-aminobutyrate aminotransferase  46.6 
 
 
429 aa  399  9.999999999999999e-111  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.742708  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4998  4-aminobutyrate aminotransferase  47.09 
 
 
425 aa  400  9.999999999999999e-111  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.554548  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4711  4-aminobutyrate aminotransferase  46.6 
 
 
446 aa  399  9.999999999999999e-111  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5361  4-aminobutyrate aminotransferase  46.6 
 
 
429 aa  399  9.999999999999999e-111  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.984164  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4909  4-aminobutyrate aminotransferase  46.6 
 
 
427 aa  399  9.999999999999999e-111  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2405  aminotransferase class-III  45.12 
 
 
450 aa  399  9.999999999999999e-111  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5241  4-aminobutyrate aminotransferase  46.6 
 
 
427 aa  400  9.999999999999999e-111  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0293  hypothetical protein  49.32 
 
 
450 aa  397  1e-109  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4229  4-aminobutyrate aminotransferase  46.24 
 
 
428 aa  395  1e-109  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.94603  normal  0.717078 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0188  4-aminobutyrate aminotransferase  46.28 
 
 
425 aa  396  1e-109  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02518  4-aminobutyrate aminotransferase  45.81 
 
 
426 aa  393  1e-108  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1021  4-aminobutyrate aminotransferase  45.92 
 
 
426 aa  392  1e-108  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02482  hypothetical protein  45.81 
 
 
426 aa  393  1e-108  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1044  4-aminobutyrate aminotransferase  46.15 
 
 
426 aa  394  1e-108  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2937  4-aminobutyrate aminotransferase  44.11 
 
 
427 aa  393  1e-108  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.735836  normal  0.115833 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3904  4-aminobutyrate aminotransferase  45.69 
 
 
426 aa  392  1e-108  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.888156 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2782  4-aminobutyrate aminotransferase  45.48 
 
 
426 aa  392  1e-108  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.480055 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0309  hypothetical protein  49.1 
 
 
450 aa  395  1e-108  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4519  4-aminobutyrate aminotransferase  47.81 
 
 
427 aa  395  1e-108  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0834  4-aminobutyrate aminotransferase  47.2 
 
 
429 aa  393  1e-108  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.379614 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1978  4-aminobutyrate aminotransferase  46.48 
 
 
425 aa  392  1e-108  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.514602 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1944  4-aminobutyrate transaminase  47.51 
 
 
421 aa  394  1e-108  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.991898 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2797  4-aminobutyrate aminotransferase  46.15 
 
 
426 aa  394  1e-108  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01279  GABA aminotransferase, PLP-dependent  47.38 
 
 
421 aa  390  1e-107  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2344  4-aminobutyrate aminotransferase  47.38 
 
 
421 aa  390  1e-107  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.00720647  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2002  4-aminobutyrate aminotransferase  46.3 
 
 
434 aa  390  1e-107  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000607298 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01290  hypothetical protein  47.38 
 
 
421 aa  390  1e-107  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2989  4-aminobutyrate aminotransferase  43.65 
 
 
427 aa  389  1e-107  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.0883038 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2972  4-aminobutyrate aminotransferase  43.88 
 
 
427 aa  391  1e-107  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.109466  normal  0.025416 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2905  4-aminobutyrate aminotransferase  43.88 
 
 
427 aa  390  1e-107  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2313  4-aminobutyrate aminotransferase  44.52 
 
 
446 aa  389  1e-107  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.233271  normal  0.897192 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3070  4-aminobutyrate aminotransferase  47.2 
 
 
433 aa  389  1e-107  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.0281034 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1538  4-aminobutyrate transaminase  47.38 
 
 
421 aa  389  1e-107  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.535334  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2942  4-aminobutyrate aminotransferase  45.45 
 
 
426 aa  389  1e-107  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2274  4-aminobutyrate aminotransferase  44.52 
 
 
446 aa  389  1e-107  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1512  4-aminobutyrate transaminase  47.38 
 
 
421 aa  390  1e-107  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2323  4-aminobutyrate transaminase  47.38 
 
 
421 aa  390  1e-107  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1820  4-aminobutyrate transaminase  47.27 
 
 
421 aa  391  1e-107  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.144249 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4167  4-aminobutyrate aminotransferase  45.48 
 
 
434 aa  388  1e-107  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.130001  normal  0.207789 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2321  4-aminobutyrate aminotransferase  44.52 
 
 
446 aa  389  1e-107  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.42867  normal  0.490264 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1417  4-aminobutyrate transaminase  47.14 
 
 
421 aa  388  1e-106  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1858  4-aminobutyrate aminotransferase  44.84 
 
 
450 aa  387  1e-106  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2545  4-aminobutyrate aminotransferase  45.31 
 
 
421 aa  387  1e-106  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.505618  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7835  4-aminobutyrate aminotransferase  45.08 
 
 
443 aa  385  1e-106  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0486392 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2581  4-aminobutyrate aminotransferase  43.57 
 
 
446 aa  387  1e-106  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.120886  normal  0.564644 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3864  4-aminobutyrate aminotransferase  45.77 
 
 
421 aa  382  1e-105  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0197143 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0809  4-aminobutyrate aminotransferase  46.43 
 
 
419 aa  385  1e-105  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.615332  normal  0.0671712 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0117  aminotransferase class-III  48.52 
 
 
453 aa  382  1e-105  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.457647  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2233  4-aminobutyrate aminotransferase  45.26 
 
 
421 aa  384  1e-105  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.4744  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1910  4-aminobutyrate aminotransferase  45.18 
 
 
426 aa  383  1e-105  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.692445  normal  0.29202 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3094  4-aminobutyrate aminotransferase  43.57 
 
 
468 aa  384  1e-105  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0817591  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0090  4-aminobutyrate aminotransferase  47.52 
 
 
426 aa  379  1e-104  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0690  4-aminobutyrate aminotransferase  45.85 
 
 
448 aa  379  1e-104  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1532  4-aminobutyrate aminotransferase  45.52 
 
 
419 aa  379  1e-104  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3862  4-aminobutyrate aminotransferase  47.85 
 
 
427 aa  380  1e-104  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.612157 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0819  4-aminobutyrate aminotransferase  46.21 
 
 
446 aa  381  1e-104  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.798552  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3398  4-aminobutyrate aminotransferase  45.71 
 
 
426 aa  380  1e-104  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1956  4-aminobutyrate aminotransferase  44.44 
 
 
450 aa  381  1e-104  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0562  4-aminobutyrate aminotransferase  45.43 
 
 
447 aa  379  1e-104  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.921583 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3721  4-aminobutyrate aminotransferase  45 
 
 
426 aa  380  1e-104  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0897  4-aminobutyrate aminotransferase  44.89 
 
 
489 aa  379  1e-104  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.122318 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2259  4-aminobutyrate aminotransferase  47.31 
 
 
426 aa  378  1e-103  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.418729  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>