More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_0117 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



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Organism name
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Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009767  Rcas_0117  aminotransferase class-III  100 
 
 		 453 aa  915    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.457647  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4570  aminotransferase class-III  91.46 
 
 		 447 aa  792    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.782068  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0562  4-aminobutyrate aminotransferase  73.47 
 
 		 447 aa  611  1e-173  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.921583 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2924  4-aminobutyrate aminotransferase  53.17 
 
 		 450 aa  455  1e-127  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.647687 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2405  aminotransferase class-III  53.29 
 
 		 450 aa  457  1e-127  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2755  4-aminobutyrate aminotransferase  49.55 
 
 		 448 aa  433  1e-120  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2903  4-aminobutyrate aminotransferase  53.74 
 
 		 438 aa  428  1e-118  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.0048698  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0371  4-aminobutyrate aminotransferase  48.75 
 
 		 479 aa  419  1e-116  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0354  4-aminobutyrate aminotransferase  48.75 
 
 		 468 aa  417  9.999999999999999e-116  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0310  4-aminobutyrate aminotransferase  47.48 
 
 		 454 aa  415  9.999999999999999e-116  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0293  4-aminobutyrate aminotransferase  47.17 
 
 		 454 aa  417  9.999999999999999e-116  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0297  4-aminobutyrate aminotransferase  48.29 
 
 		 454 aa  416  9.999999999999999e-116  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4949  4-aminobutyrate aminotransferase  48.52 
 
 		 454 aa  417  9.999999999999999e-116  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0325  4-aminobutyrate aminotransferase  47.48 
 
 		 454 aa  415  9.999999999999999e-116  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0399  4-aminobutyrate aminotransferase  48.97 
 
 		 454 aa  418  9.999999999999999e-116  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0326575  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0305  4-aminobutyrate aminotransferase  48.08 
 
 		 454 aa  417  9.999999999999999e-116  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0357  4-aminobutyrate aminotransferase  47.48 
 
 		 478 aa  416  9.999999999999999e-116  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0303  4-aminobutyrate aminotransferase  48.52 
 
 		 454 aa  412  1e-114  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1534  4-aminobutyrate aminotransferase  50.34 
 
 		 453 aa  408  1.0000000000000001e-112  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.46092  normal  0.55252 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1034  4-aminobutyrate aminotransferase  50.23 
 
 		 453 aa  403  1e-111  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0355081 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0293  hypothetical protein  50.11 
 
 		 450 aa  402  1e-111  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0309  hypothetical protein  49.77 
 
 		 450 aa  401  9.999999999999999e-111  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2000  4-aminobutyrate aminotransferase  49.65 
 
 		 432 aa  397  1e-109  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0119  4-aminobutyrate aminotransferase  47.82 
 
 		 438 aa  390  1e-107  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2245  4-aminobutyrate aminotransferase  44.06 
 
 		 441 aa  391  1e-107  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.120834  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2400  4-aminobutyrate aminotransferase  46.93 
 
 		 430 aa  388  1e-106  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.681516  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0214  4-aminobutyrate aminotransferase  47.8 
 
 		 425 aa  383  1e-105  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0174674 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0238  4-aminobutyrate aminotransferase  48.01 
 
 		 425 aa  383  1e-105  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0229  4-aminobutyrate aminotransferase  47.8 
 
 		 425 aa  383  1e-105  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2081  4-aminobutyrate aminotransferase  49.53 
 
 		 439 aa  383  1e-105  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.703939  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4998  4-aminobutyrate aminotransferase  48.48 
 
 		 425 aa  379  1e-104  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.554548  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1021  4-aminobutyrate aminotransferase  46.96 
 
 		 426 aa  377  1e-103  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1044  4-aminobutyrate aminotransferase  46.96 
 
 		 426 aa  377  1e-103  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4229  4-aminobutyrate aminotransferase  48.23 
 
