More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gura_0119 on replicon NC_009483
Organism: Geobacter uraniireducens Rf4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009483  Gura_0119  4-aminobutyrate aminotransferase  100 
 
 		 438 aa  899    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2000  4-aminobutyrate aminotransferase  56.38 
 
 		 432 aa  490  1e-137  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0310  4-aminobutyrate aminotransferase  54.37 
 
 		 454 aa  484  1e-135  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0325  4-aminobutyrate aminotransferase  54.37 
 
 		 454 aa  484  1e-135  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0399  4-aminobutyrate aminotransferase  53.9 
 
 		 454 aa  479  1e-134  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0326575  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0354  4-aminobutyrate aminotransferase  54.14 
 
 		 468 aa  480  1e-134  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0293  4-aminobutyrate aminotransferase  54.14 
 
 		 454 aa  480  1e-134  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0297  4-aminobutyrate aminotransferase  54.14 
 
 		 454 aa  480  1e-134  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0305  4-aminobutyrate aminotransferase  53.5 
 
 		 454 aa  481  1e-134  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0357  4-aminobutyrate aminotransferase  54.14 
 
 		 478 aa  481  1e-134  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0371  4-aminobutyrate aminotransferase  53.74 
 
 		 479 aa  479  1e-134  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2755  4-aminobutyrate aminotransferase  52.33 
 
 		 448 aa  475  1e-133  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0303  4-aminobutyrate aminotransferase  52.57 
 
 		 454 aa  474  1e-132  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4949  4-aminobutyrate aminotransferase  53.27 
 
 		 454 aa  474  1e-132  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2245  4-aminobutyrate aminotransferase  50.93 
 
 		 441 aa  458  9.999999999999999e-129  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.120834  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1534  4-aminobutyrate aminotransferase  51.28 
 
 		 453 aa  454  1e-127  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.46092  normal  0.55252 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2400  4-aminobutyrate aminotransferase  51.05 
 
 		 430 aa  440  9.999999999999999e-123  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.681516  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0592  4-aminobutyrate aminotransferase  49.42 
 
 		 432 aa  437  1e-121  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2081  4-aminobutyrate aminotransferase  52.57 
 
 		 439 aa  433  1e-120  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.703939  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2630  4-aminobutyrate aminotransferase  49.27 
 
 		 430 aa  419  1e-116  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0238  4-aminobutyrate aminotransferase  49.19 
 
 		 425 aa  419  1e-116  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2903  4-aminobutyrate aminotransferase  47.45 
 
 		 438 aa  420  1e-116  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.0048698  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0214  4-aminobutyrate aminotransferase  48.96 
 
 		 425 aa  417  9.999999999999999e-116  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0174674 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4695  4-aminobutyrate aminotransferase  49.07 
 
 		 430 aa  416  9.999999999999999e-116  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0229  4-aminobutyrate aminotransferase  48.96 
 
 		 425 aa  417  9.999999999999999e-116  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4998  4-aminobutyrate aminotransferase  48.73 
 
 		 425 aa  414  1e-114  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.554548  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1034  4-aminobutyrate aminotransferase  48.36 
 
 		 453 aa  412  1e-114  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0355081 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2912  4-aminobutyrate aminotransferase  47.67 
 
 		 430 aa  407  1.0000000000000001e-112  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.852765 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0232  4-aminobutyrate aminotransferase  47.93 
 
 		 440 aa  403  1e-111  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0188  4-aminobutyrate aminotransferase  47.22 
 
 		 425 aa  404  1e-111  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02518  4-aminobutyrate aminotransferase  46.98 
 
 		 426 aa  399  9.999999999999999e-111  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1021  4-aminobutyrate aminotransferase  46.74 
 
 		 426 aa  399  9.999999999999999e-111  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0344  4-aminobutyrate aminotransferase  47.81 
 
 		 426 aa  400  9.999999999999999e-111  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2782  4-aminobutyrate aminotransferase  46.98 
 