 		 428 aa  377  1e-103  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.94603  normal  0.717078 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2797  4-aminobutyrate aminotransferase  46.96 
 
 		 426 aa  377  1e-103  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2942  4-aminobutyrate aminotransferase  46.96 
 
 		 426 aa  376  1e-103  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0232  4-aminobutyrate aminotransferase  48.01 
 
 		 440 aa  375  1e-102  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3904  4-aminobutyrate aminotransferase  47.28 
 
 		 426 aa  375  1e-102  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.888156 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1956  4-aminobutyrate aminotransferase  47.11 
 
 		 450 aa  372  1e-102  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2782  4-aminobutyrate aminotransferase  47.28 
 
 		 426 aa  373  1e-102  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.480055 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02518  4-aminobutyrate aminotransferase  47.04 
 
 		 426 aa  372  1e-101  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2259  4-aminobutyrate aminotransferase  48.11 
 
 		 426 aa  369  1e-101  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.418729  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0809  4-aminobutyrate aminotransferase  47.16 
 
 		 419 aa  370  1e-101  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.615332  normal  0.0671712 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0344  4-aminobutyrate aminotransferase  47.1 
 
 		 426 aa  370  1e-101  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0188  4-aminobutyrate aminotransferase  48.47 
 
 		 425 aa  371  1e-101  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02482  hypothetical protein  47.04 
 
 		 426 aa  372  1e-101  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2274  4-aminobutyrate aminotransferase  45.6 
 
 		 446 aa  370  1e-101  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03450  4-aminobutyrate aminotransferase  47.1 
 
 		 426 aa  369  1e-101  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  1.22305e-16 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2913  4-aminobutyrate aminotransferase  44.7 
 
 		 434 aa  371  1e-101  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.976227 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1344  aminotransferase class-III  45.02 
 
 		 445 aa  370  1e-101  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.252611  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2313  4-aminobutyrate aminotransferase  45.6 
 
 		 446 aa  370  1e-101  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.233271  normal  0.897192 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2321  4-aminobutyrate aminotransferase  45.6 
 
 		 446 aa  370  1e-101  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.42867  normal  0.490264 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1858  4-aminobutyrate aminotransferase  47 
 
 		 450 aa  362  1e-98  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0592  4-aminobutyrate aminotransferase  45.67 
 
 		 432 aa  360  2e-98  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1532  4-aminobutyrate aminotransferase  45.86 
 
 		 419 aa  359  5e-98  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0819  4-aminobutyrate aminotransferase  45.6 
 
 		 446 aa  359  5e-98  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.798552  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2972  4-aminobutyrate aminotransferase  46.26 
 
 		 427 aa  359  6e-98  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.109466  normal  0.025416 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2937  4-aminobutyrate aminotransferase  46.26 
 
 		 427 aa  359  7e-98  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.735836  normal  0.115833 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0690  4-aminobutyrate aminotransferase  47.45 
 
 		 448 aa  358  9e-98  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2989  4-aminobutyrate aminotransferase  46.26 
 
 		 427 aa  357  1.9999999999999998e-97  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0883038 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3864  4-aminobutyrate aminotransferase  45.52 
 
 		 421 aa  357  1.9999999999999998e-97  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0197143 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2581  4-aminobutyrate aminotransferase  45.41 
 
 		 446 aa  357  2.9999999999999997e-97  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.120886  normal  0.564644 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2905  4-aminobutyrate aminotransferase  47.02 
 
 		 427 aa  357  2.9999999999999997e-97  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4695  4-aminobutyrate aminotransferase  46.93 
 
 		 430 aa  356  3.9999999999999996e-97  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3663  4-aminobutyrate aminotransferase  47.14 
 
 		 445 aa  356  5e-97  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2567  4-aminobutyrate aminotransferase  47.42 
 
 		 424 aa  354  2e-96  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.78639  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3137  4-aminobutyrate aminotransferase  48.59 
 
 		 424 aa  353  2.9999999999999997e-96  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.213623 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1289  4-aminobutyrate aminotransferase  42.79 
 
 		 426 aa  352  5e-96  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_10360  4-aminobutyrate aminotransferase  46.74 
 
 		 440 aa  352  5.9999999999999994e-96  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.70128  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0090  4-aminobutyrate aminotransferase  47.31 
 
 		 426 aa  352  8e-96  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3494  4-aminobutyrate aminotransferase  48.11 
 
 		 424 aa  352  8.999999999999999e-96  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.782932  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0301  4-aminobutyrate aminotransferase  47.56 
 
 		 426 aa  350  3e-95  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2630  4-aminobutyrate aminotransferase  45 
 
 		 430 aa  349  6e-95  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0315  4-aminobutyrate aminotransferase  47.24 
 
 		 440 aa  346  4e-94  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1618  4-aminobutyrate aminotransferase  44.81 
 
 		 420 aa  346  5e-94  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.346531  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0897  4-aminobutyrate aminotransferase  47.42 
 
 		 489 aa  346  6e-94  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.122318 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0952  4-aminobutyrate aminotransferase  47.07 
 
 		 425 aa  345  7e-94  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4711  4-aminobutyrate aminotransferase  44.34 
 
 		 446 aa  345  1e-93  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5241  4-aminobutyrate aminotransferase  44.34 
 
 		 427 aa  344  2e-93  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0146  4-aminobutyrate aminotransferase  47.18 
 
 		 434 aa  343  2.9999999999999997e-93  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2912  4-aminobutyrate aminotransferase  45.84 
 
 		 430 aa  343  2.9999999999999997e-93  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.852765 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4851  4-aminobutyrate aminotransferase  44 
 
 		 430 aa  343  2.9999999999999997e-93  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5049  4-aminobutyrate aminotransferase  45.69 
 
 		 436 aa  343  4e-93  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.96187  normal  0.62875 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4211  4-aminobutyrate aminotransferase  48.23 
 
 		 425 aa  343  5e-93  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.225868  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0007  aminotransferase class-III  42.21 
 
 		 425 aa  342  8e-93  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.383992  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3818  4-aminobutyrate aminotransferase  45.68 
 
 		 450 aa  342  1e-92  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.104054  normal  0.256716 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46670  4-aminobutyrate transaminase  48.03 
 
 		 426 aa  341  1e-92  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3364  4-aminobutyrate aminotransferase  44.1 
 
 		 429 aa  341  1e-92  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.158842 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0259  4-aminobutyrate aminotransferase  46.48 
 
 		 434 aa  340  2e-92  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3005  4-aminobutyrate aminotransferase  43.63 
 
 		 429 aa  340  2e-92  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.742708  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4286  4-aminobutyrate aminotransferase  49.88 
 
 		 425 aa  340  2e-92  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.012329 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5361  4-aminobutyrate aminotransferase  43.63 
 
 		 429 aa  340  2e-92  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.984164  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5663  4-aminobutyrate aminotransferase  44.68 
 
 		 429 aa  340  4e-92  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0280  4-aminobutyrate aminotransferase  43.63 
 
 		 429 aa  340  4e-92  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.969383  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01279  GABA aminotransferase, PLP-dependent  43.03 
 
 		 421 aa  339  5e-92  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2344  4-aminobutyrate aminotransferase  43.03 
 
 		 421 aa  339  5e-92  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.00720647  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2323  4-aminobutyrate transaminase  43.03 
 
 		 421 aa  339  5e-92  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1512  4-aminobutyrate transaminase  43.03 
 
 		 421 aa  339  5e-92  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_010515  Bcenmc03_4909  4-aminobutyrate aminotransferase  43.4 
 
 		 427 aa  339  5e-92  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_012892  B21_01290  hypothetical protein  43.03 
 
 		 421 aa  339  5e-92  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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