 		 426 aa  399  9.999999999999999e-111  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.480055 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2797  4-aminobutyrate aminotransferase  46.74 
 
 		 426 aa  398  9.999999999999999e-111  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1044  4-aminobutyrate aminotransferase  46.74 
 
 		 426 aa  398  9.999999999999999e-111  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03450  4-aminobutyrate aminotransferase  48.04 
 
 		 426 aa  401  9.999999999999999e-111  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  1.22305e-16 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02482  hypothetical protein  46.98 
 
 		 426 aa  399  9.999999999999999e-111  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3904  4-aminobutyrate aminotransferase  46.98 
 
 		 426 aa  400  9.999999999999999e-111  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.888156 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2942  4-aminobutyrate aminotransferase  46.74 
 
 		 426 aa  399  9.999999999999999e-111  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2002  4-aminobutyrate aminotransferase  49.29 
 
 		 434 aa  396  1e-109  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000607298 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4167  4-aminobutyrate aminotransferase  47.22 
 
 		 434 aa  394  1e-108  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.130001  normal  0.207789 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1618  4-aminobutyrate aminotransferase  47.18 
 
 		 420 aa  394  1e-108  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.346531  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3364  4-aminobutyrate aminotransferase  47.56 
 
 		 429 aa  390  1e-107  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.158842 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46670  4-aminobutyrate transaminase  49.88 
 
 		 426 aa  391  1e-107  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2913  4-aminobutyrate aminotransferase  47.21 
 
 		 434 aa  389  1e-107  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.976227 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2972  4-aminobutyrate aminotransferase  45.67 
 
 		 427 aa  389  1e-107  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.109466  normal  0.025416 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1956  4-aminobutyrate aminotransferase  47.55 
 
 		 450 aa  389  1e-107  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2937  4-aminobutyrate aminotransferase  45.67 
 
 		 427 aa  389  1e-107  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.735836  normal  0.115833 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1344  aminotransferase class-III  47.24 
 
 		 445 aa  390  1e-107  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.252611  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0090  4-aminobutyrate aminotransferase  47.7 
 
 		 426 aa  386  1e-106  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0280  4-aminobutyrate aminotransferase  46.64 
 
 		 429 aa  385  1e-106  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.969383  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4851  4-aminobutyrate aminotransferase  45.23 
 
 		 430 aa  386  1e-106  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3005  4-aminobutyrate aminotransferase  47.1 
 
 		 429 aa  387  1e-106  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.742708  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2905  4-aminobutyrate aminotransferase  45.43 
 
 		 427 aa  387  1e-106  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5361  4-aminobutyrate aminotransferase  47.1 
 
 		 429 aa  387  1e-106  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.984164  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2259  4-aminobutyrate aminotransferase  47.21 
 
 		 426 aa  385  1e-106  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.418729  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2989  4-aminobutyrate aminotransferase  45.43 
 
 		 427 aa  386  1e-106  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0883038 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4909  4-aminobutyrate aminotransferase  46.96 
 
 		 427 aa  383  1e-105  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0301  4-aminobutyrate aminotransferase  47.7 
 
 		 426 aa  384  1e-105  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0690  4-aminobutyrate aminotransferase  48.25 
 
 		 448 aa  384  1e-105  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5241  4-aminobutyrate aminotransferase  46.5 
 
 		 427 aa  382  1e-105  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2313  4-aminobutyrate aminotransferase  46.05 
 
 		 446 aa  383  1e-105  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.233271  normal  0.897192 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2274  4-aminobutyrate aminotransferase  46.05 
 
 		 446 aa  383  1e-105  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4711  4-aminobutyrate aminotransferase  46.17 
 
 		 446 aa  382  1e-105  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2581  4-aminobutyrate aminotransferase  46.74 
 
 		 446 aa  383  1e-105  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.120886  normal  0.564644 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2321  4-aminobutyrate aminotransferase  46.05 
 
 		 446 aa  383  1e-105  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.42867  normal  0.490264 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4618  4-aminobutyrate aminotransferase  45.71 
 
 		 427 aa  379  1e-104  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.914156  normal  0.10828 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4356  4-aminobutyrate aminotransferase  48.14 
 
 		 426 aa  379  1e-104  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00363071 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1978  4-aminobutyrate aminotransferase  45.94 
 
 		 425 aa  380  1e-104  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.514602 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7835  4-aminobutyrate aminotransferase  48.23 
 
 		 443 aa  380  1e-104  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0486392 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3864  4-aminobutyrate aminotransferase  45.31 
 
 		 421 aa  378  1e-104  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0197143 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3663  4-aminobutyrate aminotransferase  48.48 
 
 		 445 aa  380  1e-104  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0315  4-aminobutyrate aminotransferase  46.56 
 
 		 440 aa  380  1e-104  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0539  4-aminobutyrate aminotransferase  46.17 
 
 		 444 aa  381  1e-104  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0834  4-aminobutyrate aminotransferase  46.08 
 
 		 429 aa  375  1e-103  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.379614 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0007  aminotransferase class-III  45.35 
 
 		 425 aa  377  1e-103  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.383992  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0117  aminotransferase class-III  47.82 
 
 		 453 aa  376  1e-103  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.457647  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4570  aminotransferase class-III  48.24 
 
 		 447 aa  372  1e-102  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.782068  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1910  4-aminobutyrate aminotransferase  45.01 
 
 		 426 aa  372  1e-102  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.692445  normal  0.29202 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0309  hypothetical protein  47.21 
 
 		 450 aa  372  1e-102  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1820  4-aminobutyrate transaminase  45.9 
 
 		 421 aa  372  1e-102  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.144249 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4229  4-aminobutyrate aminotransferase  44.52 
 
 		 428 aa  375  1e-102  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.94603  normal  0.717078 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1784  4-aminobutyrate aminotransferase  46.24 
 
 		 421 aa  372  1e-102  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.988641  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1289  4-aminobutyrate aminotransferase  43.95 
 
 		 426 aa  372  1e-102  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2924  4-aminobutyrate aminotransferase  45.09 
 
 		 450 aa  374  1e-102  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.647687 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2545  4-aminobutyrate aminotransferase  44.57 
 
 		 421 aa  372  1e-102  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.505618  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4519  4-aminobutyrate aminotransferase  46.64 
 
 		 427 aa  372  1e-102  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4026  4-aminobutyrate aminotransferase  48.14 
 
 		 426 aa  372  1e-102  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.35866  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01279  GABA aminotransferase, PLP-dependent  45.67 
 
 		 421 aa  370  1e-101  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1944  4-aminobutyrate transaminase  45.9 
 
 		 421 aa  369  1e-101  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.991898 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0259  4-aminobutyrate aminotransferase  46.77 
 
 		 434 aa  369  1e-101  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2323  4-aminobutyrate transaminase  45.67 
 
 		 421 aa  370  1e-101  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3070  4-aminobutyrate aminotransferase  46.37 
 
 		 433 aa  369  1e-101  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0281034 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2233  4-aminobutyrate aminotransferase  44.79 
 
 		 421 aa  370  1e-101  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.4744  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1512  4-aminobutyrate transaminase  45.67 
 
 		 421 aa  370  1e-101  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2371  4-aminobutyrate aminotransferase  46.03 
 
 		 440 aa  372  1e-101  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0827884  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3094  4-aminobutyrate aminotransferase  49.4 
 
 		 468 aa  369  1e-101  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0817591  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4414  4-aminobutyrate aminotransferase  47.34 
 
 		 426 aa  369  1e-101  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.877124 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01290  hypothetical protein  45.67 
 
 		 421 aa  370  1e-101  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>